FuNGI

A0A4Q7JQZ9

Protein Details

Accession

A0A4Q7JQZ9

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
159-186	IAPVMKENTPKRPKKQKEEKTMFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-180	PKRPKKQKEEKTM
183-183	R
468-487	SKQRPGELTKKTKSLKRAGS
499-505	SRKKMKK
644-650	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, mito_nucl 12.5, mito 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MELIAAKSRTLSVRCGNGRDRPILLLPRPGRRPTGLNGSKTTSDGQREQYGGWSEPPPQYQYNDIPIMTTKKSLLEGLRYHLMKFSQARVSDTPIDPTNQDEFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKEEEPEPIQVDEKEAERLAQLKAEREAQRAIDQAKIAPVMKENTPKRPKKQKEEKTMFNRAPKSEAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSEANVAFMIDKSVFRMVPLEKWYRFNAKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWVMKDEEKRAGQSDLEATRRLLYGRGQMIKTESATFKAASRSEKLEHDELDVSGDEFQDDDETPYFERVEDDDLKESKERIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELQEQLREELERQKYGKSTKKALIKRDREDIYESDDSEEKPWSSSSDDESSAEEEEETNKDEEKKDADAKESQIETKDKAKGAGSKGSITPQSKQRPGELTKKTKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKSSASSNGSRAGTPAAQSNMARRNKAGHASTSDGEATAGEMSDSVVPVRKGVKMVGNSGKGTPVASRAGSPNPATAGASPSTQTAGIEPWEILDKIPQDGIAITDLIKQFHGRVGDRPGQMSRGEWIKLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.51
3	0.54
4	0.57
5	0.6
6	0.58
7	0.53
8	0.47
9	0.49
10	0.5
11	0.47
12	0.49
13	0.49
14	0.54
15	0.59
16	0.59
17	0.58
18	0.53
19	0.55
20	0.51
21	0.57
22	0.55
23	0.53
24	0.53
25	0.53
26	0.51
27	0.48
28	0.45
29	0.4
30	0.39
31	0.39
32	0.4
33	0.4
34	0.4
35	0.38
36	0.4
37	0.38
38	0.34
39	0.32
40	0.29
41	0.29
42	0.32
43	0.35
44	0.34
45	0.32
46	0.33
47	0.36
48	0.38
49	0.4
50	0.38
51	0.35
52	0.32
53	0.33
54	0.35
55	0.31
56	0.28
57	0.23
58	0.22
59	0.24
60	0.26
61	0.26
62	0.29
63	0.3
64	0.33
65	0.39
66	0.38
67	0.37
68	0.36
69	0.33
70	0.32
71	0.33
72	0.33
73	0.32
74	0.33
75	0.38
76	0.37
77	0.42
78	0.41
79	0.39
80	0.38
81	0.33
82	0.33
83	0.29
84	0.3
85	0.27
86	0.24
87	0.23
88	0.21
89	0.21
90	0.22
91	0.23
92	0.19
93	0.23
94	0.3
95	0.35
96	0.41
97	0.44
98	0.49
99	0.54
100	0.64
101	0.66
102	0.66
103	0.65
104	0.64
105	0.69
106	0.68
107	0.64
108	0.58
109	0.57
110	0.53
111	0.53
112	0.48
113	0.42
114	0.38
115	0.36
116	0.34
117	0.27
118	0.23
119	0.18
120	0.19
121	0.17
122	0.16
123	0.17
124	0.16
125	0.15
126	0.14
127	0.16
128	0.14
129	0.17
130	0.17
131	0.18
132	0.2
133	0.28
134	0.3
135	0.3
136	0.32
137	0.3
138	0.31
139	0.32
140	0.31
141	0.26
142	0.24
143	0.22
144	0.21
145	0.21
146	0.19
147	0.16
148	0.18
149	0.18
150	0.21
151	0.3
152	0.32
153	0.4
154	0.5
155	0.57
156	0.64
157	0.73
158	0.78
159	0.8
160	0.88
161	0.87
162	0.88
163	0.89
164	0.89
165	0.87
166	0.87
167	0.81
168	0.77
169	0.72
170	0.62
171	0.57
172	0.5
173	0.48
174	0.46
175	0.48
176	0.45
177	0.43
178	0.43
179	0.48
180	0.48
181	0.45
182	0.4
183	0.36
184	0.33
185	0.32
186	0.32
187	0.25
188	0.24
189	0.21
190	0.18
191	0.16
192	0.13
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.14
197	0.14
198	0.13
199	0.13
200	0.13
201	0.13
202	0.12
203	0.09
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.06
220	0.06
221	0.07
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.13
226	0.13
227	0.16
228	0.22
229	0.26
230	0.26
231	0.3
232	0.33
233	0.37
234	0.37
235	0.41
236	0.45
237	0.45
238	0.5
239	0.52
240	0.53
241	0.46
242	0.48
243	0.42
244	0.39
245	0.35
246	0.29
247	0.23
248	0.21
249	0.21
250	0.19
251	0.18
252	0.13
253	0.11
254	0.11
255	0.12
256	0.1
257	0.11
