Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q1BR16

Protein Details
Accession A0A4Q1BR16    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-41TATVMGKEKKAHKGEKRKRSDESQIESHydrophilic
164-186ETLRSGPSKKKVKGKKYVPSDETHydrophilic
544-570STDADRQARRLAKKKLRHGMARNEEKGHydrophilic
579-603AERASKRAKVISKKGRVRSEKAVAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-33KEKKAHKGEKRKR
171-179SKKKVKGKK
532-608KGLSKEERKMVKSTDADRQARRLAKKKLRHGMARNEEKGSVKLNPTSAERASKRAKVISKKGRVRSEKAVAKMKGQR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 12, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAVSRGSLRGVAQHTATVMGKEKKAHKGEKRKRSDESQIESPTVGLKLVGKSKDAELDDIFNKSVCSYLKGGFQLTHQATLNQTSTVSAIAGPSTFLEVSSNSELVRDTQVSRKKVQKSVRVQEVEVENEPDIEPVEAGPSATRLSEKDESQVDISDQEDLIHETLRSGPSKKKVKGKKYVPSDETPGDRDRRTIFVGNVPLECAKVKSALTKLRVHILSYAPSAKIESVRFRSVPFATPTSILPSDNPEKDETRRLKREKERAATWREQIDHDPKSKSKTKSRDDEEVVDTSKVYIDAKGKRKVAFIKKDFHDQAATCNAYIVFEHPPPDRSKNLPPILNPYKAAGLALKADGSEFMGRSIRVDVVRASGRKGDDADGTTKKRDGWLPSGTDPKRSLFVGGLDYAAKEEDVRVFFEELVKKERGDAPDGSWVTGVRIVRDKETQLGKGFGYVHFTDRESVDEIIALNSTKLKLAKRDIRVQQCKTLPSATVKPSPITNLKSSDKTKPKTTSARSIITTIPKGNPALGEKLKGLSKEERKMVKSTDADRQARRLAKKKLRHGMARNEEKGSVKLNPTSAERASKRAKVISKKGRVRSEKAVAKMKGQRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.25
4 0.2
5 0.25
6 0.27
7 0.3
8 0.36
9 0.42
10 0.49
11 0.57
12 0.65
13 0.67
14 0.74
15 0.81
16 0.85
17 0.89
18 0.86
19 0.85
20 0.83
21 0.83
22 0.81
23 0.78
24 0.76
25 0.69
26 0.63
27 0.56
28 0.48
29 0.39
30 0.3
31 0.22
32 0.14
33 0.14
34 0.17
35 0.24
36 0.25
37 0.25
38 0.26
39 0.28
40 0.34
41 0.32
42 0.31
43 0.25
44 0.29
45 0.29
46 0.29
47 0.28
48 0.21
49 0.2
50 0.17
51 0.19
52 0.14
53 0.17
54 0.17
55 0.2
56 0.25
57 0.27
58 0.28
59 0.26
60 0.26
61 0.32
62 0.3
63 0.32
64 0.26
65 0.26
66 0.26
67 0.29
68 0.29
69 0.2
70 0.18
71 0.15
72 0.15
73 0.14
74 0.12
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.14
87 0.17
88 0.17
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.16
93 0.19
94 0.16
95 0.16
96 0.24
97 0.32
98 0.36
99 0.42
100 0.48
101 0.52
102 0.58
103 0.65
104 0.67
105 0.69
106 0.75
107 0.78
108 0.73
109 0.65
110 0.63
111 0.57
112 0.51
113 0.42
114 0.34
115 0.24
116 0.22
117 0.22
118 0.16
119 0.13
120 0.1
121 0.08
122 0.06
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.15
133 0.19
134 0.19
135 0.23
136 0.24
137 0.25
138 0.25
139 0.25
140 0.19
141 0.16
142 0.16
143 0.13
144 0.11
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.11
153 0.14
154 0.16
155 0.17
156 0.23
157 0.32
158 0.41
159 0.47
160 0.55
161 0.62
162 0.69
163 0.77
164 0.8
165 0.8
166 0.81
167 0.84
168 0.79
169 0.73
170 0.68
171 0.61
172 0.54
173 0.48
174 0.43
175 0.37
176 0.33
177 0.32
178 0.29
179 0.28
180 0.29
181 0.29
182 0.26
183 0.27
184 0.31
185 0.3
186 0.28
187 0.26
188 0.22
189 0.19
190 0.18
191 0.14
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.14
196 0.2
197 0.25
198 0.3
199 0.34
200 0.34
201 0.39
202 0.39
203 0.36
204 0.33
205 0.29
206 0.26
207 0.23
208 0.24
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.16
214 0.16
215 0.2
216 0.23
217 0.26
218 0.26
219 0.26
220 0.29
221 0.27
222 0.29
223 0.26
224 0.23
225 0.21
226 0.21
227 0.21
228 0.22
229 0.21
