Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q1B8B6

Protein Details
Accession A0A4Q1B8B6    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-28TLRNSLARRNHKERAQPLHRTRLGHydrophilic
35-63DYVHRARDYRSKQDRIRKLREKAAFRNKDBasic
297-317RNGERKRWEGKMWKWKAERRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-55KQDRIRKLRE
161-170GERKRKGKGK
300-317ERKRWEGKMWKWKAERRR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8.5, cyto_mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSASTLRNSLARRNHKERAQPLHRTRLGLLEKHKDYVHRARDYRSKQDRIRKLREKAAFRNKDEFYWGMVKGKTVEGVAVGDRGNKALDADLVKILKTQDMGYVRVQIAQDEKKISKLRRELEVITPPGGSDSDWDAAAELAEVEKLAEMGIVIKAREDGGERKRKGKGKDLPSGHVVFAERQEEFDSYNPNHSQPKSPVLEEELAEDLGWIETVDTSNKTKKTSVSHPVPSEELEEDAREHRLSLLISLSALLRRVRLLRQAESRLHITKALMGKGASRKVREAQWVEDDTQPEDRNGERKRWEGKMWKWKAERRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.72
3 0.79
4 0.8
5 0.81
6 0.79
7 0.8
8 0.8
9 0.82
10 0.78
11 0.71
12 0.63
13 0.61
14 0.58
15 0.53
16 0.53
17 0.52
18 0.51
19 0.51
20 0.51
21 0.45
22 0.47
23 0.51
24 0.53
25 0.52
26 0.53
27 0.57
28 0.66
29 0.69
30 0.72
31 0.72
32 0.72
33 0.72
34 0.79
35 0.82
36 0.82
37 0.86
38 0.85
39 0.82
40 0.82
41 0.82
42 0.81
43 0.81
44 0.82
45 0.8
46 0.75
47 0.76
48 0.68
49 0.6
50 0.56
51 0.46
52 0.39
53 0.34
54 0.3
55 0.27
56 0.26
57 0.25
58 0.23
59 0.22
60 0.19
61 0.15
62 0.14
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.14
87 0.16
88 0.18
89 0.18
90 0.22
91 0.21
92 0.22
93 0.22
94 0.18
95 0.21
96 0.21
97 0.22
98 0.22
99 0.22
100 0.26
101 0.32
102 0.34
103 0.37
104 0.42
105 0.43
106 0.44
107 0.48
108 0.44
109 0.43
110 0.46
111 0.4
112 0.33
113 0.3
114 0.24
115 0.21
116 0.19
117 0.13
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.06
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.03
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.12
147 0.2
148 0.3
149 0.31
150 0.36
151 0.42
152 0.48
153 0.5
154 0.54
155 0.54
156 0.53
157 0.6
158 0.58
159 0.55
160 0.53
161 0.5
162 0.4
163 0.32
164 0.25
165 0.17
166 0.16
167 0.15
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.15
175 0.14
176 0.19
177 0.19
178 0.2
179 0.25
180 0.25
181 0.29
182 0.28
183 0.34
184 0.32
185 0.31
186 0.3
187 0.29
188 0.29
189 0.24
190 0.23
191 0.16
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.04
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.06
203 0.08
204 0.11
205 0.17
206 0.19
207 0.21
208 0.23
209 0.27
210 0.32
211 0.38
212 0.45
213 0.47
214 0.53
215 0.53
216 0.53
217 0.5
218 0.44
219 0.38
220 0.29
221 0.23
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.13
228 0.13
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.1
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.16
244 0.19
245 0.26
246 0.31
247 0.35
248 0.42
249 0.48
250 0.49
251 0.5
252 0.52
253 0.47
254 0.43
255 0.38
256 0.31
257 0.3
258 0.3
259 0.28
260 0.24
261 0.22
262 0.27
263 0.32
264 0.39
265 0.39
266 0.37
267 0.4
268 0.43
269 0.48
270 0.52
271 0.49
272 0.47
273 0.49
274 0.5
275 0.48
276 0.47
277 0.43
278 0.36
279 0.38
280 0.34
281 0.27
282 0.26
283 0.26
284 0.32
285 0.34
286 0.4
287 0.4
288 0.47
289 0.53
290 0.57
291 0.63
292 0.64
293 0.71
294 0.74
295 0.76
296 0.78
297 0.8