Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q1BMZ8

Protein Details
Accession A0A4Q1BMZ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-305GKEKSGSKPSKSKKEKEKVFIEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-56PKPVAKKPAEPAPAPRNVPGAVSRGGRGRGT
286-298KSGSKPSKSKKEK
320-352GGRGRGGDRGRGGRGGRGGGRGGERGGRGRGGS
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, cyto 10.5, nucl 8.5, cysk 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVISRNPFAFLEDEGDDSPAPAPAPKPVAKKPAEPAPAPRNVPGAVSRGGRGRGTYPARGSPRNGARDSQPRNTAPTADEGVTEGFETPAGFEGERVATHRRPYQGLDAHTKGPRGNRSSRGVTSGGHTARLDNVGSRRPRVVQDAAGRRQYERRSGTVGDSQKKVDQGWGAATGTAELTDEVQGEKDAQVEENAPQTPAEEDDGGWGAPATTPAVREADAEAAEPAEPEEPEEVVKSYDQFLAERAAQAFDFGKKEARQVGTQSLEGKAFVREALDEFFNGKEKSGSKPSKSKKEKEKVFIEVDGQFASPASFNGGGGGRGRGGDRGRGGRGGRGGGRGGERGGRGRGGSGFSSRGGRQGNIDANDTSAFPALGGP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.2
4 0.17
5 0.17
6 0.16
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.16
12 0.23
13 0.28
14 0.35
15 0.41
16 0.5
17 0.52
18 0.57
19 0.58
20 0.61
21 0.61
22 0.57
23 0.59
24 0.57
25 0.61
26 0.58
27 0.53
28 0.47
29 0.41
30 0.41
31 0.34
32 0.3
33 0.26
34 0.26
35 0.26
36 0.27
37 0.29
38 0.28
39 0.27
40 0.25
41 0.3
42 0.33
43 0.37
44 0.37
45 0.42
46 0.47
47 0.49
48 0.5
49 0.51
50 0.54
51 0.56
52 0.54
53 0.48
54 0.5
55 0.57
56 0.6
57 0.58
58 0.57
59 0.51
60 0.54
61 0.53
62 0.47
63 0.38
64 0.36
65 0.31
66 0.24
67 0.23
68 0.19
69 0.17
70 0.15
71 0.14
72 0.1
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.13
85 0.17
86 0.18
87 0.23
88 0.28
89 0.29
90 0.31
91 0.33
92 0.39
93 0.39
94 0.41
95 0.44
96 0.41
97 0.43
98 0.43
99 0.42
100 0.35
101 0.36
102 0.39
103 0.38
104 0.42
105 0.43
106 0.48
107 0.51
108 0.5
109 0.48
110 0.42
111 0.36
112 0.32
113 0.32
114 0.26
115 0.23
116 0.22
117 0.18
118 0.18
119 0.19
120 0.17
121 0.13
122 0.15
123 0.2
124 0.22
125 0.24
126 0.24
127 0.25
128 0.27
129 0.29
130 0.29
131 0.28
132 0.34
133 0.41
134 0.44
135 0.46
136 0.44
137 0.4
138 0.44
139 0.41
140 0.4
141 0.35
142 0.33
143 0.32
144 0.33
145 0.34
146 0.35
147 0.39
148 0.35
149 0.33
150 0.33
151 0.31
152 0.31
153 0.28
154 0.23
155 0.17
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.11
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.16
243 0.16
244 0.19
245 0.24
246 0.25
247 0.25
248 0.27
249 0.32
250 0.29
251 0.3
252 0.29
253 0.25
254 0.23
255 0.21
256 0.19
257 0.14
258 0.12
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.16
269 0.15
270 0.14
271 0.16
272 0.17
273 0.22
274 0.32
275 0.38
276 0.4
277 0.5
278 0.59
279 0.67
280 0.75
281 0.78
282 0.79
283 0.83
284 0.85
285 0.84
286 0.81
287 0.77
288 0.71
289 0.63
290 0.56
291 0.46
292 0.38
293 0.3
294 0.24
295 0.17
296 0.13
297 0.12
298 0.09
299 0.07
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.16
312 0.17
313 0.21
314 0.26
315 0.3
316 0.31
317 0.36
318 0.37
319 0.36
320 0.37
321 0.37
322 0.34
323 0.32
324 0.31
325 0.29
326 0.3
327 0.27
328 0.26
329 0.25
330 0.25
331 0.26
332 0.27
333 0.26
334 0.24
335 0.25
336 0.25
337 0.25
338 0.25
339 0.24
340 0.23
341 0.23
342 0.28
343 0.26
344 0.3
345 0.29
346 0.28
347 0.29
348 0.34
349 0.39
350 0.37
351 0.4
352 0.34
353 0.32
354 0.32
355 0.29
356 0.23
357 0.16
358 0.13