230 0.17
231 0.14
232 0.18
233 0.22
234 0.22
235 0.24
236 0.21
237 0.23
238 0.25
239 0.34
240 0.36
241 0.4
242 0.48
243 0.51
244 0.58
245 0.65
246 0.73
247 0.73
248 0.72
249 0.69
250 0.67
251 0.7
252 0.65
253 0.59
254 0.53
255 0.45
256 0.4
257 0.38
258 0.38
259 0.34
260 0.34
261 0.34
262 0.31
263 0.36
264 0.43
265 0.44
266 0.46
267 0.52
268 0.56
269 0.61
270 0.65
271 0.66
272 0.61
273 0.59
274 0.52
275 0.44
276 0.38
277 0.29
278 0.24
279 0.16
280 0.13
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.13
285 0.2
286 0.28
287 0.33
288 0.36
289 0.37
290 0.4
291 0.46
292 0.5
293 0.52
294 0.5
295 0.52
296 0.5
297 0.57
298 0.54
299 0.47
300 0.41
301 0.31
302 0.29
303 0.27
304 0.25
305 0.17
306 0.17
307 0.15
308 0.13
309 0.13
310 0.12
311 0.09
312 0.09
313 0.12
314 0.12
315 0.15
316 0.19
317 0.22
318 0.23
319 0.25
320 0.31
321 0.38
322 0.42
323 0.41
324 0.38
325 0.44
326 0.47
327 0.44
328 0.38
329 0.3
330 0.26
331 0.24
332 0.23
333 0.14
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.1
351 0.11
352 0.1
353 0.13
354 0.17
355 0.17
356 0.17
357 0.18
358 0.19
359 0.19
360 0.2
361 0.18
362 0.16
363 0.17
364 0.21
365 0.23
366 0.25
367 0.25
368 0.25
369 0.24
370 0.25
371 0.27
372 0.26
373 0.27
374 0.29
375 0.32
376 0.34
377 0.43
378 0.41
379 0.42
380 0.39
381 0.34
382 0.31
383 0.27
384 0.25
385 0.17
386 0.18
387 0.15
388 0.14
389 0.13
390 0.12
391 0.11
392 0.1
393 0.09
394 0.08
395 0.05
396 0.06
397 0.08
398 0.09
399 0.11
400 0.12
401 0.13
402 0.13
403 0.18
404 0.21
405 0.2
406 0.24
407 0.24
408 0.22
409 0.24
410 0.29
411 0.26
412 0.26
413 0.26
414 0.23
415 0.31
416 0.31
417 0.28
418 0.24
419 0.22
420 0.18
421 0.2
422 0.18
423 0.12
424 0.18
425 0.18
426 0.21
427 0.24
428 0.24
429 0.27
430 0.31
431 0.32
432 0.28
433 0.29
434 0.26
435 0.26
436 0.26
437 0.2
438 0.22
439 0.19
440 0.19
441 0.19
442 0.2
443 0.19
444 0.18
445 0.2
446 0.17
447 0.17
448 0.14
449 0.13
450 0.13
451 0.11
452 0.11
453 0.09
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.11
458 0.14
459 0.16
460 0.22
461 0.32
462 0.4
463 0.45
464 0.55
465 0.61
466 0.69
467 0.76
468 0.73
469 0.72
470 0.68
471 0.63
472 0.56
473 0.49
474 0.41
475 0.38
476 0.41
477 0.38
478 0.4
479 0.4
480 0.38
481 0.37
482 0.4
483 0.4
484 0.38
485 0.37
486 0.37
487 0.4
488 0.46
489 0.49
490 0.53
491 0.57
492 0.58
493 0.62
494 0.62
495 0.66
496 0.69
497 0.72
498 0.72
499 0.68
500 0.68
501 0.61
502 0.58
503 0.54
504 0.5
505 0.47
506 0.4
507 0.36
508 0.34
509 0.33
510 0.31
511 0.3
512 0.26
513 0.3
514 0.29
515 0.29
516 0.27
517 0.3
518 0.32
519 0.3
520 0.31
521 0.33
522 0.4
523 0.45
524 0.52
525 0.56
526 0.56
527 0.6
528 0.58
529 0.57
530 0.55
531 0.52
532 0.54
533 0.56
534 0.59
535 0.58
536 0.6
537 0.59
538 0.61
539 0.65
540 0.65
541 0.66
542 0.7
543 0.76
544 0.81
545 0.83
546 0.85
547 0.85
548 0.85
549 0.85
550 0.86
551 0.86
552 0.8
553 0.72
554 0.66
555 0.59
556 0.52
557 0.45
558 0.4
559 0.34
560 0.34
561 0.34
562 0.34
563 0.36
564 0.4
565 0.39
566 0.43
567 0.41
568 0.46
569 0.51
570 0.53
571 0.54
572 0.56
573 0.61
574 0.62
575 0.7
576 0.73
577 0.76
578 0.8
579 0.84
580 0.87
581 0.86
582 0.83
583 0.82
584 0.81
585 0.78
586 0.76
587 0.77
588 0.68
589 0.69