FuNGI

A0A428PR85

Protein Details

Accession

A0A428PR85

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
360-382	EETPKPSKKDEPKKETPQPKKFF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
367-375	KKDEPKKET

Subcellular Location(s)

mito 27

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008728 Elongator_complex_protein_4 IPR027417 P-loop_NTPase IPR011856 tRNA_endonuc-like_dom_sf IPR036167 tRNA_intron_Endo_cat-like_sf IPR006677 tRNA_intron_Endonuc_cat-like
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0033588 C:elongator holoenzyme complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000213 F:tRNA-intron endonuclease activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation GO:0002098 P:tRNA wobble uridine modification
Pfam	View protein in Pfam PF05625 PAXNEB PF01974 tRNA_int_endo
CDD	cd19494 Elp4 cd22363 tRNA-intron_lyase_C

Amino Acid Sequences

MSFRKRNVVIGSSGPASPAARQEKSLAPGTRPSPLDGRLTTSTGTQSLDQLLAGHAGMPMGTSLLIEETGTTDFGGVLLRYYAAEGLVQGHHVHLLGFGDAWRRELPGLGSLDGSKSSGKSTSSSDDKMKIAWRYETLGQRNVPARDPQVTQGPGQTTSIFCHGFNLTKRLESSAIKGQLFATSVDGPLASPTQTPFQKFTTDVTSKIKNSPPSTIHRIVVPSLLSPTLYNSAASQPREILKFLHALRALLRQFPTQVTAIVTIPVTLFPRSTGLTRWMELLSDGVLELIPLQHQAPITREAGSEDKGQGLLRAHSLPVFHEKGGGLEGTWNRENLSFKLSGSSGLVITPFSLPPIGDEEETPKPSKKDEPKKETPQPKKFFPFKRAPSCNSASFFFLLINISTSTGTMAMSSDPAPVRISKIAGRYLIFDSDAAALLRRNENVNGTLAGTAPQQPTQNIFLGLPVELRPEEAESLVQKKVAFLVDDVAAHQAALRSPNAETKRLYLDSLKTRKQTAQQVFAEKNAKRAIEVAEKHGRPRPTASRTTPSNADDDALFSSDQPEPNPRQTDAAFKSLGVTPTSSGPLISPEAERSYLAEKPTTGPLCGFLLTSGYYMTPGLRFGAKYSVYPGDPLRFHAHFMANQYGWEEEIPVLDIVAGGRLATAVKKAFLVGSKQPGTEELPDGKMRTFSIEWAAM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.25
3	0.22
4	0.2
5	0.25
6	0.29
7	0.28
8	0.3
9	0.34
10	0.38
11	0.41
12	0.48
13	0.42
14	0.38
15	0.44
16	0.44
17	0.47
18	0.43
19	0.42
20	0.38
21	0.38
22	0.41
23	0.35
24	0.4
25	0.35
26	0.36
27	0.33
28	0.3
29	0.29
30	0.24
31	0.25
32	0.19
33	0.18
34	0.18
35	0.18
36	0.16
37	0.14
38	0.13
39	0.12
40	0.11
41	0.09
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.06
46	0.05
47	0.05
48	0.05
49	0.04
50	0.04
51	0.05
52	0.06
53	0.05
54	0.06
55	0.07
56	0.08
57	0.08
58	0.08
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.09
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.08
69	0.08
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.09
74	0.09
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.1
79	0.1
80	0.1
81	0.08
82	0.09
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.14
87	0.14
88	0.17
89	0.17
90	0.17
91	0.17
92	0.19
93	0.19
94	0.19
95	0.21
96	0.18
97	0.19
98	0.18
99	0.19
100	0.17
101	0.17
102	0.12
103	0.11
104	0.12
105	0.14
106	0.15
107	0.16
108	0.19
109	0.25
110	0.29
111	0.33
112	0.35
113	0.36
114	0.36
115	0.37
116	0.39
117	0.37
118	0.35
119	0.34
120	0.32
121	0.32
122	0.38
123	0.43
124	0.42
125	0.43
126	0.41
127	0.43
128	0.47
129	0.45
130	0.41
131	0.37
132	0.35
133	0.33
134	0.35
135	0.32
136	0.34
137	0.33
138	0.31
139	0.31
140	0.3
141	0.27
142	0.26
143	0.24
144	0.18
145	0.18
146	0.21
147	0.18
148	0.16
149	0.18
150	0.18
151	0.22
152	0.24
153	0.28
154	0.24
155	0.26
156	0.26
157	0.26
158	0.28
159	0.24
160	0.26
161	0.29
162	0.34
163	0.32
164	0.31
165	0.29
166	0.27
167	0.27
168	0.22
169	0.17
170	0.12
171	0.12
172	0.12
173	0.11
174	0.09
175	0.1
176	0.1
177	0.07
178	0.07
179	0.09
180	0.15
181	0.18
182	0.21
183	0.22
184	0.23
185	0.26
186	0.26
187	0.27
188	0.29
189	0.28
190	0.29
191	0.31
192	0.35
193	0.34
194	0.39
195	0.42
196	0.4
197	0.41
198	0.43
199	0.43
200	0.45
201	0.51
202	0.49
203	0.45
204	0.4
205	0.39
206	0.33
207	0.31
208	0.24
209	0.16
210	0.14
211	0.13
212	0.11
213	0.1
214	0.11
215	0.12
216	0.12
217	0.11
218	0.11
219	0.17
220	0.21
221	0.22
222	0.2
223	0.2
224	0.22
225	0.23
226	0.23
227	0.19
228	0.16
229	0.21
230	0.21
231	0.24
232	0.22
233	0.21
234	0.22
235	0.28
236	0.27
237	0.24
238	0.25
239	0.2
240	0.21
241	0.21
242	0.22
243	0.15
244	0.15
245	0.13
246	0.13
247	0.12
248	0.12
249	0.11
250	0.09
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.09
258	0.1
259	0.11
260	0.12
261	0.16
262	0.18
263	0.18
264	0.19
265	0.18
266	0.17
267	0.16
268	0.14
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.04
273	0.04
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.04
279	0.04
280	0.06
281	0.06
282	0.08
283	0.1
284	0.13
285	0.13
286	0.13
287	0.13
288	0.14
289	0.16
290	0.17
291	0.16
292	0.14
293	0.13
294	0.13
295	0.13
296	0.12
297	0.12
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.1
305	0.15
306	0.16
307	0.14
308	0.15
309	0.15
310	0.14
311	0.15
312	0.13
313	0.07
314	0.09
315	0.1
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.15
321	0.17
322	0.14
323	0.17
324	0.14
325	0.13
326	0.15
327	0.14
328	0.13
329	0.11
330	0.11
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.14
347	0.16
348	0.19
349	0.19
350	0.18
351	0.18
352	0.19
353	0.28
354	0.34
355	0.42
356	0.5
357	0.58
358	0.66
359	0.74
360	0.81
361	0.83
362	0.84
363	0.83
364	0.78
365	0.75
366	0.74
367	0.74
368	0.7
369	0.68
370	0.67
371	0.65
372	0.71
373	0.7
374	0.65
375	0.62
376	0.6
377	0.56
378	0.48
379	0.41
380	0.32
381	0.27
382	0.24
383	0.17
384	0.14
385	0.1
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.06
394	0.06
395	0.05
396	0.05
397	0.04
398	0.05
399	0.06
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.12
406	0.12
407	0.14
408	0.14
409	0.17
410	0.19
411	0.2
412	0.2
413	0.2
414	0.2
415	0.19
416	0.17
417	0.13
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.09
425	0.11
426	0.11
427	0.12
428	0.12
429	0.14
430	0.15
431	0.15
432	0.14
433	0.13
434	0.12
435	0.11
436	0.1
437	0.09
438	0.12
439	0.12
440	0.13
441	0.14
442	0.14
443	0.17
444	0.19
445	0.19
446	0.16
447	0.15
448	0.14
449	0.13
450	0.13
451	0.11
452	0.08
453	0.09
454	0.08
455	0.09
456	0.08
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.14
463	0.14
464	0.15
465	0.13
466	0.13
467	0.15
468	0.14
469	0.13
470	0.1
471	0.12
472	0.11
473	0.11
474	0.12
475	0.11
476	0.09
477	0.08
478	0.09
479	0.07
480	0.07
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.11
485	0.18
486	0.21
487	0.23
488	0.23
489	0.24
490	0.3
491	0.3
492	0.31
493	0.27
494	0.31
495	0.38
496	0.44
497	0.47
498	0.44
499	0.46
500	0.49
501	0.52
502	0.55
503	0.52
504	0.53
505	0.52
506	0.56
507	0.54
508	0.55
509	0.56
510	0.46
511	0.45
512	0.4
513	0.35
514	0.29
515	0.3
516	0.3
517	0.31
518	0.32
519	0.34
520	0.4
521	0.4
522	0.44
523	0.47
524	0.44
525	0.38
526	0.43
527	0.45
528	0.44
529	0.51
530	0.54
531	0.56
532	0.58
533	0.6
534	0.58
535	0.5
536	0.45
537	0.37
538	0.32
539	0.24
540	0.21
541	0.18
542	0.14
543	0.13
544	0.1
545	0.13
546	0.14
547	0.15
548	0.16
549	0.22
550	0.25
551	0.33
552	0.36
553	0.34
554	0.36
555	0.36
556	0.43
557	0.4
558	0.4
559	0.33
560	0.29
561	0.3
562	0.29
563	0.3
564	0.22
565	0.19
566	0.16
567	0.17
568	0.19
569	0.17
570	0.14
571	0.12
572	0.14
573	0.15
574	0.15
575	0.14
576	0.15
577	0.18
578	0.19
579	0.19
580	0.18
581	0.19
582	0.21
583	0.22
584	0.21
585	0.19
586	0.21
587	0.29
588	0.29
589	0.26
590	0.23
591	0.24
592	0.23
593	0.23
594	0.2
595	0.12
596	0.12
597	0.12
598	0.12
599	0.1
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.1
604	0.09
605	0.09
606	0.11
607	0.13
608	0.13
609	0.14
610	0.21
611	0.21
612	0.21
613	0.25
614	0.28
615	0.26
616	0.29
617	0.3
618	0.3
619	0.29
620	0.33
621	0.35
622	0.32
623	0.33
624	0.35
625	0.36
626	0.32
627	0.36
628	0.38
629	0.32
630	0.31
631	0.3
632	0.26
633	0.22
634	0.2
635	0.17
636	0.1
637	0.1
638	0.11
639	0.1
640	0.09
641	0.08
642	0.08
643	0.07
644	0.08
645	0.07
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.06
650	0.07
651	0.12
652	0.12
653	0.13
654	0.14
655	0.15
656	0.17
657	0.2
658	0.25
659	0.28
660	0.35
661	0.37
662	0.37
663	0.37
664	0.37
665	0.38
666	0.36
667	0.34
668	0.29
669	0.31
670	0.33
671	0.34
672	0.33
673	0.31
674	0.28
675	0.29
676	0.26
677	0.23

A0A428PR85

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer