FuNGI

A0A428PCN7

Protein Details

Accession

A0A428PCN7

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-47	IDHSAAKADKKSKKEKKKRAREEDAPVDTERKHKKSKSVVAPAD	Basic
53-79	VVNGDLKAEKKKKKSKKDKHVEEAVAP	Basic
84-111	SAAVEEPKSEKKHKKKKHHDEDVAAPVE	Basic
116-162	SVVADGEKKKKHKKKNKDAEGDETTDKAEKKQRKHKKDHQPEPEPEA	Basic
425-453	AETAKMRKGKRGGQRRQRKRAPEFSMTRF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-40	KADKKSKKEKKKRAREEDAPVDTERKHKKSK
59-71	KAEKKKKKSKKDK
91-101	KSEKKHKKKKH
123-152	KKKKHKKKNKDAEGDETTDKAEKKQRKHKK
429-445	KMRKGKRGGQRRQRKRA

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 12.333, cyto 10, mito_nucl 9.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MAPIDHSAAKADKKSKKEKKKRAREEDAPVDTERKHKKSKSVVAPADLPAPEVVNGDLKAEKKKKKSKKDKHVEEAVAPAEDESAAVEEPKSEKKHKKKKHHDEDVAAPVEEADASVVADGEKKKKHKKKNKDAEGDETTDKAEKKQRKHKKDHQPEPEPEAEAEEDASPDPDAMDVDFAIPARPKSKSSSNIHQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLYPIGWAQPVTNCQYQHLRHLQNKYVPSLRGVLLDYKNVAFGEQPGRNGAAMDDETPTTVMSKDEAAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGSGEKVKGKIRFRIRNFDVGTSGETSYLSLEGTMLDKQGEKAVVAEEAETAKMRKGKRGGQRRQRKRAPEFSMTRFDVDEEQQTQDIEEEKREVLAVSED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.72
3	0.78
4	0.85
5	0.89
6	0.9
7	0.94
8	0.96
9	0.96
10	0.95
11	0.93
12	0.92
13	0.91
14	0.84
15	0.76
16	0.67
17	0.6
18	0.51
19	0.51
20	0.51
21	0.48
22	0.52
23	0.54
24	0.62
25	0.69
26	0.78
27	0.79
28	0.8
29	0.78
30	0.73
31	0.7
32	0.62
33	0.57
34	0.46
35	0.36
36	0.26
37	0.22
38	0.18
39	0.15
40	0.15
41	0.13
42	0.13
43	0.14
44	0.17
45	0.18
46	0.28
47	0.36
48	0.44
49	0.51
50	0.61
51	0.7
52	0.78
53	0.88
54	0.89
55	0.91
56	0.94
57	0.95
58	0.93
59	0.92
60	0.85
61	0.75
62	0.68
63	0.58
64	0.47
65	0.36
66	0.27
67	0.17
68	0.13
69	0.11
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.08
76	0.11
77	0.18
78	0.23
79	0.31
80	0.42
81	0.52
82	0.64
83	0.73
84	0.81
85	0.86
86	0.92
87	0.94
88	0.95
89	0.92
90	0.87
91	0.84
92	0.8
93	0.71
94	0.59
95	0.47
96	0.36
97	0.27
98	0.21
99	0.13
100	0.06
101	0.04
102	0.04
103	0.04
104	0.04
105	0.04
106	0.08
107	0.1
108	0.16
109	0.22
110	0.31
111	0.42
112	0.52
113	0.63
114	0.7
115	0.8
116	0.85
117	0.9
118	0.93
119	0.92
120	0.87
121	0.84
122	0.78
123	0.71
124	0.6
125	0.49
126	0.39
127	0.32
128	0.28
129	0.24
130	0.28
131	0.31
132	0.4
133	0.5
134	0.6
135	0.68
136	0.78
137	0.84
138	0.87
139	0.91
140	0.92
141	0.92
142	0.9
143	0.84
144	0.79
145	0.71
146	0.61
147	0.49
148	0.41
149	0.3
150	0.21
151	0.17
152	0.11
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.05
160	0.05
161	0.04
162	0.05
163	0.04
164	0.04
165	0.05
166	0.05
167	0.06
168	0.07
169	0.08
170	0.1
171	0.12
172	0.14
173	0.18
174	0.25
175	0.33
176	0.38
177	0.47
178	0.54
179	0.61
180	0.62
181	0.59
182	0.52
183	0.47
184	0.47
185	0.38
186	0.3
187	0.25
188	0.28
189	0.26
190	0.27
191	0.24
192	0.18
193	0.21
194	0.18
195	0.16
196	0.12
197	0.13
198	0.14
199	0.15
200	0.15
201	0.12
202	0.12
203	0.11
204	0.1
205	0.09
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.1
214	0.15
215	0.17
216	0.17
217	0.18
218	0.24
219	0.24
220	0.29
221	0.35
222	0.37
223	0.39
224	0.43
225	0.45
226	0.44
227	0.45
228	0.41
229	0.36
230	0.31
231	0.27
232	0.25
233	0.22
234	0.18
235	0.17
236	0.19
237	0.16
238	0.16
239	0.16
240	0.13
241	0.14
242	0.12
243	0.11
244	0.07
245	0.08
246	0.14
247	0.15
248	0.15
249	0.15
250	0.16
251	0.16
252	0.15
253	0.13
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.04
277	0.05
278	0.04
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.1
295	0.09
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.07
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.14
314	0.15
315	0.16
316	0.19
317	0.24
318	0.24
319	0.26
320	0.26
321	0.24
322	0.24
323	0.32
324	0.34
325	0.35
326	0.38
327	0.41
328	0.43
329	0.44
330	0.48
331	0.39
332	0.38
333	0.34
334	0.31
335	0.26
336	0.23
337	0.2
338	0.14
339	0.13
340	0.09
341	0.08
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.11
358	0.13
359	0.11
360	0.12
361	0.11
362	0.1
363	0.1
364	0.11
365	0.14
366	0.15
367	0.16
368	0.15
369	0.18
370	0.23
371	0.3
372	0.33
373	0.39
374	0.47
375	0.56
376	0.61
377	0.69
378	0.68
379	0.7
380	0.67
381	0.61
382	0.52
383	0.43
384	0.4
385	0.32
386	0.28
387	0.19
388	0.16
389	0.14
390	0.13
391	0.11
392	0.09
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.11
402	0.14
403	0.14
404	0.13
405	0.13
406	0.13
407	0.14
408	0.13
409	0.13
410	0.11
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.12
415	0.15
416	0.2
417	0.22
418	0.29
419	0.36
420	0.43
421	0.53
422	0.63
423	0.7
424	0.76
425	0.85
426	0.88
427	0.92
428	0.93
429	0.93
430	0.91
431	0.91
432	0.88
433	0.87
434	0.84
435	0.79
436	0.78
437	0.7
438	0.62
439	0.51
440	0.45
441	0.39
442	0.34
443	0.34
444	0.27
445	0.28
446	0.27
447	0.27
448	0.25
449	0.23
450	0.25
451	0.2
452	0.21
453	0.2
454	0.2
455	0.2
456	0.2
457	0.19

A0A428PCN7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer