FuNGI

A0A4Q1BD01

Protein Details

Accession

A0A4Q1BD01

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
124-147	QAGDATPPRRKRRWDVDDVKEEKP	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 2, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MSDQSYPTLQNFSAPQELLDEHAEMIEAEEIPDETMDRSQARQVAARQTDYHLRRFKRTEATLEGEDDSYEDRMRRQNLEKEEERVRKYKEQLEKDEQSKLDMSVDDKTPPRTLTGGDTPPKDQAGDATPPRRKRRWDVDDVKEEKPDVSSDTASTKRRSRWDQTPAAAPEAGIKRSRWDQTPSSSDAAVGAASQTTNGVVMVEDKRYRAITDEELDSILPGVVDGYVIIEVPDDYKPAPSVRKLVPAQTSDGFMMQDDADAVRARTAAGGLQGTTEQTEIEGIGTLQFLKPEDTQYFAKILGDGGGEEDDIGYTTEELKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKSALRQITDRAREFGAGPLFDKILPLLMERSLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIIQQIAQMTGCAVLPHLRNLVDAVADGLQDEQQKVRTMTALSLAALAESAAPYGIESFDNVLKPLWLGIRQHRGKTLAAFLKAIGYIIPLMDPEYAGYYVRECMPILIREFRTSDEEMRRIVLQVVKQCAGTEGVTPTYIKTEVLPEFYKAFWVRRMALDRRNYKQLVDTTVELAQKAGVAEIVGRICNDLKDESEPFRKMVMETITKVIANTGAADIDERLEVQLIDGIIFAFQEQTLEDTIILDGFSTVVSALGGRVKPYLPQIISMILWRLTNKSAKVRMLAADLTTKLAPIVKSNGEDHLLSKLGVVIFEQLGEEYPDALGSLIAAEGAIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEATINLIGRIADRGAEFVPAKEWMRICFELLDLLKAHKKAIRRAAVNSFGYIAKAIGPQDVLSVLLTNLKVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTPELNVRNGCLKALAFVFEYVGEMSKDYIHSVVGLLEDALTDRDHVHRQTACAIVKHLTIGVAGLGYEEALTHLLNLVWPNIFETSPHVIGGVMDAIEAMRLGVGPGVVLSYVLQGMFHPARRVREVYWRMYNTLILGSSDSLVPFYPNLGSASDLASGQDYTRHHLMMSI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.25
3	0.24
4	0.25
5	0.24
6	0.23
7	0.19
8	0.14
9	0.14
10	0.14
11	0.11
12	0.11
13	0.1
14	0.08
15	0.08
16	0.08
17	0.09
18	0.09
19	0.09
20	0.09
21	0.08
22	0.1
23	0.13
24	0.14
25	0.16
26	0.2
27	0.24
28	0.26
29	0.3
30	0.34
31	0.41
32	0.44
33	0.46
34	0.43
35	0.44
36	0.52
37	0.5
38	0.54
39	0.53
40	0.53
41	0.59
42	0.62
43	0.64
44	0.64
45	0.65
46	0.63
47	0.61
48	0.63
49	0.56
50	0.54
51	0.48
52	0.38
53	0.32
54	0.26
55	0.2
56	0.16
57	0.16
58	0.15
59	0.18
60	0.25
61	0.29
62	0.36
63	0.42
64	0.49
65	0.55
66	0.63
67	0.62
68	0.61
69	0.67
70	0.68
71	0.65
72	0.64
73	0.63
74	0.62
75	0.65
76	0.68
77	0.68
78	0.69
79	0.73
80	0.75
81	0.77
82	0.72
83	0.72
84	0.63
85	0.56
86	0.48
87	0.4
88	0.32
89	0.26
90	0.24
91	0.22
92	0.23
93	0.25
94	0.27
95	0.3
96	0.31
97	0.3
98	0.3
99	0.27
100	0.27
101	0.29
102	0.33
103	0.38
104	0.4
105	0.42
106	0.42
107	0.43
108	0.42
109	0.36
110	0.28
111	0.23
112	0.23
113	0.28
114	0.33
115	0.4
116	0.46
117	0.55
118	0.64
119	0.68
120	0.71
121	0.73
122	0.77
123	0.77
124	0.8
125	0.81
126	0.82
127	0.85
128	0.82
129	0.74
130	0.65
131	0.57
132	0.46
133	0.37
134	0.29
135	0.22
136	0.2
137	0.19
138	0.18
139	0.24
140	0.29
141	0.33
142	0.37
143	0.41
144	0.44
145	0.52
146	0.59
147	0.61
148	0.65
149	0.7
150	0.72
151	0.69
152	0.71
153	0.64
154	0.59
155	0.51
156	0.41
157	0.38
158	0.34
159	0.33
160	0.27
161	0.25
162	0.27
163	0.34
164	0.38
165	0.36
166	0.38
167	0.41
168	0.46
169	0.51
170	0.5
171	0.46
172	0.41
173	0.36
174	0.3
175	0.25
176	0.17
177	0.11
178	0.07
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.04
188	0.09
189	0.11
190	0.16
191	0.17
192	0.18
193	0.2
194	0.21
195	0.21
196	0.2
197	0.22
198	0.22
199	0.24
200	0.25
201	0.24
202	0.23
203	0.23
204	0.2
205	0.16
206	0.11
207	0.07
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.06
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.09
224	0.11
225	0.15
226	0.19
227	0.21
228	0.27
229	0.28
230	0.37
231	0.37
232	0.41
233	0.43
234	0.41
235	0.42
236	0.37
237	0.36
238	0.28
239	0.27
240	0.21
241	0.15
242	0.14
243	0.1
244	0.09
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.08
255	0.07
256	0.08
257	0.09
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.08
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.1
278	0.11
279	0.15
280	0.15
281	0.19
282	0.2
283	0.21
284	0.21
285	0.18
286	0.18
287	0.14
288	0.13
289	0.1
290	0.09
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.04
301	0.05
302	0.06
303	0.08
304	0.1
305	0.11
306	0.12
307	0.19
308	0.2
309	0.24
310	0.27
311	0.31
312	0.34
313	0.43
314	0.49
315	0.49
316	0.53
317	0.52
318	0.5
319	0.51
320	0.51
321	0.48
322	0.48
323	0.45
324	0.45
325	0.48
326	0.47
327	0.45
328	0.5
329	0.52
330	0.48
331	0.46
332	0.47
333	0.51
334	0.57
335	0.54
336	0.45
337	0.37
338	0.34
339	0.33
340	0.3
341	0.24
342	0.18
343	0.17
344	0.16
345	0.15
346	0.14
347	0.14
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.13
357	0.13
358	0.14
359	0.14
360	0.14
361	0.16
362	0.17
363	0.17
364	0.15
365	0.15
366	0.14
367	0.19
368	0.2
369	0.18
370	0.2
371	0.19
372	0.2
373	0.19
374	0.19
375	0.14
376	0.14
377	0.15
378	0.15
379	0.17
380	0.18
381	0.18
382	0.18
383	0.2
384	0.2
385	0.18
386	0.16
387	0.15
388	0.15
389	0.15
390	0.15
391	0.13
392	0.1
393	0.1
394	0.09
395	0.1
396	0.07
397	0.05
398	0.04
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.09
407	0.1
408	0.12
409	0.12
410	0.14
411	0.15
412	0.15
413	0.15
414	0.13
415	0.11
416	0.07
417	0.07
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.08
431	0.11
432	0.12
433	0.11
434	0.14
435	0.15
436	0.16
437	0.17
438	0.15
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.11
444	0.11
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.06
451	0.06
452	0.05
453	0.04
454	0.04
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.04
462	0.06
463	0.09
464	0.14
465	0.21
466	0.25
467	0.28
468	0.35
469	0.45
470	0.53
471	0.59
472	0.6
473	0.62
474	0.64
475	0.68
476	0.64
477	0.57
478	0.5
479	0.46
480	0.41
481	0.35
482	0.3
483	0.25
484	0.23
485	0.19
486	0.17
487	0.12
488	0.1
489	0.08
490	0.06
491	0.05
492	0.04
493	0.07
494	0.08
495	0.09
496	0.11
497	0.1
498	0.1
499	0.11
500	0.11
501	0.08
502	0.07
503	0.06
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.09
513	0.11
514	0.11
515	0.12
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.12
520	0.11
521	0.09
522	0.09
523	0.08
524	0.07
525	0.06
526	0.06
527	0.04
528	0.03
529	0.03
530	0.02
531	0.02
532	0.02
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.04
537	0.05
538	0.07
539	0.07
540	0.08
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.08
547	0.1
548	0.15
549	0.25
550	0.28
551	0.29
552	0.3
553	0.32
554	0.3
555	0.29
556	0.3
557	0.23
558	0.22
559	0.21
560	0.19
561	0.17
562	0.16
563	0.15
564	0.08
565	0.05
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.03
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.05
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.07
580	0.07
581	0.08
582	0.07
583	0.07
584	0.09
585	0.11
586	0.13
587	0.17
588	0.17
589	0.18
590	0.18
591	0.19
592	0.21
593	0.21
594	0.24
595	0.23
596	0.24
597	0.23
598	0.23
599	0.22
600	0.19
601	0.19
602	0.16
603	0.14
604	0.17
605	0.19
606	0.19
607	0.18
608	0.18
609	0.17
610	0.16
611	0.13
612	0.11
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.1
617	0.09
618	0.09
619	0.09
620	0.08
621	0.07
622	0.11
623	0.11
624	0.15
625	0.15
626	0.15
627	0.16
628	0.16
629	0.19
630	0.16
631	0.17
632	0.17
633	0.19
634	0.19
635	0.22
636	0.28
637	0.3
638	0.35
639	0.42
640	0.46
641	0.47
642	0.52
643	0.48
644	0.42
645	0.43
646	0.38
647	0.33
648	0.29
649	0.26
650	0.21
651	0.24
652	0.24
653	0.19
654	0.16
655	0.12
656	0.1
657	0.09
658	0.07
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.09
670	0.08
671	0.09
672	0.12
673	0.14
674	0.18
675	0.23
676	0.24
677	0.23
678	0.23
679	0.23
680	0.2
681	0.22
682	0.22
683	0.19
684	0.19
685	0.2
686	0.2
687	0.19
688	0.19
689	0.15
690	0.11
691	0.08
692	0.07
693	0.06
694	0.05
695	0.05
696	0.06
697	0.05
698	0.05
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.04
705	0.06
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.03
714	0.03
715	0.03
716	0.04
717	0.05
718	0.05
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.04
726	0.04
727	0.04
728	0.03
729	0.03
730	0.03
731	0.03
732	0.03
733	0.03
734	0.04
735	0.07
736	0.08
737	0.08
738	0.1
739	0.1
740	0.12
741	0.15
742	0.2
743	0.16
744	0.18
745	0.18
746	0.18
747	0.19
748	0.18
749	0.16
750	0.12
751	0.12
752	0.11
753	0.13
754	0.14
755	0.18
756	0.21
757	0.27
758	0.31
759	0.32
760	0.33
761	0.33
762	0.31
763	0.3
764	0.27
765	0.21
766	0.18
767	0.17
768	0.17
769	0.14
770	0.13
771	0.11
772	0.12
773	0.12
774	0.11
775	0.15
776	0.15
777	0.18
778	0.19
779	0.21
780	0.2
781	0.2
782	0.18
783	0.17
784	0.15
785	0.13
786	0.12
787	0.12
788	0.1
789	0.1
790	0.09
791	0.08
792	0.08
793	0.08
794	0.08
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.07
799	0.06
800	0.06
801	0.05
802	0.06
803	0.05
804	0.05
805	0.03
806	0.04
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.03
811	0.02
812	0.03
813	0.03
814	0.02
815	0.02
816	0.02
817	0.02
818	0.02
819	0.03
820	0.04
821	0.05
822	0.11
823	0.13
824	0.13
825	0.14
826	0.17
827	0.18
828	0.21
829	0.22
830	0.22
831	0.23
832	0.24
833	0.26
834	0.28
835	0.32
836	0.36
837	0.43
838	0.44
839	0.5
840	0.52
841	0.58
842	0.58
843	0.57
844	0.53
845	0.52
846	0.49
847	0.43
848	0.41
849	0.35
850	0.32
851	0.27
852	0.24
853	0.15
854	0.12
855	0.11
856	0.1
857	0.08
858	0.08
859	0.1
860	0.09
861	0.13
862	0.13
863	0.12
864	0.14
865	0.16
866	0.17
867	0.19
868	0.2
869	0.18
870	0.24
871	0.24
872	0.24
873	0.21
874	0.2
875	0.22
876	0.21
877	0.21
878	0.15
879	0.18
880	0.21
881	0.21
882	0.23
883	0.21
884	0.26
885	0.32
886	0.42
887	0.46
888	0.46
889	0.51
890	0.56
891	0.61
892	0.56
893	0.48
894	0.41
895	0.32
896	0.29
897	0.24
898	0.17
899	0.11
900	0.12
901	0.11
902	0.1
903	0.11
904	0.1
905	0.11
906	0.11
907	0.09
908	0.08
909	0.08
910	0.07
911	0.1
912	0.1
913	0.1
914	0.13
915	0.14
916	0.17
917	0.19
918	0.28
919	0.31
920	0.36
921	0.4
922	0.41
923	0.42
924	0.4
925	0.38
926	0.3
927	0.29
928	0.24
929	0.19
930	0.14
931	0.12
932	0.12
933	0.11
934	0.1
935	0.05
936	0.05
937	0.05
938	0.07
939	0.07
940	0.08
941	0.1
942	0.11
943	0.11
944	0.13
945	0.18
946	0.18
947	0.22
948	0.22
949	0.25
950	0.25
951	0.26
952	0.27
953	0.27
954	0.3
955	0.34
956	0.34
957	0.33
958	0.37
959	0.37
960	0.34
961	0.3
962	0.25
963	0.21
964	0.19
965	0.18
966	0.14
967	0.14
968	0.14
969	0.12
970	0.13
971	0.1
972	0.11
973	0.09
974	0.08
975	0.09
976	0.1
977	0.11
978	0.11
979	0.11
980	0.09
981	0.1
982	0.1
983	0.09
984	0.08
985	0.08
986	0.07
987	0.06
988	0.06
989	0.06
990	0.07
991	0.06
992	0.07
993	0.08
994	0.12
995	0.18
996	0.19
997	0.25
998	0.26
999	0.28
1000	0.32
1001	0.37
1002	0.37
1003	0.34
1004	0.35
1005	0.3
1006	0.29
1007	0.28
1008	0.23
1009	0.17
1010	0.13
1011	0.12
1012	0.09
1013	0.07
1014	0.06
1015	0.06
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.04
1019	0.04
1020	0.05
1021	0.05
1022	0.05
1023	0.05
1024	0.06
1025	0.06
1026	0.08
1027	0.09
1028	0.11
1029	0.1
1030	0.11
1031	0.13
1032	0.14
1033	0.13
1034	0.12
1035	0.17
1036	0.22
1037	0.22
1038	0.22
1039	0.2
1040	0.18
1041	0.18
1042	0.19
1043	0.14
1044	0.08
1045	0.06
1046	0.07
1047	0.06
1048	0.06
1049	0.06
1050	0.04
1051	0.03
1052	0.03
1053	0.04
1054	0.04
1055	0.04
1056	0.04
1057	0.04
1058	0.05
1059	0.05
1060	0.05
1061	0.05
1062	0.06
1063	0.07
1064	0.06
1065	0.07
1066	0.06
1067	0.14
1068	0.18
1069	0.21
1070	0.27
1071	0.31
1072	0.36
1073	0.42
1074	0.46
1075	0.41
1076	0.49
1077	0.53
1078	0.54
1079	0.59
1080	0.57
1081	0.53
1082	0.51
1083	0.49
1084	0.39
1085	0.35
1086	0.27
1087	0.18
1088	0.16
1089	0.15
1090	0.15
1091	0.15
1092	0.13
1093	0.12
1094	0.11
1095	0.12
1096	0.1
1097	0.11
1098	0.11
1099	0.11
1100	0.13
1101	0.13
1102	0.14
1103	0.14
1104	0.15
1105	0.15
1106	0.14
1107	0.13
1108	0.13
1109	0.13
1110	0.11
1111	0.16
1112	0.15
1113	0.21
1114	0.23
1115	0.23

A0A4Q1BD01

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer