Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D5GJ92

Protein Details
Accession D5GJ92    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-286TEAPPRLSKKARKALARASKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-286PRLSKKARKALARASKS
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.333, cyto 9.5, nucl 9, cyto_mito 8.332, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016195  Pol/histidinol_Pase-like  
IPR002738  RNase_P_p30  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0000171  F:ribonuclease MRP activity  
GO:0004526  F:ribonuclease P activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:1905267  P:endonucleolytic cleavage involved in tRNA processing  
GO:0034965  P:intronic box C/D RNA processing  
GO:0000294  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, RNase MRP-dependent  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG tml:GSTUM_00008888001  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01876  RNase_P_p30  
Amino Acid Sequences MFYDLNVPWAPTSPDLPRTVAFLNELGYNVIALSHTHSGKFPQSQPNPIPENPFPKHPNLQILRRITVILDDPSQNHRLAALTSAYDIVALRPTNEKLLLQACKELDCDLISVDLSQRMGYHFKHKTVGLAIQRGIFLEINYSASINDITARRNLIGNAAALIRATRGRGIVISSEARRALGVRGPFDVINLATLWGLSQDKGREAMDGLPRLVVAQAKLKRTSFRGVIDVVVNEPPRGNKRRAEDAAGPSDQPEPEASPEGNQKTEAPPRLSKKARKALARASKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.32
4 0.3
5 0.32
6 0.31
7 0.28
8 0.25
9 0.2
10 0.19
11 0.17
12 0.17
13 0.14
14 0.12
15 0.11
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.06
20 0.1
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.21
26 0.26
27 0.32
28 0.34
29 0.39
30 0.43
31 0.51
32 0.54
33 0.58
34 0.58
35 0.54
36 0.54
37 0.49
38 0.53
39 0.47
40 0.52
41 0.48
42 0.48
43 0.52
44 0.49
45 0.53
46 0.51
47 0.56
48 0.56
49 0.56
50 0.52
51 0.47
52 0.43
53 0.34
54 0.29
55 0.24
56 0.18
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.21
61 0.23
62 0.21
63 0.19
64 0.17
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.06
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.19
86 0.21
87 0.19
88 0.21
89 0.2
90 0.2
91 0.2
92 0.18
93 0.13
94 0.11
95 0.11
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.08
106 0.11
107 0.12
108 0.2
109 0.22
110 0.23
111 0.26
112 0.26
113 0.25
114 0.24
115 0.29
116 0.23
117 0.23
118 0.22
119 0.2
120 0.2
121 0.18
122 0.17
123 0.12
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.16
173 0.16
174 0.15
175 0.15
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.13
190 0.14
191 0.12
192 0.13
193 0.18
194 0.21
195 0.22
196 0.21
197 0.19
198 0.19
199 0.18
200 0.18
201 0.14
202 0.1
203 0.17
204 0.21
205 0.25
206 0.3
207 0.31
208 0.34
209 0.37
210 0.41
211 0.37
212 0.36
213 0.34
214 0.31
215 0.31
216 0.29
217 0.26
218 0.22
219 0.21
220 0.19
221 0.16
222 0.17
223 0.2
224 0.26
225 0.32
226 0.35
227 0.37
228 0.43
229 0.52
230 0.55
231 0.57
232 0.56
233 0.57
234 0.58
235 0.53
236 0.47
237 0.38
238 0.37
239 0.3
240 0.24
241 0.19
242 0.15
243 0.17
244 0.2
245 0.2
246 0.21
247 0.29
248 0.31
249 0.31
250 0.3
251 0.29
252 0.33
253 0.41
254 0.44
255 0.42
256 0.48
257 0.54
258 0.63
259 0.7
260 0.72
261 0.74
262 0.77
263 0.79
264 0.79
265 0.8
266 0.8