Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q7JIC9

Protein Details
Accession A0A4Q7JIC9    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-91PIAQHKSPSKSPQKLNTKKLCSLHydrophilic
121-140TMTTRETRSKRKDSPVERTEHydrophilic
379-398LNVRLQSKFCQKHKKQTATEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-292GGRREKKLRKFKAV
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 2, mito 1, plas 1, golg 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MGGLLNNEPKLRMGQRRIGLNRNQNTPTLLSRHKPPYKIKVPETIDAPPVSSSDEDDDSDAGFVSPIKPIAQHKSPSKSPQKLNTKKLCSLIDSSESSGEGDERAARAGIKGTNFGTTKGTMTTRETRSKRKDSPVERTENAKDADSKRRRMGETAQRTQRKASRSTPPASSGEHLRDELGFTKIRRAKATYRKKENSSQEVPVKKGLTDTQLTPSDINAEVAPKKDSATLRVPAVLQSPERTKKNKLLLPSDLPPSSPEDKPKLKLSSSFGSSQSSPGGRREKKLRKFKAVERSPSPPPAVFKMPASISDLQLRKSKNDAIEDSLIDDQTDVESQTDQVVKSNVDDDGESTEAAATCPWCGEPVDKILLDDFAKGRRLNVRLQSKFCQKHKKQTATELWEQKSYPEVQWGGLEKRFTMHHELLLNIINGGDSHFRCIHEKNILSGKARSMKKEGNMNPGYYGPRGFNLMCDYLVNEFSDLLKKKAVDDRVIAGRGSAAFIQTVLVAELAVRLIMDDMKATEKEARDILEESKALGEMIHEET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.54
3 0.63
4 0.69
5 0.7
6 0.72
7 0.72
8 0.71
9 0.7
10 0.67
11 0.59
12 0.55
13 0.5
14 0.46
15 0.43
16 0.42
17 0.39
18 0.45
19 0.54
20 0.58
21 0.63
22 0.67
23 0.7
24 0.74
25 0.79
26 0.75
27 0.75
28 0.73
29 0.69
30 0.64
31 0.57
32 0.51
33 0.42
34 0.39
35 0.29
36 0.24
37 0.22
38 0.18
39 0.17
40 0.16
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.15
46 0.15
47 0.13
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.09
53 0.1
54 0.1
55 0.14
56 0.19
57 0.27
58 0.33
59 0.4
60 0.46
61 0.53
62 0.59
63 0.66
64 0.71
65 0.72
66 0.73
67 0.75
68 0.79
69 0.81
70 0.85
71 0.85
72 0.82
73 0.78
74 0.76
75 0.68
76 0.6
77 0.55
78 0.48
79 0.43
80 0.37
81 0.34
82 0.28
83 0.26
84 0.22
85 0.19
86 0.15
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.13
96 0.15
97 0.14
98 0.17
99 0.17
100 0.22
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.21
105 0.21
106 0.21
107 0.22
108 0.18
109 0.24
110 0.31
111 0.34
112 0.43
113 0.47
114 0.55
115 0.63
116 0.7
117 0.72
118 0.74
119 0.77
120 0.76
121 0.81
122 0.8
123 0.78
124 0.7
125 0.68
126 0.61
127 0.56
128 0.49
129 0.4
130 0.38
131 0.35
132 0.44
133 0.45
134 0.48
135 0.49
136 0.54
137 0.54
138 0.52
139 0.56
140 0.56
141 0.59
142 0.63
143 0.66
144 0.66
145 0.65
146 0.67
147 0.62
148 0.56
149 0.53
150 0.5
151 0.5
152 0.52
153 0.54
154 0.52
155 0.51
156 0.48
157 0.44
158 0.39
159 0.34
160 0.3
161 0.28
162 0.25
163 0.22
164 0.19
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.16
169 0.14
170 0.23
171 0.27
172 0.29
173 0.31
174 0.34
175 0.41
176 0.49
177 0.6
178 0.61
179 0.68
180 0.72
181 0.74
182 0.78
183 0.77
184 0.75
185 0.68
186 0.64
187 0.61
188 0.58
189 0.54
190 0.49
191 0.41
192 0.33
193 0.3
194 0.25
195 0.22
196 0.2
197 0.2
198 0.21
199 0.23
200 0.23
201 0.22
202 0.2
203 0.18
204 0.16
205 0.16
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.11
212 0.12
213 0.16
214 0.16
215 0.18
216 0.22
217 0.23
218 0.23
219 0.24
220 0.23
221 0.19
222 0.21
223 0.18
224 0.13
225 0.14
226 0.2
227 0.24
228 0.29
229 0.31
230 0.33
231 0.39
232 0.46
233 0.46
234 0.45
235 0.44
236 0.44
237 0.45
238 0.44
239 0.4
240 0.32
241 0.3
242 0.26
243 0.25
244 0.25
245 0.22
246 0.23
247 0.26
248 0.29
249 0.32
250 0.37
251 0.35
252 0.32
253 0.35
254 0.35
255 0.33
256 0.32
257 0.32
258 0.27
259 0.26
260 0.25
261 0.22
262 0.19
263 0.17
264 0.15
265 0.19
266 0.27
267 0.27
268 0.32
269 0.41
270 0.5
271 0.58
272 0.67
273 0.69
274 0.69
275 0.73
276 0.76
277 0.77
278 0.74
279 0.71
280 0.64
281 0.62
282 0.55
283 0.52
284 0.46
285 0.37
286 0.31
287 0.28
288 0.27
289 0.23
290 0.21
291 0.2
292 0.19
293 0.18
294 0.21
295 0.19
296 0.17
297 0.22
298 0.23
299 0.22
300 0.26
301 0.26
302 0.23
303 0.25
304 0.28
305 0.25
306 0.28
307 0.27
308 0.27
309 0.28
310 0.27
311 0.25
312 0.22
313 0.18
314 0.14
315 0.12
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.06
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.12
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.16
357 0.15
358 0.15
359 0.13
360 0.13
361 0.17
362 0.17
363 0.19
364 0.24
365 0.26
366 0.31
367 0.39
368 0.46
369 0.48
370 0.53
371 0.58
372 0.62
373 0.67
374 0.69
375 0.72
376 0.67
377 0.72
378 0.78
379 0.8
380 0.74
381 0.76
382 0.77
383 0.73
384 0.76
385 0.73
386 0.65
387 0.57
388 0.53
389 0.44
390 0.38
391 0.33
392 0.25
393 0.22
394 0.21
395 0.19
396 0.22
397 0.26
398 0.26
399 0.26
400 0.26
401 0.2
402 0.21
403 0.22
404 0.23
405 0.26
406 0.24
407 0.25
408 0.26
409 0.26
410 0.26
411 0.27
412 0.24
413 0.16
414 0.14
415 0.1
416 0.09
417 0.1
418 0.13
419 0.11
420 0.16
421 0.18
422 0.2
423 0.23
424 0.26
425 0.29
426 0.33
427 0.34
428 0.34
429 0.4
430 0.43
431 0.42
432 0.42
433 0.43
434 0.44
435 0.45
436 0.44
437 0.43
438 0.45
439 0.48
440 0.56
441 0.54
442 0.56
443 0.56
444 0.53
445 0.48
446 0.45
447 0.43
448 0.34
449 0.31
450 0.21
451 0.2
452 0.23
453 0.21
454 0.2
455 0.22
456 0.22
457 0.2
458 0.19
459 0.2
460 0.18
461 0.19
462 0.17
463 0.12
464 0.11
465 0.12
466 0.2
467 0.21
468 0.21
469 0.23
470 0.23
471 0.27
472 0.35
473 0.39
474 0.36
475 0.37
476 0.41
477 0.43
478 0.45
479 0.4
480 0.32
481 0.28
482 0.24
483 0.23
484 0.17
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.09
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.09
505 0.13
506 0.13
507 0.15
508 0.2
509 0.21
510 0.24
511 0.26
512 0.26
513 0.25
514 0.27
515 0.27
516 0.27
517 0.26
518 0.23
519 0.22
520 0.21
521 0.18
522 0.15
523 0.14