Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q7K3M8

Protein Details
Accession A0A4Q7K3M8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-52APAGEKRVVKKLVRKKKKPARVQIDPSEFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-43KRVVKKLVRKKKKPAR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR034181  Cwc2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12360  RRM_cwf2  
Amino Acid Sequences MADQEDNRATAPEGATDESMAVAPAGEKRVVKKLVRKKKKPARVQIDPSEFTSEPPPQTGTTYNIWFNKWAGGDREAYQQTKSKGRCNIATDAGYTTADKVTGSYFCLRFARGLCPLGQDCTNLHRLPGTFDLFNPNVDCFGREKFSDYRDDMGGVGSFMRQNRTVYVGRIHVTDDIEEIVARHFAEWGQIEREAAPVRVLNSRGVAFITYTNEANAQFAREAMAHQSLDHDEVLNVRWATADPNPMAQAREARRVEEQAAEAIRRALPAEFVAEIEGKDPDARKRRRIEGSYGLEGYEAPDDVHYARGKHAVNPVGRQGHEVEYQEPLMLENGQSADGSAGATAAAAPEQSGIFSGSTLAALSKAKVAVASKPKAAASTGPLVSYDSDSDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.13
6 0.13
7 0.1
8 0.08
9 0.06
10 0.07
11 0.09
12 0.12
13 0.14
14 0.16
15 0.2
16 0.29
17 0.36
18 0.41
19 0.49
20 0.57
21 0.65
22 0.75
23 0.81
24 0.84
25 0.88
26 0.92
27 0.92
28 0.93
29 0.91
30 0.91
31 0.9
32 0.89
33 0.86
34 0.78
35 0.69
36 0.65
37 0.54
38 0.45
39 0.42
40 0.36
41 0.29
42 0.29
43 0.29
44 0.23
45 0.26
46 0.27
47 0.26
48 0.26
49 0.28
50 0.32
51 0.32
52 0.33
53 0.32
54 0.3
55 0.29
56 0.26
57 0.26
58 0.23
59 0.24
60 0.25
61 0.25
62 0.33
63 0.32
64 0.32
65 0.31
66 0.33
67 0.34
68 0.4
69 0.42
70 0.41
71 0.46
72 0.5
73 0.53
74 0.52
75 0.53
76 0.5
77 0.47
78 0.41
79 0.34
80 0.3
81 0.25
82 0.2
83 0.16
84 0.12
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.12
91 0.17
92 0.17
93 0.19
94 0.21
95 0.21
96 0.22
97 0.23
98 0.25
99 0.23
100 0.24
101 0.22
102 0.25
103 0.25
104 0.25
105 0.24
106 0.2
107 0.17
108 0.2
109 0.24
110 0.2
111 0.19
112 0.19
113 0.19
114 0.21
115 0.24
116 0.23
117 0.18
118 0.19
119 0.25
120 0.23
121 0.24
122 0.21
123 0.17
124 0.16
125 0.15
126 0.16
127 0.12
128 0.13
129 0.15
130 0.14
131 0.18
132 0.19
133 0.22
134 0.26
135 0.25
136 0.26
137 0.24
138 0.24
139 0.2
140 0.18
141 0.15
142 0.1
143 0.08
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.13
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.19
158 0.19
159 0.16
160 0.15
161 0.14
162 0.11
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.1
186 0.12
187 0.13
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.13
229 0.16
230 0.13
231 0.14
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.15
236 0.2
237 0.2
238 0.29
239 0.28
240 0.29
241 0.3
242 0.31
243 0.32
244 0.27
245 0.24
246 0.18
247 0.19
248 0.17
249 0.15
250 0.15
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.09
267 0.11
268 0.19
269 0.28
270 0.34
271 0.42
272 0.49
273 0.57
274 0.64
275 0.66
276 0.65
277 0.65
278 0.65
279 0.61
280 0.55
281 0.46
282 0.37
283 0.33
284 0.26
285 0.17
286 0.11
287 0.07
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.15
295 0.21
296 0.22
297 0.25
298 0.32
299 0.34
300 0.35
301 0.38
302 0.43
303 0.42
304 0.41
305 0.39
306 0.35
307 0.32
308 0.33
309 0.32
310 0.26
311 0.23
312 0.23
313 0.22
314 0.19
315 0.15
316 0.12
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.15
355 0.16
356 0.23
357 0.32
358 0.35
359 0.35
360 0.37
361 0.38
362 0.37
363 0.37
364 0.31
365 0.27
366 0.31
367 0.29
368 0.26
369 0.26
370 0.26
371 0.26
372 0.25
373 0.21