FuNGI

A0A401GEN6

Protein Details

Accession

A0A401GEN6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
217-243	RAYNAKQQSGKRSKKEYKPGDPFCKNC	Hydrophilic
259-284	GAEGKGPRSKKKEKKDSEKQDVKGKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
259-278	GAEGKGPRSKKKEKKDSEKQ

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 7, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MSGERRNPWSGRSSPCRRSPTPPPLCRAYWDEPGTPTGGHRPRARPQRSGENLYAQSSPRRSAAPSRRPTLSPNAGGRRYRPLGEGGAEHWTLHKDTDHSSHMNLTKLPHKLTPTNYVSWMTTMESTLDTIELFEYATGEVPEPDPDVDEARARRWKHANACVRLILASNMTEEVVSQISHLTVAAQVWQEYYTSSEIERRLKEEYAIRQNQQSTARAYNAKQQSGKRSKKEYKPGDPFCKNCERPGHYIKDCWSKGGGAEGKGPRSKKKEKKDSEKQDVKGKERVNEVKEDSDHLSCMAAPGSSSRFTWILDGGSTTHICRTKSAFVTFTPSSETIGGIWKTGPQLEVHGRGDILILCHVHSGDQHIVTLRNVCYCPDARDNIISESRMDQKGLSIHKQNGLVAVQNSNGKVIMEGARRRDLYELDCAIAPPSSHPSEISFAAQLSPSDSELWHRRLAHIGQGSLQYMVKHALVTGLDLKSVETLGPCDGCAKGKHHQAPFPKQATNRATSILHRLHMDLQGPFDLSITGYRYTLAVVDDYSRKGWKAFLKAKNDATSEIKDLVTRLETFSDKRVKIVRSDGGGEFIGNDLQTYFKSKGIKHETSAPHTPPQNGVAERYNQTTHEHALCMLQEANMSSGFWPEAHAYASLVRNRSPTRALVESTPNEKFYGQKPDVSTLRIFGARCHVRVPPESQKKLDAHSLDGIFCGFAPNQKAYKIWIPSRHKFMVSRDVIVYENVPAMPDDDDQNPALSEGRNFRDITTTSSNSSGFGITSFSANPYTARKSAIHCISTHSRQYFRTSTNARASSRTSPTFRTCHAPILDQASCRETAGIRTGDKDTQQGDQGSTHTAETNEVPTTPEGDVTQVAYMAAFGTDTPMNFREATKCSEADNWWTAMHEEIDMLQRRGTWVLEDLPPGRKAIGNRWTYVIKRGPQGEILRYKARLVAQGFSQIPGIDFNDTFSPTVRLESLRAILHLTAAHGWHRGQDDVTGAFLHSKVDVIIYMQQPVGFDDGTGRVCRLLLSLYGLRQSSHLWNEYMDGQLSTISFHRLICDSAIYVRRTETGANSILAIHVDNTLSFSDSAEEFASVRKQLHSIFEMKEEDPNWLMGFELIDNPQEHTVSISHRQYISTILRRFKMEDCVPVPTPMESSLHLSVHDAPSTPEEIAEMKKRPYRELVGALTWISVISRPDVSFVSAHLAQFNANPGKRHWEAVK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.73
3	0.78
4	0.74
5	0.75
6	0.76
7	0.77
8	0.78
9	0.77
10	0.73
11	0.71
12	0.68
13	0.65
14	0.62
15	0.57
16	0.55
17	0.53
18	0.5
19	0.45
20	0.45
21	0.42
22	0.34
23	0.3
24	0.31
25	0.33
26	0.37
27	0.43
28	0.49
29	0.57
30	0.68
31	0.72
32	0.69
33	0.7
34	0.75
35	0.75
36	0.75
37	0.69
38	0.67
39	0.63
40	0.58
41	0.54
42	0.45
43	0.44
44	0.4
45	0.39
46	0.32
47	0.32
48	0.33
49	0.41
50	0.49
51	0.52
52	0.58
53	0.6
54	0.63
55	0.63
56	0.64
57	0.63
58	0.61
59	0.58
60	0.59
61	0.62
62	0.64
63	0.66
64	0.64
65	0.63
66	0.58
67	0.53
68	0.45
69	0.4
70	0.37
71	0.36
72	0.35
73	0.27
74	0.28
75	0.26
76	0.24
77	0.22
78	0.21
79	0.19
80	0.19
81	0.2
82	0.17
83	0.21
84	0.26
85	0.3
86	0.3
87	0.3
88	0.36
89	0.36
90	0.37
91	0.35
92	0.33
93	0.35
94	0.38
95	0.39
96	0.37
97	0.4
98	0.43
99	0.46
100	0.52
101	0.5
102	0.48
103	0.48
104	0.46
105	0.41
106	0.35
107	0.32
108	0.24
109	0.19
110	0.17
111	0.15
112	0.13
113	0.13
114	0.12
115	0.11
116	0.09
117	0.08
118	0.08
119	0.07
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.07
125	0.08
126	0.08
127	0.09
128	0.1
129	0.11
130	0.12
131	0.12
132	0.12
133	0.12
134	0.14
135	0.15
136	0.2
137	0.2
138	0.26
139	0.33
140	0.33
141	0.4
142	0.46
143	0.53
144	0.57
145	0.65
146	0.68
147	0.67
148	0.69
149	0.63
150	0.55
151	0.47
152	0.39
153	0.3
154	0.22
155	0.17
156	0.13
157	0.12
158	0.11
159	0.1
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.08
168	0.07
169	0.06
170	0.06
171	0.07
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.1
179	0.13
180	0.11
181	0.11
182	0.12
183	0.16
184	0.21
185	0.28
186	0.29
187	0.29
188	0.31
189	0.31
190	0.34
191	0.37
192	0.41
193	0.45
194	0.49
195	0.49
196	0.5
197	0.51
198	0.53
199	0.5
200	0.45
201	0.39
202	0.37
203	0.39
204	0.38
205	0.38
206	0.42
207	0.44
208	0.46
209	0.47
210	0.48
211	0.55
212	0.61
213	0.69
214	0.68
215	0.72
216	0.76
217	0.8
218	0.86
219	0.85
220	0.84
221	0.86
222	0.88
223	0.87
224	0.85
225	0.78
226	0.74
227	0.75
228	0.66
229	0.62
230	0.62
231	0.57
232	0.57
233	0.63
234	0.65
235	0.56
236	0.59
237	0.59
238	0.6
239	0.54
240	0.48
241	0.41
242	0.33
243	0.3
244	0.35
245	0.32
246	0.23
247	0.3
248	0.32
249	0.36
250	0.4
251	0.43
252	0.42
253	0.48
254	0.57
255	0.59
256	0.67
257	0.73
258	0.79
259	0.87
260	0.9
261	0.92
262	0.92
263	0.91
264	0.84
265	0.82
266	0.79
267	0.73
268	0.69
269	0.62
270	0.55
271	0.55
272	0.58
273	0.52
274	0.5
275	0.49
276	0.46
277	0.43
278	0.41
279	0.36
280	0.29
281	0.26
282	0.21
283	0.18
284	0.13
285	0.13
286	0.1
287	0.07
288	0.06
289	0.08
290	0.11
291	0.12
292	0.12
293	0.14
294	0.14
295	0.15
296	0.16
297	0.15
298	0.13
299	0.12
300	0.12
301	0.11
302	0.13
303	0.13
304	0.12
305	0.16
306	0.18
307	0.19
308	0.2
309	0.24
310	0.28
311	0.32
312	0.34
313	0.31
314	0.28
315	0.35
316	0.33
317	0.29
318	0.27
319	0.22
320	0.21
321	0.19
322	0.19
323	0.12
324	0.18
325	0.17
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.14
330	0.15
331	0.15
332	0.09
333	0.14
334	0.18
335	0.23
336	0.23
337	0.22
338	0.21
339	0.2
340	0.21
341	0.16
342	0.13
343	0.09
344	0.09
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.12
351	0.13
352	0.13
353	0.13
354	0.14
355	0.15
356	0.16
357	0.2
358	0.16
359	0.16
360	0.16
361	0.16
362	0.19
363	0.19
364	0.23
365	0.24
366	0.25
367	0.24
368	0.26
369	0.28
370	0.27
371	0.28
372	0.24
373	0.2
374	0.21
375	0.24
376	0.22
377	0.21
378	0.17
379	0.17
380	0.22
381	0.25
382	0.27
383	0.27
384	0.29
385	0.32
386	0.33
387	0.31
388	0.28
389	0.25
390	0.23
391	0.18
392	0.17
393	0.15
394	0.16
395	0.16
396	0.14
397	0.13
398	0.1
399	0.09
400	0.1
401	0.14
402	0.18
403	0.21
404	0.24
405	0.29
406	0.29
407	0.3
408	0.29
409	0.26
410	0.22
411	0.25
412	0.22
413	0.19
414	0.18
415	0.18
416	0.17
417	0.15
418	0.13
419	0.08
420	0.12
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.15
425	0.17
426	0.18
427	0.17
428	0.13
429	0.12
430	0.12
431	0.12
432	0.1
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.13
439	0.18
440	0.21
441	0.24
442	0.23
443	0.23
444	0.27
445	0.28
446	0.29
447	0.26
448	0.23
449	0.21
450	0.22
451	0.21
452	0.18
453	0.18
454	0.12
455	0.1
456	0.11
457	0.09
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.07
462	0.08
463	0.11
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.1
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.05
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.08
478	0.1
479	0.12
480	0.15
481	0.2
482	0.28
483	0.34
484	0.36
485	0.41
486	0.47
487	0.54
488	0.58
489	0.56
490	0.52
491	0.47
492	0.53
493	0.51
494	0.46
495	0.38
496	0.32
497	0.3
498	0.27
499	0.33
500	0.26
501	0.23
502	0.21
503	0.21
504	0.21
505	0.21
506	0.22
507	0.15
508	0.14
509	0.13
510	0.13
511	0.12
512	0.1
513	0.08
514	0.06
515	0.07
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.08
522	0.09
523	0.08
524	0.06
525	0.06
526	0.08
527	0.09
528	0.1
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.11
533	0.15
534	0.18
535	0.26
536	0.34
537	0.4
538	0.46
539	0.51
540	0.53
541	0.53
542	0.49
543	0.42
544	0.36
545	0.31
546	0.26
547	0.22
548	0.19
549	0.16
550	0.15
551	0.13
552	0.12
553	0.1
554	0.09
555	0.1
556	0.11
557	0.12
558	0.17
559	0.24
560	0.22
561	0.24
562	0.29
563	0.28
564	0.29
565	0.33
566	0.3
567	0.24
568	0.27
569	0.24
570	0.21
571	0.2
572	0.17
573	0.12
574	0.1
575	0.09
576	0.06
577	0.05
578	0.03
579	0.04
580	0.04
581	0.08
582	0.09
583	0.12
584	0.16
585	0.17
586	0.26
587	0.34
588	0.35
589	0.33
590	0.4
591	0.41
592	0.42
593	0.46
594	0.39
595	0.34
596	0.34
597	0.34
598	0.26
599	0.25
600	0.24
601	0.2
602	0.2
603	0.18
604	0.19
605	0.2
606	0.21
607	0.19
608	0.17
609	0.18
610	0.17
611	0.17
612	0.15
613	0.14
614	0.12
615	0.12
616	0.11
617	0.11
618	0.09
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.06
627	0.06
628	0.05
629	0.06
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.1
636	0.13
637	0.15
638	0.15
639	0.16
640	0.19
641	0.2
642	0.22
643	0.21
644	0.19
645	0.21
646	0.22
647	0.22
648	0.2
649	0.25
650	0.24
651	0.27
652	0.26
653	0.23
654	0.21
655	0.21
656	0.2
657	0.19
658	0.26
659	0.23
660	0.26
661	0.26
662	0.31
663	0.32
664	0.32
665	0.28
666	0.2
667	0.2
668	0.19
669	0.18
670	0.14
671	0.22
672	0.21
673	0.22
674	0.22
675	0.22
676	0.23
677	0.25
678	0.31
679	0.33
680	0.4
681	0.43
682	0.42
683	0.46
684	0.44
685	0.44
686	0.43
687	0.33
688	0.26
689	0.26
690	0.26
691	0.21
692	0.19
693	0.17
694	0.11
695	0.1
696	0.1
697	0.06
698	0.07
699	0.1
700	0.12
701	0.14
702	0.14
703	0.15
704	0.16
705	0.22
706	0.25
707	0.28
708	0.35
709	0.42
710	0.46
711	0.53
712	0.52
713	0.48
714	0.46
715	0.45
716	0.45
717	0.39
718	0.36
719	0.29
720	0.29
721	0.27
722	0.25
723	0.21
724	0.11
725	0.1
726	0.08
727	0.08
728	0.06
729	0.07
730	0.07
731	0.08
732	0.09
733	0.09
734	0.11
735	0.11
736	0.12
737	0.11
738	0.1
739	0.1
740	0.09
741	0.1
742	0.13
743	0.15
744	0.18
745	0.18
746	0.18
747	0.22
748	0.22
749	0.26
750	0.27
751	0.27
752	0.25
753	0.26
754	0.26
755	0.22
756	0.22
757	0.16
758	0.1
759	0.09
760	0.09
761	0.07
762	0.08
763	0.07
764	0.08
765	0.09
766	0.09
767	0.1
768	0.12
769	0.16
770	0.16
771	0.19
772	0.2
773	0.22
774	0.3
775	0.34
776	0.32
777	0.28
778	0.33
779	0.36
780	0.39
781	0.42
782	0.37
783	0.35
784	0.35
785	0.41
786	0.39
787	0.35
788	0.39
789	0.37
790	0.4
791	0.46
792	0.49
793	0.44
794	0.42
795	0.44
796	0.42
797	0.44
798	0.42
799	0.37
800	0.37
801	0.41
802	0.41
803	0.39
804	0.39
805	0.34
806	0.36
807	0.35
808	0.32
809	0.28
810	0.32
811	0.32
812	0.27
813	0.26
814	0.22
815	0.21
816	0.19
817	0.18
818	0.11
819	0.12
820	0.16
821	0.17
822	0.16
823	0.18
824	0.21
825	0.22
826	0.22
827	0.23
828	0.2
829	0.19
830	0.22
831	0.2
832	0.19
833	0.18
834	0.18
835	0.17
836	0.16
837	0.15
838	0.13
839	0.12
840	0.12
841	0.12
842	0.14
843	0.12
844	0.11
845	0.12
846	0.11
847	0.13
848	0.12
849	0.12
850	0.1
851	0.11
852	0.11
853	0.1
854	0.1
855	0.07
856	0.07
857	0.06
858	0.06
859	0.05
860	0.04
861	0.03
862	0.03
863	0.06
864	0.06
865	0.07
866	0.1
867	0.11
868	0.13
869	0.13
870	0.15
871	0.17
872	0.19
873	0.24
874	0.24
875	0.24
876	0.24
877	0.27
878	0.27
879	0.28
880	0.28
881	0.24
882	0.21
883	0.21
884	0.2
885	0.17
886	0.16
887	0.11
888	0.08
889	0.08
890	0.15
891	0.17
892	0.17
893	0.16
894	0.16
895	0.17
896	0.19
897	0.18
898	0.12
899	0.12
900	0.14
901	0.16
902	0.18
903	0.2
904	0.23
905	0.23
906	0.22
907	0.21
908	0.2
909	0.2
910	0.27
911	0.33
912	0.32
913	0.33
914	0.36
915	0.39
916	0.38
917	0.43
918	0.4
919	0.36
920	0.38
921	0.39
922	0.38
923	0.41
924	0.43
925	0.43
926	0.42
927	0.43
928	0.42
929	0.4
930	0.39
931	0.36
932	0.34
933	0.33
934	0.29
935	0.26
936	0.23
937	0.29
938	0.29
939	0.26
940	0.25
941	0.18
942	0.17
943	0.16
944	0.16
945	0.12
946	0.11
947	0.12
948	0.14
949	0.15
950	0.15
951	0.14
952	0.16
953	0.14
954	0.16
955	0.15
956	0.15
957	0.15
958	0.18
959	0.2
960	0.18
961	0.18
962	0.17
963	0.16
964	0.16
965	0.14
966	0.13
967	0.11
968	0.11
969	0.12
970	0.13
971	0.13
972	0.16
973	0.17
974	0.17
975	0.16
976	0.16
977	0.17
978	0.16
979	0.16
980	0.13
981	0.11
982	0.11
983	0.11
984	0.1
985	0.08
986	0.08
987	0.07
988	0.07
989	0.07
990	0.08
991	0.14
992	0.14
993	0.15
994	0.15
995	0.16
996	0.16
997	0.17
998	0.17
999	0.11
1000	0.1
1001	0.11
1002	0.13
1003	0.15
1004	0.15
1005	0.14
1006	0.13
1007	0.13
1008	0.13
1009	0.12
1010	0.1
1011	0.09
1012	0.14
1013	0.16
1014	0.17
1015	0.21
1016	0.21
1017	0.2
1018	0.2
1019	0.23
1020	0.23
1021	0.26
1022	0.27
1023	0.24
1024	0.24
1025	0.26
1026	0.26
1027	0.25
1028	0.19
1029	0.14
1030	0.12
1031	0.12
1032	0.12
1033	0.11
1034	0.11
1035	0.12
1036	0.12
1037	0.12
1038	0.15
1039	0.15
1040	0.16
1041	0.16
1042	0.16
1043	0.14
1044	0.19
1045	0.25
1046	0.24
1047	0.24
1048	0.24
1049	0.24
1050	0.24
1051	0.25
1052	0.22
1053	0.21
1054	0.21
1055	0.21
1056	0.2
1057	0.19
1058	0.18
1059	0.16
1060	0.14
1061	0.09
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.09
1066	0.1
1067	0.11
1068	0.1
1069	0.1
1070	0.11
1071	0.11
1072	0.13
1073	0.12
1074	0.12
1075	0.1
1076	0.13
1077	0.16
1078	0.16
1079	0.17
1080	0.17
1081	0.19
1082	0.21
1083	0.26
1084	0.28
1085	0.3
1086	0.29
1087	0.33
1088	0.35
1089	0.33
1090	0.36
1091	0.31
1092	0.31
1093	0.26
1094	0.26
1095	0.21
1096	0.17
1097	0.16
1098	0.12
1099	0.12
1100	0.1
1101	0.11
1102	0.11
1103	0.14
1104	0.15
1105	0.16
1106	0.18
1107	0.17
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.17
1111	0.19
1112	0.27
1113	0.28
1114	0.31
1115	0.31
1116	0.32
1117	0.31
1118	0.36
1119	0.39
1120	0.4
1121	0.44
1122	0.46
1123	0.48
1124	0.5
1125	0.53
1126	0.49
1127	0.49
1128	0.44
1129	0.46
1130	0.42
1131	0.46
1132	0.45
1133	0.44
1134	0.42
1135	0.33
1136	0.31
1137	0.24
1138	0.23
1139	0.18
1140	0.22
1141	0.23
1142	0.23
1143	0.22
1144	0.23
1145	0.26
1146	0.27
1147	0.26
1148	0.21
1149	0.19
1150	0.22
1151	0.24
1152	0.22
1153	0.16
1154	0.15
1155	0.16
1156	0.22
1157	0.27
1158	0.29
1159	0.34
1160	0.38
1161	0.41
1162	0.44
1163	0.49
1164	0.5
1165	0.5
1166	0.52
1167	0.5
1168	0.48
1169	0.47
1170	0.42
1171	0.35
1172	0.28
1173	0.21
1174	0.14
1175	0.12
1176	0.11
1177	0.12
1178	0.15
1179	0.15
1180	0.18
1181	0.19
1182	0.21
1183	0.19
1184	0.18
1185	0.22
1186	0.21
1187	0.21
1188	0.2
1189	0.2
1190	0.18
1191	0.19
1192	0.26
1193	0.28
1194	0.29
1195	0.31
1196	0.32
1197	0.41
1198	0.42

A0A401GEN6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer