Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q1BD07

Protein Details
Accession A0A4Q1BD07    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
311-337ASSTPQPKPKKITFKKGPNQRFERIKTHydrophilic
374-399IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYAGGEITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
380-390GFRKEKNKKKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MHKLEPTQQSALDAAILSYLVNRGFTRATKAFTQATGLTQDDTAKDLCHAWAIFTSSAAYQSLSSSSSSSSSSSSSSDSSSEDEDDKENVPVTTVLPSAVESATSSATLGRDELEGVPTLDQHDSDTESNSDSSSSSDTSDSDSETGSDTETEKPAPKAQGFLDLEAEESDESEDEDTESEEEESEEEESSGSDSCSSSEGGDEVEVDGEKDSSSSSDEEKEEEEEERPVIGQKRKAPSPSPSTSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSAPPPTKKPKLSPVISTTVTITETPDLGEPTASSTPQPKPKKITFKKGPNQRFERIKTESVTFHHDGLKDNSFEARIRAGASENDYGARASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYAGGEITLETHSIKFQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.09
3 0.08
4 0.07
5 0.07
6 0.09
7 0.08
8 0.1
9 0.11
10 0.13
11 0.16
12 0.18
13 0.26
14 0.27
15 0.3
16 0.31
17 0.36
18 0.36
19 0.33
20 0.36
21 0.28
22 0.28
23 0.28
24 0.25
25 0.22
26 0.2
27 0.21
28 0.17
29 0.18
30 0.17
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.16
36 0.15
37 0.14
38 0.16
39 0.19
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.13
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.09
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.16
62 0.15
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.12
112 0.12
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.15
142 0.19
143 0.22
144 0.21
145 0.21
146 0.21
147 0.28
148 0.27
149 0.26
150 0.24
151 0.2
152 0.2
153 0.17
154 0.17
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.11
217 0.16
218 0.19
219 0.24
220 0.29
221 0.34
222 0.38
223 0.41
224 0.42
225 0.42
226 0.46
227 0.45
228 0.43
229 0.41
230 0.42
231 0.4
232 0.39
233 0.36
234 0.32
235 0.29
236 0.27
237 0.25
238 0.22
239 0.22
240 0.21
241 0.19
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.23
268 0.27
269 0.29
270 0.37
271 0.45
272 0.52
273 0.55
274 0.58
275 0.61
276 0.66
277 0.65
278 0.63
279 0.58
280 0.55
281 0.51
282 0.46
283 0.37
284 0.29
285 0.26
286 0.2
287 0.16
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.08
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.18
301 0.24
302 0.34
303 0.42
304 0.43
305 0.5
306 0.59
307 0.69
308 0.72
309 0.77
310 0.78
311 0.81
312 0.85
313 0.88
314 0.88
315 0.87
316 0.85
317 0.82
318 0.81
319 0.76
320 0.74
321 0.69
322 0.64
323 0.57
324 0.53
325 0.48
326 0.42
327 0.44
328 0.38
329 0.34
330 0.34
331 0.33
332 0.33
333 0.35
334 0.37
335 0.29
336 0.28
337 0.28
338 0.26
339 0.26
340 0.23
341 0.2
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.17
346 0.18
347 0.22
348 0.22
349 0.21
350 0.21
351 0.2
352 0.19
353 0.19
354 0.17
355 0.13
356 0.12
357 0.15
358 0.17
359 0.18
360 0.19
361 0.2
362 0.19
363 0.21
364 0.25
365 0.23
366 0.26
367 0.29
368 0.36
369 0.45
370 0.55
371 0.63
372 0.69
373 0.78
374 0.82
375 0.88
376 0.9
377 0.89
378 0.87
379 0.84
380 0.82
381 0.79
382 0.7
383 0.6
384 0.5
385 0.41
386 0.32
387 0.26
388 0.17
389 0.11