Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GMW5

Protein Details
Accession A0A401GMW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-267KINRDIDKKSKFSRKRLNEDEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-138KKKARKARR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSAGPSAAVNVLHDLAEAAEEFVEKMTSTEDEAETEGNKEGEGKMTVEERKAKMDQLRKKMRSSALANRASVIEESTKAKVTAREAARLERQRKLAEILRTKADAEERGEDVERQKNWEWTIEENDEWEKKKARKARRADYEFHDDAHAARRRYKKDLDLIKPDLVAYNKQKEIAMGLAPGTLVKSSNGPSSLNDFDPKAGSSMQLVPTSQQQQLAAEYLYRDANSLLYADNKPSEEAIDRVVGKINRDIDKKSKFSRKRLNEDEGDITYINERNRVFNKKIARYYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.08
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.06
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.14
22 0.15
23 0.15
24 0.12
25 0.11
26 0.12
27 0.11
28 0.13
29 0.14
30 0.13
31 0.14
32 0.19
33 0.22
34 0.25
35 0.31
36 0.3
37 0.34
38 0.35
39 0.38
40 0.41
41 0.48
42 0.52
43 0.57
44 0.66
45 0.65
46 0.67
47 0.69
48 0.66
49 0.64
50 0.62
51 0.61
52 0.6
53 0.6
54 0.57
55 0.5
56 0.46
57 0.39
58 0.32
59 0.23
60 0.15
61 0.13
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.18
67 0.19
68 0.21
69 0.27
70 0.27
71 0.32
72 0.32
73 0.36
74 0.43
75 0.48
76 0.49
77 0.46
78 0.48
79 0.43
80 0.43
81 0.43
82 0.4
83 0.4
84 0.43
85 0.4
86 0.39
87 0.39
88 0.37
89 0.34
90 0.3
91 0.24
92 0.2
93 0.2
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.23
100 0.21
101 0.23
102 0.24
103 0.26
104 0.26
105 0.29
106 0.27
107 0.24
108 0.28
109 0.26
110 0.24
111 0.21
112 0.23
113 0.22
114 0.22
115 0.22
116 0.23
117 0.24
118 0.31
119 0.38
120 0.46
121 0.53
122 0.6
123 0.68
124 0.72
125 0.74
126 0.71
127 0.68
128 0.66
129 0.57
130 0.48
131 0.39
132 0.28
133 0.24
134 0.28
135 0.27
136 0.2
137 0.26
138 0.32
139 0.35
140 0.4
141 0.43
142 0.39
143 0.44
144 0.52
145 0.51
146 0.52
147 0.52
148 0.47
149 0.44
150 0.39
151 0.33
152 0.25
153 0.24
154 0.21
155 0.23
156 0.23
157 0.23
158 0.23
159 0.21
160 0.21
161 0.17
162 0.13
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.08
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.17
179 0.19
180 0.19
181 0.19
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.13
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.19
196 0.23
197 0.22
198 0.2
199 0.17
200 0.17
201 0.18
202 0.19
203 0.14
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.11
216 0.12
217 0.13
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.16
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.22
230 0.22
231 0.22
232 0.26
233 0.3
234 0.32
235 0.35
236 0.39
237 0.42
238 0.49
239 0.54
240 0.58
241 0.63
242 0.65
243 0.73
244 0.79
245 0.8
246 0.83
247 0.84
248 0.83
249 0.77
250 0.73
251 0.67
252 0.58
253 0.5
254 0.39
255 0.32
256 0.26
257 0.26
258 0.22
259 0.22
260 0.22
261 0.26
262 0.33
263 0.41
264 0.41
265 0.45
266 0.54
267 0.58
268 0.65
269 0.67
270 0.69
271 0.67
272 0.7
273 0.73
274 0.66
275 0.6
276 0.55
277 0.52
278 0.47
279 0.44
280 0.4
281 0.36
282 0.36
283 0.33