Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428PJU1

Protein Details
Accession A0A428PJU1    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-85KGAHDAFKKQREKKGWQATGHydrophilic
103-127KGEASAKPSKSNKKKASAKKSSSSEHydrophilic
387-414LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-122AKPSKSNKKKASAKK
393-405KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSGSKQNPPLWLFSNNPLNPVKPSASTMGKKSTKAATAKSNDTASAPPPGQLMDLVESFLSDHAFKGAHDAFKKQREKKGWQATGAETSASLVSVFQTWEASKGEASAKPSKSNKKKASAKKSSSSEDSDSSDDGEDVDMKDADSSSESSSSSESESEDETPKPKTTKNLKRKAPVDDSSSESSSDSDSDSSSSDSDSDDEPRAKKQKRDQASSSESDSSSSSSSSESDSDSDSDDENAESDSDSSSSSSSSSSSSDSDSDSDSDSDSDGEADAETAAQVPLPDSDGSSSSSDSSDSDSDSDNKKTKKSKEVKDSSDSSVTLDGKESPEAETDSTNPPLPPDPVLTNGRKKQNEPFSRIPKNIKVDPKFASNEYVPIAYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDISEKKGIYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.44
3 0.47
4 0.45
5 0.43
6 0.41
7 0.42
8 0.37
9 0.28
10 0.31
11 0.32
12 0.38
13 0.41
14 0.42
15 0.48
16 0.49
17 0.49
18 0.5
19 0.5
20 0.49
21 0.5
22 0.5
23 0.5
24 0.52
25 0.55
26 0.55
27 0.51
28 0.44
29 0.41
30 0.38
31 0.3
32 0.3
33 0.25
34 0.22
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.17
39 0.17
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.16
54 0.19
55 0.24
56 0.25
57 0.32
58 0.38
59 0.48
60 0.58
61 0.58
62 0.64
63 0.66
64 0.73
65 0.77
66 0.8
67 0.76
68 0.71
69 0.67
70 0.61
71 0.57
72 0.49
73 0.38
74 0.27
75 0.22
76 0.17
77 0.13
78 0.1
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.13
91 0.16
92 0.17
93 0.22
94 0.28
95 0.29
96 0.36
97 0.44
98 0.53
99 0.6
100 0.68
101 0.71
102 0.73
103 0.81
104 0.84
105 0.87
106 0.87
107 0.84
108 0.82
109 0.8
110 0.74
111 0.68
112 0.62
113 0.54
114 0.46
115 0.41
116 0.34
117 0.29
118 0.25
119 0.2
120 0.15
121 0.12
122 0.1
123 0.09
124 0.07
125 0.09
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.12
145 0.14
146 0.14
147 0.15
148 0.17
149 0.19
150 0.2
151 0.21
152 0.28
153 0.37
154 0.47
155 0.56
156 0.63
157 0.68
158 0.74
159 0.77
160 0.75
161 0.72
162 0.65
163 0.59
164 0.51
165 0.49
166 0.43
167 0.39
168 0.31
169 0.24
170 0.21
171 0.16
172 0.14
173 0.1
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.1
186 0.11
187 0.14
188 0.15
189 0.2
190 0.29
191 0.32
192 0.37
193 0.43
194 0.5
195 0.55
196 0.61
197 0.59
198 0.58
199 0.59
200 0.55
201 0.49
202 0.41
203 0.34
204 0.28
205 0.25
206 0.18
207 0.13
208 0.11
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.16
287 0.19
288 0.24
289 0.28
290 0.3
291 0.36
292 0.43
293 0.48
294 0.55
295 0.62
296 0.66
297 0.71
298 0.78
299 0.77
300 0.76
301 0.73
302 0.67
303 0.6
304 0.5
305 0.4
306 0.36
307 0.3
308 0.23
309 0.2
310 0.18
311 0.16
312 0.17
313 0.16
314 0.12
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.18
321 0.2
322 0.21
323 0.19
324 0.19
325 0.21
326 0.22
327 0.21
328 0.2
329 0.2
330 0.24
331 0.31
332 0.35
333 0.42
334 0.48
335 0.55
336 0.56
337 0.57
338 0.61
339 0.66
340 0.68
341 0.67
342 0.7
343 0.7
344 0.75
345 0.78
346 0.75
347 0.72
348 0.71
349 0.71
350 0.71
351 0.66
352 0.63
353 0.6
354 0.6
355 0.55
356 0.49
357 0.47
358 0.38
359 0.36
360 0.31
361 0.29
362 0.22
363 0.21
364 0.21
365 0.18
366 0.19
367 0.19
368 0.22
369 0.23
370 0.24
371 0.23
372 0.24
373 0.24
374 0.28
375 0.3
376 0.25
377 0.25
378 0.29
379 0.3
380 0.35
381 0.37
382 0.4
383 0.48
384 0.59
385 0.67
386 0.74
387 0.82
388 0.83
389 0.9
390 0.91
391 0.9
392 0.9
393 0.88
394 0.86
395 0.84
396 0.78
397 0.67
398 0.57
399 0.55
400 0.48
401 0.43
402 0.36
403 0.27
404 0.25