Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428NJM2

Protein Details
Accession A0A428NJM2    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
368-392LGNYTKPGKRTSKKTKAQTGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
291-296RRKKRK
400-408PARIRGRIR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRKWIDKKSAQHFTLVHRPQNDPLIHDENAPSMVLNPTQTKKGSSKSKDLDDLASELGYEAENIRANEGEAASYGVYYDDTEYDYMQHLRDLNTGGGEVVFVESTATANKGKGKQKQSLVDALKKLDIEQEAGDILDEDILPSKNLTRVTYEAQQDIPDSIKGFQPDMDPRLREVLEALDDEAYVDEEDDDLFQQLAKDGRELDDYEFEDTQFDEDDGWESDATAKPNKEYNNDEVPKLVKAPAEHPEEGPSQDWLEDFKEFKKEQKSGRAPAAPSELQSNWTTTTNGGRRKKRKGALTDASSYSMTSSSLVRTEQMTLLDARFDKIEERYNEDLEDDMQSMSAVSTMSTVQGPIRSDFDNIMDDFLGNYTKPGKRTSKKTKAQTGLEQLDEIRKGLGPARIRGRIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.64
3 0.62
4 0.57
5 0.51
6 0.53
7 0.51
8 0.57
9 0.51
10 0.42
11 0.43
12 0.42
13 0.39
14 0.38
15 0.34
16 0.27
17 0.27
18 0.24
19 0.17
20 0.13
21 0.14
22 0.13
23 0.16
24 0.2
25 0.22
26 0.27
27 0.28
28 0.32
29 0.35
30 0.43
31 0.5
32 0.51
33 0.58
34 0.6
35 0.65
36 0.66
37 0.63
38 0.57
39 0.48
40 0.44
41 0.34
42 0.27
43 0.21
44 0.15
45 0.13
46 0.1
47 0.08
48 0.07
49 0.09
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.15
57 0.12
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.17
79 0.18
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.11
85 0.09
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.15
98 0.23
99 0.31
100 0.39
101 0.45
102 0.5
103 0.57
104 0.61
105 0.59
106 0.61
107 0.59
108 0.57
109 0.53
110 0.47
111 0.41
112 0.35
113 0.31
114 0.25
115 0.21
116 0.16
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.21
138 0.27
139 0.27
140 0.26
141 0.25
142 0.24
143 0.21
144 0.19
145 0.17
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.17
155 0.2
156 0.22
157 0.21
158 0.21
159 0.24
160 0.23
161 0.19
162 0.17
163 0.14
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.1
211 0.12
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.19
216 0.21
217 0.23
218 0.25
219 0.29
220 0.36
221 0.37
222 0.36
223 0.33
224 0.32
225 0.29
226 0.26
227 0.22
228 0.13
229 0.13
230 0.16
231 0.21
232 0.26
233 0.26
234 0.25
235 0.27
236 0.27
237 0.27
238 0.24
239 0.18
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.19
249 0.2
250 0.25
251 0.32
252 0.36
253 0.4
254 0.49
255 0.55
256 0.53
257 0.59
258 0.58
259 0.51
260 0.49
261 0.49
262 0.39
263 0.32
264 0.31
265 0.24
266 0.22
267 0.22
268 0.21
269 0.16
270 0.17
271 0.17
272 0.14
273 0.23
274 0.26
275 0.35
276 0.43
277 0.51
278 0.58
279 0.68
280 0.76
281 0.75
282 0.77
283 0.76
284 0.77
285 0.76
286 0.73
287 0.68
288 0.6
289 0.55
290 0.46
291 0.38
292 0.28
293 0.19
294 0.14
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.17
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.13
313 0.14
314 0.16
315 0.24
316 0.23
317 0.3
318 0.33
319 0.33
320 0.33
321 0.31
322 0.28
323 0.21
324 0.21
325 0.14
326 0.11
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.09
340 0.13
341 0.15
342 0.16
343 0.19
344 0.19
345 0.21
346 0.21
347 0.21
348 0.22
349 0.2
350 0.19
351 0.17
352 0.15
353 0.14
354 0.14
355 0.13
356 0.09
357 0.11
358 0.17
359 0.2
360 0.23
361 0.31
362 0.41
363 0.48
364 0.59
365 0.69
366 0.73
367 0.79
368 0.87
369 0.89
370 0.87
371 0.86
372 0.84
373 0.82
374 0.77
375 0.68
376 0.59
377 0.5
378 0.47
379 0.4
380 0.31
381 0.23
382 0.18
383 0.18
384 0.22
385 0.27
386 0.27
387 0.34
388 0.42