FuNGI

A0A401H6N6

Protein Details

Accession

A0A401H6N6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
603-623	APSTPEKIAKMKKRSYRELVG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9, cysk 8, cyto 5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MDLQGPFDLSVTGYRYALAVIDDYSRKGWKAFLKAKNDATSEIKDLVTHLETFSDKKVKIVRSDGGGEFIGNDLQTYFKSKGIKHETSAPHTSPQHGVAECYNQTTHEHALCMLQEANMSSGFWPEAHAYASLVRNRSPTRALVESTPNEKFYGQKPDVSTLRIFGACCHVRVPPESRKKLDAHSLDGIFCGFAPNQKAYKIWIPSRHKFMVSRDVIVYENVPTMPEDDDQNPALSEGVTASKSTQSNSPDKAVGRETSATSPPHPPTPQTSASPAPAPIPMPPENQPSTASAPTPASTPAPAPMPTPAPAHLRRSECVTRPSWIKQAAEKQQAQEQATKTHNKAIKEACTLQRQMKVQARTAPEPIPEDATVPMTPEGDVTQVAYMAAFGTDTPMNFREATKCSEADNWWIAMHEEIDMLQRRGTWVLEDLPPGRKAISNRWTYVIKRGPQGEILRYKARLVAQGFSQIPGIDFNDTFSPTVRLESLRVILHLTAAHGWHRGQDDVTGAFLHSKVDIIIYMQQPVGFDDGTASGKPNFYLKMKEEDPNWLMGFELIDNPQEHTVSISHRQYISTILRRFKMEDCIPVPTPMESSLHLSVHDAPSTPEKIAKMKKRSYRELVGALTWISVISRPDVAFVSAHLAQFNANPGKRHWEATK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.14
3	0.14
4	0.14
5	0.12
6	0.09
7	0.09
8	0.14
9	0.15
10	0.17
11	0.19
12	0.21
13	0.22
14	0.22
15	0.27
16	0.29
17	0.39
18	0.47
19	0.53
20	0.59
21	0.66
22	0.71
23	0.71
24	0.66
25	0.6
26	0.55
27	0.5
28	0.45
29	0.4
30	0.33
31	0.27
32	0.26
33	0.25
34	0.22
35	0.19
36	0.16
37	0.16
38	0.18
39	0.2
40	0.25
41	0.28
42	0.26
43	0.31
44	0.38
45	0.41
46	0.46
47	0.5
48	0.47
49	0.45
50	0.5
51	0.45
52	0.41
53	0.36
54	0.29
55	0.23
56	0.2
57	0.16
58	0.1
59	0.1
60	0.07
61	0.08
62	0.09
63	0.14
64	0.14
65	0.17
66	0.23
67	0.25
68	0.35
69	0.44
70	0.47
71	0.45
72	0.53
73	0.56
74	0.57
75	0.62
76	0.53
77	0.51
78	0.48
79	0.49
80	0.42
81	0.38
82	0.37
83	0.3
84	0.3
85	0.26
86	0.3
87	0.27
88	0.27
89	0.24
90	0.2
91	0.22
92	0.23
93	0.25
94	0.2
95	0.2
96	0.18
97	0.2
98	0.19
99	0.19
100	0.16
101	0.12
102	0.12
103	0.12
104	0.13
105	0.11
106	0.11
107	0.09
108	0.09
109	0.1
110	0.09
111	0.1
112	0.1
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.11
117	0.15
118	0.2
119	0.22
120	0.23
121	0.23
122	0.29
123	0.3
124	0.33
125	0.32
126	0.3
127	0.31
128	0.33
129	0.33
130	0.31
131	0.36
132	0.36
133	0.39
134	0.37
135	0.33
136	0.31
137	0.29
138	0.28
139	0.26
140	0.33
141	0.29
142	0.32
143	0.33
144	0.39
145	0.4
146	0.4
147	0.36
148	0.27
149	0.28
150	0.25
151	0.22
152	0.17
153	0.24
154	0.22
155	0.22
156	0.22
157	0.21
158	0.21
159	0.25
160	0.32
161	0.33
162	0.43
163	0.49
164	0.5
165	0.54
166	0.54
167	0.55
168	0.57
169	0.49
170	0.44
171	0.43
172	0.41
173	0.36
174	0.33
175	0.29
176	0.19
177	0.16
178	0.13
179	0.07
180	0.09
181	0.12
182	0.15
183	0.17
184	0.18
185	0.18
186	0.2
187	0.27
188	0.3
189	0.33
190	0.39
191	0.47
192	0.51
193	0.58
194	0.57
195	0.53
196	0.5
197	0.49
198	0.5
199	0.43
200	0.4
201	0.33
202	0.32
203	0.3
204	0.27
205	0.23
206	0.13
207	0.12
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.1
214	0.11
215	0.11
216	0.14
217	0.14
218	0.14
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.09
223	0.07
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.12
230	0.12
231	0.13
232	0.17
233	0.2
234	0.25
235	0.27
236	0.29
237	0.28
238	0.28
239	0.29
240	0.27
241	0.23
242	0.2
243	0.2
244	0.19
245	0.19
246	0.22
247	0.2
248	0.2
249	0.25
250	0.24
251	0.27
252	0.26
253	0.25
254	0.27
255	0.32
256	0.33
257	0.29
258	0.31
259	0.28
260	0.29
261	0.28
262	0.23
263	0.18
264	0.16
265	0.15
266	0.12
267	0.16
268	0.16
269	0.18
270	0.2
271	0.24
272	0.25
273	0.25
274	0.25
275	0.22
276	0.24
277	0.22
278	0.2
279	0.16
280	0.15
281	0.14
282	0.14
283	0.13
284	0.1
285	0.09
286	0.1
287	0.09
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.13
294	0.14
295	0.15
296	0.19
297	0.21
298	0.25
299	0.29
300	0.3
301	0.29
302	0.35
303	0.37
304	0.34
305	0.35
306	0.32
307	0.3
308	0.31
309	0.33
310	0.32
311	0.31
312	0.29
313	0.29
314	0.35
315	0.4
316	0.43
317	0.42
318	0.38
319	0.38
320	0.41
321	0.38
322	0.35
323	0.28
324	0.26
325	0.28
326	0.31
327	0.28
328	0.31
329	0.32
330	0.29
331	0.33
332	0.32
333	0.32
334	0.32
335	0.36
336	0.34
337	0.35
338	0.37
339	0.35
340	0.36
341	0.33
342	0.36
343	0.38
344	0.36
345	0.35
346	0.38
347	0.39
348	0.36
349	0.38
350	0.32
351	0.27
352	0.27
353	0.24
354	0.21
355	0.17
356	0.16
357	0.13
358	0.14
359	0.12
360	0.11
361	0.11
362	0.09
363	0.09
364	0.08
365	0.08
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.04
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.08
382	0.09
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.14
387	0.16
388	0.21
389	0.21
390	0.21
391	0.2
392	0.23
393	0.23
394	0.24
395	0.23
396	0.19
397	0.17
398	0.16
399	0.15
400	0.12
401	0.11
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.09
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.12
411	0.13
412	0.13
413	0.1
414	0.1
415	0.12
416	0.13
417	0.15
418	0.17
419	0.19
420	0.2
421	0.19
422	0.18
423	0.18
424	0.19
425	0.27
426	0.33
427	0.34
428	0.35
429	0.39
430	0.41
431	0.4
432	0.46
433	0.44
434	0.39
435	0.39
436	0.4
437	0.37
438	0.4
439	0.42
440	0.4
441	0.38
442	0.39
443	0.38
444	0.36
445	0.35
446	0.32
447	0.31
448	0.3
449	0.26
450	0.24
451	0.21
452	0.27
453	0.26
454	0.23
455	0.23
456	0.17
457	0.15
458	0.15
459	0.15
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.12
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.14
468	0.13
469	0.14
470	0.14
471	0.13
472	0.14
473	0.16
474	0.18
475	0.16
476	0.16
477	0.16
478	0.14
479	0.14
480	0.13
481	0.12
482	0.1
483	0.1
484	0.11
485	0.12
486	0.12
487	0.14
488	0.16
489	0.16
490	0.15
491	0.15
492	0.16
493	0.14
494	0.15
495	0.12
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.13
507	0.13
508	0.15
509	0.15
510	0.15
511	0.15
512	0.16
513	0.16
514	0.1
515	0.09
516	0.09
517	0.11
518	0.12
519	0.12
520	0.13
521	0.12
522	0.13
523	0.14
524	0.16
525	0.17
526	0.18
527	0.24
528	0.25
529	0.32
530	0.34
531	0.38
532	0.37
533	0.41
534	0.4
535	0.38
536	0.35
537	0.27
538	0.24
539	0.2
540	0.2
541	0.12
542	0.13
543	0.1
544	0.12
545	0.13
546	0.15
547	0.16
548	0.15
549	0.14
550	0.14
551	0.15
552	0.17
553	0.25
554	0.26
555	0.29
556	0.29
557	0.3
558	0.28
559	0.33
560	0.37
561	0.38
562	0.42
563	0.44
564	0.46
565	0.48
566	0.5
567	0.47
568	0.47
569	0.42
570	0.43
571	0.4
572	0.44
573	0.43
574	0.42
575	0.4
576	0.31
577	0.29
578	0.23
579	0.22
580	0.17
581	0.21
582	0.22
583	0.21
584	0.21
585	0.21
586	0.24
587	0.25
588	0.25
589	0.2
590	0.19
591	0.25
592	0.27
593	0.25
594	0.24
595	0.24
596	0.32
597	0.42
598	0.49
599	0.54
600	0.61
601	0.69
602	0.75
603	0.81
604	0.81
605	0.79
606	0.76
607	0.72
608	0.65
609	0.56
610	0.49
611	0.39
612	0.31
613	0.22
614	0.16
615	0.1
616	0.1
617	0.1
618	0.11
619	0.14
620	0.14
621	0.16
622	0.17
623	0.18
624	0.16
625	0.16
626	0.2
627	0.19
628	0.19
629	0.18
630	0.17
631	0.16
632	0.18
633	0.25
634	0.28
635	0.28
636	0.3
637	0.32
638	0.41
639	0.42

A0A401H6N6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer