Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428QXT4

Protein Details
Accession A0A428QXT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
408-437GTGVSRATSKNRKREEKKRARGRKGTVYEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-431SKNRKREEKKRARGRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006849  Elp1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF04762  IKI3  
Amino Acid Sequences MYQDTKRPKALDADALPTSDASPAPRGSPEKVNTVCDALIKALQSRKDTNLQNIITAHVCKSPPALDDGLLLVSELMKEDEKVAEKAVEHICFLVDVNRLYENALGLYNLELALLVAQQSQRDPREYLPFVQHLHAQPELRRKFEIDDHLERRVKALNHLRALDVFDELLAYTTKHALYHDALRLYRYDPPRLRALTDAYAAYLESASKYREAGLAYESLENFAKATSCYRTAGATCWQECLYTAAQQQPPMSTDSMAELANALADALWEAKDYAAAATIHLESLGAIDMAVRCLCKGYHFADAIRIVIQRNRPDLLTTAVDTGLADALGTTTEFLADCKAQLKAQVPRVAELRRKAAEDPLAFYEGERAGGGDIPDDISIAASSRVSTSASLFTRYTGKAGSVGTAGTGVSRATSKNRKREEKKRARGRKGTVYEEEYLVNSIRRLIERVSATAPDVERLVFALVRRNMPERARAAEALMAEVSEACTAAVTEVFNSPEGEDKKPEQEEPTWQATGGEAVLQDFVLGRGKKLEPPVVTALSKLTLLGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.38
4 0.31
5 0.26
6 0.19
7 0.16
8 0.14
9 0.17
10 0.17
11 0.19
12 0.25
13 0.28
14 0.31
15 0.39
16 0.39
17 0.44
18 0.46
19 0.48
20 0.44
21 0.42
22 0.39
23 0.31
24 0.29
25 0.21
26 0.21
27 0.18
28 0.22
29 0.24
30 0.28
31 0.32
32 0.35
33 0.38
34 0.45
35 0.48
36 0.51
37 0.55
38 0.5
39 0.49
40 0.45
41 0.42
42 0.37
43 0.34
44 0.27
45 0.23
46 0.23
47 0.2
48 0.22
49 0.22
50 0.2
51 0.24
52 0.23
53 0.19
54 0.2
55 0.2
56 0.17
57 0.14
58 0.13
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.13
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.24
74 0.27
75 0.24
76 0.21
77 0.21
78 0.19
79 0.17
80 0.17
81 0.15
82 0.13
83 0.13
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.07
105 0.08
106 0.1
107 0.16
108 0.19
109 0.22
110 0.24
111 0.26
112 0.34
113 0.36
114 0.37
115 0.37
116 0.38
117 0.36
118 0.36
119 0.37
120 0.31
121 0.31
122 0.31
123 0.28
124 0.29
125 0.38
126 0.39
127 0.36
128 0.35
129 0.34
130 0.34
131 0.37
132 0.42
133 0.39
134 0.45
135 0.46
136 0.53
137 0.54
138 0.5
139 0.46
140 0.43
141 0.36
142 0.36
143 0.42
144 0.42
145 0.43
146 0.44
147 0.43
148 0.38
149 0.39
150 0.3
151 0.21
152 0.13
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.11
165 0.13
166 0.18
167 0.21
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.24
172 0.23
173 0.27
174 0.26
175 0.31
176 0.31
177 0.35
178 0.4
179 0.4
180 0.4
181 0.35
182 0.35
183 0.28
184 0.27
185 0.23
186 0.17
187 0.16
188 0.14
189 0.12
190 0.08
191 0.06
192 0.05
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.09
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.16
221 0.2
222 0.22
223 0.2
224 0.21
225 0.21
226 0.19
227 0.19
228 0.2
229 0.15
230 0.13
231 0.15
232 0.19
233 0.2
234 0.22
235 0.22
236 0.2
237 0.2
238 0.19
239 0.17
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.1
285 0.11
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.2
290 0.21
291 0.2
292 0.18
293 0.16
294 0.12
295 0.15
296 0.2
297 0.19
298 0.21
299 0.22
300 0.21
301 0.21
302 0.21
303 0.21
304 0.17
305 0.15
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.09
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.12
330 0.18
331 0.22
332 0.29
333 0.33
334 0.32
335 0.33
336 0.37
337 0.39
338 0.39
339 0.36
340 0.35
341 0.32
342 0.33
343 0.33
344 0.33
345 0.34
346 0.3
347 0.29
348 0.26
349 0.26
350 0.23
351 0.22
352 0.21
353 0.15
354 0.14
355 0.11
356 0.09
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.14
378 0.15
379 0.18
380 0.17
381 0.18
382 0.22
383 0.22
384 0.21
385 0.16
386 0.16
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.11
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.08
401 0.16
402 0.27
403 0.35
404 0.44
405 0.54
406 0.65
407 0.73
408 0.83
409 0.86
410 0.87
411 0.9
412 0.92
413 0.93
414 0.93
415 0.92
416 0.89
417 0.88
418 0.83
419 0.79
420 0.74
421 0.67
422 0.58
423 0.5
424 0.43
425 0.33
426 0.27
427 0.22
428 0.17
429 0.13
430 0.13
431 0.15
432 0.15
433 0.17
434 0.17
435 0.22
436 0.23
437 0.26
438 0.26
439 0.24
440 0.24
441 0.26
442 0.24
443 0.19
444 0.18
445 0.15
446 0.13
447 0.12
448 0.13
449 0.1
450 0.11
451 0.18
452 0.21
453 0.24
454 0.27
455 0.3
456 0.35
457 0.36
458 0.43
459 0.37
460 0.39
461 0.39
462 0.37
463 0.34
464 0.31
465 0.28
466 0.23
467 0.19
468 0.14
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.07
479 0.06
480 0.08
481 0.1
482 0.11
483 0.12
484 0.13
485 0.13
486 0.2
487 0.22
488 0.25
489 0.27
490 0.3
491 0.37
492 0.39
493 0.42
494 0.39
495 0.4
496 0.45
497 0.46
498 0.48
499 0.41
500 0.38
501 0.35
502 0.3
503 0.28
504 0.19
505 0.14
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.08
513 0.14
514 0.15
515 0.15
516 0.21
517 0.23
518 0.28
519 0.35
520 0.41
521 0.35
522 0.41
523 0.46
524 0.45
525 0.43
526 0.39
527 0.34
528 0.28
529 0.26