Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GDP4

Protein Details
Accession A0A401GDP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-212MDEGEPRKKSRKRKRDSEPAPAKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-244PRKKSRKRKRDSEPAPAKTSRAKSKPKKESAEPAPKKKAAGGKGRRNGVKS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035503  IOC4-like_PWWP  
IPR000313  PWWP_dom  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PF00855  PWWP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50812  PWWP  
CDD cd05840  PWWP_ScIOC4-like  
Amino Acid Sequences MRGPGYAERGVEGLLLTINRDHSLANVPRPPPLPPFFRSYASIMSKKNAKTQPPKDNSYELRDVVLAKVRGYPPWPGMIVDPESVPQNVSNERPNAKSKKGNWYCVRFFPAGDYAWMVPKDISKLQPHEIQAYINEPYKRSGDLLQGYRIALDPTKWEEEREALRAEAAEAEANAEVDQLDASEEDEDMDEGEPRKKSRKRKRDSEPAPAKTSRAKSKPKKESAEPAPKKKAAGGKGRRNGVKSKAMVESEDEGAEPEEEDAGPSKQTSPPPAKKAKRENQGEEEGESAQSNDPEAMKVREWRHKLQKAFLGKVVPKEEEMPPLDQLFATIENYENMTIHCLSFSKIGKVMRHLHALSEEKVPRDSEFKFRDRAKALVDKWQDIVNANKTNGEPKTSANGASASPQNKPEATNGKVQSEEPKEGHELAMEVDADADADAKGEEAPAADAEAEEEPDDAHADPAGDESVLADVTMSEAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.23
11 0.27
12 0.33
13 0.38
14 0.38
15 0.43
16 0.45
17 0.46
18 0.44
19 0.45
20 0.44
21 0.4
22 0.46
23 0.44
24 0.46
25 0.46
26 0.42
27 0.44
28 0.45
29 0.48
30 0.43
31 0.45
32 0.5
33 0.49
34 0.55
35 0.54
36 0.57
37 0.61
38 0.69
39 0.74
40 0.74
41 0.78
42 0.73
43 0.75
44 0.7
45 0.67
46 0.62
47 0.51
48 0.45
49 0.4
50 0.36
51 0.3
52 0.33
53 0.25
54 0.21
55 0.26
56 0.26
57 0.27
58 0.29
59 0.3
60 0.25
61 0.28
62 0.28
63 0.22
64 0.23
65 0.25
66 0.25
67 0.22
68 0.2
69 0.17
70 0.18
71 0.17
72 0.17
73 0.13
74 0.14
75 0.17
76 0.19
77 0.24
78 0.28
79 0.31
80 0.35
81 0.42
82 0.45
83 0.49
84 0.55
85 0.55
86 0.61
87 0.66
88 0.71
89 0.71
90 0.73
91 0.71
92 0.67
93 0.67
94 0.56
95 0.49
96 0.42
97 0.37
98 0.29
99 0.25
100 0.22
101 0.17
102 0.2
103 0.2
104 0.17
105 0.14
106 0.15
107 0.18
108 0.2
109 0.24
110 0.26
111 0.3
112 0.33
113 0.38
114 0.38
115 0.37
116 0.34
117 0.3
118 0.25
119 0.24
120 0.23
121 0.22
122 0.22
123 0.2
124 0.21
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.21
129 0.22
130 0.27
131 0.29
132 0.29
133 0.29
134 0.28
135 0.26
136 0.24
137 0.19
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.14
142 0.19
143 0.19
144 0.19
145 0.19
146 0.23
147 0.25
148 0.25
149 0.22
150 0.17
151 0.17
152 0.16
153 0.15
154 0.11
155 0.09
156 0.07
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.04
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.08
179 0.11
180 0.13
181 0.15
182 0.25
183 0.31
184 0.42
185 0.52
186 0.61
187 0.67
188 0.76
189 0.84
190 0.86
191 0.86
192 0.86
193 0.85
194 0.79
195 0.75
196 0.65
197 0.57
198 0.52
199 0.5
200 0.48
201 0.46
202 0.52
203 0.56
204 0.66
205 0.75
206 0.77
207 0.77
208 0.72
209 0.73
210 0.73
211 0.75
212 0.7
213 0.68
214 0.66
215 0.61
216 0.57
217 0.51
218 0.47
219 0.42
220 0.46
221 0.48
222 0.51
223 0.56
224 0.61
225 0.59
226 0.56
227 0.54
228 0.49
229 0.46
230 0.37
231 0.35
232 0.33
233 0.31
234 0.29
235 0.26
236 0.22
237 0.16
238 0.15
239 0.12
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.08
253 0.11
254 0.13
255 0.19
256 0.27
257 0.34
258 0.41
259 0.51
260 0.56
261 0.61
262 0.7
263 0.73
264 0.73
265 0.74
266 0.73
267 0.69
268 0.68
269 0.6
270 0.5
271 0.42
272 0.33
273 0.26
274 0.2
275 0.14
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.19
286 0.24
287 0.31
288 0.36
289 0.44
290 0.52
291 0.57
292 0.59
293 0.58
294 0.6
295 0.58
296 0.55
297 0.5
298 0.45
299 0.4
300 0.43
301 0.4
302 0.33
303 0.28
304 0.28
305 0.27
306 0.26
307 0.26
308 0.23
309 0.21
310 0.2
311 0.2
312 0.16
313 0.15
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.08
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.09
329 0.1
330 0.16
331 0.17
332 0.17
333 0.2
334 0.25
335 0.26
336 0.33
337 0.39
338 0.36
339 0.41
340 0.38
341 0.36
342 0.37
343 0.38
344 0.34
345 0.35
346 0.33
347 0.29
348 0.3
349 0.3
350 0.26
351 0.27
352 0.27
353 0.29
354 0.34
355 0.36
356 0.42
357 0.44
358 0.51
359 0.49
360 0.5
361 0.46
362 0.48
363 0.46
364 0.48
365 0.49
366 0.42
367 0.4
368 0.4
369 0.34
370 0.28
371 0.33
372 0.31
373 0.32
374 0.31
375 0.32
376 0.31
377 0.36
378 0.35
379 0.33
380 0.27
381 0.25
382 0.31
383 0.29
384 0.3
385 0.24
386 0.24
387 0.2
388 0.23
389 0.27
390 0.22
391 0.24
392 0.25
393 0.27
394 0.27
395 0.28
396 0.32
397 0.34
398 0.35
399 0.41
400 0.41
401 0.41
402 0.41
403 0.41
404 0.42
405 0.4
406 0.43
407 0.35
408 0.35
409 0.36
410 0.35
411 0.34
412 0.26
413 0.2
414 0.16
415 0.17
416 0.13
417 0.1
418 0.09
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.08
442 0.09
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.1
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.05