Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428NHT5

Protein Details
Accession A0A428NHT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-162METAKAKEFRDKRKKKEVKLSKLTSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-155GRKRKPSSDSPSQAGRSRSRSRSQSRQSMETAKAKEFRDKRKKKEVK
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 13.333, nucl 11, cyto_nucl 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MAPETPRGVSSRLLTMKFMQRAVASANSSPDVDTNSAKKRKLGHSPAAGRIDMNIDEAAIKAALDNQEAKRQAALDKHVGGDTHWDVPKNEDDDSDDSDSEDSDAPTPGRKRKPSSDSPSQAGRSRSRSRSQSRQSMETAKAKEFRDKRKKKEVKLSKLTSISSGGGISSGGGNQFSPASSKAMTCYKCHQAGHKAVDCPKSGGFRGRSNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.43
4 0.43
5 0.41
6 0.35
7 0.3
8 0.3
9 0.31
10 0.29
11 0.23
12 0.21
13 0.23
14 0.22
15 0.22
16 0.21
17 0.18
18 0.17
19 0.17
20 0.18
21 0.22
22 0.3
23 0.36
24 0.37
25 0.4
26 0.44
27 0.5
28 0.57
29 0.6
30 0.59
31 0.63
32 0.67
33 0.7
34 0.66
35 0.58
36 0.47
37 0.4
38 0.33
39 0.24
40 0.2
41 0.12
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.06
47 0.06
48 0.04
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.12
53 0.13
54 0.2
55 0.21
56 0.21
57 0.2
58 0.2
59 0.22
60 0.21
61 0.24
62 0.21
63 0.21
64 0.22
65 0.21
66 0.2
67 0.18
68 0.19
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.17
74 0.2
75 0.23
76 0.2
77 0.19
78 0.14
79 0.17
80 0.18
81 0.21
82 0.2
83 0.16
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.1
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.11
94 0.14
95 0.21
96 0.27
97 0.32
98 0.37
99 0.44
100 0.52
101 0.57
102 0.62
103 0.65
104 0.62
105 0.6
106 0.59
107 0.54
108 0.51
109 0.46
110 0.42
111 0.4
112 0.43
113 0.46
114 0.47
115 0.53
116 0.57
117 0.63
118 0.66
119 0.67
120 0.64
121 0.62
122 0.59
123 0.55
124 0.53
125 0.49
126 0.44
127 0.38
128 0.4
129 0.38
130 0.43
131 0.45
132 0.52
133 0.56
134 0.63
135 0.68
136 0.74
137 0.82
138 0.82
139 0.86
140 0.86
141 0.85
142 0.86
143 0.82
144 0.78
145 0.72
146 0.64
147 0.55
148 0.46
149 0.36
150 0.26
151 0.21
152 0.14
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.1
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.17
170 0.25
171 0.27
172 0.28
173 0.33
174 0.39
175 0.44
176 0.46
177 0.49
178 0.5
179 0.57
180 0.62
181 0.61
182 0.6
183 0.6
184 0.63
185 0.58
186 0.52
187 0.47
188 0.43
189 0.4
190 0.43
191 0.42