FuNGI

A0A4Q1BIN6

Protein Details

Accession

A0A4Q1BIN6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-43	SQKSTGAFPKPNHRNQRQTIHIGQC	Hydrophilic
1113-1135	VITTGKEKDQKKKEQVEEEKEKE	Acidic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, pero 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MLGDIKERSIISPPPEPPSQKSTGAFPKPNHRNQRQTIHIGQCSLTSPRSIVNTNGIPGVSTHRPTYDGRNHLDEVGRIRTEVDEENKRRVESMTEEEREQEVEDLQQRFGSRLLDVLRTRAQLRGFSRDPQLTPEPTSQIPPQLTSTKITSPLQVGEQSHKLEKQIGPPVEVEDHLSHLKSIYFPTVPSEPDKLAWLQPLPSPSPNEDPTPRFDLTGSPLSSESTLSIPVSKGLHHHGSSPHLAGYTIDEVLWLCRSAMPSQRVTMFGVLSGIIRRYISFSLPKEADRVAKEIGVVERGLELSLEGLKGKSNNILRASVDLLYTCVGSQETGHEQGSQRPISDHWDISHYDLRRAIKIFDLPWEELIPTLCKLLSTDVLSPLSTSQLISILRLAVRHSKSLADQLIPSFTPIAQHQTLSRPWPPSPSINNEINELSNPPSILTLSLLIEAVTSSRLVAQNIMENSIPAGLLKFLIPSLWDASDLTHDLVHGVSTLLIQLGRYGLSSSFARSSRDIFEDLQRALVDRGDDTLLEKYWDLTAIWTCCAVDPHRTTPEHDITWSQVISMGWEEDAFSQFDKMVKDENWGTVSSILWFLVSWTEGLRVNTPDRLTEWGQQVWKMLERTSIVHQLSERDDEIEGVEIKRALAGLSRLRRILNFDPHSRRVMKDERIDLREMWSRVLETDTLLSDHERTGKWQRRAFHLMRSFRQGEEPLALDLIDALLSLPSPTTSSSSPTRLQPDGNLLTTGERSQVEEHSQMVELSSVAINIHSEGHKEENDPINFTILRPLYQHMILPDLQNVIGPIIPNHFYLPSTSTLRSLPLSPIKPNPSSFSSNTSLIHGDETIGENHSIPIRKEGLPLSPDWTFQPLRELSRSGESEALQHAQNIIDWSPGEIEIVRAVLGLVQSQLLSCGFYEDDGKGGMNRSRLILGLMDVFMLEQNQSSSSSSTSHDEVFRDDLISSTIDHLLDLTIKPFPDHPDHTVNLEKLKVKLNEDGHGDRGQEKEKVGPLERGFSGVGTFYQYYSTLLSLHSSISVGHRAFTRVLLVPLSIKYPSDYKKLVWSHPDILKALNLANVKSEEVPVDEATSKWSLSSSSSFLSASPSHSSIEKVITTGKEKDQKKKEQVEEEKEKEQEKKEVDREKEEREEIKKEVEKEKEKEGIMEEDLEVLWGYCRALGKGWVNERGFLWDMAIIHLDKFFFHSTGDVIKQGQLSYKEEEPKSLGRDKLNDEKMSKKQLEERDRVKEKEKEKERMMRAIFSSGSSNVIRRLLGKVSNDEEKRRLEIIQSSCGSEIVQRVKNLMRSSTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.46
3	0.49
4	0.49
5	0.51
6	0.51
7	0.49
8	0.48
9	0.5
10	0.54
11	0.59
12	0.61
13	0.59
14	0.64
15	0.69
16	0.77
17	0.8
18	0.79
19	0.8
20	0.82
21	0.86
22	0.83
23	0.81
24	0.8
25	0.78
26	0.72
27	0.63
28	0.55
29	0.47
30	0.42
31	0.37
32	0.29
33	0.22
34	0.2
35	0.22
36	0.26
37	0.26
38	0.26
39	0.3
40	0.31
41	0.31
42	0.31
43	0.27
44	0.23
45	0.22
46	0.26
47	0.24
48	0.24
49	0.25
50	0.24
51	0.28
52	0.3
53	0.39
54	0.42
55	0.44
56	0.46
57	0.5
58	0.5
59	0.5
60	0.5
61	0.43
62	0.39
63	0.38
64	0.33
65	0.28
66	0.27
67	0.25
68	0.25
69	0.28
70	0.31
71	0.35
72	0.38
73	0.47
74	0.49
75	0.49
76	0.47
77	0.42
78	0.39
79	0.35
80	0.4
81	0.41
82	0.4
83	0.4
84	0.41
85	0.41
86	0.37
87	0.32
88	0.24
89	0.16
90	0.18
91	0.24
92	0.23
93	0.23
94	0.24
95	0.24
96	0.24
97	0.25
98	0.21
99	0.15
100	0.17
101	0.2
102	0.25
103	0.25
104	0.29
105	0.32
106	0.34
107	0.35
108	0.34
109	0.34
110	0.34
111	0.38
112	0.41
113	0.4
114	0.41
115	0.48
116	0.48
117	0.47
118	0.46
119	0.48
120	0.42
121	0.44
122	0.43
123	0.39
124	0.36
125	0.39
126	0.34
127	0.35
128	0.33
129	0.31
130	0.32
131	0.32
132	0.32
133	0.31
134	0.33
135	0.3
136	0.33
137	0.32
138	0.3
139	0.29
140	0.29
141	0.29
142	0.3
143	0.28
144	0.29
145	0.33
146	0.34
147	0.35
148	0.34
149	0.33
150	0.35
151	0.36
152	0.38
153	0.42
154	0.4
155	0.38
156	0.38
157	0.39
158	0.34
159	0.31
160	0.28
161	0.19
162	0.21
163	0.21
164	0.2
165	0.18
166	0.17
167	0.17
168	0.15
169	0.16
170	0.17
171	0.16
172	0.16
173	0.2
174	0.22
175	0.23
176	0.26
177	0.27
178	0.24
179	0.24
180	0.26
181	0.24
182	0.24
183	0.25
184	0.23
185	0.21
186	0.23
187	0.26
188	0.27
189	0.28
190	0.3
191	0.3
192	0.35
193	0.36
194	0.39
195	0.41
196	0.39
197	0.41
198	0.44
199	0.4
200	0.34
201	0.32
202	0.29
203	0.29
204	0.34
205	0.29
206	0.24
207	0.24
208	0.25
209	0.25
210	0.22
211	0.18
212	0.11
213	0.12
214	0.11
215	0.12
216	0.11
217	0.14
218	0.14
219	0.14
220	0.16
221	0.2
222	0.26
223	0.25
224	0.28
225	0.29
226	0.33
227	0.35
228	0.33
229	0.28
230	0.22
231	0.21
232	0.18
233	0.18
234	0.15
235	0.13
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.12
240	0.13
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.12
245	0.15
246	0.23
247	0.26
248	0.27
249	0.3
250	0.31
251	0.31
252	0.31
253	0.29
254	0.21
255	0.17
256	0.15
257	0.12
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.12
265	0.13
266	0.16
267	0.22
268	0.23
269	0.3
270	0.31
271	0.31
272	0.31
273	0.32
274	0.33
275	0.28
276	0.29
277	0.23
278	0.22
279	0.22
280	0.22
281	0.21
282	0.17
283	0.15
284	0.12
285	0.11
286	0.11
287	0.1
288	0.08
289	0.06
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.08
296	0.09
297	0.1
298	0.16
299	0.19
300	0.25
301	0.27
302	0.29
303	0.27
304	0.29
305	0.3
306	0.24
307	0.2
308	0.14
309	0.13
310	0.11
311	0.11
312	0.08
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.09
318	0.12
319	0.15
320	0.15
321	0.18
322	0.18
323	0.24
324	0.3
325	0.27
326	0.24
327	0.22
328	0.23
329	0.26
330	0.29
331	0.24
332	0.19
333	0.22
334	0.22
335	0.25
336	0.3
337	0.25
338	0.24
339	0.28
340	0.28
341	0.29
342	0.3
343	0.26
344	0.24
345	0.26
346	0.24
347	0.25
348	0.27
349	0.24
350	0.24
351	0.24
352	0.21
353	0.18
354	0.19
355	0.15
356	0.11
357	0.11
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.11
362	0.13
363	0.13
364	0.15
365	0.17
366	0.18
367	0.17
368	0.17
369	0.15
370	0.14
371	0.11
372	0.1
373	0.07
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.12
381	0.13
382	0.18
383	0.2
384	0.21
385	0.21
386	0.21
387	0.22
388	0.27
389	0.27
390	0.2
391	0.2
392	0.19
393	0.2
394	0.18
395	0.18
396	0.13
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.16
401	0.14
402	0.15
403	0.16
404	0.2
405	0.23
406	0.26
407	0.29
408	0.27
409	0.27
410	0.31
411	0.32
412	0.35
413	0.37
414	0.4
415	0.41
416	0.43
417	0.43
418	0.4
419	0.38
420	0.32
421	0.27
422	0.21
423	0.18
424	0.13
425	0.13
426	0.11
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.07
433	0.08
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.1
446	0.1
447	0.14
448	0.15
449	0.16
450	0.13
451	0.12
452	0.12
453	0.11
454	0.1
455	0.05
456	0.05
457	0.04
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.04
462	0.05
463	0.05
464	0.06
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.09
470	0.1
471	0.11
472	0.1
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.08
493	0.08
494	0.1
495	0.13
496	0.14
497	0.16
498	0.16
499	0.19
500	0.19
501	0.21
502	0.21
503	0.19
504	0.22
505	0.23
506	0.22
507	0.21
508	0.18
509	0.17
510	0.15
511	0.15
512	0.11
513	0.08
514	0.09
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.09
519	0.08
520	0.09
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.07
526	0.07
527	0.1
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.12
534	0.12
535	0.15
536	0.18
537	0.22
538	0.27
539	0.28
540	0.3
541	0.34
542	0.37
543	0.31
544	0.28
545	0.25
546	0.22
547	0.23
548	0.2
549	0.14
550	0.12
551	0.11
552	0.11
553	0.1
554	0.09
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.06
559	0.07
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.07
564	0.09
565	0.09
566	0.09
567	0.11
568	0.11
569	0.15
570	0.15
571	0.16
572	0.15
573	0.15
574	0.15
575	0.12
576	0.12
577	0.1
578	0.09
579	0.07
580	0.06
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.04
587	0.06
588	0.08
589	0.09
590	0.1
591	0.12
592	0.13
593	0.15
594	0.15
595	0.14
596	0.14
597	0.17
598	0.18
599	0.21
600	0.22
601	0.22
602	0.22
603	0.22
604	0.22
605	0.19
606	0.2
607	0.16
608	0.13
609	0.13
610	0.13
611	0.15
612	0.16
613	0.22
614	0.19
615	0.19
616	0.19
617	0.19
618	0.2
619	0.19
620	0.17
621	0.11
622	0.11
623	0.1
624	0.1
625	0.09
626	0.08
627	0.07
628	0.07
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.05
634	0.05
635	0.07
636	0.13
637	0.16
638	0.18
639	0.19
640	0.19
641	0.19
642	0.24
643	0.26
644	0.3
645	0.31
646	0.36
647	0.41
648	0.43
649	0.47
650	0.42
651	0.38
652	0.35
653	0.38
654	0.36
655	0.35
656	0.4
657	0.41
658	0.42
659	0.43
660	0.37
661	0.34
662	0.33
663	0.29
664	0.23
665	0.18
666	0.16
667	0.15
668	0.15
669	0.12
670	0.07
671	0.07
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.07
676	0.07
677	0.07
678	0.1
679	0.09
680	0.12
681	0.22
682	0.3
683	0.37
684	0.4
685	0.41
686	0.46
687	0.54
688	0.52
689	0.51
690	0.51
691	0.5
692	0.48
693	0.52
694	0.46
695	0.38
696	0.39
697	0.31
698	0.24
699	0.19
700	0.18
701	0.12
702	0.11
703	0.1
704	0.07
705	0.06
706	0.05
707	0.03
708	0.03
709	0.02
710	0.02
711	0.02
712	0.02
713	0.03
714	0.03
715	0.04
716	0.04
717	0.07
718	0.07
719	0.11
720	0.14
721	0.18
722	0.2
723	0.23
724	0.26
725	0.26
726	0.26
727	0.23
728	0.27
729	0.25
730	0.23
731	0.2
732	0.16
733	0.16
734	0.16
735	0.15
736	0.1
737	0.08
738	0.09
739	0.1
740	0.11
741	0.13
742	0.13
743	0.14
744	0.13
745	0.13
746	0.11
747	0.1
748	0.09
749	0.06
750	0.06
751	0.05
752	0.05
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.05
757	0.06
758	0.06
759	0.06
760	0.08
761	0.1
762	0.11
763	0.12
764	0.16
765	0.22
766	0.23
767	0.24
768	0.23
769	0.23
770	0.22
771	0.21
772	0.22
773	0.15
774	0.15
775	0.14
776	0.16
777	0.15
778	0.16
779	0.17
780	0.11
781	0.13
782	0.14
783	0.13
784	0.13
785	0.11
786	0.11
787	0.1
788	0.09
789	0.07
790	0.07
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.09
795	0.09
796	0.1
797	0.1
798	0.1
799	0.11
800	0.13
801	0.14
802	0.16
803	0.16
804	0.17
805	0.17
806	0.18
807	0.18
808	0.17
809	0.18
810	0.22
811	0.24
812	0.25
813	0.31
814	0.34
815	0.36
816	0.36
817	0.35
818	0.33
819	0.36
820	0.35
821	0.35
822	0.33
823	0.32
824	0.31
825	0.29
826	0.25
827	0.2
828	0.19
829	0.13
830	0.1
831	0.09
832	0.1
833	0.09
834	0.09
835	0.09
836	0.08
837	0.09
838	0.12
839	0.14
840	0.13
841	0.16
842	0.19
843	0.19
844	0.21
845	0.22
846	0.23
847	0.22
848	0.22
849	0.22
850	0.19
851	0.19
852	0.18
853	0.21
854	0.17
855	0.16
856	0.21
857	0.2
858	0.23
859	0.24
860	0.25
861	0.22
862	0.27
863	0.28
864	0.23
865	0.23
866	0.2
867	0.2
868	0.2
869	0.2
870	0.14
871	0.14
872	0.13
873	0.11
874	0.11
875	0.11
876	0.09
877	0.09
878	0.08
879	0.09
880	0.09
881	0.09
882	0.08
883	0.07
884	0.07
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.05
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.05
893	0.05
894	0.05
895	0.05
896	0.05
897	0.06
898	0.05
899	0.06
900	0.05
901	0.06
902	0.06
903	0.07
904	0.09
905	0.08
906	0.08
907	0.09
908	0.09
909	0.08
910	0.12
911	0.14
912	0.14
913	0.15
914	0.15
915	0.16
916	0.16
917	0.15
918	0.13
919	0.11
920	0.1
921	0.09
922	0.08
923	0.07
924	0.07
925	0.06
926	0.06
927	0.05
928	0.04
929	0.05
930	0.06
931	0.07
932	0.08
933	0.09
934	0.1
935	0.12
936	0.13
937	0.15
938	0.16
939	0.17
940	0.18
941	0.18
942	0.19
943	0.2
944	0.18
945	0.16
946	0.15
947	0.13
948	0.12
949	0.12
950	0.1
951	0.1
952	0.11
953	0.1
954	0.1
955	0.09
956	0.08
957	0.1
958	0.09
959	0.09
960	0.09
961	0.09
962	0.1
963	0.12
964	0.16
965	0.21
966	0.25
967	0.28
968	0.32
969	0.33
970	0.36
971	0.39
972	0.36
973	0.32
974	0.32
975	0.3
976	0.26
977	0.33
978	0.32
979	0.3
980	0.36
981	0.36
982	0.37
983	0.4
984	0.4
985	0.35
986	0.34
987	0.32
988	0.28
989	0.28
990	0.27
991	0.23
992	0.22
993	0.23
994	0.25
995	0.29
996	0.29
997	0.33
998	0.32
999	0.34
1000	0.33
1001	0.31
1002	0.26
1003	0.22
1004	0.2
1005	0.13
1006	0.12
1007	0.11
1008	0.12
1009	0.1
1010	0.11
1011	0.11
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.12
1015	0.1
1016	0.1
1017	0.11
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.09
1022	0.09
1023	0.11
1024	0.16
1025	0.15
1026	0.16
1027	0.17
1028	0.19
1029	0.19
1030	0.19
1031	0.2
1032	0.16
1033	0.17
1034	0.16
1035	0.16
1036	0.15
1037	0.15
1038	0.17
1039	0.14
1040	0.12
1041	0.13
1042	0.19
1043	0.22
1044	0.26
1045	0.28
1046	0.27
1047	0.36
1048	0.4
1049	0.43
1050	0.44
1051	0.46
1052	0.47
1053	0.49
1054	0.51
1055	0.42
1056	0.39
1057	0.34
1058	0.29
1059	0.24
1060	0.21
1061	0.19
1062	0.15
1063	0.17
1064	0.17
1065	0.18
1066	0.17
1067	0.17
1068	0.13
1069	0.14
1070	0.16
1071	0.14
1072	0.15
1073	0.15
1074	0.14
1075	0.17
1076	0.17
1077	0.15
1078	0.13
1079	0.13
1080	0.11
1081	0.14
1082	0.17
1083	0.16
1084	0.16
1085	0.17
1086	0.17
1087	0.17
1088	0.21
1089	0.18
1090	0.19
1091	0.2
1092	0.2
1093	0.2
1094	0.21
1095	0.23
1096	0.2
1097	0.23
1098	0.19
1099	0.16
1100	0.19
1101	0.22
1102	0.25
1103	0.28
1104	0.34
1105	0.39
1106	0.45
1107	0.54
1108	0.6
1109	0.67
1110	0.73
1111	0.78
1112	0.79
1113	0.81
1114	0.85
1115	0.85
1116	0.85
1117	0.8
1118	0.76
1119	0.69
1120	0.65
1121	0.61
1122	0.55
1123	0.52
1124	0.48
1125	0.52
1126	0.55
1127	0.61
1128	0.62
1129	0.65
1130	0.66
1131	0.65
1132	0.66
1133	0.62
1134	0.6
1135	0.57
1136	0.56
1137	0.49
1138	0.53
1139	0.51
1140	0.49
1141	0.52
1142	0.55
1143	0.58
1144	0.57
1145	0.62
1146	0.59
1147	0.54
1148	0.51
1149	0.46
1150	0.4
1151	0.33
1152	0.31
1153	0.24
1154	0.19
1155	0.18
1156	0.16
1157	0.12
1158	0.09
1159	0.08
1160	0.07
1161	0.07
1162	0.08
1163	0.09
1164	0.1
1165	0.12
1166	0.18
1167	0.24
1168	0.31
1169	0.36
1170	0.43
1171	0.42
1172	0.43
1173	0.42
1174	0.41
1175	0.37
1176	0.29
1177	0.25
1178	0.18
1179	0.18
1180	0.17
1181	0.19
1182	0.14
1183	0.13
1184	0.14
1185	0.13
1186	0.11
1187	0.15
1188	0.16
1189	0.14
1190	0.14
1191	0.15
1192	0.15
1193	0.2
1194	0.22
1195	0.2
1196	0.19
1197	0.21
1198	0.22
1199	0.22
1200	0.25
1201	0.24
1202	0.26
1203	0.28
1204	0.34
1205	0.4
1206	0.39
1207	0.41
1208	0.4
1209	0.42
1210	0.44
1211	0.47
1212	0.45
1213	0.42
1214	0.48
1215	0.52
1216	0.58
1217	0.6
1218	0.6
1219	0.57
1220	0.6
1221	0.62
1222	0.66
1223	0.61
1224	0.56
1225	0.56
1226	0.61
1227	0.67
1228	0.68
1229	0.69
1230	0.69
1231	0.74
1232	0.74
1233	0.75
1234	0.72
1235	0.7
1236	0.72
1237	0.73
1238	0.72
1239	0.73
1240	0.78
1241	0.76
1242	0.77
1243	0.72
1244	0.67
1245	0.6
1246	0.55
1247	0.47
1248	0.38
1249	0.36
1250	0.27
1251	0.28
1252	0.24
1253	0.24
1254	0.23
1255	0.24
1256	0.23
1257	0.22
1258	0.25
1259	0.26
1260	0.3
1261	0.33
1262	0.35
1263	0.39
1264	0.48
1265	0.5
1266	0.53
1267	0.52
1268	0.51
1269	0.51
1270	0.46
1271	0.42
1272	0.37
1273	0.41
1274	0.4
1275	0.43
1276	0.41
1277	0.39
1278	0.37
1279	0.36
1280	0.32
1281	0.26
1282	0.29
1283	0.28
1284	0.32
1285	0.31
1286	0.35
1287	0.4
1288	0.46
1289	0.46

A0A4Q1BIN6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer