FuNGI

A0A428PRP6

Protein Details

Accession

A0A428PRP6

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-46	HPNGAPKPKANPLRPMRKKPRANPLVSRKAG	Hydrophilic
181-208	APVAKEVNPKRPKKQKEEKTNFNRAPKT	Hydrophilic
483-510	NTPSGKKPEGSKKGKSRKRPGSPTLSES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-49	HPNGAPKPKANPLRPMRKKPRANPLVSRKAGPKP
188-201	NPKRPKKQKEEKTN
467-506	DKKAGEKAKGSGTKGTNTPSGKKPEGSKKGKSRKRPGSPT
514-524	ESSRKKLKKNA

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPGGPSGSAPGHPNGAPKPKANPLRPMRKKPRANPLVSRKAGPKPGAQPNAGSQNGMTPSIEERRKLYDGWSEPPPAQFTDIAIMTTKKALLDGIRYHMMKFSQAKMGDKPIDPSDQDDFARPVTLHRRDARQPPPGRAPKIEAPEAPQVDEQEAERLAQMKAEREAQRAIDQAKIAPVAKEVNPKRPKKQKEEKTNFNRAPKTQAAKKESELRYEEALPWHLEDAEGKNVWVGSYVAALSEANVAFMIDQSVFRMVPLEKWYKFTSKPPFQPFTIDEAEALMGKKVDVGRWVMKDEEKRAGRQDLEATRQLLYGRGPMVKTESATFKAASRSEKLEHDEIDMSGDEFQDDDEAPLFEKNDDEETKDSKDRIRREQLGANLFGDGDEQEVDRELAEELKEEIERQRLGKATRKALIKRDREDIYESDDSEDNPWSSSSDDSDSDEEEEGEEDKKDEEKKEDDDKKAGEKAKGSGTKGTNTPSGKKPEGSKKGKSRKRPGSPTLSESSGNESSRKKLKKNATPAAGSRAGTPLPQGAAARRMGAGSGSDGEATGGEMSDGAVSRKKKLKLVSGSARGTPSASRAGSPIPTQGGASPSAGGSIIEPSEILEKIPNEGIVIGDLIKLFQHRLGDRPGQMPKSEWIQLVKKLCDYGPDKRLRRRT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.28
3	0.28
4	0.31
5	0.32
6	0.4
7	0.42
8	0.42
9	0.47
10	0.53
11	0.62
12	0.62
13	0.65
14	0.66
15	0.74
16	0.81
17	0.85
18	0.87
19	0.88
20	0.92
21	0.9
22	0.91
23	0.9
24	0.88
25	0.87
26	0.86
27	0.87
28	0.79
29	0.74
30	0.69
31	0.67
32	0.67
33	0.6
34	0.57
35	0.55
36	0.63
37	0.65
38	0.6
39	0.54
40	0.53
41	0.58
42	0.5
43	0.42
44	0.31
45	0.31
46	0.31
47	0.29
48	0.23
49	0.16
50	0.2
51	0.29
52	0.32
53	0.28
54	0.29
55	0.34
56	0.37
57	0.36
58	0.35
59	0.36
60	0.37
61	0.4
62	0.42
63	0.38
64	0.38
65	0.4
66	0.38
67	0.3
68	0.28
69	0.24
70	0.2
71	0.21
72	0.2
73	0.18
74	0.17
75	0.17
76	0.15
77	0.16
78	0.16
79	0.11
80	0.11
81	0.13
82	0.13
83	0.19
84	0.21
85	0.25
86	0.3
87	0.3
88	0.3
89	0.32
90	0.3
91	0.3
92	0.31
93	0.29
94	0.31
95	0.33
96	0.36
97	0.36
98	0.43
99	0.42
100	0.39
101	0.39
102	0.35
103	0.37
104	0.34
105	0.34
106	0.3
107	0.29
108	0.28
109	0.27
110	0.25
111	0.21
112	0.23
113	0.19
114	0.21
115	0.28
116	0.33
117	0.38
118	0.42
119	0.48
120	0.53
121	0.62
122	0.64
123	0.65
124	0.64
125	0.64
126	0.7
127	0.72
128	0.69
129	0.63
130	0.61
131	0.58
132	0.58
133	0.55
134	0.45
135	0.42
136	0.45
137	0.42
138	0.38
139	0.32
140	0.27
141	0.24
142	0.24
143	0.19
144	0.14
145	0.13
146	0.11
147	0.11
148	0.12
149	0.11
150	0.13
151	0.14
152	0.15
153	0.17
154	0.25
155	0.26
156	0.27
157	0.3
158	0.29
159	0.3
160	0.31
161	0.3
162	0.24
163	0.22
164	0.21
165	0.2
166	0.2
167	0.18
168	0.15
169	0.15
170	0.16
171	0.18
172	0.27
173	0.29
174	0.37
175	0.46
176	0.51
177	0.6
178	0.67
179	0.73
180	0.74
181	0.82
182	0.82
183	0.84
184	0.88
185	0.89
186	0.88
187	0.9
188	0.85
189	0.82
190	0.77
191	0.67
192	0.64
193	0.6
194	0.57
195	0.53
196	0.56
197	0.54
198	0.51
199	0.53
200	0.56
201	0.51
202	0.5
203	0.47
204	0.4
205	0.37
206	0.35
207	0.34
208	0.26
209	0.26
210	0.2
211	0.18
212	0.16
213	0.13
214	0.11
215	0.11
216	0.12
217	0.14
218	0.13
219	0.12
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.09
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.09
247	0.08
248	0.1
249	0.16
250	0.21
251	0.21
252	0.25
253	0.27
254	0.29
255	0.31
256	0.36
257	0.42
258	0.44
259	0.51
260	0.55
261	0.56
262	0.53
263	0.55
264	0.49
265	0.44
266	0.38
267	0.3
268	0.22
269	0.19
270	0.19
271	0.15
272	0.13
273	0.08
274	0.05
275	0.05
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.09
280	0.12
281	0.15
282	0.17
283	0.18
284	0.18
285	0.21
286	0.23
287	0.24
288	0.29
289	0.27
290	0.28
291	0.3
292	0.31
293	0.28
294	0.27
295	0.3
296	0.24
297	0.27
298	0.27
299	0.25
300	0.23
301	0.23
302	0.21
303	0.17
304	0.14
305	0.11
306	0.11
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.14
311	0.13
312	0.13
313	0.13
314	0.14
315	0.14
316	0.16
317	0.16
318	0.14
319	0.17
320	0.18
321	0.19
322	0.19
323	0.19
324	0.2
325	0.22
326	0.24
327	0.23
328	0.21
329	0.21
330	0.19
331	0.16
332	0.15
333	0.13
334	0.1
335	0.08
336	0.08
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.1
352	0.1
353	0.12
354	0.14
355	0.16
356	0.19
357	0.21
358	0.21
359	0.22
360	0.28
361	0.32
362	0.38
363	0.44
364	0.46
365	0.48
366	0.51
367	0.52
368	0.48
369	0.44
370	0.36
371	0.27
372	0.22
373	0.18
374	0.14
375	0.09
376	0.05
377	0.05
378	0.04
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.1
393	0.13
394	0.14
395	0.14
396	0.17
397	0.19
398	0.23
399	0.3
400	0.34
401	0.36
402	0.4
403	0.46
404	0.47
405	0.53
406	0.59
407	0.58
408	0.56
409	0.57
410	0.54
411	0.49
412	0.49
413	0.41
414	0.38
415	0.32
416	0.29
417	0.25
418	0.23
419	0.21
420	0.19
421	0.19
422	0.12
423	0.11
424	0.11
425	0.09
426	0.1
427	0.1
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.14
432	0.15
433	0.15
434	0.15
435	0.15
436	0.13
437	0.11
438	0.1
439	0.09
440	0.09
441	0.08
442	0.07
443	0.08
444	0.12
445	0.15
446	0.17
447	0.2
448	0.23
449	0.28
450	0.38
451	0.45
452	0.44
453	0.46
454	0.45
455	0.45
456	0.49
457	0.47
458	0.4
459	0.35
460	0.34
461	0.39
462	0.42
463	0.39
464	0.39
465	0.38
466	0.38
467	0.38
468	0.38
469	0.36
470	0.34
471	0.38
472	0.37
473	0.42
474	0.41
475	0.42
476	0.48
477	0.52
478	0.6
479	0.62
480	0.65
481	0.68
482	0.77
483	0.82
484	0.84
485	0.84
486	0.85
487	0.88
488	0.88
489	0.85
490	0.85
491	0.81
492	0.76
493	0.69
494	0.6
495	0.51
496	0.42
497	0.4
498	0.34
499	0.31
500	0.29
501	0.27
502	0.31
503	0.39
504	0.45
505	0.43
506	0.48
507	0.57
508	0.63
509	0.71
510	0.75
511	0.72
512	0.7
513	0.68
514	0.65
515	0.59
516	0.49
517	0.4
518	0.33
519	0.27
520	0.22
521	0.21
522	0.16
523	0.13
524	0.14
525	0.14
526	0.14
527	0.18
528	0.18
529	0.18
530	0.17
531	0.16
532	0.14
533	0.14
534	0.12
535	0.09
536	0.1
537	0.09
538	0.09
539	0.09
540	0.09
541	0.08
542	0.08
543	0.06
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.05
548	0.06
549	0.06
550	0.07
551	0.13
552	0.14
553	0.22
554	0.3
555	0.33
556	0.38
557	0.44
558	0.52
559	0.56
560	0.64
561	0.67
562	0.68
563	0.67
564	0.65
565	0.6
566	0.5
567	0.43
568	0.34
569	0.27
570	0.24
571	0.22
572	0.2
573	0.2
574	0.23
575	0.24
576	0.25
577	0.25
578	0.21
579	0.21
580	0.21
581	0.21
582	0.2
583	0.19
584	0.18
585	0.15
586	0.13
587	0.13
588	0.12
589	0.1
590	0.08
591	0.09
592	0.09
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.11
597	0.11
598	0.11
599	0.13
600	0.14
601	0.17
602	0.18
603	0.17
604	0.15
605	0.15
606	0.15
607	0.11
608	0.11
609	0.09
610	0.08
611	0.08
612	0.08
613	0.09
614	0.1
615	0.1
616	0.12
617	0.19
618	0.2
619	0.25
620	0.32
621	0.38
622	0.41
623	0.47
624	0.52
625	0.49
626	0.49
627	0.47
628	0.44
629	0.43
630	0.43
631	0.39
632	0.38
633	0.4
634	0.46
635	0.51
636	0.5
637	0.46
638	0.45
639	0.42
640	0.44
641	0.44
642	0.46
643	0.48
644	0.56
645	0.61

A0A428PRP6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer