Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1M307

Protein Details
Accession A0A4V1M307    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-67GTSSKTIQFQQQKKKKRRRPLPEPYSPADVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-57KKKKRRRP
Subcellular Location(s) nucl 9.5, mito 8, cyto_nucl 8, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030390  MeTrfase_TrmA_AS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
PS01230  TRMA_1  
Amino Acid Sequences MSASASPPSTPPPKRLKLDESLPTNGMILLESSIIPVGTSSKTIQFQQQKKKKRRRPLPEPYSPADVLFRDICDFLGPDYCQVILESRSEEEWVPPSGLEIQRILELRVGAFTVSGESLSLYEEDGKKWAVVVPFAHPGDLIRARIYKHDRFCSFGGLVDIIEYSEDYRGGEGDRRKYPENGCRYFGECGGCQLQPIPYPLQLLHKRRTVQLAYQRFSGLPFEQVPIIRETIGSPKQWGYRTKITPHFDAPPKSLQRMNAPIVVEEKRKKWECRIGFERKGRPGVMDIEECPIATPVLNEKLKEERARIEQTILTFKKGATLLLRDSLPPPSPIPGIGNPYRHITDEETHLAVTNHRQPVFERVGNYLFSFTAGSFFQNNNSILVPLTEHVQEAIFPSSLPPSDSPQDTTATITDDSASAPQPTHLVDTYCGSGLFGITLSSRFEKVAGVEINNDSIVAARKNAEMNGLEGKTTWLCGKAEDIFAGLPQEGFKGENSCVVVDPPRKGCDEPFLRQLLAFAPVTIVYVSCNVHTQARDVGWFLREAEKGEHQYVLESVRGFDLFPQVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.69
3 0.69
4 0.67
5 0.72
6 0.72
7 0.67
8 0.63
9 0.57
10 0.49
11 0.42
12 0.35
13 0.26
14 0.18
15 0.13
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.13
28 0.18
29 0.21
30 0.24
31 0.33
32 0.4
33 0.49
34 0.58
35 0.66
36 0.71
37 0.8
38 0.89
39 0.9
40 0.91
41 0.92
42 0.92
43 0.93
44 0.94
45 0.93
46 0.93
47 0.9
48 0.83
49 0.78
50 0.68
51 0.57
52 0.49
53 0.39
54 0.32
55 0.26
56 0.23
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.15
61 0.15
62 0.12
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.17
78 0.16
79 0.17
80 0.17
81 0.16
82 0.14
83 0.15
84 0.21
85 0.22
86 0.21
87 0.19
88 0.18
89 0.21
90 0.22
91 0.22
92 0.17
93 0.16
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.17
117 0.13
118 0.15
119 0.16
120 0.17
121 0.23
122 0.24
123 0.23
124 0.2
125 0.19
126 0.23
127 0.24
128 0.22
129 0.18
130 0.2
131 0.21
132 0.29
133 0.37
134 0.38
135 0.42
136 0.49
137 0.48
138 0.5
139 0.51
140 0.47
141 0.4
142 0.34
143 0.28
144 0.19
145 0.18
146 0.14
147 0.13
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.13
159 0.18
160 0.24
161 0.29
162 0.33
163 0.36
164 0.4
165 0.46
166 0.49
167 0.53
168 0.5
169 0.48
170 0.46
171 0.46
172 0.43
173 0.38
174 0.33
175 0.23
176 0.22
177 0.22
178 0.2
179 0.17
180 0.17
181 0.16
182 0.15
183 0.17
184 0.16
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.25
189 0.31
190 0.35
191 0.38
192 0.41
193 0.42
194 0.43
195 0.49
196 0.42
197 0.41
198 0.45
199 0.48
200 0.44
201 0.44
202 0.42
203 0.36
204 0.34
205 0.3
206 0.2
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.16
219 0.18
220 0.17
221 0.17
222 0.2
223 0.24
224 0.28
225 0.31
226 0.31
227 0.37
228 0.41
229 0.46
230 0.52
231 0.51
232 0.5
233 0.48
234 0.48
235 0.45
236 0.43
237 0.39
238 0.39
239 0.37
240 0.37
241 0.36
242 0.31
243 0.31
244 0.34
245 0.33
246 0.28
247 0.26
248 0.24
249 0.26
250 0.26
251 0.26
252 0.24
253 0.24
254 0.29
255 0.34
256 0.36
257 0.4
258 0.46
259 0.45
260 0.51
261 0.57
262 0.58
263 0.61
264 0.66
265 0.65
266 0.59
267 0.58
268 0.49
269 0.41
270 0.34
271 0.29
272 0.25
273 0.2
274 0.17
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.13
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.14
285 0.15
286 0.15
287 0.16
288 0.21
289 0.24
290 0.26
291 0.25
292 0.22
293 0.27
294 0.31
295 0.29
296 0.27
297 0.24
298 0.24
299 0.31
300 0.27
301 0.23
302 0.2
303 0.19
304 0.21
305 0.2
306 0.2
307 0.13
308 0.15
309 0.15
310 0.17
311 0.17
312 0.14
313 0.15
314 0.17
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.19
324 0.22
325 0.23
326 0.23
327 0.25
328 0.26
329 0.24
330 0.23
331 0.21
332 0.19
333 0.21
334 0.21
335 0.19
336 0.18
337 0.18
338 0.17
339 0.15
340 0.17
341 0.2
342 0.22
343 0.23
344 0.23
345 0.23
346 0.3
347 0.35
348 0.33
349 0.28
350 0.26
351 0.27
352 0.28
353 0.27
354 0.2
355 0.14
356 0.13
357 0.12
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.13
371 0.13
372 0.11
373 0.08
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.12
389 0.14
390 0.18
391 0.19
392 0.21
393 0.21
394 0.23
395 0.22
396 0.22
397 0.18
398 0.17
399 0.16
400 0.13
401 0.12
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.13
412 0.12
413 0.13
414 0.13
415 0.15
416 0.16
417 0.15
418 0.14
419 0.11
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.06
427 0.09
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.12
432 0.12
433 0.13
434 0.18
435 0.18
436 0.17
437 0.19
438 0.2
439 0.2
440 0.19
441 0.18
442 0.11
443 0.11
444 0.13
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.14
449 0.16
450 0.16
451 0.18
452 0.16
453 0.18
454 0.23
455 0.22
456 0.2
457 0.18
458 0.21
459 0.17
460 0.18
461 0.17
462 0.13
463 0.13
464 0.14
465 0.18
466 0.18
467 0.19
468 0.18
469 0.18
470 0.14
471 0.15
472 0.15
473 0.12
474 0.09
475 0.08
476 0.09
477 0.08
478 0.09
479 0.1
480 0.12
481 0.12
482 0.16
483 0.17
484 0.18
485 0.17
486 0.19
487 0.25
488 0.27
489 0.32
490 0.33
491 0.34
492 0.37
493 0.38
494 0.38
495 0.41
496 0.43
497 0.43
498 0.45
499 0.45
500 0.42
501 0.4
502 0.39
503 0.3
504 0.27
505 0.22
506 0.15
507 0.13
508 0.12
509 0.13
510 0.12
511 0.11
512 0.08
513 0.11
514 0.12
515 0.11
516 0.14
517 0.15
518 0.19
519 0.2
520 0.22
521 0.24
522 0.25
523 0.25
524 0.25
525 0.26
526 0.23
527 0.24
528 0.23
529 0.24
530 0.24
531 0.25
532 0.28
533 0.33
534 0.36
535 0.37
536 0.37
537 0.31
538 0.31
539 0.3
540 0.27
541 0.23
542 0.18
543 0.17
544 0.17
545 0.18
546 0.16
547 0.16