Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428NCS3

Protein Details
Accession A0A428NCS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
582-624NQNKEWLRKHQEKVFRKKVEAERPKQTRKRRKRARMGEGQTSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
371-378GKGKKRKR
590-616KHQEKVFRKKVEAERPKQTRKRRKRAR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MSSFLTPPKSGPNGLRPTVKPRFAKPNPVRAVREREERRAAAATASASQSLRINAVNRNASLANPSRPQCPNKSCPNPNVVDGTCQTCGRIADDSNIVSEITFGESSSGAAVVHGSYIGADQAGVRSMGPAFRRVGGSEDREKSIREAKSLMQGYAQQLNVGDSLITAGTQVFKLASSANFVQGRTLASVAAVCLYAACRAQPPCKVMLIDLADLVQLNVFKLGRIFKKLNEVVPIGNDGLIPVYPEDLIWRFATKMEFHQETAKVAEDAVRLVKRMSRDWMVMGRRPSGICGACLLMAARMHNFRRTVREVVYIVKVTNHTIQSRLQEFKVTESSRMSVEDFLKQDFLESSHDPPSFYRNTEEYKKTLEGKGKKRKRPSTDLEGDEGEDALADKIDPRLIEGGADLSKAPVVEYRRDDDGFIIPPIPSKIAKDPSLVNRLNGNNATDDQNEEANVENLDNLVEEFGDALEEELEADSRANGKQKGKPQLPINEEWEQDEQELEGVIEEIFNDPLTYEHAMAYSNAEQRAQIHTVWALQQRPQKEVSMSADVTEDEFADDPEVINCLLSPEEAQIKEMIWVNQNKEWLRKHQEKVFRKKVEAERPKQTRKRRKRARMGEGQTSPASSAAEAAVNVAKDRAWSKRINYDAIRNIFDMPNVGGPGSEATSQKTSVAGSTMGGDDASEAGNESVVGDETEVPQEEEEEEEEEQYDETQNYGDGEEFGGGEFEGGYDEDDPDMDAQYGLDDEYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.6
3 0.55
4 0.61
5 0.66
6 0.68
7 0.63
8 0.62
9 0.68
10 0.66
11 0.74
12 0.73
13 0.75
14 0.75
15 0.78
16 0.77
17 0.74
18 0.78
19 0.73
20 0.75
21 0.71
22 0.72
23 0.72
24 0.66
25 0.62
26 0.56
27 0.49
28 0.4
29 0.35
30 0.28
31 0.23
32 0.23
33 0.21
34 0.17
35 0.18
36 0.19
37 0.18
38 0.18
39 0.18
40 0.21
41 0.24
42 0.32
43 0.35
44 0.33
45 0.35
46 0.34
47 0.31
48 0.35
49 0.35
50 0.33
51 0.35
52 0.37
53 0.41
54 0.47
55 0.53
56 0.56
57 0.59
58 0.62
59 0.66
60 0.74
61 0.75
62 0.75
63 0.77
64 0.7
65 0.64
66 0.62
67 0.52
68 0.46
69 0.4
70 0.39
71 0.33
72 0.3
73 0.27
74 0.23
75 0.23
76 0.2
77 0.21
78 0.18
79 0.19
80 0.22
81 0.22
82 0.21
83 0.2
84 0.18
85 0.14
86 0.13
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.06
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.12
116 0.13
117 0.16
118 0.17
119 0.19
120 0.21
121 0.2
122 0.24
123 0.26
124 0.31
125 0.36
126 0.37
127 0.38
128 0.38
129 0.38
130 0.38
131 0.4
132 0.36
133 0.3
134 0.3
135 0.29
136 0.37
137 0.37
138 0.34
139 0.27
140 0.29
141 0.29
142 0.32
143 0.29
144 0.21
145 0.19
146 0.2
147 0.18
148 0.15
149 0.11
150 0.06
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.13
165 0.13
166 0.19
167 0.21
168 0.21
169 0.21
170 0.2
171 0.21
172 0.17
173 0.17
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.11
187 0.15
188 0.19
189 0.23
190 0.26
191 0.26
192 0.29
193 0.28
194 0.24
195 0.27
196 0.25
197 0.21
198 0.18
199 0.16
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.08
204 0.05
205 0.05
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.09
210 0.15
211 0.17
212 0.24
213 0.26
214 0.25
215 0.35
216 0.38
217 0.38
218 0.36
219 0.35
220 0.29
221 0.28
222 0.28
223 0.18
224 0.16
225 0.13
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.07
235 0.08
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.15
242 0.14
243 0.17
244 0.22
245 0.22
246 0.23
247 0.27
248 0.26
249 0.25
250 0.25
251 0.22
252 0.15
253 0.14
254 0.15
255 0.11
256 0.11
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.15
262 0.15
263 0.17
264 0.21
265 0.19
266 0.2
267 0.22
268 0.28
269 0.3
270 0.32
271 0.32
272 0.29
273 0.28
274 0.27
275 0.26
276 0.24
277 0.2
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.13
289 0.15
290 0.18
291 0.21
292 0.21
293 0.27
294 0.31
295 0.32
296 0.29
297 0.32
298 0.3
299 0.3
300 0.31
301 0.25
302 0.2
303 0.19
304 0.18
305 0.16
306 0.19
307 0.18
308 0.16
309 0.17
310 0.2
311 0.23
312 0.26
313 0.26
314 0.22
315 0.23
316 0.23
317 0.24
318 0.28
319 0.25
320 0.23
321 0.22
322 0.22
323 0.19
324 0.2
325 0.18
326 0.14
327 0.15
328 0.17
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.14
333 0.14
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.14
339 0.18
340 0.19
341 0.19
342 0.19
343 0.22
344 0.2
345 0.2
346 0.2
347 0.18
348 0.22
349 0.28
350 0.3
351 0.27
352 0.28
353 0.3
354 0.3
355 0.31
356 0.34
357 0.37
358 0.45
359 0.54
360 0.6
361 0.65
362 0.73
363 0.78
364 0.78
365 0.78
366 0.74
367 0.73
368 0.71
369 0.66
370 0.58
371 0.49
372 0.42
373 0.33
374 0.26
375 0.15
376 0.08
377 0.06
378 0.04
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.1
400 0.14
401 0.16
402 0.19
403 0.21
404 0.22
405 0.22
406 0.2
407 0.2
408 0.17
409 0.15
410 0.13
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.1
416 0.11
417 0.16
418 0.2
419 0.21
420 0.22
421 0.25
422 0.29
423 0.37
424 0.36
425 0.31
426 0.32
427 0.31
428 0.33
429 0.3
430 0.25
431 0.18
432 0.19
433 0.2
434 0.15
435 0.15
436 0.13
437 0.13
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.06
466 0.08
467 0.12
468 0.17
469 0.22
470 0.27
471 0.35
472 0.45
473 0.47
474 0.52
475 0.55
476 0.58
477 0.58
478 0.56
479 0.55
480 0.48
481 0.45
482 0.41
483 0.36
484 0.28
485 0.23
486 0.19
487 0.13
488 0.09
489 0.09
490 0.06
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.04
501 0.05
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.1
509 0.13
510 0.14
511 0.16
512 0.16
513 0.16
514 0.16
515 0.17
516 0.22
517 0.2
518 0.16
519 0.14
520 0.14
521 0.15
522 0.19
523 0.22
524 0.2
525 0.23
526 0.27
527 0.28
528 0.3
529 0.31
530 0.29
531 0.26
532 0.29
533 0.28
534 0.29
535 0.27
536 0.25
537 0.24
538 0.21
539 0.21
540 0.17
541 0.12
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.06
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.08
558 0.13
559 0.13
560 0.14
561 0.14
562 0.14
563 0.16
564 0.19
565 0.18
566 0.2
567 0.24
568 0.27
569 0.29
570 0.35
571 0.34
572 0.38
573 0.41
574 0.44
575 0.49
576 0.54
577 0.59
578 0.61
579 0.7
580 0.73
581 0.79
582 0.81
583 0.77
584 0.71
585 0.74
586 0.75
587 0.76
588 0.77
589 0.73
590 0.73
591 0.77
592 0.85
593 0.84
594 0.86
595 0.86
596 0.87
597 0.91
598 0.92
599 0.93
600 0.94
601 0.95
602 0.94
603 0.94
604 0.9
605 0.88
606 0.79
607 0.72
608 0.61
609 0.51
610 0.41
611 0.31
612 0.24
613 0.14
614 0.12
615 0.09
616 0.09
617 0.08
618 0.09
619 0.1
620 0.1
621 0.1
622 0.1
623 0.09
624 0.11
625 0.14
626 0.19
627 0.22
628 0.27
629 0.32
630 0.4
631 0.44
632 0.49
633 0.5
634 0.53
635 0.56
636 0.56
637 0.53
638 0.45
639 0.44
640 0.38
641 0.34
642 0.27
643 0.2
644 0.18
645 0.16
646 0.15
647 0.12
648 0.11
649 0.13
650 0.13
651 0.14
652 0.13
653 0.16
654 0.18
655 0.19
656 0.19
657 0.18
658 0.17
659 0.15
660 0.16
661 0.12
662 0.11
663 0.12
664 0.12
665 0.11
666 0.1
667 0.09
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.07
680 0.07
681 0.08
682 0.09
683 0.12
684 0.13
685 0.13
686 0.12
687 0.13
688 0.12
689 0.13
690 0.13
691 0.13
692 0.13
693 0.12
694 0.13
695 0.13
696 0.12
697 0.12
698 0.13
699 0.1
700 0.1
701 0.1
702 0.1
703 0.11
704 0.11
705 0.11
706 0.09
707 0.1
708 0.1
709 0.09
710 0.09
711 0.08
712 0.07
713 0.07
714 0.06
715 0.05
716 0.06
717 0.06
718 0.07
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.09
723 0.1
724 0.09
725 0.1
726 0.09
727 0.09
728 0.08
729 0.08
730 0.09