Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D5GJX5

Protein Details
Accession D5GJX5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
376-401EEQMGRGSRVKRKRQRSFSPPARGTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
383-391SRVKRKRQR
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 9.5, extr 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0016586  C:RSC-type complex  
GO:0033696  P:heterochromatin boundary formation  
KEGG tml:GSTUM_00009257001  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MKPPQALTTTYATRIATFSTALITPAGLNPTSGAPGATPVGERTSGRTKRGTTVINYAEVDGDDDLEVDGESNAGQRGSNALIVGAGPPQNGLGTNSMGNVVEAIKRPVQIPGRPAQPRSSQGLYRTEHQLLAASNLPSVLVPIRLDFDLDPPSRGRIHDSFLWNLNETLITPDNFAITTCVDLDLPLQPYASMISAAIRDQISEYAPVATIPISEESGEMRVVCNLNVNLGERVYTDKFEWDLTGGLSPEYFAKSVAADLGLTGEFIPAIAHAIYEFCLQKKKDLCETGITPELENDAHRPETEAGWRVDLESLGAEWESRVETLTREEIDKREGDREREIRRLRRDTARLGGTPGGVIMPSHWGPGASNDVGGEEQMGRGSRVKRKRQRSFSPPARGTPTRTPSHQQGNGINGSGGILNGGLTEWEKQNWRCSWCFITGTGTWGVREGPDGPKTLCHNCGQAWMETGVLPEWAKGLHMRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.2
4 0.17
5 0.15
6 0.15
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.11
12 0.12
13 0.15
14 0.12
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.15
19 0.14
20 0.12
21 0.09
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.14
28 0.16
29 0.16
30 0.2
31 0.3
32 0.34
33 0.38
34 0.43
35 0.43
36 0.47
37 0.53
38 0.52
39 0.46
40 0.5
41 0.48
42 0.46
43 0.44
44 0.38
45 0.32
46 0.27
47 0.24
48 0.15
49 0.13
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.17
95 0.23
96 0.28
97 0.29
98 0.32
99 0.35
100 0.42
101 0.45
102 0.47
103 0.46
104 0.46
105 0.47
106 0.48
107 0.46
108 0.4
109 0.41
110 0.46
111 0.43
112 0.4
113 0.42
114 0.37
115 0.33
116 0.3
117 0.27
118 0.2
119 0.2
120 0.2
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.1
126 0.11
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.12
136 0.18
137 0.18
138 0.19
139 0.18
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.25
144 0.2
145 0.23
146 0.27
147 0.3
148 0.3
149 0.33
150 0.34
151 0.29
152 0.27
153 0.23
154 0.17
155 0.14
156 0.15
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.09
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.07
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.1
220 0.07
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.03
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.05
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.14
267 0.15
268 0.2
269 0.26
270 0.29
271 0.33
272 0.36
273 0.37
274 0.35
275 0.37
276 0.35
277 0.34
278 0.31
279 0.24
280 0.21
281 0.2
282 0.16
283 0.15
284 0.13
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.17
292 0.2
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.16
297 0.16
298 0.14
299 0.11
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.1
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.17
317 0.18
318 0.2
319 0.22
320 0.21
321 0.27
322 0.3
323 0.31
324 0.37
325 0.43
326 0.45
327 0.52
328 0.58
329 0.58
330 0.64
331 0.67
332 0.65
333 0.66
334 0.67
335 0.63
336 0.62
337 0.59
338 0.5
339 0.46
340 0.41
341 0.32
342 0.26
343 0.21
344 0.14
345 0.09
346 0.08
347 0.06
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.13
355 0.18
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.11
363 0.06
364 0.06
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.14
369 0.21
370 0.29
371 0.39
372 0.5
373 0.58
374 0.69
375 0.78
376 0.83
377 0.88
378 0.88
379 0.89
380 0.89
381 0.9
382 0.82
383 0.77
384 0.75
385 0.68
386 0.65
387 0.64
388 0.61
389 0.55
390 0.55
391 0.56
392 0.55
393 0.62
394 0.59
395 0.55
396 0.51
397 0.52
398 0.49
399 0.44
400 0.36
401 0.26
402 0.22
403 0.17
404 0.13
405 0.07
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.08
413 0.1
414 0.14
415 0.21
416 0.24
417 0.32
418 0.37
419 0.42
420 0.42
421 0.46
422 0.47
423 0.45
424 0.44
425 0.37
426 0.37
427 0.32
428 0.33
429 0.31
430 0.27
431 0.23
432 0.21
433 0.21
434 0.16
435 0.17
436 0.17
437 0.19
438 0.22
439 0.25
440 0.25
441 0.3
442 0.35
443 0.39
444 0.4
445 0.37
446 0.38
447 0.35
448 0.43
449 0.4
450 0.35
451 0.33
452 0.29
453 0.27
454 0.23
455 0.23
456 0.15
457 0.15
458 0.14
459 0.11
460 0.11
461 0.1
462 0.11