FuNGI

C4QZM5

Protein Details

Accession

C4QZM5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
510-535	GPQQRGYYPNNRQNKNRNQKEEGNSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 14, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR036053 PABP-dom IPR006515 PABP_1234 IPR002004 PABP_HYD IPR034364 PABP_RRM1 IPR035979 RBD_domain_sf IPR045305 RRM2_I_PABPs IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0010494 C:cytoplasmic stress granule GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0005840 C:ribosome GO:0140693 F:molecular condensate scaffold activity GO:0008143 F:poly(A) binding GO:1990841 F:promoter-specific chromatin binding GO:0008428 F:ribonuclease inhibitor activity GO:0006397 P:mRNA processing GO:0051028 P:mRNA transport GO:0060212 P:negative regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening GO:0006446 P:regulation of translational initiation
KEGG	ppa:PAS_chr2-1_0097 -
Pfam	View protein in Pfam PF00658 PABP PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51309 PABC PS50102 RRM
CDD	cd12378 RRM1_I_PABPs cd12379 RRM2_I_PABPs cd12380 RRM3_I_PABPs cd12381 RRM4_I_PABPs

Amino Acid Sequences

MSVDTKEVQESLDQLNISESPATAVTEETPATSTEAAEESNESSTQASETLASLYVGELDPTVTESDLYEFFSPIGSVNSIRVCRDAVTKRSLGYGYVNFHSQAAGERALEELNYAEIKGVRCRLMWSQRDPSLRRSGSGNIFIKNLDPAIENKTLHDTFSSFGKVLSCKVATDENGNSKGFGFVHYESDEAAQAAIENINGMLLNGREIYVGPHLAKKDRESRFQEMIKNYTNVFVKNFDTESTEDELRELFESYGPITSIHLQVDSEGHNKGFGFVNFAEHDDAVKAVEALNDKEYKGKPLYVGRAQKKNERVHELTKKYEADRLEKLQKYQSVNLFIKNLDESIDDARLEEEFKPFGTITSAKVMLDENGKSRGFGFVCLSTPEEATKAISEMNQRMVANKPLYVALAQPKAIRRSQLAQQIQARNQMRMQQQAGPGIPNQFVQPIFYGQQPGMLPPGARVPPMGNQIPQFAGMPRPGPFPQGQFPRMAPNGQPMPVYGQPVFNGNGPQQRGYYPNNRQNKNRNQKEEGNSLAAILPQLPLEQQKRVLGEELYPKVVATNKTQDPEAAGKITGMILDLDNQEILQLLEDEELFNTHFNEALQAYEEYKSKTVEQQQQADAQAN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.19
3	0.18
4	0.18
5	0.16
6	0.13
7	0.11
8	0.12
9	0.13
10	0.11
11	0.11
12	0.11
13	0.13
14	0.13
15	0.12
16	0.12
17	0.13
18	0.14
19	0.14
20	0.12
21	0.12
22	0.12
23	0.12
24	0.12
25	0.13
26	0.12
27	0.14
28	0.14
29	0.13
30	0.12
31	0.12
32	0.12
33	0.11
34	0.1
35	0.09
36	0.09
37	0.1
38	0.1
39	0.09
40	0.09
41	0.08
42	0.1
43	0.09
44	0.08
45	0.07
46	0.07
47	0.07
48	0.08
49	0.09
50	0.07
51	0.08
52	0.08
53	0.1
54	0.11
55	0.13
56	0.13
57	0.12
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.1
62	0.12
63	0.11
64	0.11
65	0.13
66	0.19
67	0.2
68	0.21
69	0.22
70	0.21
71	0.21
72	0.29
73	0.33
74	0.33
75	0.38
76	0.39
77	0.38
78	0.41
79	0.4
80	0.33
81	0.3
82	0.3
83	0.27
84	0.28
85	0.28
86	0.25
87	0.25
88	0.23
89	0.18
90	0.17
91	0.15
92	0.15
93	0.14
94	0.13
95	0.14
96	0.14
97	0.13
98	0.1
99	0.07
100	0.08
101	0.08
102	0.08
103	0.08
104	0.11
105	0.13
106	0.17
107	0.2
108	0.2
109	0.2
110	0.24
111	0.31
112	0.38
113	0.44
114	0.46
115	0.51
116	0.56
117	0.63
118	0.63
119	0.61
120	0.61
121	0.55
122	0.49
123	0.44
124	0.44
125	0.41
126	0.48
127	0.44
128	0.35
129	0.35
130	0.34
131	0.31
132	0.26
133	0.21
134	0.13
135	0.11
136	0.12
137	0.17
138	0.21
139	0.2
140	0.2
141	0.27
142	0.26
143	0.25
144	0.24
145	0.19
146	0.16
147	0.19
148	0.2
149	0.13
150	0.13
151	0.15
152	0.15
153	0.16
154	0.19
155	0.17
156	0.15
157	0.17
158	0.19
159	0.18
160	0.21
161	0.24
162	0.25
163	0.28
164	0.28
165	0.26
166	0.24
167	0.24
168	0.2
169	0.17
170	0.16
171	0.14
172	0.17
173	0.17
174	0.17
175	0.16
176	0.16
177	0.15
178	0.11
179	0.09
180	0.06
181	0.05
182	0.06
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.08
198	0.08
199	0.1
200	0.1
201	0.13
202	0.15
203	0.19
204	0.21
205	0.24
206	0.32
207	0.34
208	0.42
209	0.46
210	0.51
211	0.54
212	0.56
213	0.57
214	0.51
215	0.51
216	0.46
217	0.4
218	0.34
219	0.32
220	0.29
221	0.24
222	0.22
223	0.2
224	0.18
225	0.18
226	0.18
227	0.15
228	0.16
229	0.16
230	0.17
231	0.18
232	0.17
233	0.15
234	0.15
235	0.15
236	0.12
237	0.12
238	0.1
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.08
247	0.09
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.11
255	0.11
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.1
260	0.11
261	0.12
262	0.1
263	0.13
264	0.12
265	0.15
266	0.15
267	0.16
268	0.15
269	0.13
270	0.13
271	0.09
272	0.09
273	0.06
274	0.06
275	0.05
276	0.04
277	0.06
278	0.07
279	0.08
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.16
284	0.16
285	0.18
286	0.18
287	0.18
288	0.19
289	0.22
290	0.28
291	0.3
292	0.39
293	0.41
294	0.47
295	0.49
296	0.52
297	0.56
298	0.57
299	0.54
300	0.53
301	0.5
302	0.51
303	0.58
304	0.55
305	0.49
306	0.47
307	0.44
308	0.37
309	0.38
310	0.31
311	0.27
312	0.27
313	0.3
314	0.34
315	0.34
316	0.35
317	0.35
318	0.38
319	0.36
320	0.37
321	0.35
322	0.34
323	0.34
324	0.34
325	0.31
326	0.26
327	0.24
328	0.2
329	0.16
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.1
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.09
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.11
348	0.11
349	0.11
350	0.14
351	0.15
352	0.13
353	0.14
354	0.14
355	0.12
356	0.14
357	0.14
358	0.12
359	0.16
360	0.16
361	0.16
362	0.16
363	0.18
364	0.16
365	0.16
366	0.17
367	0.14
368	0.15
369	0.16
370	0.17
371	0.13
372	0.13
373	0.12
374	0.11
375	0.09
376	0.09
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.13
382	0.14
383	0.17
384	0.19
385	0.19
386	0.2
387	0.22
388	0.25
389	0.23
390	0.21
391	0.19
392	0.16
393	0.17
394	0.16
395	0.16
396	0.16
397	0.17
398	0.17
399	0.19
400	0.23
401	0.26
402	0.27
403	0.27
404	0.25
405	0.27
406	0.32
407	0.39
408	0.37
409	0.4
410	0.46
411	0.5
412	0.48
413	0.53
414	0.48
415	0.41
416	0.4
417	0.4
418	0.36
419	0.36
420	0.36
421	0.32
422	0.32
423	0.34
424	0.33
425	0.28
426	0.26
427	0.23
428	0.21
429	0.17
430	0.15
431	0.14
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.14
437	0.14
438	0.16
439	0.13
440	0.17
441	0.16
442	0.16
443	0.15
444	0.14
445	0.13
446	0.12
447	0.19
448	0.15
449	0.15
450	0.16
451	0.16
452	0.19
453	0.25
454	0.26
455	0.23
456	0.23
457	0.25
458	0.24
459	0.23
460	0.2
461	0.15
462	0.16
463	0.15
464	0.16
465	0.16
466	0.2
467	0.19
468	0.23
469	0.24
470	0.25
471	0.31
472	0.37
473	0.37
474	0.35
475	0.36
476	0.39
477	0.39
478	0.37
479	0.3
480	0.31
481	0.32
482	0.31
483	0.3
484	0.23
485	0.27
486	0.27
487	0.3
488	0.23
489	0.21
490	0.2
491	0.23
492	0.24
493	0.19
494	0.2
495	0.2
496	0.25
497	0.25
498	0.26
499	0.25
500	0.26
501	0.29
502	0.33
503	0.39
504	0.43
505	0.51
506	0.59
507	0.63
508	0.7
509	0.76
510	0.81
511	0.82
512	0.82
513	0.81
514	0.79
515	0.82
516	0.81
517	0.77
518	0.7
519	0.62
520	0.51
521	0.43
522	0.37
523	0.28
524	0.21
525	0.14
526	0.11
527	0.07
528	0.08
529	0.09
530	0.15
531	0.18
532	0.22
533	0.25
534	0.28
535	0.3
536	0.31
537	0.32
538	0.26
539	0.28
540	0.33
541	0.33
542	0.31
543	0.29
544	0.27
545	0.27
546	0.31
547	0.28
548	0.26
549	0.32
550	0.35
551	0.37
552	0.38
553	0.36
554	0.36
555	0.37
556	0.34
557	0.27
558	0.22
559	0.2
560	0.2
561	0.2
562	0.15
563	0.11
564	0.09
565	0.07
566	0.1
567	0.11
568	0.11
569	0.11
570	0.1
571	0.1
572	0.09
573	0.09
574	0.07
575	0.07
576	0.07
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.09
581	0.1
582	0.09
583	0.1
584	0.1
585	0.1
586	0.11
587	0.1
588	0.13
589	0.12
590	0.13
591	0.15
592	0.15
593	0.16
594	0.18
595	0.21
596	0.21
597	0.23
598	0.25
599	0.25
600	0.32
601	0.4
602	0.47
603	0.53
604	0.56
605	0.57
606	0.6

C4QZM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer