FuNGI

A0A4Q1BWJ9

Protein Details

Accession

A0A4Q1BWJ9

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MDEILRRKKVKPRRDPSSQPSSLP	Hydrophilic
600-627	SPTPPFPSDNRLNKKKKRLSATPTPGPE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-14	RRKKVKPRR
408-418	KRVRKMMRKRG
612-617	NKKKKR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MDEILRRKKVKPRRDPSSQPSSLPKRDEATSHASTSAEASSPPRPSDPSKIVEIKLYSTAPNDTTRFNLMKFNYAREFDPLTLPDPLLTRKQPGERIKPTIALDDNGNVIGKYVYDNNGKLLFGADGRPIIEHIETMDMNLVGQAKGLQEGPGPRRKFRNTAREVFHQDVETVKLKREEAQPWVLEAKTPREKPPIPEHWVGRMVEGSTLPMVLFVNEGKNDGFSVVPLGRTYRFNPERPFKVLDSDEANKLFEFQAKNKFVDRWSQRPDGASSVAQVKPEPGMDNRAARIEQRVLQKHGEPSTSRVKVERYEDDYLREGRAVQLGVEGGIDEELDFDANEHFQDDDDVNDFHRNDEEEEEAKLQEEKLKKEFRMANANVGDKPQIDSGSDSDDLFGDKEQKLTQEGKRVRKMMRKRGEKGDEDLWGSSTSSESDSESDSVKTEKKETDDKATDKEKGQENSAAEKEVRSRANSRGPNDGRPTASPSRRSHTPAVTSQPGSGAALVAQRATGQDTPHRSRGTSPISRSRTPTDARSASPTPRGVSPSLSGAVSPSKTRPTQKSRDSSSKSQSPNLESTSTPGSSSALQPGTGPSNKRKTSPTPPFPSDNRLNKKKKRLSATPTPGPEVEPFEGMITPQEVVAWFKEVGKSHTGVAMNDLVLGFKKRILASGDKKDEQQKMFLSSVRSVTEQGDGKMMRLRPEYL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.89
3	0.87
4	0.88
5	0.8
6	0.74
7	0.73
8	0.74
9	0.7
10	0.65
11	0.61
12	0.54
13	0.53
14	0.51
15	0.46
16	0.45
17	0.41
18	0.38
19	0.35
20	0.31
21	0.29
22	0.28
23	0.24
24	0.16
25	0.14
26	0.16
27	0.21
28	0.24
29	0.26
30	0.27
31	0.3
32	0.35
33	0.43
34	0.46
35	0.44
36	0.48
37	0.51
38	0.5
39	0.5
40	0.46
41	0.4
42	0.38
43	0.35
44	0.29
45	0.25
46	0.27
47	0.24
48	0.29
49	0.28
50	0.25
51	0.27
52	0.32
53	0.31
54	0.3
55	0.35
56	0.3
57	0.38
58	0.38
59	0.41
60	0.4
61	0.4
62	0.4
63	0.38
64	0.4
65	0.32
66	0.34
67	0.29
68	0.27
69	0.26
70	0.25
71	0.22
72	0.21
73	0.23
74	0.25
75	0.26
76	0.28
77	0.32
78	0.39
79	0.46
80	0.53
81	0.6
82	0.61
83	0.66
84	0.64
85	0.63
86	0.58
87	0.55
88	0.48
89	0.39
90	0.33
91	0.27
92	0.25
93	0.21
94	0.19
95	0.13
96	0.11
97	0.1
98	0.08
99	0.09
100	0.11
101	0.15
102	0.19
103	0.2
104	0.23
105	0.24
106	0.24
107	0.22
108	0.2
109	0.16
110	0.13
111	0.14
112	0.12
113	0.11
114	0.12
115	0.12
116	0.12
117	0.12
118	0.11
119	0.1
120	0.09
121	0.12
122	0.11
123	0.11
124	0.12
125	0.1
126	0.1
127	0.11
128	0.11
129	0.08
130	0.08
131	0.09
132	0.08
133	0.09
134	0.1
135	0.09
136	0.11
137	0.18
138	0.24
139	0.32
140	0.35
141	0.38
142	0.47
143	0.51
144	0.58
145	0.61
146	0.65
147	0.65
148	0.7
149	0.71
150	0.71
151	0.72
152	0.66
153	0.58
154	0.48
155	0.4
156	0.33
157	0.31
158	0.29
159	0.23
160	0.23
161	0.23
162	0.23
163	0.29
164	0.34
165	0.34
166	0.34
167	0.39
168	0.36
169	0.36
170	0.37
171	0.32
172	0.28
173	0.26
174	0.29
175	0.32
176	0.34
177	0.37
178	0.43
179	0.46
180	0.49
181	0.57
182	0.57
183	0.55
184	0.58
185	0.55
186	0.52
187	0.54
188	0.48
189	0.39
190	0.31
191	0.25
192	0.2
193	0.18
194	0.13
195	0.09
196	0.09
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.05
201	0.06
202	0.06
203	0.09
204	0.09
205	0.1
206	0.09
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.06
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.1
216	0.11
217	0.13
218	0.15
219	0.18
220	0.25
221	0.3
222	0.34
223	0.42
224	0.48
225	0.5
226	0.52
227	0.54
228	0.44
229	0.45
230	0.4
231	0.35
232	0.33
233	0.31
234	0.29
235	0.26
236	0.25
237	0.2
238	0.2
239	0.18
240	0.17
241	0.17
242	0.18
243	0.27
244	0.29
245	0.31
246	0.32
247	0.33
248	0.31
249	0.37
250	0.39
251	0.38
252	0.42
253	0.44
254	0.43
255	0.43
256	0.43
257	0.36
258	0.32
259	0.24
260	0.19
261	0.2
262	0.2
263	0.18
264	0.17
265	0.15
266	0.13
267	0.14
268	0.15
269	0.11
270	0.14
271	0.16
272	0.18
273	0.19
274	0.2
275	0.19
276	0.18
277	0.2
278	0.18
279	0.2
280	0.26
281	0.29
282	0.31
283	0.32
284	0.34
285	0.35
286	0.35
287	0.33
288	0.26
289	0.26
290	0.32
291	0.32
292	0.3
293	0.28
294	0.28
295	0.29
296	0.33
297	0.33
298	0.3
299	0.32
300	0.32
301	0.33
302	0.33
303	0.3
304	0.26
305	0.21
306	0.15
307	0.12
308	0.13
309	0.1
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.02
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.11
338	0.11
339	0.1
340	0.1
341	0.11
342	0.1
343	0.11
344	0.13
345	0.11
346	0.12
347	0.12
348	0.11
349	0.11
350	0.1
351	0.09
352	0.12
353	0.14
354	0.16
355	0.22
356	0.27
357	0.27
358	0.33
359	0.37
360	0.36
361	0.42
362	0.4
363	0.4
364	0.38
365	0.4
366	0.33
367	0.3
368	0.27
369	0.17
370	0.18
371	0.12
372	0.1
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.13
377	0.13
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.12
389	0.15
390	0.2
391	0.22
392	0.28
393	0.35
394	0.42
395	0.48
396	0.52
397	0.55
398	0.58
399	0.65
400	0.66
401	0.69
402	0.7
403	0.7
404	0.75
405	0.75
406	0.69
407	0.63
408	0.56
409	0.48
410	0.4
411	0.34
412	0.25
413	0.19
414	0.17
415	0.12
416	0.1
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.12
428	0.14
429	0.15
430	0.17
431	0.18
432	0.21
433	0.28
434	0.3
435	0.37
436	0.4
437	0.41
438	0.44
439	0.45
440	0.44
441	0.39
442	0.42
443	0.4
444	0.35
445	0.36
446	0.34
447	0.32
448	0.35
449	0.33
450	0.29
451	0.23
452	0.22
453	0.23
454	0.24
455	0.24
456	0.22
457	0.25
458	0.29
459	0.38
460	0.43
461	0.42
462	0.47
463	0.48
464	0.51
465	0.53
466	0.5
467	0.43
468	0.39
469	0.44
470	0.42
471	0.45
472	0.46
473	0.45
474	0.47
475	0.5
476	0.54
477	0.52
478	0.49
479	0.48
480	0.45
481	0.48
482	0.46
483	0.43
484	0.37
485	0.33
486	0.28
487	0.23
488	0.18
489	0.12
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.1
498	0.11
499	0.12
500	0.17
501	0.26
502	0.31
503	0.37
504	0.38
505	0.35
506	0.37
507	0.43
508	0.46
509	0.45
510	0.46
511	0.5
512	0.55
513	0.57
514	0.58
515	0.55
516	0.53
517	0.49
518	0.48
519	0.46
520	0.43
521	0.42
522	0.44
523	0.43
524	0.4
525	0.43
526	0.4
527	0.33
528	0.33
529	0.35
530	0.29
531	0.28
532	0.26
533	0.23
534	0.22
535	0.2
536	0.17
537	0.15
538	0.18
539	0.17
540	0.17
541	0.17
542	0.22
543	0.27
544	0.35
545	0.43
546	0.48
547	0.57
548	0.64
549	0.7
550	0.73
551	0.79
552	0.79
553	0.77
554	0.76
555	0.75
556	0.69
557	0.66
558	0.63
559	0.57
560	0.54
561	0.49
562	0.43
563	0.35
564	0.34
565	0.33
566	0.28
567	0.23
568	0.19
569	0.17
570	0.16
571	0.18
572	0.21
573	0.17
574	0.16
575	0.17
576	0.19
577	0.24
578	0.26
579	0.29
580	0.32
581	0.42
582	0.44
583	0.47
584	0.51
585	0.53
586	0.6
587	0.67
588	0.68
589	0.67
590	0.7
591	0.73
592	0.7
593	0.7
594	0.69
595	0.69
596	0.69
597	0.7
598	0.76
599	0.79
600	0.86
601	0.87
602	0.86
603	0.85
604	0.85
605	0.83
606	0.84
607	0.84
608	0.82
609	0.76
610	0.71
611	0.62
612	0.55
613	0.48
614	0.43
615	0.35
616	0.27
617	0.23
618	0.2
619	0.2
620	0.17
621	0.16
622	0.12
623	0.1
624	0.09
625	0.09
626	0.09
627	0.11
628	0.12
629	0.14
630	0.13
631	0.15
632	0.2
633	0.21
634	0.24
635	0.26
636	0.27
637	0.24
638	0.29
639	0.29
640	0.24
641	0.26
642	0.24
643	0.2
644	0.2
645	0.18
646	0.14
647	0.14
648	0.17
649	0.14
650	0.13
651	0.18
652	0.17
653	0.22
654	0.26
655	0.35
656	0.41
657	0.51
658	0.58
659	0.56
660	0.6
661	0.65
662	0.67
663	0.6
664	0.57
665	0.5
666	0.47
667	0.47
668	0.45
669	0.42
670	0.38
671	0.39
672	0.35
673	0.33
674	0.29
675	0.28
676	0.31
677	0.29
678	0.26
679	0.3
680	0.28
681	0.28
682	0.33
683	0.34
684	0.34

A0A4Q1BWJ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer