Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401H3X4

Protein Details
Accession A0A401H3X4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
447-468VNTLVAKRKKDKKRIQPNFVGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
453-460KRKKDKKR
Subcellular Location(s) plas 20, nucl 2, E.R. 2, mito 1, cyto 1, golg 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MRFTKPAWVIHKDAMMKGEQSKRLSIFSVHVHPDGSRIATGGLDAKVRIWSTKPILNSASELSGRPPKSLCTLQMHTGPVLVVRWAHSGRWLASGSDDEIVMIWDLDPTARGKVWGSDEVNVEGWKPLKRLPGHESDVTDVSWSPGDRYLATVGLDSQVLIWCGYTLERLRKIDQHQGFVKGVCWDPVGEFLATGSDDRSVRIWRTTDWHLEAEIRKPFDHSPGTFFRRLSWSPDGAHITASNATNNEGYVFIAAVISRNTWTSEISLVGHENTVEVAAYNPHIFLRDPFLPVVASNICSVVALGADDRAVSVWQTKSARPLIVAKEVFERQIMDLSWAQDGLTLYAVSSDGTMAVFSFDADELEGIAPLSAQEQYLKKFGFTPPPLPEGYSHPIPVQHPVLQKAISTRITPPPSPSRPQTQVPPHHVHSQSDFGVTINGSGCGEHVNTLVAKRKKDKKRIQPNFVGSLAGSVPSAANEAAPPGGISAPSSVAAPSTRSFGEVPGASSSVPLPPPLSFAAPGQSFGSSTSAFGLESTVSEDVEMFPMDSSEVRISSLDTSGQVGGKGKRKAIDVMDDRVPSKPRTLGGDRVRETVQVREIASGGTGLAVQGSALGLWNEQPNLAGRLEVPPLLTYLKVTVEGNEDIFEGRNPEGDGSAEVLYVNGRQTQWLDYLPSPVLALAATTVFCAVAMQDGSVNVYSPTGRRLMPTLSIGVPCSCLSGSKGSLMLLTSTGQLHVWNVKKQRATFPPVSLLPILGSSPNCTILSASVRPNGVPVIQLSSGVAHSYDPGLSSWVKLSDMWWAEGSDAWQGRQRTSSSNNRGVISVVESAISERVDDQSVAGKQRPPWWNAALTLGHLETKLHAAKALDSPHEYKQALLLYAKKIADEAFRGKAEELVKELFGPVYWRPGREDSWSPTLLGFSKRDLLKDVLAVFARSKTLTKLAMDWQDMLKKASSEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.36
3 0.33
4 0.37
5 0.41
6 0.41
7 0.42
8 0.45
9 0.45
10 0.44
11 0.44
12 0.38
13 0.34
14 0.34
15 0.38
16 0.37
17 0.35
18 0.34
19 0.32
20 0.32
21 0.3
22 0.26
23 0.19
24 0.15
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.18
34 0.19
35 0.2
36 0.19
37 0.26
38 0.3
39 0.34
40 0.35
41 0.36
42 0.38
43 0.37
44 0.37
45 0.31
46 0.3
47 0.27
48 0.26
49 0.25
50 0.32
51 0.31
52 0.3
53 0.29
54 0.28
55 0.34
56 0.38
57 0.39
58 0.39
59 0.42
60 0.45
61 0.49
62 0.48
63 0.41
64 0.37
65 0.31
66 0.23
67 0.2
68 0.16
69 0.12
70 0.12
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.22
75 0.25
76 0.25
77 0.29
78 0.28
79 0.23
80 0.23
81 0.25
82 0.22
83 0.18
84 0.17
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.08
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.1
98 0.12
99 0.12
100 0.17
101 0.22
102 0.28
103 0.28
104 0.29
105 0.31
106 0.32
107 0.33
108 0.28
109 0.24
110 0.2
111 0.21
112 0.21
113 0.2
114 0.22
115 0.29
116 0.32
117 0.39
118 0.42
119 0.48
120 0.5
121 0.52
122 0.5
123 0.45
124 0.43
125 0.36
126 0.31
127 0.22
128 0.18
129 0.16
130 0.15
131 0.13
132 0.15
133 0.16
134 0.15
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.12
153 0.16
154 0.23
155 0.29
156 0.32
157 0.36
158 0.42
159 0.47
160 0.52
161 0.51
162 0.51
163 0.48
164 0.5
165 0.48
166 0.42
167 0.38
168 0.32
169 0.29
170 0.22
171 0.19
172 0.15
173 0.14
174 0.16
175 0.17
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.13
187 0.16
188 0.17
189 0.22
190 0.22
191 0.21
192 0.27
193 0.31
194 0.35
195 0.35
196 0.34
197 0.3
198 0.34
199 0.35
200 0.35
201 0.35
202 0.31
203 0.27
204 0.29
205 0.3
206 0.31
207 0.35
208 0.3
209 0.31
210 0.37
211 0.43
212 0.44
213 0.42
214 0.39
215 0.4
216 0.4
217 0.41
218 0.38
219 0.35
220 0.33
221 0.38
222 0.38
223 0.32
224 0.31
225 0.24
226 0.21
227 0.21
228 0.2
229 0.17
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.05
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.15
274 0.15
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.16
280 0.18
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.08
300 0.09
301 0.14
302 0.17
303 0.17
304 0.23
305 0.26
306 0.26
307 0.23
308 0.28
309 0.26
310 0.32
311 0.31
312 0.27
313 0.29
314 0.29
315 0.27
316 0.23
317 0.2
318 0.13
319 0.15
320 0.14
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.07
361 0.09
362 0.11
363 0.16
364 0.16
365 0.15
366 0.18
367 0.2
368 0.26
369 0.27
370 0.31
371 0.3
372 0.33
373 0.33
374 0.31
375 0.3
376 0.27
377 0.29
378 0.24
379 0.22
380 0.2
381 0.22
382 0.21
383 0.24
384 0.2
385 0.2
386 0.21
387 0.23
388 0.24
389 0.22
390 0.22
391 0.2
392 0.22
393 0.19
394 0.18
395 0.19
396 0.25
397 0.28
398 0.28
399 0.31
400 0.35
401 0.38
402 0.41
403 0.41
404 0.41
405 0.42
406 0.44
407 0.47
408 0.47
409 0.5
410 0.54
411 0.55
412 0.51
413 0.54
414 0.53
415 0.46
416 0.39
417 0.35
418 0.28
419 0.24
420 0.21
421 0.13
422 0.13
423 0.11
424 0.1
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.08
437 0.16
438 0.19
439 0.21
440 0.29
441 0.39
442 0.48
443 0.58
444 0.67
445 0.69
446 0.78
447 0.85
448 0.85
449 0.83
450 0.78
451 0.71
452 0.61
453 0.5
454 0.38
455 0.29
456 0.21
457 0.13
458 0.09
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.09
484 0.08
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.12
489 0.11
490 0.12
491 0.11
492 0.11
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.1
505 0.1
506 0.13
507 0.12
508 0.13
509 0.12
510 0.11
511 0.1
512 0.1
513 0.12
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.05
522 0.05
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.08
545 0.07
546 0.08
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.11
551 0.15
552 0.22
553 0.24
554 0.24
555 0.26
556 0.27
557 0.3
558 0.28
559 0.32
560 0.29
561 0.31
562 0.33
563 0.31
564 0.31
565 0.3
566 0.31
567 0.23
568 0.22
569 0.21
570 0.18
571 0.24
572 0.27
573 0.33
574 0.38
575 0.45
576 0.44
577 0.45
578 0.44
579 0.4
580 0.37
581 0.31
582 0.27
583 0.2
584 0.19
585 0.17
586 0.17
587 0.14
588 0.13
589 0.1
590 0.07
591 0.05
592 0.04
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.02
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.07
608 0.08
609 0.11
610 0.1
611 0.09
612 0.09
613 0.11
614 0.12
615 0.12
616 0.11
617 0.09
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.12
628 0.13
629 0.13
630 0.12
631 0.12
632 0.11
633 0.11
634 0.1
635 0.09
636 0.08
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.08
646 0.08
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.09
654 0.1
655 0.12
656 0.14
657 0.14
658 0.17
659 0.15
660 0.18
661 0.17
662 0.16
663 0.14
664 0.12
665 0.11
666 0.07
667 0.07
668 0.04
669 0.05
670 0.04
671 0.04
672 0.05
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.06
682 0.07
683 0.07
684 0.08
685 0.06
686 0.07
687 0.07
688 0.08
689 0.1
690 0.11
691 0.12
692 0.13
693 0.15
694 0.17
695 0.18
696 0.2
697 0.2
698 0.19
699 0.2
700 0.2
701 0.17
702 0.17
703 0.15
704 0.14
705 0.11
706 0.11
707 0.12
708 0.15
709 0.15
710 0.15
711 0.15
712 0.14
713 0.15
714 0.14
715 0.13
716 0.1
717 0.1
718 0.09
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.1
724 0.16
725 0.19
726 0.24
727 0.3
728 0.35
729 0.4
730 0.43
731 0.5
732 0.51
733 0.55
734 0.53
735 0.51
736 0.51
737 0.47
738 0.46
739 0.37
740 0.3
741 0.23
742 0.18
743 0.16
744 0.12
745 0.12
746 0.12
747 0.13
748 0.16
749 0.15
750 0.15
751 0.15
752 0.15
753 0.2
754 0.21
755 0.23
756 0.23
757 0.24
758 0.23
759 0.24
760 0.22
761 0.17
762 0.15
763 0.13
764 0.14
765 0.13
766 0.14
767 0.13
768 0.13
769 0.13
770 0.12
771 0.11
772 0.07
773 0.07
774 0.08
775 0.08
776 0.08
777 0.08
778 0.1
779 0.11
780 0.11
781 0.13
782 0.13
783 0.13
784 0.13
785 0.13
786 0.18
787 0.19
788 0.2
789 0.19
790 0.18
791 0.18
792 0.18
793 0.19
794 0.17
795 0.16
796 0.16
797 0.2
798 0.21
799 0.23
800 0.26
801 0.27
802 0.27
803 0.34
804 0.44
805 0.48
806 0.55
807 0.57
808 0.54
809 0.52
810 0.46
811 0.4
812 0.32
813 0.24
814 0.16
815 0.13
816 0.12
817 0.12
818 0.13
819 0.12
820 0.09
821 0.08
822 0.1
823 0.12
824 0.12
825 0.11
826 0.17
827 0.2
828 0.24
829 0.26
830 0.29
831 0.31
832 0.4
833 0.46
834 0.43
835 0.45
836 0.46
837 0.45
838 0.42
839 0.43
840 0.35
841 0.29
842 0.29
843 0.23
844 0.2
845 0.17
846 0.16
847 0.12
848 0.18
849 0.18
850 0.16
851 0.18
852 0.18
853 0.21
854 0.26
855 0.29
856 0.27
857 0.29
858 0.32
859 0.34
860 0.4
861 0.37
862 0.32
863 0.32
864 0.31
865 0.3
866 0.3
867 0.3
868 0.26
869 0.32
870 0.32
871 0.28
872 0.26
873 0.25
874 0.25
875 0.26
876 0.28
877 0.28
878 0.29
879 0.3
880 0.3
881 0.33
882 0.31
883 0.28
884 0.26
885 0.23
886 0.22
887 0.21
888 0.21
889 0.17
890 0.15
891 0.16
892 0.14
893 0.22
894 0.24
895 0.25
896 0.3
897 0.34
898 0.37
899 0.4
900 0.46
901 0.42
902 0.47
903 0.46
904 0.42
905 0.38
906 0.38
907 0.34
908 0.32
909 0.27
910 0.24
911 0.3
912 0.31
913 0.32
914 0.34
915 0.34
916 0.31
917 0.34
918 0.31
919 0.28
920 0.28
921 0.28
922 0.25
923 0.23
924 0.23
925 0.2
926 0.21
927 0.2
928 0.24
929 0.27
930 0.27
931 0.29
932 0.35
933 0.41
934 0.41
935 0.4
936 0.4
937 0.41
938 0.41
939 0.39
940 0.34