Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428NXR3

Protein Details
Accession A0A428NXR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
408-437GTGVSRATSKNRRREEKKRARGRKGTVYEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-431SKNRRREEKKRARGRK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.5, cyto 10, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006849  Elp1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF04762  IKI3  
Amino Acid Sequences MYQDTKRPKALDADALPTSDSPPAPRGSPEKVNTVCDALIKALQSRKTTNLQNIITAHVCKSPPALDDGLLLVSELMKEDEKVAEKAVEHICFLVDVNRLYENALGLYNLELALLVAQQSQRDPREYLPFVQHLHAQPELRRKFEIDDHLERRVKALNHLQALDVFDELLAYTTKHALYHDALRLYRYDVPRLRALTDAYAAYLESTSKYREAGLAYESLENYAKATSCYRTAGATCWQECLYTAAQQQPPMSADALAELANALADALWEAKDYAAAATIHLESLGAIDMAVRCLCKGYHFADAIRIVIQRNRPDLLTTAVDTGLADALGTTTEFLADCKAQLKAQVPRVAELRRKAAEDPLAFYEGERAGGGDIPDDISIAASSRVSTSASLFTRYTGKAGSVGTAGTGVSRATSKNRRREEKKRARGRKGTVYEEEYLVNSIRRLIERVSATAPDVERLVFALVRRNMPERARAAEALMAEVSEACTAAVAEVFNSPEGEEKKPEQEEPTWQATGGEAVLQDFVLGRGKKLEPPVVTALSKLTLLGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.39
4 0.31
5 0.28
6 0.22
7 0.2
8 0.17
9 0.2
10 0.22
11 0.23
12 0.28
13 0.32
14 0.35
15 0.44
16 0.44
17 0.49
18 0.5
19 0.51
20 0.48
21 0.45
22 0.39
23 0.31
24 0.29
25 0.21
26 0.21
27 0.18
28 0.22
29 0.25
30 0.3
31 0.32
32 0.35
33 0.39
34 0.43
35 0.49
36 0.52
37 0.55
38 0.51
39 0.52
40 0.49
41 0.48
42 0.44
43 0.38
44 0.32
45 0.27
46 0.26
47 0.22
48 0.24
49 0.22
50 0.2
51 0.24
52 0.23
53 0.19
54 0.2
55 0.2
56 0.17
57 0.14
58 0.13
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.13
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.24
74 0.27
75 0.24
76 0.21
77 0.21
78 0.19
79 0.17
80 0.17
81 0.15
82 0.13
83 0.13
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.07
105 0.08
106 0.1
107 0.16
108 0.19
109 0.22
110 0.24
111 0.26
112 0.34
113 0.36
114 0.37
115 0.37
116 0.38
117 0.36
118 0.36
119 0.37
120 0.31
121 0.31
122 0.31
123 0.28
124 0.29
125 0.38
126 0.39
127 0.36
128 0.35
129 0.34
130 0.34
131 0.37
132 0.42
133 0.39
134 0.45
135 0.46
136 0.53
137 0.54
138 0.5
139 0.46
140 0.43
141 0.36
142 0.33
143 0.38
144 0.36
145 0.36
146 0.37
147 0.35
148 0.31
149 0.32
150 0.26
151 0.17
152 0.11
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.11
165 0.13
166 0.18
167 0.21
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.24
172 0.24
173 0.27
174 0.24
175 0.28
176 0.29
177 0.32
178 0.36
179 0.37
180 0.34
181 0.3
182 0.3
183 0.23
184 0.21
185 0.17
186 0.13
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.19
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.21
226 0.19
227 0.19
228 0.2
229 0.15
230 0.13
231 0.15
232 0.19
233 0.2
234 0.22
235 0.22
236 0.2
237 0.2
238 0.17
239 0.16
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.1
285 0.11
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.2
290 0.21
291 0.2
292 0.18
293 0.16
294 0.12
295 0.15
296 0.2
297 0.19
298 0.21
299 0.22
300 0.21
301 0.21
302 0.21
303 0.21
304 0.17
305 0.15
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.09
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.12
330 0.18
331 0.22
332 0.29
333 0.33
334 0.32
335 0.33
336 0.37
337 0.39
338 0.39
339 0.36
340 0.35
341 0.32
342 0.33
343 0.33
344 0.33
345 0.34
346 0.3
347 0.29
348 0.26
349 0.26
350 0.23
351 0.22
352 0.21
353 0.15
354 0.14
355 0.11
356 0.09
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.14
378 0.15
379 0.18
380 0.17
381 0.18
382 0.22
383 0.22
384 0.21
385 0.16
386 0.16
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.11
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.08
401 0.16
402 0.27
403 0.35
404 0.45
405 0.55
406 0.65
407 0.73
408 0.82
409 0.86
410 0.87
411 0.89
412 0.91
413 0.92
414 0.92
415 0.92
416 0.88
417 0.88
418 0.83
419 0.79
420 0.73
421 0.67
422 0.58
423 0.5
424 0.43
425 0.33
426 0.27
427 0.22
428 0.17
429 0.13
430 0.13
431 0.15
432 0.15
433 0.17
434 0.17
435 0.22
436 0.23
437 0.26
438 0.26
439 0.24
440 0.24
441 0.26
442 0.24
443 0.19
444 0.18
445 0.15
446 0.13
447 0.12
448 0.13
449 0.1
450 0.11
451 0.18
452 0.21
453 0.24
454 0.27
455 0.3
456 0.35
457 0.36
458 0.43
459 0.37
460 0.39
461 0.39
462 0.37
463 0.34
464 0.31
465 0.28
466 0.23
467 0.19
468 0.14
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.15
487 0.18
488 0.21
489 0.25
490 0.27
491 0.34
492 0.37
493 0.4
494 0.39
495 0.4
496 0.45
497 0.46
498 0.48
499 0.41
500 0.38
501 0.35
502 0.3
503 0.28
504 0.19
505 0.14
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.08
513 0.14
514 0.15
515 0.15
516 0.21
517 0.23
518 0.28
519 0.35
520 0.41
521 0.35
522 0.41
523 0.46
524 0.45
525 0.43
526 0.39
527 0.34
528 0.28
529 0.26