FuNGI

A0A428Q024

Protein Details

Accession

A0A428Q024

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-32	IDHAAAKAEKKSKKEKKRAREEDGHVDTE	Basic
52-77	VVNGDLKAEKKKKSKKDKHAEEAVAP	Hydrophilic
82-109	SAAVEEPKSEKKHKKKKHHDEDVAAPVE	Basic
113-161	ASVVTDGEKKKKHKKKNKEVEGDETTDKAEKKHKKHKKDHQPEPEPEVE	Basic
423-451	AETAKMRKGKRGGQRRQRKRAPEFSMTRF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-39	KAEKKSKKEKKRAREEDGHVDTERKHKKSK
58-70	KAEKKKKSKKDKH
88-99	PKSEKKHKKKKH
121-150	KKKKHKKKNKEVEGDETTDKAEKKHKKHKK
427-443	KMRKGKRGGQRRQRKRA

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 11.666, cyto 10, mito_nucl 9.166, cyto_mito 8.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MAPIDHAAAKAEKKSKKEKKRAREEDGHVDTERKHKKSKSVVAPADLPAPEVVNGDLKAEKKKKSKKDKHAEEAVAPAESESAAVEEPKSEKKHKKKKHHDEDVAAPVEEADASVVTDGEKKKKHKKKNKEVEGDETTDKAEKKHKKHKKDHQPEPEPEVEVEEDASPDPDAMDVDFAIPARPKSKSSSNIHQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLYPIGWAQPVTNCQYQHLRHLQNKYVPSLRGVLLDYKNVAFGEQPGRNGAAMDDETPTTVMSKDEAAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGSGEKIKGKIRFRIRNFDVGTSGETSYLSLEGTMLDKQGEKAVVAEEAETAKMRKGKRGGQRRQRKRAPEFSMTRFAVDEEEQTQDNEEEKREVLAVSED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.65
3	0.72
4	0.8
5	0.83
6	0.86
7	0.91
8	0.94
9	0.92
10	0.92
11	0.88
12	0.88
13	0.83
14	0.76
15	0.65
16	0.58
17	0.51
18	0.51
19	0.53
20	0.47
21	0.5
22	0.51
23	0.6
24	0.67
25	0.75
26	0.75
27	0.77
28	0.77
29	0.73
30	0.71
31	0.62
32	0.57
33	0.46
34	0.36
35	0.26
36	0.22
37	0.18
38	0.15
39	0.15
40	0.13
41	0.13
42	0.14
43	0.17
44	0.18
45	0.28
46	0.34
47	0.41
48	0.48
49	0.58
50	0.67
51	0.76
52	0.84
53	0.85
54	0.9
55	0.93
56	0.92
57	0.91
58	0.84
59	0.75
60	0.68
61	0.58
62	0.47
63	0.36
64	0.26
65	0.17
66	0.13
67	0.11
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.08
74	0.11
75	0.18
76	0.24
77	0.32
78	0.42
79	0.53
80	0.64
81	0.73
82	0.81
83	0.86
84	0.92
85	0.94
86	0.95
87	0.92
88	0.87
89	0.84
90	0.8
91	0.71
92	0.59
93	0.47
94	0.36
95	0.27
96	0.21
97	0.13
98	0.06
99	0.04
100	0.04
101	0.04
102	0.04
103	0.04
104	0.1
105	0.13
106	0.2
107	0.26
108	0.35
109	0.46
110	0.56
111	0.67
112	0.73
113	0.81
114	0.86
115	0.91
116	0.93
117	0.93
118	0.87
119	0.84
120	0.78
121	0.71
122	0.6
123	0.49
124	0.39
125	0.33
126	0.28
127	0.23
128	0.27
129	0.32
130	0.41
131	0.51
132	0.6
133	0.68
134	0.78
135	0.86
136	0.89
137	0.91
138	0.92
139	0.92
140	0.91
141	0.85
142	0.8
143	0.72
144	0.61
145	0.5
146	0.41
147	0.3
148	0.21
149	0.17
150	0.11
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.05
158	0.05
159	0.04
160	0.05
161	0.04
162	0.04
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.07
167	0.08
168	0.1
169	0.12
170	0.14
171	0.18
172	0.26
173	0.33
174	0.39
175	0.47
176	0.55
177	0.61
178	0.62
179	0.59
180	0.52
181	0.47
182	0.47
183	0.38
184	0.31
185	0.26
186	0.28
187	0.27
188	0.27
189	0.24
190	0.19
191	0.21
192	0.18
193	0.17
194	0.12
195	0.13
196	0.14
197	0.15
198	0.15
199	0.12
200	0.12
201	0.11
202	0.1
203	0.09
204	0.07
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.1
212	0.15
213	0.18
214	0.17
215	0.18
216	0.24
217	0.24
218	0.29
219	0.35
220	0.37
221	0.39
222	0.43
223	0.45
224	0.44
225	0.45
226	0.41
227	0.37
228	0.31
229	0.27
230	0.25
231	0.22
232	0.18
233	0.17
234	0.19
235	0.16
236	0.16
237	0.16
238	0.13
239	0.13
240	0.12
241	0.11
242	0.07
243	0.08
244	0.14
245	0.15
246	0.15
247	0.15
248	0.16
249	0.16
250	0.15
251	0.13
252	0.09
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.04
275	0.05
276	0.04
277	0.03
278	0.04
279	0.04
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.1
293	0.09
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.05
303	0.07
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.14
312	0.14
313	0.16
314	0.19
315	0.24
316	0.24
317	0.26
318	0.26
319	0.24
320	0.24
321	0.32
322	0.34
323	0.35
324	0.38
325	0.41
326	0.43
327	0.44
328	0.48
329	0.39
330	0.38
331	0.34
332	0.31
333	0.26
334	0.23
335	0.2
336	0.14
337	0.13
338	0.09
339	0.08
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.09
350	0.09
351	0.1
352	0.11
353	0.11
354	0.1
355	0.11
356	0.13
357	0.11
358	0.12
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.11
363	0.14
364	0.14
365	0.16
366	0.15
367	0.18
368	0.23
369	0.3
370	0.33
371	0.39
372	0.47
373	0.56
374	0.61
375	0.69
376	0.68
377	0.7
378	0.67
379	0.61
380	0.52
381	0.43
382	0.4
383	0.31
384	0.28
385	0.19
386	0.16
387	0.14
388	0.13
389	0.11
390	0.09
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.1
399	0.11
400	0.14
401	0.14
402	0.13
403	0.13
404	0.13
405	0.14
406	0.13
407	0.13
408	0.11
409	0.11
410	0.12
411	0.12
412	0.12
413	0.15
414	0.2
415	0.22
416	0.29
417	0.36
418	0.43
419	0.53
420	0.63
421	0.7
422	0.76
423	0.85
424	0.88
425	0.92
426	0.93
427	0.93
428	0.91
429	0.91
430	0.88
431	0.87
432	0.84
433	0.79
434	0.79
435	0.69
436	0.6
437	0.5
438	0.43
439	0.36
440	0.29
441	0.26
442	0.18
443	0.2
444	0.2
445	0.2
446	0.21
447	0.19
448	0.21
449	0.2
450	0.21
451	0.2
452	0.2
453	0.21
454	0.2
455	0.19

A0A428Q024

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer