Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GAW9

Protein Details
Accession A0A401GAW9    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-133VAKPADQKDKEKKQRRINRRPGRRGSKSVPBasic
155-183GSDEAAKPKKKKKNNRKNRRKVPEGEPRABasic
195-217TDAATRRKARKPKVLRPHRAAGEBasic
253-277VVSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-130KDKEKKQRRINRRPGRRGSK
160-183AKPKKKKKNNRKNRRKVPEGEPRA
198-213ATRRKARKPKVLRPHR
260-270RRRWGKPRKSK
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 13.833, nucl 8, mito_nucl 5.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAVPLTENGVPPAAQEIVVDETPGFKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFAPVESDVISAQVILRGTRSAGYGFVAVATAEAAQKAVELLDKQELDGRQVIVEVAKPADQKDKEKKQRRINRRPGRRGSKSVPGEVSEAEANGEVSERAEGATPGSDEAAKPKKKKKNNRKNRRKVPEGEPRAEGAEGAEAAEGTDAATRRKARKPKVLRPHRAAGEDPIGEPSKTVVFVANLGFNIDDAGLSALFTDADIKVVSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDVGDEEEQKKAIELLQGKDVGGRNIAVKVAVNAQMEEEAETDNTAVEAQPEREATPEATVVAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.14
4 0.17
5 0.13
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.12
13 0.13
14 0.14
15 0.15
16 0.13
17 0.08
18 0.1
19 0.1
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.17
28 0.13
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.1
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.17
81 0.17
82 0.18
83 0.2
84 0.18
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.1
89 0.11
90 0.09
91 0.08
92 0.1
93 0.1
94 0.12
95 0.2
96 0.22
97 0.29
98 0.38
99 0.49
100 0.58
101 0.68
102 0.76
103 0.78
104 0.86
105 0.9
106 0.91
107 0.91
108 0.91
109 0.92
110 0.93
111 0.92
112 0.92
113 0.87
114 0.83
115 0.77
116 0.76
117 0.68
118 0.61
119 0.52
120 0.43
121 0.37
122 0.3
123 0.26
124 0.17
125 0.13
126 0.1
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.11
146 0.2
147 0.24
148 0.3
149 0.39
150 0.47
151 0.57
152 0.68
153 0.74
154 0.77
155 0.83
156 0.9
157 0.92
158 0.94
159 0.96
160 0.94
161 0.9
162 0.85
163 0.83
164 0.82
165 0.77
166 0.68
167 0.59
168 0.5
169 0.43
170 0.36
171 0.27
172 0.16
173 0.1
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.11
186 0.15
187 0.2
188 0.28
189 0.37
190 0.44
191 0.54
192 0.64
193 0.7
194 0.77
195 0.83
196 0.85
197 0.82
198 0.82
199 0.75
200 0.67
201 0.58
202 0.5
203 0.43
204 0.35
205 0.28
206 0.24
207 0.21
208 0.18
209 0.17
210 0.14
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.11
243 0.16
244 0.24
245 0.27
246 0.34
247 0.42
248 0.51
249 0.61
250 0.68
251 0.74
252 0.77
253 0.85
254 0.88
255 0.87
256 0.84
257 0.82
258 0.8
259 0.74
260 0.65
261 0.55
262 0.46
263 0.38
264 0.35
265 0.27
266 0.19
267 0.16
268 0.14
269 0.13
270 0.11
271 0.12
272 0.1
273 0.11
274 0.16
275 0.19
276 0.21
277 0.26
278 0.27
279 0.26
280 0.3
281 0.3
282 0.25
283 0.21
284 0.2
285 0.17
286 0.17
287 0.17
288 0.14
289 0.12
290 0.13
291 0.15
292 0.19
293 0.19
294 0.18
295 0.18
296 0.18
297 0.18
298 0.18
299 0.14
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.11
310 0.13
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.19
315 0.22
316 0.2
317 0.2
318 0.19