Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D5GFZ3

Protein Details
Accession D5GFZ3    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-139REPALLPHRRRQRQQKLCEGVLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, extr 6, mito_nucl 6, plas 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006369  Protohaem_IX_farnesylTrfase  
IPR000537  UbiA_prenyltransferase  
IPR030470  UbiA_prenylTrfase_CS  
IPR044878  UbiA_sf  
Gene Ontology GO:0031966  C:mitochondrial membrane  
GO:0008495  F:protoheme IX farnesyltransferase activity  
GO:0006784  P:heme A biosynthetic process  
KEGG tml:GSTUM_00001943001  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01040  UbiA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00943  UBIA  
CDD cd13957  PT_UbiA_Cox10  
Amino Acid Sequences MYSPNAVASPLALPRPLTNRNSSASNAMLLLLPQVLPPPTICSHCLRRLTTYTRRPFSSTLHPLRSLDAVSLHVPSLLPRSRPKWHSQYFFSNGYLRADAGDSGKHTHTRDGSTTPMREPALLPHRRRQRQQKLCEGVLSPHTTTAGANQSTAVTAMQLPPDASSLLSTTSSQQTSSWKRALYSYLALTKPRLTALIVLSAMAPYALFPVDPLLSDVPTLSALTLTFLTVGTALSSSSANAFNMYLEPTYDRQMSRTRNRPLVRGLLTPRQALVFAAATGLLGVGSLYLGVNPAVAALGGINIVLYAGVYTPLKRISVVNTWVGAIVGGIPPLMGWAAAAGNVQGVDSTWSSTLSHSGGWLLAGLLFAWQFPHFNSLSWGIRDEYRRVGYQMMVWKYPALNARVALRYSLLLFPICFGLWATGVTDVGFLVDSSAVNGWLVREAWAFYSKGGEGGNAKRLFWASVWHLPVVMGLAMVHKEGLWRGVWESIVGGAEEEEHE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.29
3 0.36
4 0.38
5 0.41
6 0.44
7 0.46
8 0.49
9 0.46
10 0.43
11 0.36
12 0.32
13 0.26
14 0.22
15 0.18
16 0.15
17 0.14
18 0.1
19 0.09
20 0.08
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.12
25 0.16
26 0.18
27 0.21
28 0.24
29 0.29
30 0.36
31 0.43
32 0.5
33 0.47
34 0.51
35 0.55
36 0.61
37 0.64
38 0.67
39 0.69
40 0.67
41 0.68
42 0.66
43 0.61
44 0.58
45 0.58
46 0.58
47 0.57
48 0.57
49 0.57
50 0.53
51 0.52
52 0.48
53 0.38
54 0.29
55 0.21
56 0.18
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.19
64 0.2
65 0.24
66 0.29
67 0.35
68 0.44
69 0.49
70 0.57
71 0.6
72 0.65
73 0.67
74 0.67
75 0.7
76 0.67
77 0.64
78 0.58
79 0.51
80 0.43
81 0.39
82 0.34
83 0.25
84 0.2
85 0.17
86 0.16
87 0.14
88 0.14
89 0.12
90 0.15
91 0.18
92 0.21
93 0.21
94 0.26
95 0.27
96 0.3
97 0.31
98 0.3
99 0.35
100 0.37
101 0.38
102 0.34
103 0.35
104 0.32
105 0.3
106 0.28
107 0.3
108 0.34
109 0.4
110 0.43
111 0.47
112 0.57
113 0.64
114 0.72
115 0.75
116 0.76
117 0.78
118 0.83
119 0.85
120 0.81
121 0.75
122 0.69
123 0.59
124 0.5
125 0.45
126 0.39
127 0.29
128 0.22
129 0.21
130 0.18
131 0.17
132 0.18
133 0.19
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.11
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.13
158 0.14
159 0.13
160 0.14
161 0.21
162 0.26
163 0.31
164 0.32
165 0.3
166 0.3
167 0.31
168 0.33
169 0.27
170 0.24
171 0.22
172 0.24
173 0.25
174 0.25
175 0.24
176 0.23
177 0.21
178 0.19
179 0.17
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.1
189 0.07
190 0.06
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.2
241 0.27
242 0.34
243 0.41
244 0.44
245 0.51
246 0.52
247 0.53
248 0.5
249 0.49
250 0.43
251 0.39
252 0.38
253 0.36
254 0.36
255 0.33
256 0.3
257 0.24
258 0.21
259 0.17
260 0.14
261 0.08
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.02
285 0.02
286 0.02
287 0.02
288 0.02
289 0.02
290 0.02
291 0.02
292 0.02
293 0.02
294 0.02
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.13
304 0.18
305 0.21
306 0.21
307 0.21
308 0.2
309 0.2
310 0.19
311 0.14
312 0.08
313 0.06
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.04
320 0.04
321 0.03
322 0.02
323 0.03
324 0.03
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.03
332 0.04
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.12
360 0.11
361 0.12
362 0.15
363 0.19
364 0.21
365 0.22
366 0.23
367 0.2
368 0.24
369 0.27
370 0.27
371 0.28
372 0.28
373 0.29
374 0.29
375 0.29
376 0.25
377 0.27
378 0.32
379 0.29
380 0.27
381 0.26
382 0.26
383 0.25
384 0.28
385 0.28
386 0.22
387 0.21
388 0.22
389 0.26
390 0.28
391 0.28
392 0.25
393 0.21
394 0.19
395 0.19
396 0.19
397 0.16
398 0.13
399 0.12
400 0.13
401 0.13
402 0.12
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.05
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.13
432 0.17
433 0.16
434 0.15
435 0.18
436 0.16
437 0.17
438 0.17
439 0.16
440 0.19
441 0.23
442 0.32
443 0.29
444 0.29
445 0.3
446 0.31
447 0.3
448 0.25
449 0.27
450 0.24
451 0.31
452 0.33
453 0.31
454 0.3
455 0.28
456 0.28
457 0.23
458 0.16
459 0.09
460 0.07
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.08
466 0.09
467 0.1
468 0.13
469 0.12
470 0.13
471 0.15
472 0.17
473 0.18
474 0.16
475 0.16
476 0.14
477 0.14
478 0.12
479 0.11
480 0.08