Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q1B9Z1

Protein Details
Accession A0A4Q1B9Z1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
906-932EMARVKLEKLKMKRGWKRPEWQMMRMDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
905-923KEMARVKLEKLKMKRGWKR
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 8, mito 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014801  Mediator_Med5_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08689  Med5  
Amino Acid Sequences MAQEDASLRSLVGKAYARGVSPAKLVKLLPQWLKKHNQNPSDSSSLIAHTLLQRLTGDNPPSLIFSYLTFSLQSGLITARNIIFELLFILNSEGPLSIYILTSISSLVLANPTGLGPSEPLPSHLTHPPAPTPEIGTSASASSPPPTSSTTLGLLLSLIRLCADPSAPPPAPLIGLVSHLLSLLHPYPVPPLDVGLAAGQLMATAPDVIAIPLKNCLAGLMAEMTFAQDMGPLLPHVSGFERVPSGVAGTEEQMAVDPKSTLAKDSSINIPLMEVIRYLLAYVEHSDRFSENHSYLESTAKPSPNFIHTIHVARHFLPDSRQFLMHLLQCAIRSMAVEASPLSKVRKHVILTERLPLLLRWWKDQSDLKWNCPNDLPTILDETFNSDASSLQDLNSWIQVTYQELLANAAAEDEGGGFIQPAGWSLAAIQDVVTRRLVELGLLDEGQASSKPPESDSSSYESLLMRYSTCPSSHLPVLRHLICFGKGTSRSLALELVNCIQACPGAPPPDNLFSRLSEDSTVLAALTAFIQPPDLLHLLDQHLLNAPDDPAARAEDPQGCLAKFGEGFSLTENVVALFNLPHPALLQDARTALDWADLSSEERGLVSGWVKALFGSDGIDDQVLVATSPVNFCRLACCLIQQAIRAVILGQIELETLHNGLSYFSQNLLSWCLGGIVAWLCEEIARQGKLSAIHFVVLGSLVLSDSFPESLLRANAPAILAVIEGNPYLAEVIQSSGFDASAVRDKVIKSLLPGTPMMSSQAERRPQDDLQIIRHLELADSTWPLRVLSSMNQTITTEGPNISAKMIMDELLFPPPSISQSSDPLITFSTLLLTLPLSHDDYRPLIASLIGDVLPQILSTPLSETQVGVFTKVLKRCLVVVFDIDDRTGRWTEELVNELMERRSKEMARVKLEKLKMKRGWKRPEWQMMRMDVEMVCRQLVDEEVVGVLPILRKLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.24
3 0.26
4 0.24
5 0.29
6 0.31
7 0.27
8 0.3
9 0.33
10 0.29
11 0.31
12 0.3
13 0.32
14 0.37
15 0.44
16 0.47
17 0.51
18 0.56
19 0.61
20 0.71
21 0.73
22 0.75
23 0.76
24 0.75
25 0.73
26 0.73
27 0.71
28 0.67
29 0.58
30 0.51
31 0.42
32 0.35
33 0.3
34 0.24
35 0.2
36 0.17
37 0.21
38 0.19
39 0.19
40 0.18
41 0.19
42 0.23
43 0.27
44 0.27
45 0.24
46 0.25
47 0.24
48 0.25
49 0.25
50 0.22
51 0.16
52 0.14
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.15
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.09
72 0.12
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.1
105 0.14
106 0.13
107 0.16
108 0.19
109 0.2
110 0.24
111 0.27
112 0.3
113 0.29
114 0.33
115 0.34
116 0.35
117 0.36
118 0.33
119 0.32
120 0.28
121 0.27
122 0.25
123 0.22
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.16
134 0.19
135 0.2
136 0.22
137 0.22
138 0.21
139 0.2
140 0.18
141 0.15
142 0.13
143 0.12
144 0.09
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.12
153 0.2
154 0.19
155 0.2
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.18
160 0.18
161 0.1
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.14
175 0.15
176 0.16
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.11
226 0.1
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.18
253 0.21
254 0.2
255 0.2
256 0.18
257 0.17
258 0.16
259 0.15
260 0.12
261 0.09
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.08
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.16
277 0.19
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.18
282 0.18
283 0.2
284 0.18
285 0.18
286 0.22
287 0.24
288 0.24
289 0.25
290 0.26
291 0.26
292 0.29
293 0.25
294 0.25
295 0.24
296 0.27
297 0.27
298 0.29
299 0.28
300 0.24
301 0.27
302 0.23
303 0.22
304 0.23
305 0.27
306 0.26
307 0.27
308 0.27
309 0.24
310 0.24
311 0.27
312 0.25
313 0.2
314 0.17
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.15
319 0.11
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.13
331 0.15
332 0.18
333 0.23
334 0.22
335 0.29
336 0.34
337 0.4
338 0.39
339 0.41
340 0.38
341 0.33
342 0.33
343 0.25
344 0.24
345 0.21
346 0.21
347 0.2
348 0.23
349 0.23
350 0.27
351 0.32
352 0.31
353 0.36
354 0.38
355 0.4
356 0.44
357 0.43
358 0.41
359 0.38
360 0.36
361 0.28
362 0.26
363 0.22
364 0.16
365 0.2
366 0.19
367 0.17
368 0.16
369 0.17
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.13
377 0.09
378 0.08
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.1
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.02
405 0.02
406 0.03
407 0.03
408 0.04
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.07
418 0.09
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.11
441 0.15
442 0.17
443 0.19
444 0.23
445 0.21
446 0.21
447 0.22
448 0.19
449 0.15
450 0.14
451 0.12
452 0.08
453 0.08
454 0.1
455 0.11
456 0.11
457 0.13
458 0.13
459 0.16
460 0.18
461 0.21
462 0.2
463 0.23
464 0.27
465 0.26
466 0.25
467 0.23
468 0.21
469 0.18
470 0.18
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.16
475 0.16
476 0.16
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.09
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.12
493 0.12
494 0.14
495 0.17
496 0.22
497 0.22
498 0.23
499 0.22
500 0.19
501 0.22
502 0.22
503 0.2
504 0.15
505 0.15
506 0.13
507 0.12
508 0.11
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.09
525 0.1
526 0.12
527 0.12
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.09
534 0.08
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.12
542 0.13
543 0.14
544 0.16
545 0.17
546 0.15
547 0.15
548 0.15
549 0.14
550 0.12
551 0.11
552 0.09
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.1
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.07
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.04
565 0.05
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.09
574 0.08
575 0.09
576 0.09
577 0.1
578 0.1
579 0.08
580 0.09
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.08
597 0.08
598 0.07
599 0.08
600 0.07
601 0.06
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.06
616 0.06
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.11
621 0.12
622 0.14
623 0.13
624 0.14
625 0.15
626 0.18
627 0.19
628 0.18
629 0.17
630 0.16
631 0.15
632 0.14
633 0.12
634 0.1
635 0.09
636 0.08
637 0.06
638 0.05
639 0.05
640 0.06
641 0.06
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.06
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.09
652 0.1
653 0.11
654 0.11
655 0.14
656 0.12
657 0.11
658 0.1
659 0.09
660 0.08
661 0.07
662 0.08
663 0.05
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.06
670 0.07
671 0.11
672 0.12
673 0.12
674 0.13
675 0.15
676 0.18
677 0.18
678 0.19
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.14
683 0.12
684 0.1
685 0.08
686 0.05
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.06
696 0.06
697 0.08
698 0.1
699 0.1
700 0.1
701 0.1
702 0.1
703 0.1
704 0.1
705 0.08
706 0.07
707 0.06
708 0.06
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.04
714 0.04
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.06
720 0.06
721 0.06
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.08
728 0.14
729 0.14
730 0.14
731 0.17
732 0.17
733 0.2
734 0.23
735 0.21
736 0.17
737 0.23
738 0.24
739 0.24
740 0.24
741 0.23
742 0.21
743 0.21
744 0.21
745 0.16
746 0.16
747 0.18
748 0.25
749 0.31
750 0.32
751 0.33
752 0.35
753 0.34
754 0.39
755 0.4
756 0.36
757 0.33
758 0.39
759 0.37
760 0.33
761 0.34
762 0.28
763 0.22
764 0.19
765 0.16
766 0.11
767 0.13
768 0.13
769 0.12
770 0.13
771 0.13
772 0.12
773 0.12
774 0.12
775 0.15
776 0.22
777 0.25
778 0.25
779 0.26
780 0.26
781 0.26
782 0.25
783 0.22
784 0.16
785 0.13
786 0.15
787 0.15
788 0.16
789 0.15
790 0.15
791 0.13
792 0.13
793 0.13
794 0.11
795 0.1
796 0.11
797 0.12
798 0.14
799 0.15
800 0.13
801 0.13
802 0.13
803 0.15
804 0.16
805 0.18
806 0.17
807 0.21
808 0.23
809 0.25
810 0.24
811 0.23
812 0.22
813 0.19
814 0.16
815 0.12
816 0.12
817 0.1
818 0.09
819 0.09
820 0.08
821 0.08
822 0.09
823 0.12
824 0.14
825 0.15
826 0.16
827 0.19
828 0.2
829 0.21
830 0.21
831 0.19
832 0.15
833 0.15
834 0.14
835 0.12
836 0.12
837 0.1
838 0.08
839 0.08
840 0.08
841 0.07
842 0.07
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.07
847 0.1
848 0.11
849 0.14
850 0.14
851 0.14
852 0.15
853 0.2
854 0.19
855 0.17
856 0.16
857 0.19
858 0.26
859 0.3
860 0.32
861 0.28
862 0.29
863 0.31
864 0.34
865 0.32
866 0.27
867 0.25
868 0.25
869 0.26
870 0.26
871 0.23
872 0.19
873 0.17
874 0.2
875 0.18
876 0.16
877 0.15
878 0.16
879 0.19
880 0.22
881 0.25
882 0.21
883 0.21
884 0.21
885 0.23
886 0.24
887 0.25
888 0.23
889 0.23
890 0.29
891 0.29
892 0.38
893 0.44
894 0.5
895 0.54
896 0.59
897 0.61
898 0.64
899 0.7
900 0.7
901 0.68
902 0.7
903 0.7
904 0.75
905 0.79
906 0.8
907 0.84
908 0.84
909 0.86
910 0.86
911 0.89
912 0.85
913 0.82
914 0.78
915 0.73
916 0.68
917 0.58
918 0.5
919 0.39
920 0.37
921 0.33
922 0.27
923 0.22
924 0.18
925 0.18
926 0.16
927 0.17
928 0.15
929 0.12
930 0.11
931 0.11
932 0.11
933 0.11
934 0.09
935 0.09
936 0.08