Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A428NJV8

Protein Details
Accession A0A428NJV8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
446-469ERDWEEARLRKRQKRKDGIPDSGSBasic
487-508PESQKTMTKKEMKKNQQAKAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
455-461RKRQKRK
Subcellular Location(s) mito 12.5, nucl 10.5, cyto_mito 8.333, cyto_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPHPQAQVPPRAFSPQPTPSPAASQSSFALPPQKRARTDGPPSQPESPYATSPYAASPGPTGTPPAAANSPAYAHSPALPQPYATPYTNGHTTPGLNLPDARPNSTPPIQTPHHPPMPQYTNATMTPVPAPAVAPVVAPVQGPGAMGPPQRPAERPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMNELYSTGFDEARTGFAQHPPGAKGSFYGAGPANQPAQSTPDQSQEQFAAQQAERAWSESSMRLAVQRTQEIGDPFLMVATLHRRADKIAREHHLSLNLDLKNNSQTMGKMRLPEQFPCPKVNIKTAQGPDAALVQTIGSYIPHDAYLVDQLALLSIASKQRLRGLLEDAHVVATNRQKTSHGDVPEDWAPAAAPMNAEPLQPIEKPAEGVDAAGVESVNGEGTNPLKRSAEGAGLTNGAPPVKLPKISSYMTTTMRDLARQERDWEEARLRKRQKRKDGIPDSGSTTSRAGSVAPGTPGTTAPESQKTMTKKEMKKNQQAKAAELDSHQSQNTTSSLFAGLGGKGGLFGKKKTGKTYDWMNVGRGGSGASTPTRNPSGLGKGAGGSAAAAAPVNMAMTTEGRNRLGTWREDKEKGRNIQLRDWVSVLERDGREHKALQRAYLHLDASNPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.43
3 0.45
4 0.43
5 0.46
6 0.49
7 0.5
8 0.46
9 0.5
10 0.48
11 0.46
12 0.38
13 0.35
14 0.31
15 0.31
16 0.3
17 0.26
18 0.33
19 0.28
20 0.36
21 0.44
22 0.5
23 0.5
24 0.56
25 0.61
26 0.61
27 0.69
28 0.69
29 0.69
30 0.67
31 0.69
32 0.68
33 0.62
34 0.55
35 0.53
36 0.46
37 0.39
38 0.37
39 0.33
40 0.28
41 0.28
42 0.27
43 0.23
44 0.19
45 0.18
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.14
52 0.17
53 0.16
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.18
60 0.17
61 0.19
62 0.17
63 0.16
64 0.17
65 0.19
66 0.21
67 0.25
68 0.24
69 0.22
70 0.22
71 0.26
72 0.29
73 0.27
74 0.27
75 0.24
76 0.28
77 0.32
78 0.3
79 0.27
80 0.24
81 0.24
82 0.24
83 0.27
84 0.24
85 0.21
86 0.23
87 0.23
88 0.29
89 0.3
90 0.31
91 0.27
92 0.29
93 0.35
94 0.37
95 0.38
96 0.32
97 0.37
98 0.36
99 0.39
100 0.44
101 0.46
102 0.48
103 0.47
104 0.45
105 0.48
106 0.51
107 0.5
108 0.46
109 0.4
110 0.37
111 0.36
112 0.38
113 0.29
114 0.25
115 0.22
116 0.19
117 0.16
118 0.13
119 0.13
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.08
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.17
138 0.21
139 0.22
140 0.24
141 0.27
142 0.34
143 0.38
144 0.41
145 0.43
146 0.46
147 0.46
148 0.46
149 0.44
150 0.39
151 0.35
152 0.32
153 0.26
154 0.2
155 0.18
156 0.16
157 0.14
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.15
187 0.18
188 0.2
189 0.21
190 0.2
191 0.22
192 0.21
193 0.19
194 0.17
195 0.16
196 0.15
197 0.12
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.14
206 0.12
207 0.15
208 0.16
209 0.18
210 0.18
211 0.22
212 0.23
213 0.23
214 0.24
215 0.21
216 0.2
217 0.18
218 0.17
219 0.16
220 0.14
221 0.16
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.16
227 0.12
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.17
236 0.18
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.2
241 0.18
242 0.18
243 0.14
244 0.12
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.05
249 0.06
250 0.09
251 0.12
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.16
256 0.21
257 0.26
258 0.29
259 0.32
260 0.35
261 0.39
262 0.41
263 0.41
264 0.4
265 0.35
266 0.3
267 0.3
268 0.27
269 0.24
270 0.22
271 0.22
272 0.19
273 0.18
274 0.17
275 0.11
276 0.11
277 0.14
278 0.2
279 0.2
280 0.2
281 0.22
282 0.27
283 0.28
284 0.29
285 0.32
286 0.32
287 0.32
288 0.32
289 0.33
290 0.32
291 0.32
292 0.35
293 0.33
294 0.29
295 0.34
296 0.33
297 0.32
298 0.28
299 0.26
300 0.21
301 0.18
302 0.15
303 0.09
304 0.08
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.04
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.03
326 0.05
327 0.06
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.13
332 0.16
333 0.17
334 0.17
335 0.2
336 0.21
337 0.21
338 0.21
339 0.18
340 0.16
341 0.14
342 0.13
343 0.12
344 0.14
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.18
349 0.21
350 0.28
351 0.31
352 0.28
353 0.27
354 0.27
355 0.31
356 0.31
357 0.28
358 0.21
359 0.15
360 0.13
361 0.11
362 0.11
363 0.07
364 0.05
365 0.05
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.12
372 0.12
373 0.13
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.06
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.13
398 0.14
399 0.16
400 0.16
401 0.18
402 0.15
403 0.16
404 0.15
405 0.16
406 0.15
407 0.14
408 0.13
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.12
413 0.13
414 0.15
415 0.15
416 0.18
417 0.24
418 0.25
419 0.27
420 0.26
421 0.28
422 0.3
423 0.3
424 0.27
425 0.26
426 0.26
427 0.25
428 0.23
429 0.26
430 0.29
431 0.29
432 0.32
433 0.3
434 0.33
435 0.34
436 0.35
437 0.35
438 0.35
439 0.39
440 0.46
441 0.53
442 0.58
443 0.66
444 0.73
445 0.77
446 0.81
447 0.86
448 0.87
449 0.86
450 0.86
451 0.79
452 0.71
453 0.65
454 0.57
455 0.48
456 0.39
457 0.3
458 0.23
459 0.19
460 0.17
461 0.12
462 0.1
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.16
474 0.21
475 0.23
476 0.24
477 0.29
478 0.3
479 0.33
480 0.41
481 0.47
482 0.51
483 0.59
484 0.68
485 0.72
486 0.79
487 0.84
488 0.82
489 0.81
490 0.74
491 0.67
492 0.63
493 0.55
494 0.45
495 0.37
496 0.34
497 0.28
498 0.28
499 0.25
500 0.19
501 0.17
502 0.18
503 0.18
504 0.15
505 0.12
506 0.11
507 0.12
508 0.11
509 0.12
510 0.11
511 0.1
512 0.1
513 0.09
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.13
518 0.13
519 0.15
520 0.24
521 0.31
522 0.35
523 0.42
524 0.47
525 0.46
526 0.5
527 0.58
528 0.55
529 0.56
530 0.55
531 0.49
532 0.47
533 0.43
534 0.38
535 0.28
536 0.22
537 0.14
538 0.13
539 0.13
540 0.11
541 0.14
542 0.14
543 0.2
544 0.22
545 0.22
546 0.23
547 0.26
548 0.3
549 0.31
550 0.31
551 0.27
552 0.24
553 0.24
554 0.23
555 0.17
556 0.11
557 0.08
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.04
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.04
566 0.05
567 0.06
568 0.07
569 0.11
570 0.16
571 0.2
572 0.21
573 0.22
574 0.23
575 0.29
576 0.34
577 0.38
578 0.41
579 0.46
580 0.51
581 0.58
582 0.63
583 0.66
584 0.69
585 0.68
586 0.71
587 0.69
588 0.67
589 0.68
590 0.71
591 0.64
592 0.58
593 0.52
594 0.43
595 0.39
596 0.36
597 0.31
598 0.3
599 0.27
600 0.29
601 0.33
602 0.36
603 0.37
604 0.4
605 0.44
606 0.45
607 0.46
608 0.47
609 0.48
610 0.46
611 0.49
612 0.47
613 0.42
614 0.33