258	0.14
259	0.17
260	0.21
261	0.21
262	0.22
263	0.23
264	0.26
265	0.29
266	0.28
267	0.29
268	0.25
269	0.25
270	0.25
271	0.25
272	0.21
273	0.19
274	0.2
275	0.17
276	0.18
277	0.18
278	0.16
279	0.16
280	0.17
281	0.16
282	0.13
283	0.11
284	0.15
285	0.19
286	0.22
287	0.21
288	0.22
289	0.23
290	0.23
291	0.22
292	0.19
293	0.15
294	0.13
295	0.14
296	0.14
297	0.13
298	0.16
299	0.17
300	0.17
301	0.19
302	0.2
303	0.21
304	0.23
305	0.25
306	0.23
307	0.22
308	0.21
309	0.19
310	0.16
311	0.15
312	0.13
313	0.09
314	0.08
315	0.07
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.08
329	0.07
330	0.12
331	0.13
332	0.14
333	0.17
334	0.17
335	0.18
336	0.18
337	0.19
338	0.19
339	0.23
340	0.25
341	0.29
342	0.37
343	0.4
344	0.43
345	0.46
346	0.46
347	0.44
348	0.41
349	0.35
350	0.26
351	0.22
352	0.18
353	0.14
354	0.08
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.06
361	0.05
362	0.07
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.1
368	0.13
369	0.13
370	0.14
371	0.2
372	0.21
373	0.24
374	0.25
375	0.25
376	0.27
377	0.34
378	0.41
379	0.38
380	0.42
381	0.45
382	0.53
383	0.57
384	0.63
385	0.66
386	0.66
387	0.65
388	0.67
389	0.62
390	0.56
391	0.54
392	0.44
393	0.41
394	0.34
395	0.3
396	0.24
397	0.23
398	0.21
399	0.19
400	0.19
401	0.13
402	0.12
403	0.12
404	0.12
405	0.12
406	0.13
407	0.16
408	0.18
409	0.18
410	0.18
411	0.19
412	0.18
413	0.17
414	0.16
415	0.11
416	0.09
417	0.1
418	0.1
419	0.11
420	0.1
421	0.12
422	0.14
423	0.15
424	0.16
425	0.17
426	0.21
427	0.25
428	0.25
429	0.27
430	0.28
431	0.29
432	0.32
433	0.31
434	0.28
435	0.26
436	0.27
437	0.26
438	0.29
439	0.31
440	0.27
441	0.27
442	0.29
443	0.31
444	0.33
445	0.36
446	0.32
447	0.3
448	0.3
449	0.32
450	0.35
451	0.31
452	0.33
453	0.35
454	0.42
455	0.46
456	0.46
457	0.48
458	0.49
459	0.53
460	0.58
461	0.58
462	0.59
463	0.58
464	0.65
465	0.66
466	0.63
467	0.65
468	0.65
469	0.64
470	0.61
471	0.65
472	0.61
473	0.6
474	0.56
475	0.51
476	0.44
477	0.36
478	0.29
479	0.22
480	0.23
481	0.22
482	0.21
483	0.22
484	0.22
485	0.27
486	0.36
487	0.4
488	0.39
489	0.45
490	0.54
491	0.61
492	0.66
493	0.71
494	0.73
495	0.75
496	0.74
497	0.71
498	0.67
499	0.57
500	0.49
501	0.39
502	0.32
503	0.26
504	0.23
505	0.22
506	0.18
507	0.2
508	0.2
509	0.26
510	0.32
511	0.35
512	0.36
513	0.33
514	0.36
515	0.38
516	0.45
517	0.41
518	0.36
519	0.36
520	0.4
521	0.39
522	0.36
523	0.31
524	0.24
525	0.21
526	0.16
527	0.13
528	0.08
529	0.08
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.06
534	0.07
535	0.07
536	0.1
537	0.1
538	0.13
539	0.15
540	0.17
541	0.17
542	0.2
543	0.26
544	0.25
545	0.33
546	0.39
547	0.4
548	0.4
549	0.39
550	0.38
551	0.31
552	0.29
553	0.23
554	0.18
555	0.18
556	0.17
557	0.19
558	0.2
559	0.24
560	0.28
561	0.28
562	0.26
563	0.25
564	0.25
565	0.24
566	0.21
567	0.21
568	0.17
569	0.17
570	0.16
571	0.15
572	0.15
573	0.14
574	0.14
575	0.11
576	0.12
577	0.12
578	0.13
579	0.12
580	0.12
581	0.15
582	0.15
583	0.14
584	0.17
585	0.17
586	0.17
587	0.18
588	0.17
589	0.14
590	0.14
591	0.15
592	0.12
593	0.11
594	0.1
595	0.15
596	0.16
597	0.16
598	0.17
599	0.17
600	0.17
601	0.2
602	0.25
603	0.22
604	0.26
605	0.34
606	0.41
607	0.42
608	0.45
609	0.43
610	0.4
611	0.39
612	0.35
613	0.32
614	0.29
615	0.28
616	0.27
617	0.28
618	0.3
619	0.36
620	0.37
621	0.35
622	0.33
623	0.36
624	0.35
625	0.39
626	0.37
627	0.38
628	0.44
629	0.5
630	0.55

A0A4Q7JQZ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer