Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428P1M9

Protein Details
Accession A0A428P1M9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-266HCIHQRLHSHHPYRRRGRGRRPVVNNPLMNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
250-257RRRGRGRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046670  DUF6540  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF20174  DUF6540  
Amino Acid Sequences MATRPQPTTTKNQEPTTRHNKHNSTLLYSTLLYSTLLYSTLLYSTLLYSTQPHQSIIMMFSADSSPSDTSASTSPTLSSASPLSTPSTTVSQPEPEPTPFQVFHVEAPRGHHKLFVSTGPQPALGFFFYVLHLPGLDQPMMITMTDTVSSIQQLATVHDSRLVGSIAAHDMNRLRILIHGLGVPYCPTESDPPNEARRRAERWIYDVVDTLLEDGVLEPPPPPPRPHQLPRHHHTAHCIHQRLHSHHPYRRRGRGRRPVVNNPLMNPSPESRGPREPREH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.75
3 0.76
4 0.74
5 0.71
6 0.74
7 0.71
8 0.68
9 0.71
10 0.64
11 0.6
12 0.54
13 0.48
14 0.41
15 0.36
16 0.32
17 0.23
18 0.2
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.08
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.11
36 0.13
37 0.19
38 0.2
39 0.19
40 0.19
41 0.2
42 0.21
43 0.19
44 0.17
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.15
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.14
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.14
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.2
81 0.21
82 0.19
83 0.22
84 0.21
85 0.24
86 0.21
87 0.22
88 0.22
89 0.2
90 0.21
91 0.24
92 0.23
93 0.2
94 0.24
95 0.3
96 0.29
97 0.28
98 0.28
99 0.23
100 0.25
101 0.26
102 0.23
103 0.2
104 0.2
105 0.21
106 0.19
107 0.19
108 0.16
109 0.15
110 0.14
111 0.1
112 0.08
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.05
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.11
176 0.14
177 0.18
178 0.21
179 0.25
180 0.34
181 0.38
182 0.38
183 0.4
184 0.43
185 0.45
186 0.47
187 0.5
188 0.44
189 0.44
190 0.48
191 0.43
192 0.38
193 0.34
194 0.28
195 0.21
196 0.19
197 0.15
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.11
207 0.16
208 0.19
209 0.22
210 0.26
211 0.35
212 0.44
213 0.53
214 0.6
215 0.65
216 0.73
217 0.75
218 0.79
219 0.73
220 0.65
221 0.64
222 0.61
223 0.6
224 0.6
225 0.6
226 0.52
227 0.55
228 0.62
229 0.61
230 0.63
231 0.63
232 0.62
233 0.64
234 0.72
235 0.76
236 0.77
237 0.82
238 0.83
239 0.83
240 0.86
241 0.9
242 0.91
243 0.91
244 0.9
245 0.9
246 0.89
247 0.88
248 0.79
249 0.71
250 0.68
251 0.59
252 0.52
253 0.45
254 0.38
255 0.34
256 0.37
257 0.41
258 0.39
259 0.49
260 0.54