Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q1BH16

Protein Details
Accession A0A4Q1BH16    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-156DAEGDAKPRKPRQKRERRRQPDEGGDEBasic
163-189GENGLKSKAKPRKPRTKKPAREARIDEBasic
248-267VKSAKVVRGRRNPLGRKSFFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-123AQRRKENREKRAAAKKEG
135-149AKPRKPRQKRERRRQ
166-184GLKSKAKPRKPRTKKPARE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 12.5, cyto 12, mito_nucl 7.166, cyto_pero 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSVQEEIPNGAEALAAAPQVEEGPKVYVGNLSYTATEDEVREFMSQAGGEITSVELPQRFNRPSGYAFVGYKTLEQAQKAVEELNEKTLLDRAVRMQVARSKEESAQRRKENREKRAAAKKEGAEATTTDAEGDAKPRKPRQKRERRRQPDEGGDETLVEKEGENGLKSKAKPRKPRTKKPAREARIDEVEGEVSAAEGQVTTKERPRKPRMQLTGEASPTTIFVANLPFNVDDAALAAIFTNLSIRVKSAKVVRGRRNPLGRKSFFASKGFGFVEVEDHAQQQEAVDKVEGCMIGERKISAKIANQMKPVEEEQVAEAEAEAAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.07
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.15
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.15
20 0.16
21 0.17
22 0.15
23 0.16
24 0.14
25 0.14
26 0.13
27 0.14
28 0.13
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.09
43 0.11
44 0.15
45 0.23
46 0.24
47 0.25
48 0.28
49 0.3
50 0.3
51 0.33
52 0.33
53 0.29
54 0.28
55 0.27
56 0.26
57 0.23
58 0.22
59 0.2
60 0.2
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.17
68 0.13
69 0.14
70 0.15
71 0.17
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.14
78 0.15
79 0.13
80 0.18
81 0.19
82 0.18
83 0.2
84 0.24
85 0.27
86 0.28
87 0.28
88 0.26
89 0.29
90 0.37
91 0.42
92 0.47
93 0.52
94 0.58
95 0.64
96 0.7
97 0.76
98 0.78
99 0.78
100 0.79
101 0.76
102 0.76
103 0.79
104 0.75
105 0.7
106 0.67
107 0.59
108 0.54
109 0.49
110 0.41
111 0.31
112 0.26
113 0.24
114 0.18
115 0.16
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.09
120 0.13
121 0.14
122 0.18
123 0.24
124 0.31
125 0.42
126 0.5
127 0.61
128 0.68
129 0.75
130 0.82
131 0.88
132 0.93
133 0.93
134 0.92
135 0.9
136 0.84
137 0.81
138 0.75
139 0.66
140 0.56
141 0.46
142 0.37
143 0.29
144 0.23
145 0.15
146 0.09
147 0.06
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.1
154 0.14
155 0.15
156 0.23
157 0.3
158 0.38
159 0.48
160 0.57
161 0.67
162 0.73
163 0.84
164 0.86
165 0.89
166 0.9
167 0.9
168 0.91
169 0.84
170 0.82
171 0.76
172 0.71
173 0.64
174 0.55
175 0.45
176 0.34
177 0.3
178 0.21
179 0.16
180 0.09
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.05
188 0.08
189 0.1
190 0.16
191 0.25
192 0.31
193 0.41
194 0.5
195 0.57
196 0.63
197 0.72
198 0.74
199 0.72
200 0.72
201 0.68
202 0.66
203 0.57
204 0.48
205 0.38
206 0.3
207 0.24
208 0.19
209 0.14
210 0.07
211 0.07
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.11
235 0.12
236 0.16
237 0.21
238 0.27
239 0.35
240 0.45
241 0.54
242 0.61
243 0.68
244 0.73
245 0.77
246 0.79
247 0.79
248 0.8
249 0.73
250 0.67
251 0.66
252 0.65
253 0.59
254 0.54
255 0.47
256 0.37
257 0.39
258 0.35
259 0.3
260 0.23
261 0.18
262 0.18
263 0.16
264 0.18
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.14
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.17
278 0.16
279 0.12
280 0.17
281 0.17
282 0.19
283 0.2
284 0.21
285 0.2
286 0.23
287 0.24
288 0.22
289 0.26
290 0.32
291 0.4
292 0.44
293 0.47
294 0.46
295 0.46
296 0.47
297 0.43
298 0.39
299 0.3
300 0.26
301 0.23
302 0.22
303 0.21
304 0.16
305 0.15