FuNGI

A0A4Q1BDC5

Protein Details

Accession

A0A4Q1BDC5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-108	VLNHPTKKANPLRGSRKPLPPLRD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
97-102	RGSRKP

Subcellular Location(s)

nucl 8, mito 6, cyto 5, extr 2, pero 2, plas 1, E.R. 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54

Amino Acid Sequences

MSSSPSPLRPPLPASPALPSPPPSESFFSELDGTASVLEHSALDFGWDDSRIDPKSLNLVSWKLGIDFNVQDDINKRGFNAISTVLNHPTKKANPLRGSRKPLPPLRDPPPILPKPPPPSAYDPYLQTVTPLYDTLINAQASSSSSSGGEYDLQQPGRPDLPSLSSVPELFFDPDFDLGKPSTWEEVVGNAGPALKSRFSDNLDVLENHLVHEITQRSASFFSALSNLQDLQSESSTCLSRIAELQEALREVGDKQARKGLEIIDAQEELRILRTVEQNVKQIGDLNDMLNRARNVVADGDWATGLNQIGDIVNWWERHGVGEKGDFQSSLPSPTEVKSTSPPVSQSLPLSSLASLSTLPATVSEITSQISVLLEAALTAQLLAMLSTVEETPEFDKDAFKMCMEPLIGGLVRCGTPEALSKLWREVVITSIRDASRKHLPLLQSDEEVGEDGKIDIKGTSLVGALKTMDHNRFLLLTVQINSASLSRLERVQIMGELLQEVLTATCSLSPLTISNRTLDVTASLKTNPTPSLHPLEILTAGCEVANARASKILASRSDQHASLSLEEFVELFQINWEFILATETLAKRMIVPLRGVTATQARAFLVAYHAVRLTKSAKSVEDELWTQIDVPPSLQHIVDLLVQSAVSDPPECNIPPPPAITNGAAGPQKTLSIEERNFFVVRATMETLELLEDYLKIVINLELVVTDVMSRIVEFLKSFNSRTCQVVLGAGAMRSAGLKNITAKHLALASQSLSVVVALIPYIREFVRRHLSPKQAVMLTEFDKLKRDFQEHQNEIHAKLVAIMSDRLAVHCASLRDIDWESTSEKNGPSLYAELLVKETATLHKVLSKYLPAQTVESVMSEVLGAIVYRVGEEYKKVELKSEEAKRRMLQDATLITQRLSPLCSTDNTLTVLETLVRDKPTPRKMSQTMAGLLRRRGSSSVKPAPASLEKEESIVDPGEDEEHALEDPPDLPEETPVVVNGETSQVSKEDSQPLDPVEQVETTEPANPPDPPDRGEQTGQTQEETSEVLDVREEQVDTGPATPPKETDKAPAVPSKLVDGNRLDETQEGEVETLDQSQDKLNDPIQAEEKADGEKEMEGKGGEETESGPRVPDKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.42
3	0.44
4	0.43
5	0.4
6	0.36
7	0.34
8	0.34
9	0.35
10	0.34
11	0.35
12	0.35
13	0.35
14	0.33
15	0.32
16	0.3
17	0.27
18	0.23
19	0.19
20	0.16
21	0.12
22	0.11
23	0.09
24	0.08
25	0.08
26	0.07
27	0.06
28	0.07
29	0.06
30	0.07
31	0.08
32	0.08
33	0.1
34	0.11
35	0.12
36	0.13
37	0.2
38	0.2
39	0.21
40	0.21
41	0.21
42	0.29
43	0.29
44	0.29
45	0.28
46	0.28
47	0.29
48	0.3
49	0.29
50	0.22
51	0.22
52	0.21
53	0.21
54	0.2
55	0.2
56	0.22
57	0.21
58	0.21
59	0.22
60	0.26
61	0.24
62	0.23
63	0.22
64	0.23
65	0.23
66	0.22
67	0.24
68	0.22
69	0.22
70	0.25
71	0.28
72	0.31
73	0.36
74	0.35
75	0.34
76	0.38
77	0.38
78	0.46
79	0.51
80	0.54
81	0.57
82	0.67
83	0.75
84	0.77
85	0.83
86	0.81
87	0.82
88	0.81
89	0.8
90	0.77
91	0.76
92	0.75
93	0.73
94	0.74
95	0.68
96	0.67
97	0.69
98	0.67
99	0.63
100	0.61
101	0.63
102	0.6
103	0.63
104	0.58
105	0.53
106	0.56
107	0.56
108	0.55
109	0.49
110	0.45
111	0.42
112	0.41
113	0.35
114	0.28
115	0.24
116	0.21
117	0.18
118	0.16
119	0.13
120	0.14
121	0.15
122	0.17
123	0.21
124	0.19
125	0.18
126	0.17
127	0.17
128	0.15
129	0.18
130	0.15
131	0.1
132	0.1
133	0.11
134	0.11
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.16
139	0.2
140	0.21
141	0.22
142	0.23
143	0.25
144	0.27
145	0.25
146	0.22
147	0.19
148	0.22
149	0.23
150	0.23
151	0.23
152	0.21
153	0.21
154	0.2
155	0.19
156	0.17
157	0.17
158	0.15
159	0.14
160	0.13
161	0.15
162	0.16
163	0.15
164	0.16
165	0.15
166	0.16
167	0.16
168	0.16
169	0.16
170	0.15
171	0.16
172	0.13
173	0.14
174	0.16
175	0.15
176	0.13
177	0.11
178	0.12
179	0.1
180	0.12
181	0.13
182	0.12
183	0.13
184	0.16
185	0.21
186	0.23
187	0.28
188	0.27
189	0.27
190	0.29
191	0.29
192	0.28
193	0.27
194	0.23
195	0.19
196	0.19
197	0.16
198	0.13
199	0.19
200	0.18
201	0.15
202	0.17
203	0.17
204	0.17
205	0.19
206	0.19
207	0.14
208	0.13
209	0.13
210	0.13
211	0.13
212	0.13
213	0.14
214	0.14
215	0.13
216	0.14
217	0.13
218	0.14
219	0.14
220	0.14
221	0.13
222	0.15
223	0.15
224	0.15
225	0.16
226	0.13
227	0.13
228	0.15
229	0.17
230	0.17
231	0.17
232	0.17
233	0.17
234	0.18
235	0.17
236	0.14
237	0.12
238	0.1
239	0.16
240	0.21
241	0.21
242	0.22
243	0.27
244	0.27
245	0.28
246	0.29
247	0.23
248	0.23
249	0.24
250	0.24
251	0.2
252	0.21
253	0.19
254	0.18
255	0.17
256	0.11
257	0.11
258	0.1
259	0.08
260	0.12
261	0.16
262	0.2
263	0.28
264	0.31
265	0.34
266	0.34
267	0.34
268	0.3
269	0.31
270	0.28
271	0.24
272	0.22
273	0.19
274	0.19
275	0.2
276	0.2
277	0.19
278	0.17
279	0.15
280	0.14
281	0.13
282	0.13
283	0.13
284	0.13
285	0.12
286	0.13
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.09
291	0.1
292	0.09
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.12
304	0.12
305	0.14
306	0.17
307	0.16
308	0.14
309	0.17
310	0.2
311	0.22
312	0.22
313	0.2
314	0.17
315	0.21
316	0.19
317	0.2
318	0.17
319	0.16
320	0.17
321	0.17
322	0.21
323	0.16
324	0.18
325	0.19
326	0.23
327	0.24
328	0.25
329	0.26
330	0.25
331	0.27
332	0.26
333	0.24
334	0.2
335	0.19
336	0.19
337	0.18
338	0.15
339	0.13
340	0.11
341	0.1
342	0.08
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.05
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.07
380	0.07
381	0.09
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.15
386	0.15
387	0.14
388	0.14
389	0.13
390	0.15
391	0.15
392	0.14
393	0.09
394	0.1
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.08
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.06
403	0.06
404	0.09
405	0.12
406	0.13
407	0.15
408	0.16
409	0.17
410	0.18
411	0.17
412	0.15
413	0.12
414	0.15
415	0.17
416	0.16
417	0.15
418	0.18
419	0.18
420	0.2
421	0.2
422	0.2
423	0.25
424	0.26
425	0.27
426	0.26
427	0.27
428	0.3
429	0.36
430	0.33
431	0.25
432	0.24
433	0.22
434	0.19
435	0.18
436	0.14
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.07
446	0.06
447	0.07
448	0.06
449	0.07
450	0.06
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.09
455	0.12
456	0.13
457	0.14
458	0.14
459	0.14
460	0.14
461	0.14
462	0.14
463	0.11
464	0.12
465	0.12
466	0.12
467	0.12
468	0.11
469	0.11
470	0.09
471	0.09
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.08
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.05
487	0.05
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.03
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.06
499	0.09
500	0.13
501	0.13
502	0.14
503	0.15
504	0.15
505	0.15
506	0.13
507	0.12
508	0.09
509	0.1
510	0.1
511	0.09
512	0.1
513	0.1
514	0.12
515	0.11
516	0.12
517	0.13
518	0.15
519	0.2
520	0.19
521	0.19
522	0.18
523	0.17
524	0.17
525	0.14
526	0.11
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.05
531	0.05
532	0.04
533	0.08
534	0.07
535	0.08
536	0.09
537	0.09
538	0.1
539	0.11
540	0.13
541	0.11
542	0.14
543	0.17
544	0.2
545	0.22
546	0.21
547	0.19
548	0.2
549	0.19
550	0.18
551	0.15
552	0.11
553	0.1
554	0.1
555	0.09
556	0.06
557	0.06
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.09
574	0.09
575	0.08
576	0.11
577	0.13
578	0.12
579	0.13
580	0.12
581	0.14
582	0.14
583	0.14
584	0.12
585	0.13
586	0.13
587	0.12
588	0.12
589	0.1
590	0.11
591	0.11
592	0.09
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.1
598	0.1
599	0.1
600	0.12
601	0.13
602	0.11
603	0.14
604	0.15
605	0.15
606	0.17
607	0.2
608	0.19
609	0.19
610	0.18
611	0.17
612	0.15
613	0.14
614	0.12
615	0.11
616	0.11
617	0.09
618	0.09
619	0.08
620	0.1
621	0.11
622	0.1
623	0.08
624	0.07
625	0.08
626	0.09
627	0.09
628	0.07
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.07
633	0.06
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.06
638	0.08
639	0.08
640	0.09
641	0.12
642	0.13
643	0.14
644	0.15
645	0.16
646	0.16
647	0.18
648	0.17
649	0.15
650	0.14
651	0.16
652	0.16
653	0.15
654	0.13
655	0.11
656	0.11
657	0.1
658	0.12
659	0.11
660	0.17
661	0.19
662	0.19
663	0.2
664	0.22
665	0.22
666	0.2
667	0.17
668	0.12
669	0.11
670	0.12
671	0.12
672	0.1
673	0.1
674	0.1
675	0.1
676	0.08
677	0.08
678	0.05
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.05
683	0.05
684	0.04
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.03
696	0.04
697	0.04
698	0.04
699	0.04
700	0.05
701	0.06
702	0.06
703	0.07
704	0.12
705	0.14
706	0.15
707	0.17
708	0.2
709	0.21
710	0.23
711	0.24
712	0.19
713	0.18
714	0.18
715	0.15
716	0.13
717	0.12
718	0.1
719	0.08
720	0.07
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.07
727	0.11
728	0.14
729	0.16
730	0.17
731	0.17
732	0.16
733	0.16
734	0.16
735	0.13
736	0.11
737	0.1
738	0.09
739	0.09
740	0.08
741	0.07
742	0.06
743	0.06
744	0.05
745	0.04
746	0.03
747	0.03
748	0.04
749	0.04
750	0.06
751	0.05
752	0.1
753	0.11
754	0.18
755	0.26
756	0.28
757	0.33
758	0.39
759	0.46
760	0.45
761	0.47
762	0.46
763	0.38
764	0.37
765	0.35
766	0.31
767	0.25
768	0.26
769	0.24
770	0.2
771	0.24
772	0.25
773	0.27
774	0.28
775	0.31
776	0.32
777	0.41
778	0.51
779	0.48
780	0.49
781	0.51
782	0.49
783	0.45
784	0.41
785	0.32
786	0.21
787	0.2
788	0.19
789	0.12
790	0.12
791	0.11
792	0.09
793	0.11
794	0.12
795	0.1
796	0.12
797	0.11
798	0.1
799	0.12
800	0.13
801	0.11
802	0.12
803	0.12
804	0.14
805	0.15
806	0.16
807	0.14
808	0.15
809	0.16
810	0.16
811	0.17
812	0.17
813	0.16
814	0.17
815	0.16
816	0.15
817	0.15
818	0.15
819	0.14
820	0.14
821	0.14
822	0.12
823	0.13
824	0.13
825	0.11
826	0.09
827	0.1
828	0.09
829	0.11
830	0.11
831	0.1
832	0.14
833	0.15
834	0.16
835	0.18
836	0.2
837	0.22
838	0.25
839	0.28
840	0.25
841	0.27
842	0.26
843	0.25
844	0.22
845	0.18
846	0.15
847	0.11
848	0.09
849	0.08
850	0.07
851	0.05
852	0.04
853	0.04
854	0.03
855	0.04
856	0.04
857	0.04
858	0.05
859	0.06
860	0.07
861	0.09
862	0.11
863	0.17
864	0.21
865	0.21
866	0.25
867	0.26
868	0.3
869	0.37
870	0.45
871	0.48
872	0.47
873	0.52
874	0.5
875	0.52
876	0.53
877	0.44
878	0.36
879	0.32
880	0.32
881	0.31
882	0.31
883	0.28
884	0.23
885	0.23
886	0.23
887	0.19
888	0.17
889	0.15
890	0.14
891	0.16
892	0.17
893	0.2
894	0.2
895	0.21
896	0.22
897	0.21
898	0.19
899	0.17
900	0.16
901	0.12
902	0.12
903	0.12
904	0.13
905	0.15
906	0.16
907	0.22
908	0.31
909	0.39
910	0.46
911	0.47
912	0.53
913	0.55
914	0.6
915	0.6
916	0.56
917	0.51
918	0.49
919	0.52
920	0.47
921	0.45
922	0.43
923	0.39
924	0.35
925	0.34
926	0.35
927	0.37
928	0.43
929	0.49
930	0.49
931	0.49
932	0.48
933	0.5
934	0.5
935	0.46
936	0.4
937	0.36
938	0.32
939	0.32
940	0.32
941	0.26
942	0.23
943	0.19
944	0.14
945	0.1
946	0.1
947	0.11
948	0.1
949	0.1
950	0.08
951	0.08
952	0.08
953	0.08
954	0.08
955	0.08
956	0.09
957	0.09
958	0.11
959	0.11
960	0.11
961	0.12
962	0.13
963	0.13
964	0.12
965	0.12
966	0.12
967	0.11
968	0.11
969	0.1
970	0.12
971	0.11
972	0.11
973	0.12
974	0.11
975	0.14
976	0.16
977	0.19
978	0.25
979	0.26
980	0.27
981	0.28
982	0.3
983	0.29
984	0.28
985	0.25
986	0.19
987	0.17
988	0.16
989	0.16
990	0.15
991	0.14
992	0.18
993	0.17
994	0.18
995	0.2
996	0.19
997	0.23
998	0.28
999	0.3
1000	0.28
1001	0.34
1002	0.36
1003	0.38
1004	0.4
1005	0.39
1006	0.39
1007	0.44
1008	0.42
1009	0.37
1010	0.33
1011	0.28
1012	0.27
1013	0.24
1014	0.18
1015	0.13
1016	0.12
1017	0.11
1018	0.11
1019	0.12
1020	0.13
1021	0.14
1022	0.14
1023	0.12
1024	0.13
1025	0.15
1026	0.15
1027	0.15
1028	0.18
1029	0.19
1030	0.21
1031	0.21
1032	0.22
1033	0.26
1034	0.3
1035	0.3
1036	0.32
1037	0.36
1038	0.4
1039	0.44
1040	0.48
1041	0.45
1042	0.43
1043	0.42
1044	0.41
1045	0.39
1046	0.35
1047	0.36
1048	0.33
1049	0.34
1050	0.35
1051	0.34
1052	0.3
1053	0.26
1054	0.27
1055	0.24
1056	0.21
1057	0.18
1058	0.14
1059	0.13
1060	0.14
1061	0.13
1062	0.11
1063	0.1
1064	0.1
1065	0.1
1066	0.14
1067	0.17
1068	0.19
1069	0.22
1070	0.23
1071	0.28
1072	0.29
1073	0.33
1074	0.33
1075	0.33
1076	0.31
1077	0.28
1078	0.27
1079	0.24
1080	0.23
1081	0.18
1082	0.16
1083	0.16
1084	0.16
1085	0.16
1086	0.16
1087	0.14
1088	0.14
1089	0.15
1090	0.15
1091	0.13
1092	0.12
1093	0.13
1094	0.17
1095	0.19
1096	0.18
1097	0.19

A0A4Q1BDC5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer