Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D5GAW6

Protein Details
Accession D5GAW6    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-177REAKDRKKFKAAQRLEKLRKKSBasic
236-257VDARLKKDVKAQKRVAKRDKKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-177AAIKEKLRALNARPIKKVREAKDRKKFKAAQRLEKLRKKS
197-257KLMAKAGKKKLKAKVKVVVARGPNKGQGRPRGVKGRYKIVDARLKKDVKAQKRVAKRDKKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG tml:GSTUM_00005337001  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MFFDQDIFQDIAFDYSIENSTNVLHGGGEAGMGDGSGTEEEGDAETGIEIVKAQKDDSWNAEEEPMKNGKIDIEIITAEAMSLAQRLATGKSSAEANIIDDGFNKYSFRDRDGLPDWFLDDENKHSKPNRPITAAGAAAIKEKLRALNARPIKKVREAKDRKKFKAAQRLEKLRKKSALMADEEGMTEKEKAANITKLMAKAGKKKLKAKVKVVVARGPNKGQGRPRGVKGRYKIVDARLKKDVKAQKRVAKRDKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.1
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.07
15 0.06
16 0.05
17 0.05
18 0.04
19 0.04
20 0.04
21 0.03
22 0.04
23 0.04
24 0.04
25 0.04
26 0.04
27 0.05
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.06
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.12
42 0.15
43 0.18
44 0.22
45 0.23
46 0.22
47 0.22
48 0.26
49 0.26
50 0.23
51 0.25
52 0.23
53 0.2
54 0.19
55 0.19
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.03
69 0.04
70 0.03
71 0.03
72 0.04
73 0.05
74 0.06
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.15
94 0.16
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.25
99 0.28
100 0.29
101 0.24
102 0.23
103 0.21
104 0.18
105 0.18
106 0.13
107 0.1
108 0.12
109 0.16
110 0.17
111 0.19
112 0.21
113 0.28
114 0.35
115 0.43
116 0.43
117 0.41
118 0.41
119 0.41
120 0.41
121 0.35
122 0.27
123 0.19
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.09
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.12
133 0.14
134 0.22
135 0.3
136 0.34
137 0.38
138 0.41
139 0.42
140 0.48
141 0.53
142 0.5
143 0.55
144 0.6
145 0.66
146 0.73
147 0.8
148 0.75
149 0.77
150 0.78
151 0.75
152 0.76
153 0.74
154 0.74
155 0.74
156 0.81
157 0.81
158 0.81
159 0.78
160 0.74
161 0.7
162 0.61
163 0.58
164 0.54
165 0.48
166 0.45
167 0.41
168 0.35
169 0.31
170 0.29
171 0.24
172 0.17
173 0.14
174 0.11
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.13
179 0.16
180 0.18
181 0.18
182 0.22
183 0.24
184 0.23
185 0.24
186 0.26
187 0.26
188 0.33
189 0.42
190 0.46
191 0.51
192 0.58
193 0.66
194 0.72
195 0.76
196 0.75
197 0.73
198 0.75
199 0.75
200 0.71
201 0.68
202 0.65
203 0.63
204 0.6
205 0.54
206 0.52
207 0.49
208 0.51
209 0.52
210 0.54
211 0.57
212 0.58
213 0.64
214 0.66
215 0.68
216 0.7
217 0.68
218 0.69
219 0.62
220 0.62
221 0.6
222 0.59
223 0.64
224 0.6
225 0.6
226 0.59
227 0.59
228 0.54
229 0.58
230 0.59
231 0.59
232 0.64
233 0.68
234 0.68
235 0.76
236 0.85
237 0.87