Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GD42

Protein Details
Accession A0A401GD42    Localization Confidence Low Confidence Score 5.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-222ALFAQKKRDNRNRNVECYNCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 18, cyto_nucl 11.333, cyto_pero 11.333, nucl 3.5, pero 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MASLNPHVKLPTLTGDNYYDWKFAVSMVMRRNACWDVVSGKVSKPAEDKLGDWPKKAEDGLTLIGLTVDPSQYGYIRDCTDGPAAWKALAAVYEKNSRANRIALKRQFYNFVHDPKCPIRDYISGITNLAAKLKGIGVVLEDEDVTDVLIFNLHEDYSNIAGTLTATKGDLKIADVTGALVDEEGRRGGLPKADDEKEVENMALFAQKKRDNRNRNVECYNCGKRGHIARDCRLPGRYNEKNSAKAEKASVAFDLRDIAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.28
4 0.32
5 0.31
6 0.25
7 0.21
8 0.21
9 0.18
10 0.15
11 0.19
12 0.19
13 0.23
14 0.28
15 0.35
16 0.35
17 0.35
18 0.4
19 0.34
20 0.32
21 0.26
22 0.23
23 0.18
24 0.21
25 0.23
26 0.2
27 0.2
28 0.26
29 0.26
30 0.26
31 0.26
32 0.26
33 0.29
34 0.28
35 0.29
36 0.32
37 0.42
38 0.42
39 0.4
40 0.39
41 0.35
42 0.36
43 0.35
44 0.26
45 0.17
46 0.19
47 0.19
48 0.17
49 0.15
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.07
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.13
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.12
80 0.17
81 0.18
82 0.24
83 0.24
84 0.25
85 0.26
86 0.28
87 0.33
88 0.35
89 0.44
90 0.43
91 0.47
92 0.47
93 0.47
94 0.49
95 0.43
96 0.44
97 0.38
98 0.4
99 0.38
100 0.35
101 0.38
102 0.35
103 0.38
104 0.3
105 0.27
106 0.23
107 0.23
108 0.27
109 0.26
110 0.25
111 0.22
112 0.21
113 0.2
114 0.18
115 0.15
116 0.12
117 0.08
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.09
176 0.12
177 0.13
178 0.17
179 0.23
180 0.24
181 0.25
182 0.26
183 0.27
184 0.26
185 0.25
186 0.2
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.2
194 0.26
195 0.32
196 0.43
197 0.53
198 0.59
199 0.67
200 0.77
201 0.77
202 0.79
203 0.81
204 0.73
205 0.67
206 0.66
207 0.63
208 0.57
209 0.5
210 0.44
211 0.44
212 0.5
213 0.54
214 0.53
215 0.55
216 0.57
217 0.65
218 0.67
219 0.65
220 0.6
221 0.54
222 0.54
223 0.56
224 0.58
225 0.56
226 0.62
227 0.63
228 0.66
229 0.67
230 0.67
231 0.6
232 0.55
233 0.51
234 0.47
235 0.43
236 0.37
237 0.35
238 0.3
239 0.27
240 0.24