FuNGI

A0A4Q1BTN7

Protein Details

Accession

A0A4Q1BTN7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
145-165	HGPSRAKRKGSRARKRAAVRA	Basic
441-464	WELGVKWKKTREKGLKHKEMNGHP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
148-162	SRAKRKGSRARKRAA

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, mito_nucl 9.5, cyto 6, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MPPKRRNKTRQTYDDGEEVIGGQVLPIAEIPEDWVGVPEDGATYLALAGRANAGLSFFSRAPLPRQIEVDMDTEIHIEASHVGTSKKTRHPALPKESWLVTFAEHFKKYRQNLTSRWPPPSMTQPPHYPPFPDIRLRSSFDFYLHGPSRAKRKGSRARKRAAVRAAAISLEEEESMMNDGVPISDVTAEVRTSDQISGMSTGGSGEKNEEEEDGGFDEDLEEEYEVIDEGTEESQTISQEEEGEDKPYEPPEPLLSVLKGLHTNNILRLLTYFTHFLLDPLSSPILSIPSYLPTQPPSPPTQPQTILPEQPHTTLPDNTSTSHTPNSTHYPAKKTGTLSKPRREPFPDLYARWIFTLLLILDNQLSGEEISILRELARAAMRVAGWRWIVAVNTGEITKLVSVSPTFHPSTDGSEGGKNGVIVGDTYQEGEISDEEEDEGWELGVKWKKTREKGLKHKEMNGHPDVDMNGGTDSDEQNGGRKDEVIKEDSSKKREGGNVDDTLSRCWLIVAAISVGWAQHDLLQEMESLFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.63
3	0.52
4	0.41
5	0.32
6	0.23
7	0.17
8	0.12
9	0.07
10	0.07
11	0.07
12	0.07
13	0.06
14	0.07
15	0.07
16	0.07
17	0.1
18	0.09
19	0.09
20	0.09
21	0.1
22	0.11
23	0.11
24	0.11
25	0.09
26	0.08
27	0.08
28	0.09
29	0.07
30	0.06
31	0.06
32	0.07
33	0.08
34	0.07
35	0.07
36	0.08
37	0.08
38	0.08
39	0.07
40	0.07
41	0.08
42	0.09
43	0.12
44	0.11
45	0.12
46	0.15
47	0.17
48	0.22
49	0.3
50	0.33
51	0.33
52	0.35
53	0.36
54	0.35
55	0.36
56	0.33
57	0.24
58	0.2
59	0.17
60	0.15
61	0.13
62	0.11
63	0.08
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.09
68	0.09
69	0.1
70	0.13
71	0.19
72	0.27
73	0.34
74	0.39
75	0.43
76	0.51
77	0.61
78	0.68
79	0.71
80	0.71
81	0.67
82	0.65
83	0.61
84	0.53
85	0.44
86	0.35
87	0.26
88	0.23
89	0.25
90	0.27
91	0.28
92	0.29
93	0.32
94	0.4
95	0.44
96	0.49
97	0.51
98	0.51
99	0.55
100	0.62
101	0.68
102	0.64
103	0.64
104	0.56
105	0.51
106	0.48
107	0.52
108	0.52
109	0.47
110	0.47
111	0.49
112	0.53
113	0.56
114	0.53
115	0.45
116	0.39
117	0.41
118	0.41
119	0.41
120	0.38
121	0.39
122	0.42
123	0.44
124	0.44
125	0.4
126	0.36
127	0.29
128	0.29
129	0.24
130	0.29
131	0.27
132	0.28
133	0.27
134	0.29
135	0.38
136	0.42
137	0.47
138	0.44
139	0.53
140	0.6
141	0.69
142	0.76
143	0.76
144	0.77
145	0.8
146	0.81
147	0.78
148	0.74
149	0.68
150	0.59
151	0.52
152	0.45
153	0.36
154	0.3
155	0.22
156	0.16
157	0.11
158	0.08
159	0.06
160	0.05
161	0.05
162	0.07
163	0.06
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.06
169	0.05
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.06
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.08
179	0.09
180	0.09
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.09
185	0.09
186	0.08
187	0.06
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.03
215	0.03
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.09
229	0.09
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.1
240	0.11
241	0.11
242	0.1
243	0.11
244	0.11
245	0.11
246	0.12
247	0.11
248	0.12
249	0.12
250	0.13
251	0.13
252	0.16
253	0.15
254	0.13
255	0.13
256	0.13
257	0.12
258	0.13
259	0.12
260	0.09
261	0.1
262	0.1
263	0.1
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.06
276	0.08
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.12
281	0.14
282	0.15
283	0.17
284	0.21
285	0.24
286	0.28
287	0.3
288	0.32
289	0.32
290	0.32
291	0.36
292	0.34
293	0.33
294	0.3
295	0.31
296	0.27
297	0.27
298	0.26
299	0.22
300	0.22
301	0.2
302	0.2
303	0.21
304	0.22
305	0.21
306	0.24
307	0.23
308	0.22
309	0.23
310	0.22
311	0.19
312	0.21
313	0.26
314	0.27
315	0.31
316	0.32
317	0.35
318	0.39
319	0.4
320	0.4
321	0.37
322	0.42
323	0.45
324	0.52
325	0.56
326	0.59
327	0.65
328	0.64
329	0.68
330	0.64
331	0.62
332	0.57
333	0.58
334	0.56
335	0.48
336	0.52
337	0.47
338	0.42
339	0.35
340	0.3
341	0.2
342	0.14
343	0.16
344	0.1
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.09
364	0.1
365	0.09
366	0.09
367	0.11
368	0.12
369	0.13
370	0.14
371	0.15
372	0.14
373	0.14
374	0.14
375	0.13
376	0.13
377	0.13
378	0.13
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.11
391	0.14
392	0.18
393	0.19
394	0.19
395	0.21
396	0.21
397	0.25
398	0.25
399	0.23
400	0.2
401	0.21
402	0.21
403	0.2
404	0.2
405	0.14
406	0.11
407	0.1
408	0.09
409	0.07
410	0.07
411	0.08
412	0.07
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.08
425	0.07
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.14
431	0.2
432	0.21
433	0.26
434	0.34
435	0.43
436	0.5
437	0.61
438	0.64
439	0.69
440	0.79
441	0.85
442	0.87
443	0.84
444	0.85
445	0.83
446	0.79
447	0.76
448	0.69
449	0.6
450	0.49
451	0.46
452	0.39
453	0.31
454	0.24
455	0.17
456	0.13
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.13
463	0.12
464	0.18
465	0.21
466	0.22
467	0.2
468	0.22
469	0.24
470	0.29
471	0.34
472	0.31
473	0.31
474	0.36
475	0.45
476	0.5
477	0.52
478	0.49
479	0.46
480	0.48
481	0.52
482	0.51
483	0.49
484	0.48
485	0.47
486	0.45
487	0.47
488	0.42
489	0.39
490	0.35
491	0.27
492	0.2
493	0.17
494	0.15
495	0.11
496	0.12
497	0.11
498	0.1
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.09
505	0.08
506	0.1
507	0.13
508	0.13
509	0.14
510	0.14
511	0.15

A0A4Q1BTN7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer