Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q1BA78

Protein Details
Accession A0A4Q1BA78    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-148TATTPAKIPKFKKKKKVAGEDGEEREMRRKEKKEKRREEKENRAEVEEBasic
170-194RIDAIGKKPKNTRRKRKGEDVDILDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-140KIPKFKKKKKVAGEDGEEREMRRKEKKEKRREEK
175-186GKKPKNTRRKRK
438-443KMAKKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPSPPVQPRAMTSTTSDLYAQVFGADSDDELSEEEDDQPRRQVAFPPRPVQPVVEDATSHVDDYDEDEAEVEAPIVNDRDADEEEEEEGAGDVYVPATATTPAKIPKFKKKKKVAGEDGEEREMRRKEKKEKRREEKENRAEVEEEEEEEQPVYDEATQRRMALEARIDAIGKKPKNTRRKRKGEDVDILDEYHESICIRLRDRMLAAAEKDKASNDAKLPATAKLAMLDEVMSVLRNQTLTQAITDNQVLDAVRVWLEPIYPSGALPAVGIQKAIFEVLPKMDLDTQILKECRLGPIVLFYTKTKRVTPLINRQADNLVQMWSRPIIKRPTTLNLNPLTSTETTRQGQTELDEVTDEDEEVVRERIKVLPKRFDAKAATKENEGRRGVRIRNNTDVQYTIVPVSNLLQGSGEQRNVSRIQADNRKFNRFARQIKMAKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.35
3 0.36
4 0.34
5 0.32
6 0.29
7 0.23
8 0.22
9 0.21
10 0.17
11 0.11
12 0.1
13 0.09
14 0.1
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.1
22 0.09
23 0.1
24 0.13
25 0.18
26 0.2
27 0.22
28 0.25
29 0.26
30 0.28
31 0.29
32 0.34
33 0.39
34 0.47
35 0.54
36 0.55
37 0.57
38 0.59
39 0.59
40 0.52
41 0.44
42 0.39
43 0.33
44 0.29
45 0.25
46 0.22
47 0.27
48 0.25
49 0.22
50 0.17
51 0.14
52 0.12
53 0.16
54 0.17
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.11
61 0.08
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.1
78 0.09
79 0.07
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.11
92 0.17
93 0.21
94 0.29
95 0.34
96 0.44
97 0.55
98 0.64
99 0.71
100 0.77
101 0.83
102 0.85
103 0.9
104 0.88
105 0.86
106 0.83
107 0.81
108 0.73
109 0.67
110 0.57
111 0.47
112 0.44
113 0.39
114 0.37
115 0.38
116 0.43
117 0.5
118 0.61
119 0.71
120 0.75
121 0.83
122 0.89
123 0.91
124 0.93
125 0.93
126 0.94
127 0.93
128 0.9
129 0.81
130 0.72
131 0.62
132 0.51
133 0.45
134 0.34
135 0.25
136 0.19
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.1
146 0.11
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.18
152 0.17
153 0.16
154 0.17
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.17
161 0.23
162 0.21
163 0.26
164 0.33
165 0.42
166 0.52
167 0.63
168 0.69
169 0.73
170 0.83
171 0.85
172 0.87
173 0.87
174 0.84
175 0.81
176 0.73
177 0.66
178 0.56
179 0.48
180 0.37
181 0.29
182 0.21
183 0.13
184 0.09
185 0.05
186 0.05
187 0.08
188 0.1
189 0.12
190 0.14
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.19
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.16
201 0.16
202 0.14
203 0.16
204 0.15
205 0.16
206 0.13
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.19
211 0.17
212 0.17
213 0.15
214 0.14
215 0.11
216 0.11
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.1
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.07
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.12
276 0.13
277 0.14
278 0.19
279 0.19
280 0.18
281 0.19
282 0.2
283 0.19
284 0.17
285 0.16
286 0.11
287 0.15
288 0.17
289 0.16
290 0.17
291 0.17
292 0.22
293 0.27
294 0.3
295 0.27
296 0.29
297 0.32
298 0.39
299 0.46
300 0.52
301 0.56
302 0.6
303 0.59
304 0.56
305 0.55
306 0.46
307 0.39
308 0.29
309 0.21
310 0.15
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.17
315 0.17
316 0.23
317 0.29
318 0.32
319 0.37
320 0.4
321 0.45
322 0.49
323 0.5
324 0.51
325 0.46
326 0.45
327 0.4
328 0.37
329 0.33
330 0.26
331 0.27
332 0.23
333 0.25
334 0.25
335 0.26
336 0.26
337 0.23
338 0.23
339 0.21
340 0.21
341 0.16
342 0.15
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.12
347 0.11
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.12
356 0.17
357 0.26
358 0.34
359 0.4
360 0.47
361 0.52
362 0.58
363 0.58
364 0.6
365 0.58
366 0.57
367 0.59
368 0.58
369 0.54
370 0.53
371 0.6
372 0.6
373 0.61
374 0.56
375 0.49
376 0.48
377 0.54
378 0.56
379 0.57
380 0.6
381 0.58
382 0.63
383 0.66
384 0.61
385 0.56
386 0.5
387 0.44
388 0.36
389 0.31
390 0.24
391 0.21
392 0.19
393 0.17
394 0.17
395 0.18
396 0.16
397 0.15
398 0.14
399 0.13
400 0.18
401 0.22
402 0.22
403 0.2
404 0.21
405 0.25
406 0.26
407 0.27
408 0.27
409 0.28
410 0.35
411 0.44
412 0.5
413 0.56
414 0.61
415 0.67
416 0.66
417 0.66
418 0.67
419 0.66
420 0.68
421 0.66
422 0.7
423 0.71