Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1M3C5

Protein Details
Accession A0A4V1M3C5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-271QKLGRFAAKIRRWRKPEPYRGKGIFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-268KLGRFAAKIRRWRKPEPYRGKG
277-284KLKEIKKK
Subcellular Location(s) mito 22, cyto_nucl 3.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000702  Ribosomal_L6  
IPR020040  Ribosomal_L6_a/b-dom  
IPR036789  Ribosomal_L6_a/b-dom_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00347  Ribosomal_L6  
Amino Acid Sequences MKFSSQHVLRPLRHTRSFHSTHMISSHIGLKPIPIPPSVVLSLPPSSISPTLPMTSPLAQRYITVTGPLGKHVVPILPPIILSPLSQTSLFSSSSPSPSSTSTSSTDDATQQKESIEQPTPTLSLTIHNRDSKQHRSLWGLTRSLIHNAVQGVTIGYTLELRLVGVGYRASVEPIPPVFLALQAQVPRIARPNKPGSPPYVLPPLPENRLNIKLGYAHPVLIDIPRDIEVETPQPTKIILRGTDKQKLGRFAAKIRRWRKPEPYRGKGIFVGDETIKLKEIKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.64
3 0.65
4 0.65
5 0.6
6 0.58
7 0.5
8 0.45
9 0.43
10 0.38
11 0.3
12 0.27
13 0.3
14 0.23
15 0.23
16 0.21
17 0.21
18 0.23
19 0.26
20 0.26
21 0.2
22 0.21
23 0.21
24 0.26
25 0.25
26 0.21
27 0.19
28 0.2
29 0.2
30 0.18
31 0.18
32 0.14
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.17
39 0.16
40 0.18
41 0.18
42 0.22
43 0.25
44 0.24
45 0.23
46 0.22
47 0.22
48 0.24
49 0.23
50 0.19
51 0.17
52 0.16
53 0.18
54 0.19
55 0.19
56 0.18
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.11
62 0.13
63 0.12
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.13
79 0.15
80 0.15
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.18
86 0.21
87 0.19
88 0.2
89 0.21
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.21
94 0.22
95 0.23
96 0.22
97 0.2
98 0.18
99 0.17
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.19
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.17
108 0.15
109 0.15
110 0.11
111 0.12
112 0.16
113 0.19
114 0.22
115 0.24
116 0.25
117 0.3
118 0.36
119 0.39
120 0.39
121 0.38
122 0.36
123 0.38
124 0.42
125 0.44
126 0.42
127 0.35
128 0.32
129 0.31
130 0.29
131 0.26
132 0.22
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.2
176 0.24
177 0.24
178 0.31
179 0.39
180 0.42
181 0.47
182 0.48
183 0.46
184 0.47
185 0.45
186 0.42
187 0.41
188 0.36
189 0.32
190 0.35
191 0.34
192 0.32
193 0.33
194 0.32
195 0.29
196 0.33
197 0.33
198 0.28
199 0.25
200 0.25
201 0.24
202 0.26
203 0.22
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.15
209 0.15
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.15
218 0.19
219 0.19
220 0.18
221 0.17
222 0.18
223 0.18
224 0.19
225 0.21
226 0.22
227 0.28
228 0.36
229 0.43
230 0.5
231 0.52
232 0.56
233 0.55
234 0.56
235 0.54
236 0.53
237 0.5
238 0.51
239 0.59
240 0.59
241 0.65
242 0.68
243 0.73
244 0.73
245 0.79
246 0.81
247 0.81
248 0.84
249 0.85
250 0.84
251 0.84
252 0.8
253 0.76
254 0.68
255 0.6
256 0.52
257 0.42
258 0.39
259 0.29
260 0.3
261 0.27
262 0.24
263 0.23
264 0.23