FuNGI

A0A4Q1BMC1

Protein Details

Accession

A0A4Q1BMC1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
118-137	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic
606-628	VEEKLSKRQRRLLRKRKRDEAGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
611-623	SKRQRRLLRKRKR

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 10, mito_nucl 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MKTLTDANSQGVPALFRWLSRKYPKIVARVIEDTPSRVQSSDGELVDVPLRYENPNPNGFEVDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEDMMVEIFKYTERVVNMAKPRKVLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAVEKEEERREAIRLFEAMGHPVSAETRNQKSWDTNAITPGTPFMDLLSISLKYWISYKLTNDPGWKDLKIIISDSSVPGEGEHKIMDWIRRQRTHPGWDANTNHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFFQGSKDPQVCKNCGEPGHFAANCKGDKKIADPTVVIKAKPVDPKPFIFLDVACLREYLAVELNVTHQPFPFDLELAIDDWIFMIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDALLKIWRSELPRMGGYLTNHGKVNLDRAGVILEGLAKSEDEIFAKRREDEERQDHNSKRRRIEDHRRQDEAKAAKESGRSATPAQGSMQLNGQEYVAVTPAATARGGPLHPSLPTRPGFDLVPKVDLEKQTNGNASLGGSAPDKTAKNANLTAAQLLKAELEGDDTSPEDATEVKEGPKSDTTAKEPSANPEDDGEPVVPSEDVEVEAEAVAGAEDEDVAEDVDEDTPVEEKLSKRQRRLLRKRKRDEAGLDEEEDDDDDDELEAPPNPEDDQPVPKKKLKVNTDGTVDGYVDDVRLWEPGYRERYYRQKFGVELSDTEFIDQITKHYMEGLCWVLEYYYQGVPAWDWYYPYHYAPFAQDFHDVGKMKIEFKVAEPFKPFAQLLGVFPAASRKHLPEPLQGLMTDPMSPIIDFYPEDFDIDMNGKKMAWQGVALLPFIDQTRLLTALKSHEDELTDEEKRRNRWGDNVMFIAEENKLYTDLAGLYTLKAGQKPIPLDPVASKGITGAVMADTNCVPHSALDSPLPNIPECPDLTNNISISVRYYFPRQAHPHVSRLLRGFRPPPPVLTEGDKDWVRRGGQGAGGRDRRNGPGTGGQSQRNGSQSVQNGRPRNPSGTYTPQGGYGSNGTYTPQPLPSGYGVYNGQSGTTAGYGGYGGYGGYEGQNPYSGTYGGAGTYARPQQAYGGYAPPPPRNPYAPPPNPYASLPPPPSYNAPYSKPPPAFPPYPPSSYQSRRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.18
3	0.19
4	0.24
5	0.28
6	0.36
7	0.44
8	0.51
9	0.49
10	0.59
11	0.63
12	0.67
13	0.68
14	0.64
15	0.61
16	0.59
17	0.55
18	0.51
19	0.45
20	0.4
21	0.38
22	0.36
23	0.31
24	0.27
25	0.26
26	0.23
27	0.29
28	0.31
29	0.27
30	0.26
31	0.25
32	0.26
33	0.28
34	0.25
35	0.19
36	0.15
37	0.17
38	0.17
39	0.24
40	0.31
41	0.34
42	0.4
43	0.41
44	0.41
45	0.43
46	0.4
47	0.36
48	0.32
49	0.28
50	0.23
51	0.21
52	0.19
53	0.15
54	0.15
55	0.13
56	0.09
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.09
61	0.09
62	0.12
63	0.17
64	0.2
65	0.2
66	0.26
67	0.32
68	0.36
69	0.41
70	0.4
71	0.4
72	0.38
73	0.41
74	0.36
75	0.32
76	0.28
77	0.23
78	0.21
79	0.17
80	0.15
81	0.11
82	0.1
83	0.07
84	0.09
85	0.09
86	0.13
87	0.13
88	0.17
89	0.2
90	0.28
91	0.37
92	0.45
93	0.47
94	0.45
95	0.45
96	0.45
97	0.43
98	0.37
99	0.31
100	0.28
101	0.26
102	0.24
103	0.24
104	0.21
105	0.2
106	0.19
107	0.16
108	0.1
109	0.13
110	0.19
111	0.26
112	0.36
113	0.45
114	0.55
115	0.66
116	0.73
117	0.79
118	0.81
119	0.77
120	0.74
121	0.74
122	0.71
123	0.68
124	0.68
125	0.61
126	0.57
127	0.56
128	0.5
129	0.41
130	0.39
131	0.33
132	0.28
133	0.26
134	0.25
135	0.23
136	0.25
137	0.25
138	0.21
139	0.21
140	0.21
141	0.21
142	0.2
143	0.19
144	0.17
145	0.14
146	0.13
147	0.14
148	0.13
149	0.17
150	0.22
151	0.26
152	0.3
153	0.32
154	0.35
155	0.36
156	0.39
157	0.43
158	0.41
159	0.38
160	0.39
161	0.39
162	0.37
163	0.33
164	0.3
165	0.23
166	0.17
167	0.15
168	0.11
169	0.1
170	0.09
171	0.1
172	0.11
173	0.1
174	0.1
175	0.13
176	0.13
177	0.12
178	0.14
179	0.16
180	0.17
181	0.2
182	0.23
183	0.29
184	0.34
185	0.37
186	0.41
187	0.41
188	0.41
189	0.41
190	0.38
191	0.31
192	0.29
193	0.3
194	0.26
195	0.25
196	0.22
197	0.2
198	0.21
199	0.21
200	0.19
201	0.15
202	0.13
203	0.12
204	0.13
205	0.11
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.12
210	0.15
211	0.19
212	0.25
213	0.34
214	0.41
215	0.47
216	0.49
217	0.56
218	0.61
219	0.64
220	0.64
221	0.63
222	0.59
223	0.61
224	0.62
225	0.57
226	0.54
227	0.46
228	0.38
229	0.3
230	0.26
231	0.18
232	0.17
233	0.12
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.04
244	0.05
245	0.06
246	0.07
247	0.08
248	0.14
249	0.16
250	0.16
251	0.2
252	0.22
253	0.26
254	0.27
255	0.28
256	0.25
257	0.27
258	0.26
259	0.23
260	0.24
261	0.2
262	0.21
263	0.23
264	0.24
265	0.28
266	0.34
267	0.35
268	0.33
269	0.37
270	0.38
271	0.38
272	0.39
273	0.35
274	0.33
275	0.39
276	0.36
277	0.34
278	0.33
279	0.35
280	0.33
281	0.31
282	0.28
283	0.23
284	0.23
285	0.25
286	0.3
287	0.28
288	0.28
289	0.28
290	0.29
291	0.36
292	0.37
293	0.33
294	0.26
295	0.26
296	0.29
297	0.36
298	0.38
299	0.36
300	0.38
301	0.4
302	0.41
303	0.39
304	0.36
305	0.29
306	0.25
307	0.23
308	0.22
309	0.21
310	0.18
311	0.17
312	0.15
313	0.15
314	0.16
315	0.11
316	0.11
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.13
321	0.14
322	0.15
323	0.14
324	0.12
325	0.13
326	0.13
327	0.16
328	0.14
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.1
334	0.11
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.03
343	0.03
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.08
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.11
359	0.12
360	0.11
361	0.11
362	0.1
363	0.07
364	0.05
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.07
370	0.1
371	0.13
372	0.17
373	0.19
374	0.21
375	0.22
376	0.23
377	0.23
378	0.23
379	0.21
380	0.26
381	0.25
382	0.24
383	0.23
384	0.23
385	0.23
386	0.2
387	0.24
388	0.18
389	0.16
390	0.14
391	0.14
392	0.14
393	0.12
394	0.11
395	0.07
396	0.06
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.05
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.09
406	0.11
407	0.14
408	0.16
409	0.17
410	0.19
411	0.23
412	0.28
413	0.34
414	0.4
415	0.44
416	0.5
417	0.56
418	0.58
419	0.62
420	0.65
421	0.64
422	0.61
423	0.61
424	0.62
425	0.65
426	0.72
427	0.74
428	0.77
429	0.77
430	0.74
431	0.69
432	0.62
433	0.59
434	0.53
435	0.45
436	0.37
437	0.31
438	0.29
439	0.29
440	0.29
441	0.24
442	0.2
443	0.18
444	0.16
445	0.19
446	0.18
447	0.17
448	0.17
449	0.21
450	0.21
451	0.19
452	0.21
453	0.18
454	0.18
455	0.17
456	0.16
457	0.1
458	0.09
459	0.09
460	0.07
461	0.05
462	0.04
463	0.04
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.09
473	0.09
474	0.11
475	0.13
476	0.14
477	0.17
478	0.19
479	0.2
480	0.19
481	0.2
482	0.19
483	0.19
484	0.23
485	0.18
486	0.19
487	0.16
488	0.17
489	0.19
490	0.21
491	0.21
492	0.19
493	0.2
494	0.21
495	0.22
496	0.21
497	0.18
498	0.16
499	0.13
500	0.11
501	0.09
502	0.08
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.1
507	0.1
508	0.1
509	0.15
510	0.15
511	0.18
512	0.18
513	0.19
514	0.18
515	0.18
516	0.18
517	0.15
518	0.13
519	0.1
520	0.09
521	0.08
522	0.06
523	0.06
524	0.04
525	0.06
526	0.05
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.04
534	0.05
535	0.05
536	0.06
537	0.07
538	0.07
539	0.09
540	0.1
541	0.12
542	0.13
543	0.14
544	0.16
545	0.18
546	0.21
547	0.23
548	0.23
549	0.26
550	0.25
551	0.27
552	0.29
553	0.26
554	0.23
555	0.2
556	0.2
557	0.16
558	0.17
559	0.12
560	0.08
561	0.07
562	0.07
563	0.06
564	0.05
565	0.05
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.03
575	0.02
576	0.02
577	0.02
578	0.02
579	0.02
580	0.02
581	0.02
582	0.02
583	0.02
584	0.02
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.04
589	0.03
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.05
594	0.07
595	0.07
596	0.16
597	0.27
598	0.32
599	0.35
600	0.44
601	0.52
602	0.62
603	0.73
604	0.75
605	0.76
606	0.81
607	0.86
608	0.87
609	0.82
610	0.77
611	0.7
612	0.66
613	0.62
614	0.53
615	0.45
616	0.36
617	0.32
618	0.26
619	0.21
620	0.14
621	0.07
622	0.05
623	0.04
624	0.04
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.07
632	0.08
633	0.08
634	0.1
635	0.12
636	0.19
637	0.26
638	0.33
639	0.37
640	0.4
641	0.45
642	0.47
643	0.54
644	0.52
645	0.55
646	0.55
647	0.54
648	0.53
649	0.49
650	0.45
651	0.36
652	0.3
653	0.21
654	0.15
655	0.1
656	0.07
657	0.06
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.06
662	0.07
663	0.09
664	0.15
665	0.2
666	0.21
667	0.23
668	0.28
669	0.38
670	0.41
671	0.45
672	0.42
673	0.39
674	0.39
675	0.4
676	0.41
677	0.32
678	0.28
679	0.25
680	0.25
681	0.22
682	0.21
683	0.19
684	0.12
685	0.12
686	0.11
687	0.09
688	0.1
689	0.1
690	0.1
691	0.13
692	0.13
693	0.12
694	0.15
695	0.15
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.08
700	0.08
701	0.09
702	0.09
703	0.08
704	0.08
705	0.08
706	0.08
707	0.09
708	0.1
709	0.1
710	0.08
711	0.09
712	0.09
713	0.14
714	0.15
715	0.16
716	0.16
717	0.15
718	0.16
719	0.17
720	0.2
721	0.17
722	0.17
723	0.17
724	0.16
725	0.17
726	0.22
727	0.2
728	0.17
729	0.21
730	0.2
731	0.2
732	0.21
733	0.22
734	0.17
735	0.18
736	0.28
737	0.24
738	0.26
739	0.28
740	0.28
741	0.26
742	0.29
743	0.27
744	0.18
745	0.19
746	0.17
747	0.14
748	0.16
749	0.16
750	0.12
751	0.12
752	0.18
753	0.15
754	0.17
755	0.18
756	0.18
757	0.23
758	0.28
759	0.31
760	0.31
761	0.35
762	0.34
763	0.33
764	0.3
765	0.27
766	0.23
767	0.21
768	0.15
769	0.1
770	0.1
771	0.09
772	0.09
773	0.08
774	0.07
775	0.08
776	0.08
777	0.09
778	0.13
779	0.12
780	0.13
781	0.12
782	0.12
783	0.12
784	0.14
785	0.14
786	0.1
787	0.1
788	0.1
789	0.11
790	0.13
791	0.14
792	0.12
793	0.11
794	0.13
795	0.15
796	0.17
797	0.16
798	0.13
799	0.11
800	0.11
801	0.11
802	0.1
803	0.07
804	0.07
805	0.08
806	0.11
807	0.11
808	0.1
809	0.12
810	0.16
811	0.19
812	0.2
813	0.19
814	0.18
815	0.19
816	0.19
817	0.22
818	0.23
819	0.23
820	0.24
821	0.28
822	0.32
823	0.34
824	0.41
825	0.42
826	0.39
827	0.44
828	0.51
829	0.51
830	0.49
831	0.48
832	0.41
833	0.35
834	0.33
835	0.26
836	0.18
837	0.13
838	0.09
839	0.08
840	0.08
841	0.08
842	0.08
843	0.07
844	0.07
845	0.07
846	0.08
847	0.08
848	0.08
849	0.08
850	0.11
851	0.11
852	0.12
853	0.14
854	0.15
855	0.2
856	0.22
857	0.24
858	0.27
859	0.26
860	0.27
861	0.26
862	0.27
863	0.25
864	0.22
865	0.2
866	0.15
867	0.15
868	0.13
869	0.11
870	0.08
871	0.06
872	0.07
873	0.08
874	0.09
875	0.08
876	0.09
877	0.09
878	0.09
879	0.09
880	0.08
881	0.11
882	0.11
883	0.13
884	0.16
885	0.17
886	0.18
887	0.21
888	0.22
889	0.19
890	0.18
891	0.18
892	0.18
893	0.17
894	0.2
895	0.19
896	0.21
897	0.24
898	0.27
899	0.25
900	0.24
901	0.23
902	0.19
903	0.2
904	0.19
905	0.18
906	0.16
907	0.21
908	0.25
909	0.27
910	0.37
911	0.4
912	0.46
913	0.54
914	0.56
915	0.57
916	0.57
917	0.57
918	0.52
919	0.52
920	0.51
921	0.45
922	0.47
923	0.47
924	0.46
925	0.53
926	0.49
927	0.47
928	0.45
929	0.44
930	0.4
931	0.4
932	0.37
933	0.3
934	0.36
935	0.35
936	0.3
937	0.31
938	0.33
939	0.28
940	0.28
941	0.29
942	0.25
943	0.29
944	0.33
945	0.35
946	0.4
947	0.45
948	0.44
949	0.46
950	0.46
951	0.45
952	0.43
953	0.39
954	0.34
955	0.35
956	0.38
957	0.41
958	0.43
959	0.42
960	0.42
961	0.42
962	0.42
963	0.37
964	0.34
965	0.29
966	0.3
967	0.34
968	0.39
969	0.45
970	0.49
971	0.53
972	0.55
973	0.62
974	0.59
975	0.57
976	0.53
977	0.49
978	0.49
979	0.52
980	0.5
981	0.46
982	0.42
983	0.4
984	0.37
985	0.33
986	0.28
987	0.22
988	0.2
989	0.17
990	0.17
991	0.15
992	0.16
993	0.19
994	0.18
995	0.18
996	0.18
997	0.18
998	0.21
999	0.22
1000	0.23
1001	0.21
1002	0.22
1003	0.21
1004	0.21
1005	0.22
1006	0.19
1007	0.17
1008	0.14
1009	0.14
1010	0.11
1011	0.1
1012	0.09
1013	0.07
1014	0.07
1015	0.07
1016	0.06
1017	0.06
1018	0.05
1019	0.04
1020	0.04
1021	0.05
1022	0.05
1023	0.06
1024	0.09
1025	0.1
1026	0.11
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.15
1030	0.17
1031	0.16
1032	0.13
1033	0.14
1034	0.13
1035	0.1
1036	0.11
1037	0.1
1038	0.09
1039	0.15
1040	0.19
1041	0.19
1042	0.19
1043	0.19
1044	0.23
1045	0.26
1046	0.27
1047	0.24
1048	0.24
1049	0.25
1050	0.3
1051	0.34
1052	0.37
1053	0.39
1054	0.41
1055	0.44
1056	0.45
1057	0.49
1058	0.54
1059	0.61
1060	0.63
1061	0.62
1062	0.63
1063	0.62
1064	0.6
1065	0.56
1066	0.53
1067	0.48
1068	0.49
1069	0.49
1070	0.45
1071	0.44
1072	0.45
1073	0.48
1074	0.45
1075	0.47
1076	0.43
1077	0.44
1078	0.5
1079	0.53
1080	0.58
1081	0.56
1082	0.53
1083	0.53
1084	0.55
1085	0.54
1086	0.51
1087	0.54
1088	0.51
1089	0.53
1090	0.53
1091	0.5
1092	0.52

A0A4Q1BMC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer