Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q1BHI1

Protein Details
Accession A0A4Q1BHI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-227STIPSKRGRGRPKGSRNKPKPFAEIKVKPPKPPSKPRGRPLKTRLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-226SKRGRGRPKGSRNKPKPFAEIKVKPPKPPSKPRGRPLKTR
247-254RARGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 15.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MPPLVMSTQPSHFNITTLGPIDPSLAQLSKPQPPPPIDPSLFQIEQVVNHVRTGSRLDPNTLQPTSVQEQDGGVEEGTIGEEIGPGIDHSALAMEGEDIDPALREIVNSLTRAQDTHRREQQQAEQDTTGVEEEALHQSLQSTLDDLTSGEYHALLQGLQDPQSPYLIDPHPDSSSNAEAGPSTIPSKRGRGRPKGSRNKPKPFAEIKVKPPKPPSKPRGRPLKTRLPEDQAEYEQRKQDKAMGIQRARGRPRKFPGYLVREMRLKHNRAQFMEVIRQHEDRNRTSESQNREGEIQREDNEEGDDMGEENGVGEEYEWDMGQGHSLLDVVGLQQQGIEEDAGVPSADVHLDRGVMRVFELPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.27
4 0.23
5 0.22
6 0.16
7 0.16
8 0.17
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.14
14 0.21
15 0.25
16 0.32
17 0.36
18 0.4
19 0.43
20 0.47
21 0.53
22 0.53
23 0.58
24 0.51
25 0.48
26 0.47
27 0.48
28 0.43
29 0.37
30 0.33
31 0.25
32 0.24
33 0.27
34 0.28
35 0.21
36 0.21
37 0.22
38 0.19
39 0.2
40 0.25
41 0.25
42 0.27
43 0.28
44 0.32
45 0.35
46 0.41
47 0.46
48 0.41
49 0.36
50 0.29
51 0.33
52 0.32
53 0.31
54 0.26
55 0.19
56 0.19
57 0.19
58 0.21
59 0.16
60 0.12
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.03
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.09
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.17
101 0.23
102 0.27
103 0.35
104 0.42
105 0.44
106 0.46
107 0.51
108 0.55
109 0.55
110 0.52
111 0.46
112 0.39
113 0.35
114 0.32
115 0.28
116 0.2
117 0.11
118 0.08
119 0.05
120 0.06
121 0.08
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.08
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.17
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.12
173 0.13
174 0.2
175 0.25
176 0.33
177 0.42
178 0.5
179 0.57
180 0.64
181 0.74
182 0.79
183 0.83
184 0.86
185 0.87
186 0.87
187 0.87
188 0.8
189 0.77
190 0.7
191 0.67
192 0.65
193 0.62
194 0.62
195 0.65
196 0.63
197 0.6
198 0.64
199 0.66
200 0.65
201 0.7
202 0.69
203 0.7
204 0.77
205 0.81
206 0.84
207 0.8
208 0.81
209 0.78
210 0.79
211 0.73
212 0.69
213 0.66
214 0.6
215 0.56
216 0.5
217 0.46
218 0.38
219 0.4
220 0.37
221 0.36
222 0.36
223 0.35
224 0.32
225 0.29
226 0.31
227 0.3
228 0.33
229 0.37
230 0.42
231 0.42
232 0.47
233 0.52
234 0.54
235 0.57
236 0.59
237 0.55
238 0.55
239 0.61
240 0.64
241 0.6
242 0.6
243 0.62
244 0.61
245 0.65
246 0.6
247 0.56
248 0.51
249 0.5
250 0.53
251 0.52
252 0.48
253 0.47
254 0.5
255 0.53
256 0.52
257 0.55
258 0.49
259 0.44
260 0.49
261 0.45
262 0.41
263 0.39
264 0.38
265 0.36
266 0.38
267 0.39
268 0.34
269 0.36
270 0.38
271 0.38
272 0.41
273 0.46
274 0.48
275 0.5
276 0.49
277 0.46
278 0.44
279 0.44
280 0.42
281 0.4
282 0.36
283 0.29
284 0.3
285 0.29
286 0.26
287 0.24
288 0.21
289 0.17
290 0.13
291 0.12
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.09
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.11
339 0.14
340 0.15
341 0.14
342 0.15