FuNGI

D5GNE3

Protein Details

Accession

D5GNE3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-49	EANSNPLVQRQKRPRAPVVNRQKLA	Hydrophilic
121-140	PTQFTRPVRLHRRDPRAPLQ	Hydrophilic
188-209	GGAQKQKQKVFHKKTQQVFKSN	Hydrophilic
544-565	PESGTESRKKPKKNNAATNSTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
392-409	RKKLEEVRRKHGKRVKKA
444-473	RKEEEKKKEEERKKAEAAAEKEKADPRKSK
517-522	KDKHPA
527-556	PLSDKKPQLKRAGTPPHPESGTESRKKPKK

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	tml:GSTUM_00011245001 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MASPAPSSAPTTGSPVPRMVARRREANSNPLVQRQKRPRAPVVNRQKLAAPPPPPPIAAAPAKTVSSTASSVSGTGSAIAVDDEGEWHEFKLTTTKASLLKGLRHHVMRMQSKREIDPTDPTQFTRPVRLHRRDPRAPLQGAKEEAAANQLAAANKAAEAGEKAKDEVEQAKKDAEKQANLDKIAPFGGAQKQKQKVFHKKTQQVFKSNDAEKKLRYEEFFPWFIEDFDNKNTWQGQLESSLSKGVFAMFVLEEGAFRMVPIEKWYKFQEKNRFPTMTSEEAELEMKKNARPPRWLMKRTEEKESKQRELEENARANKTLFTRKGDRLKGEADNDDLDFEDDQFADDEEAPIMEGEEQENKEIEKRIKKEQLSANFFDARDERDWEKEELERKKLEEVRRKHGKRVKKALMNREGNFTYESDSDANPYGTSGDEDSEDEEETARKEEEKKKEEERKKAEAAAEKEKADPRKSKTPPVATPASTSTPSAVAAPAPSQPKSKATGGTTGAPHPNAANKKDKHPAGTPLPLSDKKPQLKRAGTPPHPESGTESRKKPKKNNAATNSTTGKSTTLPILGGTDKKNIVKLKVASESLSQIASSTPSPSPPPPGVGAGNKKRKADVSAGARSGDERSGEMSDGPGSKKQRIKITTGGRSLSPAAAAAASRQGTPGASRAGSPAAAAGAGNTSAPAARGTPGPPDFITDAEIRTVLSSNPEGVTLKFIADKFKNRVRNEEVKKGLVSSLRRLSVSTDKRTYKLKEGVSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.31
3	0.31
4	0.33
5	0.4
6	0.42
7	0.47
8	0.48
9	0.54
10	0.56
11	0.64
12	0.63
13	0.65
14	0.63
15	0.62
16	0.61
17	0.61
18	0.67
19	0.64
20	0.7
21	0.72
22	0.76
23	0.75
24	0.79
25	0.8
26	0.82
27	0.85
28	0.85
29	0.86
30	0.86
31	0.78
32	0.72
33	0.66
34	0.6
35	0.58
36	0.55
37	0.48
38	0.43
39	0.49
40	0.49
41	0.45
42	0.42
43	0.38
44	0.36
45	0.37
46	0.33
47	0.31
48	0.3
49	0.3
50	0.28
51	0.26
52	0.21
53	0.19
54	0.18
55	0.15
56	0.15
57	0.15
58	0.15
59	0.15
60	0.14
61	0.1
62	0.1
63	0.09
64	0.07
65	0.06
66	0.06
67	0.06
68	0.05
69	0.05
70	0.05
71	0.07
72	0.09
73	0.09
74	0.09
75	0.11
76	0.11
77	0.12
78	0.19
79	0.18
80	0.19
81	0.2
82	0.25
83	0.27
84	0.28
85	0.34
86	0.3
87	0.35
88	0.38
89	0.42
90	0.44
91	0.42
92	0.42
93	0.41
94	0.47
95	0.51
96	0.53
97	0.54
98	0.54
99	0.56
100	0.57
101	0.59
102	0.53
103	0.47
104	0.46
105	0.46
106	0.47
107	0.44
108	0.42
109	0.41
110	0.43
111	0.41
112	0.43
113	0.41
114	0.44
115	0.53
116	0.6
117	0.66
118	0.7
119	0.78
120	0.76
121	0.8
122	0.79
123	0.78
124	0.73
125	0.67
126	0.63
127	0.59
128	0.54
129	0.46
130	0.39
131	0.3
132	0.27
133	0.24
134	0.18
135	0.12
136	0.11
137	0.12
138	0.11
139	0.11
140	0.12
141	0.09
142	0.09
143	0.1
144	0.09
145	0.07
146	0.09
147	0.11
148	0.13
149	0.14
150	0.14
151	0.14
152	0.15
153	0.16
154	0.23
155	0.27
156	0.27
157	0.28
158	0.32
159	0.33
160	0.36
161	0.42
162	0.39
163	0.35
164	0.37
165	0.44
166	0.44
167	0.44
168	0.43
169	0.35
170	0.31
171	0.28
172	0.23
173	0.16
174	0.15
175	0.21
176	0.25
177	0.29
178	0.36
179	0.43
180	0.47
181	0.56
182	0.62
183	0.66
184	0.68
185	0.74
186	0.76
187	0.78
188	0.82
189	0.84
190	0.81
191	0.77
192	0.72
193	0.7
194	0.67
195	0.64
196	0.61
197	0.56
198	0.52
199	0.46
200	0.48
201	0.45
202	0.4
203	0.36
204	0.36
205	0.36
206	0.38
207	0.38
208	0.33
209	0.31
210	0.28
211	0.26
212	0.25
213	0.21
214	0.18
215	0.19
216	0.2
217	0.18
218	0.2
219	0.2
220	0.18
221	0.18
222	0.17
223	0.15
224	0.16
225	0.18
226	0.16
227	0.15
228	0.17
229	0.15
230	0.13
231	0.12
232	0.09
233	0.08
234	0.07
235	0.08
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.05
244	0.05
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.11
249	0.17
250	0.18
251	0.21
252	0.26
253	0.34
254	0.39
255	0.47
256	0.54
257	0.56
258	0.62
259	0.66
260	0.63
261	0.55
262	0.55
263	0.52
264	0.45
265	0.37
266	0.32
267	0.25
268	0.25
269	0.25
270	0.19
271	0.15
272	0.13
273	0.14
274	0.14
275	0.2
276	0.25
277	0.28
278	0.33
279	0.38
280	0.47
281	0.56
282	0.59
283	0.58
284	0.61
285	0.68
286	0.65
287	0.69
288	0.64
289	0.59
290	0.63
291	0.65
292	0.59
293	0.51
294	0.52
295	0.45
296	0.45
297	0.45
298	0.43
299	0.42
300	0.41
301	0.4
302	0.37
303	0.34
304	0.31
305	0.29
306	0.3
307	0.28
308	0.29
309	0.34
310	0.41
311	0.49
312	0.5
313	0.48
314	0.43
315	0.44
316	0.42
317	0.39
318	0.33
319	0.26
320	0.23
321	0.2
322	0.18
323	0.14
324	0.11
325	0.08
326	0.07
327	0.06
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.11
349	0.14
350	0.19
351	0.23
352	0.26
353	0.34
354	0.41
355	0.42
356	0.47
357	0.5
358	0.53
359	0.52
360	0.51
361	0.46
362	0.41
363	0.4
364	0.34
365	0.28
366	0.22
367	0.17
368	0.18
369	0.17
370	0.17
371	0.19
372	0.19
373	0.2
374	0.2
375	0.26
376	0.27
377	0.3
378	0.28
379	0.26
380	0.32
381	0.36
382	0.42
383	0.44
384	0.45
385	0.51
386	0.61
387	0.62
388	0.64
389	0.66
390	0.67
391	0.67
392	0.73
393	0.71
394	0.68
395	0.74
396	0.74
397	0.77
398	0.75
399	0.66
400	0.6
401	0.52
402	0.45
403	0.39
404	0.29
405	0.22
406	0.15
407	0.16
408	0.12
409	0.12
410	0.12
411	0.12
412	0.12
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.16
433	0.24
434	0.33
435	0.37
436	0.42
437	0.5
438	0.61
439	0.67
440	0.7
441	0.69
442	0.66
443	0.64
444	0.62
445	0.57
446	0.53
447	0.5
448	0.47
449	0.43
450	0.37
451	0.38
452	0.39
453	0.4
454	0.39
455	0.41
456	0.39
457	0.47
458	0.49
459	0.55
460	0.58
461	0.61
462	0.59
463	0.58
464	0.56
465	0.47
466	0.46
467	0.4
468	0.35
469	0.28
470	0.25
471	0.19
472	0.15
473	0.15
474	0.13
475	0.1
476	0.08
477	0.07
478	0.08
479	0.11
480	0.14
481	0.15
482	0.17
483	0.18
484	0.21
485	0.24
486	0.26
487	0.27
488	0.26
489	0.3
490	0.3
491	0.32
492	0.31
493	0.3
494	0.29
495	0.25
496	0.24
497	0.19
498	0.23
499	0.24
500	0.27
501	0.33
502	0.33
503	0.39
504	0.47
505	0.48
506	0.46
507	0.45
508	0.48
509	0.44
510	0.49
511	0.43
512	0.38
513	0.42
514	0.4
515	0.4
516	0.4
517	0.43
518	0.44
519	0.51
520	0.55
521	0.58
522	0.6
523	0.62
524	0.65
525	0.67
526	0.66
527	0.66
528	0.61
529	0.57
530	0.53
531	0.48
532	0.44
533	0.43
534	0.46
535	0.44
536	0.47
537	0.52
538	0.59
539	0.67
540	0.7
541	0.71
542	0.73
543	0.78
544	0.83
545	0.82
546	0.83
547	0.77
548	0.74
549	0.67
550	0.56
551	0.46
552	0.36
553	0.29
554	0.22
555	0.2
556	0.16
557	0.13
558	0.13
559	0.12
560	0.14
561	0.15
562	0.18
563	0.18
564	0.2
565	0.22
566	0.23
567	0.28
568	0.29
569	0.29
570	0.33
571	0.34
572	0.35
573	0.37
574	0.37
575	0.33
576	0.32
577	0.32
578	0.25
579	0.23
580	0.17
581	0.12
582	0.12
583	0.12
584	0.11
585	0.12
586	0.11
587	0.13
588	0.17
589	0.19
590	0.24
591	0.24
592	0.26
593	0.24
594	0.27
595	0.28
596	0.32
597	0.41
598	0.45
599	0.54
600	0.56
601	0.55
602	0.54
603	0.53
604	0.5
605	0.46
606	0.45
607	0.43
608	0.46
609	0.46
610	0.44
611	0.41
612	0.38
613	0.33
614	0.27
615	0.19
616	0.13
617	0.14
618	0.14
619	0.15
620	0.14
621	0.13
622	0.14
623	0.16
624	0.18
625	0.21
626	0.24
627	0.31
628	0.36
629	0.41
630	0.48
631	0.49
632	0.53
633	0.56
634	0.62
635	0.63
636	0.63
637	0.59
638	0.5
639	0.49
640	0.44
641	0.35
642	0.26
643	0.17
644	0.13
645	0.12
646	0.11
647	0.09
648	0.13
649	0.13
650	0.13
651	0.13
652	0.13
653	0.13
654	0.14
655	0.17
656	0.16
657	0.15
658	0.16
659	0.17
660	0.18
661	0.17
662	0.16
663	0.13
664	0.1
665	0.09
666	0.09
667	0.07
668	0.06
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.07
675	0.07
676	0.07
677	0.09
678	0.11
679	0.13
680	0.21
681	0.22
682	0.25
683	0.24
684	0.27
685	0.27
686	0.25
687	0.27
688	0.21
689	0.2
690	0.18
691	0.18
692	0.14
693	0.14
694	0.14
695	0.11
696	0.14
697	0.15
698	0.15
699	0.16
700	0.17
701	0.18
702	0.17
703	0.21
704	0.17
705	0.17
706	0.19
707	0.2
708	0.27
709	0.32
710	0.39
711	0.43
712	0.51
713	0.59
714	0.58
715	0.66
716	0.66
717	0.71
718	0.71
719	0.74
720	0.7
721	0.65
722	0.63
723	0.55
724	0.51
725	0.47
726	0.43
727	0.41
728	0.43
729	0.42
730	0.42
731	0.41
732	0.43
733	0.47
734	0.51
735	0.51
736	0.53
737	0.54
738	0.57
739	0.65
740	0.65
741	0.64
742	0.63

D5GNE3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer