Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GKI0

Protein Details
Accession A0A401GKI0    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-195VNGFKTQKGGKKKGKGKKHKNAPIVAVHydrophilic
226-249EQLAEKRRAEERKRNRRSNSYSDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-189QKGGKKKGKGKKHKN
222-242EERREQLAEKRRAEERKRNRR
541-551KGKGRGGKAKE
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 5.5, cyto_nucl 5.5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS50102  RRM  
CDD cd12374  RRM_UHM_SPF45_PUF60  
Amino Acid Sequences MSSRAGGLYGGIQFSSTKAFSSSTPQNAVQTPVTAPVEKTEVTATPSTDQPSTVPPVENASATASISTTFDAGASAKATAGWSASLAFAPIRRNQAQKAKPAAPRLPVGAAMTTAMGAGAPAAISSTAIVFAPPALVEPAKPAETQNQPQGQGWGRKVKPPSMVLDEDVNGFKTQKGGKKKGKGKKHKNAPIVAVWDPTEQYNPMRPNDYNEYKNHKRHEHEERREQLAEKRRAEERKRNRRSNSYSDSYGSGSDDERPRKAGRFDDRDDYRNEEDYDKPRGPGSGPPGQPPPAAMPMNLTGDEAYQRRLAMSAAFRRAASPGPPTSSTTPVTSTEFVIPSSSSARSSVSSTVPQAPVSGLPPSFSPAAADDEDEDVIPGLNVPSAPRILQGETGEDAYLRRLALSQASPPSAPAREERDGSPLAYNPFAPPSSVPPPPTLAPPMGTTLSEEKVRSSQQVAAAIAAKLRALAPPAGSDSPELSAASSSQSPVPEAAPKRPDPRGFAERLMAKWGHKEGQGLGADGSGIVHALTVEQVAGGKGKGRGGKAKEQGNKSIGVGSKMGKIVNLNEDAKTREDRERFGEPSRVVVLTNMVGPEDVGDEDLREEIGDECSKNGTVERVIVHLVQPPPEEPEDAVRIFVLFAGPVGAWKTVRELDGRYFGGRSVRARYFPEARFNQFAFDAPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.16
3 0.13
4 0.12
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.24
9 0.31
10 0.33
11 0.37
12 0.38
13 0.41
14 0.41
15 0.44
16 0.37
17 0.31
18 0.26
19 0.27
20 0.29
21 0.26
22 0.24
23 0.23
24 0.25
25 0.23
26 0.23
27 0.2
28 0.18
29 0.21
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.24
34 0.26
35 0.24
36 0.24
37 0.21
38 0.23
39 0.27
40 0.28
41 0.26
42 0.24
43 0.28
44 0.29
45 0.28
46 0.24
47 0.21
48 0.19
49 0.18
50 0.17
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.11
76 0.15
77 0.19
78 0.26
79 0.3
80 0.34
81 0.41
82 0.51
83 0.54
84 0.59
85 0.63
86 0.63
87 0.65
88 0.69
89 0.66
90 0.6
91 0.57
92 0.5
93 0.43
94 0.37
95 0.32
96 0.24
97 0.19
98 0.15
99 0.13
100 0.1
101 0.08
102 0.06
103 0.05
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.02
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.11
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.22
131 0.29
132 0.33
133 0.38
134 0.4
135 0.4
136 0.41
137 0.44
138 0.43
139 0.43
140 0.43
141 0.45
142 0.41
143 0.46
144 0.49
145 0.49
146 0.48
147 0.45
148 0.45
149 0.41
150 0.42
151 0.37
152 0.36
153 0.31
154 0.27
155 0.25
156 0.21
157 0.15
158 0.14
159 0.12
160 0.15
161 0.2
162 0.25
163 0.35
164 0.43
165 0.52
166 0.62
167 0.71
168 0.76
169 0.82
170 0.86
171 0.88
172 0.88
173 0.9
174 0.89
175 0.87
176 0.83
177 0.76
178 0.69
179 0.62
180 0.53
181 0.43
182 0.35
183 0.28
184 0.23
185 0.2
186 0.17
187 0.13
188 0.14
189 0.2
190 0.22
191 0.23
192 0.27
193 0.27
194 0.31
195 0.39
196 0.43
197 0.4
198 0.43
199 0.5
200 0.55
201 0.61
202 0.62
203 0.6
204 0.59
205 0.62
206 0.68
207 0.7
208 0.71
209 0.74
210 0.72
211 0.7
212 0.67
213 0.61
214 0.57
215 0.57
216 0.56
217 0.48
218 0.47
219 0.49
220 0.56
221 0.62
222 0.65
223 0.66
224 0.69
225 0.77
226 0.82
227 0.82
228 0.83
229 0.83
230 0.81
231 0.78
232 0.71
233 0.64
234 0.56
235 0.5
236 0.41
237 0.33
238 0.24
239 0.17
240 0.13
241 0.16
242 0.21
243 0.22
244 0.22
245 0.25
246 0.26
247 0.29
248 0.32
249 0.34
250 0.37
251 0.42
252 0.44
253 0.5
254 0.52
255 0.51
256 0.5
257 0.47
258 0.4
259 0.35
260 0.33
261 0.27
262 0.28
263 0.29
264 0.34
265 0.29
266 0.27
267 0.25
268 0.24
269 0.23
270 0.23
271 0.25
272 0.27
273 0.27
274 0.29
275 0.31
276 0.32
277 0.3
278 0.27
279 0.23
280 0.2
281 0.2
282 0.17
283 0.16
284 0.17
285 0.18
286 0.17
287 0.15
288 0.09
289 0.09
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.15
300 0.18
301 0.2
302 0.21
303 0.21
304 0.21
305 0.21
306 0.2
307 0.16
308 0.16
309 0.14
310 0.16
311 0.18
312 0.2
313 0.21
314 0.24
315 0.23
316 0.2
317 0.21
318 0.19
319 0.2
320 0.18
321 0.17
322 0.15
323 0.14
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.12
337 0.13
338 0.14
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.15
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.09
392 0.1
393 0.13
394 0.14
395 0.15
396 0.15
397 0.15
398 0.17
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.2
403 0.22
404 0.24
405 0.23
406 0.25
407 0.25
408 0.25
409 0.23
410 0.18
411 0.17
412 0.16
413 0.16
414 0.12
415 0.14
416 0.13
417 0.12
418 0.11
419 0.15
420 0.19
421 0.22
422 0.22
423 0.22
424 0.24
425 0.25
426 0.26
427 0.23
428 0.19
429 0.17
430 0.17
431 0.18
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.16
437 0.17
438 0.16
439 0.15
440 0.17
441 0.19
442 0.18
443 0.18
444 0.19
445 0.2
446 0.23
447 0.22
448 0.2
449 0.2
450 0.18
451 0.16
452 0.13
453 0.1
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.11
478 0.11
479 0.12
480 0.18
481 0.2
482 0.26
483 0.3
484 0.34
485 0.39
486 0.45
487 0.47
488 0.45
489 0.5
490 0.51
491 0.48
492 0.45
493 0.46
494 0.42
495 0.39
496 0.39
497 0.32
498 0.26
499 0.27
500 0.29
501 0.26
502 0.25
503 0.26
504 0.22
505 0.27
506 0.27
507 0.23
508 0.2
509 0.17
510 0.15
511 0.13
512 0.12
513 0.05
514 0.04
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.04
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.09
528 0.1
529 0.14
530 0.18
531 0.21
532 0.29
533 0.33
534 0.43
535 0.46
536 0.53
537 0.58
538 0.59
539 0.62
540 0.57
541 0.52
542 0.44
543 0.42
544 0.35
545 0.29
546 0.27
547 0.22
548 0.24
549 0.24
550 0.23
551 0.19
552 0.19
553 0.2
554 0.23
555 0.27
556 0.25
557 0.25
558 0.27
559 0.28
560 0.29
561 0.3
562 0.29
563 0.32
564 0.33
565 0.35
566 0.39
567 0.43
568 0.44
569 0.44
570 0.48
571 0.39
572 0.4
573 0.39
574 0.34
575 0.28
576 0.25
577 0.22
578 0.16
579 0.17
580 0.13
581 0.11
582 0.1
583 0.1
584 0.1
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.08
591 0.09
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.11
597 0.14
598 0.14
599 0.14
600 0.16
601 0.17
602 0.17
603 0.17
604 0.16
605 0.15
606 0.18
607 0.18
608 0.18
609 0.2
610 0.2
611 0.2
612 0.23
613 0.23
614 0.23
615 0.24
616 0.23
617 0.26
618 0.26
619 0.26
620 0.21
621 0.25
622 0.27
623 0.26
624 0.25
625 0.2
626 0.19
627 0.17
628 0.17
629 0.11
630 0.06
631 0.06
632 0.07
633 0.06
634 0.08
635 0.1
636 0.11
637 0.11
638 0.12
639 0.17
640 0.18
641 0.21
642 0.22
643 0.24
644 0.28
645 0.34
646 0.36
647 0.33
648 0.3
649 0.3
650 0.34
651 0.34
652 0.33
653 0.34
654 0.37
655 0.4
656 0.44
657 0.5
658 0.52
659 0.52
660 0.59
661 0.57
662 0.58
663 0.61
664 0.56
665 0.52
666 0.44