Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GDF7

Protein Details
Accession A0A401GDF7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-291DDEGAPKKKKKKEGPGVTARNMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-283PKKKKKKEG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 4, pero 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MKTEQDPSTPMTTFSAAQWGPTQIPIDPALQQQSQQATSTYPHYQTYQHYPQASYSHYQQYAPPQTAQQIQSQAVAPTSRQAAQSNAMDTADIATLNDALGSAGVDLRAEEETLHRTYDQFQQSYRPYEDRTRTQPAAPNFNTQYLGTTMRAVGTQHKVTKVPEDSVNYMALALRARLQDLIVAMVAASEHRTDTQFDRPASHYADGSPMWSIVIRSDVGKQLAAIEKVERDEEVRVRRERKERAEAAAAQHAALAAQAGAGMGVDGGFDDEGAPKKKKKKEGPGVTARNMSEDVRKKMSNAVASQAAGLGTGKYAWMTAANANASVPAKPKPTATASAGSSGGANTPASAAAPAAGSTATAGGWARPYVPTRPSQQQMPQREDLRRAITLRDAMFVIEKERGHGGGRGSATGWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.27
3 0.22
4 0.23
5 0.24
6 0.24
7 0.23
8 0.25
9 0.25
10 0.17
11 0.21
12 0.21
13 0.2
14 0.2
15 0.22
16 0.25
17 0.24
18 0.25
19 0.27
20 0.29
21 0.29
22 0.27
23 0.25
24 0.21
25 0.23
26 0.27
27 0.28
28 0.25
29 0.26
30 0.27
31 0.3
32 0.34
33 0.41
34 0.44
35 0.45
36 0.45
37 0.44
38 0.46
39 0.46
40 0.44
41 0.38
42 0.35
43 0.37
44 0.36
45 0.36
46 0.35
47 0.41
48 0.45
49 0.44
50 0.41
51 0.34
52 0.37
53 0.42
54 0.41
55 0.36
56 0.33
57 0.31
58 0.31
59 0.31
60 0.28
61 0.23
62 0.22
63 0.17
64 0.16
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.19
69 0.2
70 0.24
71 0.27
72 0.25
73 0.23
74 0.21
75 0.18
76 0.17
77 0.16
78 0.11
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.08
99 0.11
100 0.12
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.16
105 0.24
106 0.28
107 0.26
108 0.26
109 0.32
110 0.35
111 0.4
112 0.4
113 0.34
114 0.33
115 0.4
116 0.45
117 0.45
118 0.48
119 0.5
120 0.48
121 0.49
122 0.51
123 0.47
124 0.5
125 0.46
126 0.46
127 0.4
128 0.4
129 0.37
130 0.31
131 0.29
132 0.21
133 0.22
134 0.16
135 0.15
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.15
141 0.17
142 0.21
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.26
147 0.32
148 0.29
149 0.27
150 0.26
151 0.27
152 0.27
153 0.27
154 0.26
155 0.2
156 0.17
157 0.15
158 0.12
159 0.09
160 0.07
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.04
176 0.03
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.08
181 0.11
182 0.18
183 0.22
184 0.22
185 0.25
186 0.26
187 0.28
188 0.29
189 0.27
190 0.2
191 0.16
192 0.17
193 0.15
194 0.13
195 0.1
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.1
218 0.08
219 0.11
220 0.15
221 0.2
222 0.26
223 0.3
224 0.34
225 0.41
226 0.48
227 0.53
228 0.56
229 0.59
230 0.56
231 0.54
232 0.55
233 0.5
234 0.44
235 0.41
236 0.34
237 0.24
238 0.21
239 0.17
240 0.12
241 0.1
242 0.07
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.03
258 0.05
259 0.09
260 0.14
261 0.18
262 0.23
263 0.33
264 0.4
265 0.5
266 0.58
267 0.65
268 0.72
269 0.79
270 0.83
271 0.85
272 0.85
273 0.78
274 0.72
275 0.61
276 0.52
277 0.43
278 0.34
279 0.32
280 0.32
281 0.33
282 0.34
283 0.34
284 0.33
285 0.38
286 0.41
287 0.38
288 0.32
289 0.31
290 0.28
291 0.28
292 0.27
293 0.21
294 0.16
295 0.11
296 0.1
297 0.07
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.07
306 0.08
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.19
317 0.2
318 0.21
319 0.23
320 0.27
321 0.31
322 0.32
323 0.33
324 0.31
325 0.33
326 0.32
327 0.27
328 0.23
329 0.18
330 0.15
331 0.11
332 0.1
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.09
352 0.09
353 0.1
354 0.13
355 0.17
356 0.21
357 0.25
358 0.3
359 0.35
360 0.43
361 0.46
362 0.5
363 0.56
364 0.6
365 0.64
366 0.67
367 0.68
368 0.66
369 0.67
370 0.66
371 0.63
372 0.59
373 0.55
374 0.49
375 0.44
376 0.43
377 0.43
378 0.38
379 0.34
380 0.29
381 0.25
382 0.26
383 0.24
384 0.21
385 0.21
386 0.2
387 0.2
388 0.22
389 0.22
390 0.22
391 0.24
392 0.24
393 0.25
394 0.27
395 0.25