FuNGI

A0A401H1S6

Protein Details

Accession

A0A401H1S6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MATTARQPKPNRKGPPEPANRVRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-13	K

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD

Amino Acid Sequences

MATTARQPKPNRKGPPEPANRVRAPAWSSPGPRASPTFSPGATPVRLPNGPQSASPAAFPPLGHANGAPSPAPTRPDKDDRVLAQLSGLTGTTITLSTKTNVRYEGSVLSTNAEGDTTGVTLRDVKDLTVPGAPLRDTLFIAATNIDQWSSGPADAKLTNGDTFKTDTDISQKTGRRERELQAWQPHPDDPSAPSASASTSNSAAPPARTTDDETFGSGSQGASWDQFAVNERLFGVRAQFDEEAYTTRLDRSAPDFKERERQAAKIASEILSSSTSNTHIAEERTQNFVGVAEGANEEDKYGAVVRSANAYVPPGARKGPLPSTNGTAKSPPDIPKVAVNAPDGSAVPAAEKEAGSAQPAADAVPAFRDFVSSEKDRLMKKKQALMKNEMDKRLADLVKFSQNFKLNKPIPDDLVPILAKDEDKQRQIREKSTKDAESSHARAIGATTLTTTASPTVARAVPSAAAAGPATAKVAPELTRQALSKSGTIPPAAQKNATVPSKPGEPPKGRISMVIQSIPPFRGKRVSTAGHSATSSSTQGAARASLNTNVAAQQGGHSPLSPGAANRLNVNASSFRPNVKQFSPPGGSPRLNGTPSSSASPKTKPADSASSVSPVPAPPNPFFGTRTIKKTPPVHIKDDFNPFKHGKVPDAKQVPWTWPYTGKRYMQLFPPPQMQPQPQSPHMQHPGPPQPPPQPTYEEESAAQAATRGYVYAYPPYGYPQQMQMIPGMGPPPPGAYIPGPPAFMQPMAYPMPPPNAMYPSTPMGQMQPYGMPPPPPGAYPPPNGAGPRPSMPPTPIPSHAHPYYHQSPQLQHAVPYQMMMPPPGPHGYDQAQAPPVQMGGHA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.89
3	0.88
4	0.88
5	0.87
6	0.85
7	0.77
8	0.71
9	0.62
10	0.58
11	0.52
12	0.48
13	0.46
14	0.45
15	0.46
16	0.49
17	0.53
18	0.49
19	0.47
20	0.45
21	0.44
22	0.4
23	0.4
24	0.38
25	0.32
26	0.32
27	0.33
28	0.34
29	0.3
30	0.29
31	0.29
32	0.31
33	0.32
34	0.32
35	0.37
36	0.38
37	0.38
38	0.36
39	0.39
40	0.37
41	0.37
42	0.35
43	0.29
44	0.25
45	0.25
46	0.24
47	0.21
48	0.22
49	0.22
50	0.22
51	0.2
52	0.21
53	0.22
54	0.24
55	0.2
56	0.16
57	0.18
58	0.2
59	0.24
60	0.25
61	0.28
62	0.34
63	0.42
64	0.46
65	0.5
66	0.55
67	0.53
68	0.55
69	0.51
70	0.43
71	0.36
72	0.31
73	0.25
74	0.18
75	0.16
76	0.09
77	0.07
78	0.08
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.08
83	0.1
84	0.12
85	0.17
86	0.21
87	0.23
88	0.25
89	0.26
90	0.27
91	0.27
92	0.29
93	0.27
94	0.27
95	0.24
96	0.23
97	0.21
98	0.2
99	0.17
100	0.13
101	0.1
102	0.07
103	0.08
104	0.07
105	0.07
106	0.06
107	0.07
108	0.1
109	0.11
110	0.15
111	0.14
112	0.15
113	0.18
114	0.19
115	0.2
116	0.19
117	0.19
118	0.16
119	0.18
120	0.18
121	0.15
122	0.16
123	0.16
124	0.14
125	0.14
126	0.14
127	0.12
128	0.13
129	0.12
130	0.1
131	0.1
132	0.1
133	0.09
134	0.08
135	0.08
136	0.09
137	0.1
138	0.11
139	0.12
140	0.12
141	0.15
142	0.16
143	0.16
144	0.16
145	0.17
146	0.19
147	0.18
148	0.18
149	0.16
150	0.18
151	0.18
152	0.19
153	0.17
154	0.15
155	0.21
156	0.23
157	0.25
158	0.3
159	0.34
160	0.38
161	0.46
162	0.5
163	0.5
164	0.54
165	0.55
166	0.57
167	0.61
168	0.61
169	0.62
170	0.62
171	0.58
172	0.54
173	0.52
174	0.43
175	0.37
176	0.3
177	0.23
178	0.24
179	0.23
180	0.21
181	0.19
182	0.18
183	0.18
184	0.19
185	0.18
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.14
190	0.16
191	0.16
192	0.14
193	0.15
194	0.16
195	0.17
196	0.18
197	0.24
198	0.24
199	0.27
200	0.26
201	0.26
202	0.24
203	0.22
204	0.21
205	0.15
206	0.12
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.09
215	0.12
216	0.14
217	0.13
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.14
222	0.13
223	0.13
224	0.11
225	0.11
226	0.14
227	0.14
228	0.14
229	0.14
230	0.15
231	0.14
232	0.14
233	0.14
234	0.11
235	0.12
236	0.12
237	0.11
238	0.13
239	0.17
240	0.25
241	0.26
242	0.33
243	0.34
244	0.36
245	0.45
246	0.44
247	0.46
248	0.4
249	0.39
250	0.38
251	0.41
252	0.39
253	0.32
254	0.32
255	0.24
256	0.21
257	0.2
258	0.16
259	0.12
260	0.11
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.12
265	0.12
266	0.12
267	0.13
268	0.15
269	0.18
270	0.23
271	0.23
272	0.26
273	0.26
274	0.24
275	0.22
276	0.2
277	0.16
278	0.11
279	0.09
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.1
299	0.11
300	0.11
301	0.13
302	0.12
303	0.12
304	0.13
305	0.14
306	0.17
307	0.23
308	0.26
309	0.28
310	0.28
311	0.31
312	0.34
313	0.35
314	0.32
315	0.27
316	0.23
317	0.23
318	0.26
319	0.25
320	0.25
321	0.24
322	0.24
323	0.25
324	0.28
325	0.27
326	0.25
327	0.22
328	0.19
329	0.18
330	0.18
331	0.14
332	0.12
333	0.1
334	0.08
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.06
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.09
359	0.14
360	0.14
361	0.14
362	0.17
363	0.21
364	0.23
365	0.29
366	0.35
367	0.37
368	0.39
369	0.45
370	0.49
371	0.52
372	0.55
373	0.55
374	0.55
375	0.57
376	0.58
377	0.53
378	0.46
379	0.39
380	0.36
381	0.35
382	0.28
383	0.19
384	0.17
385	0.18
386	0.23
387	0.24
388	0.23
389	0.23
390	0.29
391	0.31
392	0.31
393	0.38
394	0.35
395	0.37
396	0.41
397	0.37
398	0.32
399	0.32
400	0.32
401	0.22
402	0.22
403	0.18
404	0.13
405	0.13
406	0.11
407	0.1
408	0.09
409	0.16
410	0.16
411	0.2
412	0.24
413	0.27
414	0.35
415	0.38
416	0.45
417	0.48
418	0.47
419	0.49
420	0.51
421	0.49
422	0.42
423	0.41
424	0.36
425	0.33
426	0.33
427	0.27
428	0.24
429	0.22
430	0.2
431	0.19
432	0.16
433	0.1
434	0.07
435	0.06
436	0.05
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.07
445	0.08
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.09
452	0.06
453	0.06
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.04
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.04
462	0.06
463	0.07
464	0.09
465	0.11
466	0.12
467	0.14
468	0.14
469	0.15
470	0.17
471	0.17
472	0.16
473	0.16
474	0.18
475	0.17
476	0.17
477	0.18
478	0.18
479	0.22
480	0.22
481	0.2
482	0.18
483	0.19
484	0.25
485	0.26
486	0.22
487	0.18
488	0.19
489	0.23
490	0.25
491	0.29
492	0.31
493	0.32
494	0.37
495	0.41
496	0.43
497	0.38
498	0.38
499	0.35
500	0.31
501	0.31
502	0.27
503	0.23
504	0.2
505	0.22
506	0.21
507	0.23
508	0.18
509	0.17
510	0.23
511	0.23
512	0.26
513	0.31
514	0.33
515	0.31
516	0.36
517	0.37
518	0.31
519	0.3
520	0.26
521	0.2
522	0.18
523	0.16
524	0.11
525	0.11
526	0.1
527	0.11
528	0.1
529	0.11
530	0.1
531	0.12
532	0.13
533	0.12
534	0.13
535	0.12
536	0.12
537	0.12
538	0.11
539	0.1
540	0.08
541	0.08
542	0.09
543	0.11
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.12
549	0.11
550	0.09
551	0.12
552	0.16
553	0.16
554	0.16
555	0.17
556	0.16
557	0.16
558	0.18
559	0.16
560	0.14
561	0.19
562	0.2
563	0.21
564	0.25
565	0.27
566	0.3
567	0.3
568	0.33
569	0.3
570	0.36
571	0.37
572	0.34
573	0.36
574	0.37
575	0.36
576	0.31
577	0.35
578	0.32
579	0.3
580	0.29
581	0.28
582	0.25
583	0.26
584	0.29
585	0.25
586	0.23
587	0.26
588	0.28
589	0.32
590	0.32
591	0.32
592	0.31
593	0.34
594	0.38
595	0.37
596	0.37
597	0.32
598	0.3
599	0.28
600	0.25
601	0.22
602	0.17
603	0.17
604	0.17
605	0.2
606	0.18
607	0.24
608	0.25
609	0.26
610	0.27
611	0.3
612	0.35
613	0.36
614	0.42
615	0.42
616	0.44
617	0.5
618	0.54
619	0.57
620	0.59
621	0.6
622	0.59
623	0.6
624	0.61
625	0.59
626	0.64
627	0.6
628	0.51
629	0.53
630	0.47
631	0.43
632	0.44
633	0.4
634	0.36
635	0.4
636	0.42
637	0.44
638	0.48
639	0.47
640	0.46
641	0.47
642	0.44
643	0.39
644	0.38
645	0.31
646	0.35
647	0.38
648	0.4
649	0.45
650	0.44
651	0.47
652	0.48
653	0.49
654	0.47
655	0.52
656	0.5
657	0.47
658	0.51
659	0.46
660	0.46
661	0.49
662	0.47
663	0.42
664	0.46
665	0.49
666	0.46
667	0.51
668	0.5
669	0.52
670	0.54
671	0.52
672	0.48
673	0.5
674	0.56
675	0.53
676	0.54
677	0.51
678	0.53
679	0.55
680	0.53
681	0.48
682	0.44
683	0.43
684	0.46
685	0.43
686	0.37
687	0.32
688	0.31
689	0.28
690	0.23
691	0.2
692	0.13
693	0.11
694	0.09
695	0.09
696	0.07
697	0.07
698	0.09
699	0.11
700	0.15
701	0.16
702	0.16
703	0.16
704	0.2
705	0.24
706	0.24
707	0.24
708	0.24
709	0.28
710	0.28
711	0.29
712	0.25
713	0.22
714	0.2
715	0.2
716	0.17
717	0.13
718	0.12
719	0.12
720	0.12
721	0.12
722	0.12
723	0.14
724	0.15
725	0.18
726	0.22
727	0.24
728	0.24
729	0.23
730	0.25
731	0.24
732	0.22
733	0.2
734	0.15
735	0.17
736	0.19
737	0.19
738	0.18
739	0.19
740	0.23
741	0.23
742	0.25
743	0.25
744	0.25
745	0.27
746	0.27
747	0.28
748	0.27
749	0.27
750	0.26
751	0.22
752	0.22
753	0.22
754	0.21
755	0.19
756	0.18
757	0.18
758	0.21
759	0.22
760	0.22
761	0.21
762	0.25
763	0.24
764	0.23
765	0.26
766	0.31
767	0.36
768	0.37
769	0.4
770	0.39
771	0.41
772	0.41
773	0.4
774	0.36
775	0.35
776	0.34
777	0.34
778	0.35
779	0.35
780	0.37
781	0.41
782	0.42
783	0.43
784	0.47
785	0.48
786	0.5
787	0.55
788	0.54
789	0.51
790	0.47
791	0.5
792	0.5
793	0.5
794	0.5
795	0.46
796	0.46
797	0.49
798	0.55
799	0.47
800	0.43
801	0.41
802	0.41
803	0.37
804	0.34
805	0.29
806	0.23
807	0.23
808	0.23
809	0.2
810	0.17
811	0.21
812	0.23
813	0.24
814	0.22
815	0.27
816	0.28
817	0.3
818	0.3
819	0.32
820	0.32
821	0.31
822	0.3
823	0.25
824	0.22

A0A401H1S6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer