FuNGI

A0A401GM49

Protein Details

Accession

A0A401GM49

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
215-243	VKHANFKAKLKGKDKDRKKKGKCAFCGFP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
220-236	FKAKLKGKDKDRKKKGK

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 6, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSLYPPVPQVKPKAESNRLYDVLFLESNGSNFQMWKYRMTTIFRLCGLYALIDGTETDLGAADSTKKADWDFRNSEALAQITLTLKDEPLNGVMYSMTVQDAWEKLNKHYEGRGKQTLAYLISDLFRSTLSNESPLEPQLNTMQQKAHILETLGLALDDTLIAIAMTISLPPSYSTLRTILMASDSKLTVEKVVNEVLSEEKRRGEMTAASALIVKHANFKAKLKGKDKDRKKKGKCAFCGFPGHTKDECRKFKASQAEGTAAKGDKKAEKAAETKESAKIASVSQVDSETLCLFIAEELAHGDDLLHRWIVNSGASSHMTFHREWFINYRTLAMPKRVYLGDEHFILAVGIGQVTLHAAVDHGSMNTGIVQEVLHVPDLNGNLLSVSQFDHNSYDVRFTDGTCRISNAQGQLNAIGHISVGSVLKMVQKRMVKGMSIIGEKVSEAICKPCLHGKQTRQQILKESDVKNPRVLHRTYSDVCGPMQTQTRSGHCYFITFIDGHTHKLVANLMKMKDEALSQLKAFIERAEVKTGQHANILQTDGGGEYESKEFDAYLKAKGIHHEKTNAYTPQENGVSERMNRTVEEMARCMLNDARLPNAYWGDAILHAVNILNSIPTRVLPDGLTPYEAHTGNKLSVAHLRIFGCKVYVHIPKEKHQKLDSKMLECTHLGFTENCKAYRLVHRPTGRIIESRDVYFDEGSEVEPSHVTIDVTPAQPAPDVRPLLQLQPLLALHPPRPTVEDVPDEDEDAPALLNIDDDSDDEDDDEDDDEDDEDDDAPLPEPHYQHRQQAPRAAQSPPPVSVPAAALVPELRRSGRTCTAPVVADDDRYFVSSYTRKLKDQDNAGGVGAAAGPAEGAAGVGDENAENVRKAANWDELQTYEEAMSRPDAARWKAACTEELHAFVKAELYDEVERPRNRKVVDCKWVFKIKRGPDGEIEKYKARLVAKGFTQVEGLDFNETFAPVAKFTSIRTLLALTAKLDLEIHQMDVKSAFLNGDLDEEIYMNIPPSFRKDNKLIWRLNKALYGLKQAGHKWYKKICAEFEALGFTRCNSDHSVFYKNDNGTLLIIAIYIDDMLILSDNPTAVNTLKDDLNTPMAQNQKLIKLSEAEIDPKPYQSALGSLMYAMLGTRPDLAFAVGALSQHAAKPSKEHWNALMWVYRYLRGTAEKRLVYQTTTREKELLLGYVDADWAADVNDRRSVTGFVFHISEGAVSWSSKKQSPTVQSTEYMAGAHGTKEAIWLHAFLSEIGQVLKGPTSLLIDNQSAIVLTKNAAFHDRTKHIAMRYHFIREKYDSGEIQPEYVPTGNQVADILTKALPREKLKKFKAEMGLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.69
3	0.69
4	0.69
5	0.63
6	0.58
7	0.5
8	0.41
9	0.37
10	0.3
11	0.24
12	0.19
13	0.18
14	0.18
15	0.18
16	0.18
17	0.14
18	0.15
19	0.17
20	0.23
21	0.23
22	0.28
23	0.3
24	0.35
25	0.4
26	0.46
27	0.52
28	0.5
29	0.53
30	0.5
31	0.49
32	0.42
33	0.38
34	0.32
35	0.24
36	0.18
37	0.13
38	0.11
39	0.09
40	0.09
41	0.09
42	0.08
43	0.08
44	0.07
45	0.07
46	0.07
47	0.07
48	0.08
49	0.09
50	0.1
51	0.12
52	0.13
53	0.14
54	0.16
55	0.24
56	0.29
57	0.36
58	0.4
59	0.42
60	0.47
61	0.45
62	0.46
63	0.4
64	0.35
65	0.25
66	0.2
67	0.19
68	0.15
69	0.16
70	0.16
71	0.14
72	0.13
73	0.15
74	0.16
75	0.15
76	0.15
77	0.17
78	0.14
79	0.14
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.11
84	0.09
85	0.07
86	0.08
87	0.1
88	0.11
89	0.14
90	0.18
91	0.19
92	0.22
93	0.32
94	0.34
95	0.34
96	0.41
97	0.48
98	0.51
99	0.57
100	0.61
101	0.54
102	0.53
103	0.53
104	0.5
105	0.42
106	0.36
107	0.28
108	0.22
109	0.21
110	0.2
111	0.16
112	0.13
113	0.11
114	0.11
115	0.12
116	0.16
117	0.16
118	0.2
119	0.21
120	0.23
121	0.25
122	0.26
123	0.27
124	0.21
125	0.22
126	0.23
127	0.29
128	0.29
129	0.29
130	0.29
131	0.29
132	0.33
133	0.33
134	0.29
135	0.23
136	0.22
137	0.21
138	0.2
139	0.18
140	0.14
141	0.11
142	0.09
143	0.08
144	0.06
145	0.05
146	0.04
147	0.03
148	0.03
149	0.03
150	0.03
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.04
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.09
160	0.12
161	0.13
162	0.16
163	0.17
164	0.18
165	0.19
166	0.19
167	0.17
168	0.18
169	0.18
170	0.17
171	0.17
172	0.16
173	0.16
174	0.17
175	0.17
176	0.16
177	0.17
178	0.18
179	0.18
180	0.2
181	0.19
182	0.18
183	0.19
184	0.2
185	0.22
186	0.23
187	0.22
188	0.22
189	0.23
190	0.23
191	0.24
192	0.22
193	0.2
194	0.21
195	0.24
196	0.22
197	0.21
198	0.22
199	0.21
200	0.2
201	0.19
202	0.15
203	0.18
204	0.21
205	0.27
206	0.28
207	0.32
208	0.4
209	0.47
210	0.56
211	0.56
212	0.62
213	0.67
214	0.74
215	0.82
216	0.83
217	0.86
218	0.87
219	0.88
220	0.91
221	0.9
222	0.9
223	0.88
224	0.85
225	0.8
226	0.75
227	0.75
228	0.67
229	0.65
230	0.59
231	0.55
232	0.49
233	0.48
234	0.52
235	0.53
236	0.57
237	0.55
238	0.56
239	0.53
240	0.57
241	0.62
242	0.57
243	0.53
244	0.5
245	0.5
246	0.45
247	0.44
248	0.4
249	0.31
250	0.28
251	0.24
252	0.24
253	0.23
254	0.26
255	0.3
256	0.3
257	0.33
258	0.37
259	0.4
260	0.43
261	0.42
262	0.41
263	0.39
264	0.37
265	0.32
266	0.29
267	0.24
268	0.18
269	0.2
270	0.19
271	0.16
272	0.16
273	0.16
274	0.15
275	0.14
276	0.15
277	0.1
278	0.09
279	0.08
280	0.07
281	0.07
282	0.06
283	0.07
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.09
297	0.1
298	0.11
299	0.1
300	0.1
301	0.09
302	0.12
303	0.13
304	0.13
305	0.15
306	0.17
307	0.19
308	0.18
309	0.2
310	0.24
311	0.24
312	0.25
313	0.29
314	0.29
315	0.3
316	0.3
317	0.31
318	0.25
319	0.3
320	0.32
321	0.31
322	0.3
323	0.27
324	0.3
325	0.28
326	0.27
327	0.25
328	0.26
329	0.23
330	0.22
331	0.21
332	0.18
333	0.17
334	0.16
335	0.12
336	0.08
337	0.05
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.05
349	0.06
350	0.05
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.08
365	0.1
366	0.11
367	0.11
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.05
374	0.06
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.1
379	0.11
380	0.12
381	0.13
382	0.15
383	0.14
384	0.16
385	0.15
386	0.15
387	0.21
388	0.24
389	0.27
390	0.24
391	0.26
392	0.24
393	0.26
394	0.28
395	0.24
396	0.23
397	0.21
398	0.22
399	0.21
400	0.2
401	0.18
402	0.15
403	0.11
404	0.08
405	0.06
406	0.06
407	0.05
408	0.05
409	0.04
410	0.05
411	0.06
412	0.11
413	0.13
414	0.14
415	0.19
416	0.21
417	0.23
418	0.28
419	0.29
420	0.24
421	0.24
422	0.26
423	0.24
424	0.22
425	0.21
426	0.16
427	0.15
428	0.14
429	0.14
430	0.1
431	0.08
432	0.07
433	0.09
434	0.12
435	0.12
436	0.14
437	0.19
438	0.23
439	0.27
440	0.35
441	0.4
442	0.46
443	0.54
444	0.61
445	0.58
446	0.56
447	0.59
448	0.55
449	0.54
450	0.53
451	0.46
452	0.46
453	0.5
454	0.5
455	0.47
456	0.46
457	0.44
458	0.42
459	0.41
460	0.37
461	0.33
462	0.38
463	0.35
464	0.34
465	0.31
466	0.26
467	0.25
468	0.23
469	0.2
470	0.17
471	0.21
472	0.18
473	0.21
474	0.22
475	0.25
476	0.29
477	0.29
478	0.29
479	0.23
480	0.24
481	0.21
482	0.19
483	0.18
484	0.13
485	0.13
486	0.17
487	0.17
488	0.18
489	0.17
490	0.17
491	0.15
492	0.16
493	0.18
494	0.13
495	0.16
496	0.19
497	0.19
498	0.19
499	0.19
500	0.18
501	0.17
502	0.15
503	0.15
504	0.14
505	0.15
506	0.13
507	0.16
508	0.16
509	0.16
510	0.15
511	0.12
512	0.13
513	0.15
514	0.17
515	0.19
516	0.19
517	0.19
518	0.25
519	0.26
520	0.22
521	0.21
522	0.2
523	0.17
524	0.18
525	0.19
526	0.13
527	0.11
528	0.1
529	0.08
530	0.07
531	0.06
532	0.05
533	0.05
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.11
541	0.11
542	0.12
543	0.14
544	0.15
545	0.16
546	0.21
547	0.26
548	0.25
549	0.26
550	0.3
551	0.29
552	0.31
553	0.35
554	0.33
555	0.29
556	0.27
557	0.25
558	0.24
559	0.24
560	0.21
561	0.17
562	0.17
563	0.17
564	0.16
565	0.17
566	0.15
567	0.15
568	0.14
569	0.15
570	0.16
571	0.17
572	0.18
573	0.17
574	0.16
575	0.15
576	0.15
577	0.14
578	0.11
579	0.1
580	0.1
581	0.1
582	0.12
583	0.12
584	0.13
585	0.13
586	0.13
587	0.12
588	0.09
589	0.09
590	0.08
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.04
599	0.04
600	0.04
601	0.04
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.07
606	0.07
607	0.08
608	0.08
609	0.09
610	0.11
611	0.11
612	0.12
613	0.1
614	0.12
615	0.14
616	0.14
617	0.13
618	0.12
619	0.13
620	0.12
621	0.14
622	0.13
623	0.1
624	0.13
625	0.15
626	0.15
627	0.17
628	0.17
629	0.16
630	0.17
631	0.16
632	0.13
633	0.11
634	0.12
635	0.14
636	0.19
637	0.2
638	0.26
639	0.28
640	0.34
641	0.45
642	0.47
643	0.46
644	0.45
645	0.49
646	0.47
647	0.55
648	0.51
649	0.43
650	0.42
651	0.38
652	0.35
653	0.28
654	0.26
655	0.16
656	0.13
657	0.12
658	0.1
659	0.12
660	0.17
661	0.19
662	0.17
663	0.18
664	0.18
665	0.19
666	0.28
667	0.32
668	0.29
669	0.35
670	0.37
671	0.37
672	0.39
673	0.41
674	0.33
675	0.29
676	0.28
677	0.25
678	0.23
679	0.22
680	0.21
681	0.18
682	0.17
683	0.15
684	0.12
685	0.08
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.05
697	0.07
698	0.09
699	0.09
700	0.1
701	0.09
702	0.09
703	0.1
704	0.1
705	0.11
706	0.14
707	0.14
708	0.14
709	0.18
710	0.19
711	0.2
712	0.22
713	0.19
714	0.14
715	0.15
716	0.15
717	0.11
718	0.12
719	0.12
720	0.11
721	0.13
722	0.14
723	0.13
724	0.15
725	0.17
726	0.17
727	0.19
728	0.2
729	0.19
730	0.22
731	0.22
732	0.21
733	0.18
734	0.16
735	0.13
736	0.1
737	0.08
738	0.04
739	0.04
740	0.03
741	0.03
742	0.03
743	0.04
744	0.04
745	0.04
746	0.06
747	0.06
748	0.06
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.05
755	0.05
756	0.05
757	0.05
758	0.05
759	0.05
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.05
765	0.06
766	0.06
767	0.06
768	0.09
769	0.1
770	0.13
771	0.2
772	0.23
773	0.29
774	0.36
775	0.42
776	0.43
777	0.49
778	0.5
779	0.47
780	0.47
781	0.43
782	0.39
783	0.37
784	0.36
785	0.3
786	0.27
787	0.22
788	0.2
789	0.19
790	0.16
791	0.11
792	0.09
793	0.08
794	0.07
795	0.07
796	0.08
797	0.09
798	0.09
799	0.09
800	0.11
801	0.13
802	0.18
803	0.23
804	0.25
805	0.25
806	0.26
807	0.28
808	0.26
809	0.25
810	0.25
811	0.19
812	0.18
813	0.17
814	0.15
815	0.13
816	0.14
817	0.14
818	0.09
819	0.13
820	0.14
821	0.18
822	0.26
823	0.29
824	0.29
825	0.32
826	0.38
827	0.39
828	0.42
829	0.43
830	0.36
831	0.34
832	0.32
833	0.29
834	0.23
835	0.17
836	0.11
837	0.06
838	0.04
839	0.03
840	0.02
841	0.02
842	0.02
843	0.02
844	0.02
845	0.02
846	0.02
847	0.02
848	0.02
849	0.03
850	0.03
851	0.03
852	0.04
853	0.05
854	0.05
855	0.05
856	0.06
857	0.06
858	0.08
859	0.11
860	0.16
861	0.16
862	0.18
863	0.2
864	0.2
865	0.21
866	0.19
867	0.16
868	0.11
869	0.11
870	0.1
871	0.09
872	0.09
873	0.1
874	0.1
875	0.12
876	0.17
877	0.17
878	0.24
879	0.24
880	0.26
881	0.28
882	0.29
883	0.28
884	0.25
885	0.27
886	0.23
887	0.25
888	0.23
889	0.2
890	0.19
891	0.17
892	0.16
893	0.12
894	0.11
895	0.08
896	0.11
897	0.12
898	0.13
899	0.17
900	0.23
901	0.26
902	0.27
903	0.32
904	0.33
905	0.33
906	0.4
907	0.46
908	0.48
909	0.55
910	0.58
911	0.57
912	0.58
913	0.66
914	0.59
915	0.57
916	0.57
917	0.53
918	0.57
919	0.56
920	0.52
921	0.5
922	0.55
923	0.54
924	0.5
925	0.48
926	0.4
927	0.39
928	0.37
929	0.34
930	0.29
931	0.27
932	0.24
933	0.26
934	0.25
935	0.32
936	0.32
937	0.28
938	0.28
939	0.24
940	0.21
941	0.18
942	0.17
943	0.1
944	0.1
945	0.1
946	0.1
947	0.1
948	0.09
949	0.1
950	0.1
951	0.08
952	0.09
953	0.1
954	0.1
955	0.11
956	0.18
957	0.17
958	0.17
959	0.17
960	0.18
961	0.18
962	0.2
963	0.2
964	0.13
965	0.13
966	0.13
967	0.12
968	0.11
969	0.1
970	0.12
971	0.12
972	0.12
973	0.13
974	0.13
975	0.13
976	0.13
977	0.13
978	0.09
979	0.09
980	0.08
981	0.07
982	0.08
983	0.07
984	0.08
985	0.08
986	0.08
987	0.08
988	0.08
989	0.07
990	0.07
991	0.07
992	0.06
993	0.07
994	0.07
995	0.08
996	0.13
997	0.22
998	0.23
999	0.29
1000	0.33
1001	0.42
1002	0.52
1003	0.6
1004	0.61
1005	0.6
1006	0.65
1007	0.63
1008	0.6
1009	0.54
1010	0.46
1011	0.43
1012	0.38
1013	0.38
1014	0.32
1015	0.31
1016	0.32
1017	0.32
1018	0.39
1019	0.41
1020	0.43
1021	0.44
1022	0.48
1023	0.54
1024	0.56
1025	0.59
1026	0.53
1027	0.49
1028	0.49
1029	0.43
1030	0.37
1031	0.34
1032	0.28
1033	0.25
1034	0.22
1035	0.17
1036	0.17
1037	0.16
1038	0.18
1039	0.17
1040	0.19
1041	0.23
1042	0.26
1043	0.32
1044	0.3
1045	0.33
1046	0.38
1047	0.33
1048	0.33
1049	0.29
1050	0.26
1051	0.21
1052	0.2
1053	0.17
1054	0.09
1055	0.09
1056	0.07
1057	0.06
1058	0.05
1059	0.04
1060	0.03
1061	0.03
1062	0.03
1063	0.03
1064	0.03
1065	0.04
1066	0.04
1067	0.05
1068	0.05
1069	0.06
1070	0.06
1071	0.08
1072	0.08
1073	0.09
1074	0.1
1075	0.12
1076	0.13
1077	0.13
1078	0.15
1079	0.16
1080	0.2
1081	0.19
1082	0.18
1083	0.21
1084	0.25
1085	0.25
1086	0.27
1087	0.28
1088	0.29
1089	0.31
1090	0.32
1091	0.28
1092	0.26
1093	0.27
1094	0.28
1095	0.26
1096	0.25
1097	0.23
1098	0.28
1099	0.27
1100	0.25
1101	0.25
1102	0.2
1103	0.19
1104	0.16
1105	0.16
1106	0.14
1107	0.14
1108	0.13
1109	0.12
1110	0.12
1111	0.11
1112	0.1
1113	0.08
1114	0.06
1115	0.05
1116	0.06
1117	0.08
1118	0.08
1119	0.09
1120	0.1
1121	0.1
1122	0.09
1123	0.08
1124	0.1
1125	0.08
1126	0.08
1127	0.07
1128	0.08
1129	0.08
1130	0.09
1131	0.14
1132	0.15
1133	0.15
1134	0.2
1135	0.25
1136	0.35
1137	0.38
1138	0.4
1139	0.38
1140	0.41
1141	0.43
1142	0.41
1143	0.41
1144	0.32
1145	0.33
1146	0.33
1147	0.33
1148	0.29
1149	0.28
1150	0.28
1151	0.3
1152	0.32
1153	0.35
1154	0.41
1155	0.4
1156	0.41
1157	0.45
1158	0.44
1159	0.39
1160	0.41
1161	0.42
1162	0.44
1163	0.46
1164	0.46
1165	0.41
1166	0.4
1167	0.41
1168	0.37
1169	0.31
1170	0.23
1171	0.19
1172	0.18
1173	0.17
1174	0.17
1175	0.12
1176	0.1
1177	0.07
1178	0.05
1179	0.05
1180	0.09
1181	0.11
1182	0.13
1183	0.18
1184	0.18
1185	0.2
1186	0.21
1187	0.23
1188	0.2
1189	0.24
1190	0.22
1191	0.19
1192	0.2
1193	0.19
1194	0.18
1195	0.16
1196	0.14
1197	0.09
1198	0.11
1199	0.1
1200	0.09
1201	0.13
1202	0.17
1203	0.21
1204	0.25
1205	0.28
1206	0.31
1207	0.38
1208	0.46
1209	0.52
1210	0.53
1211	0.53
1212	0.51
1213	0.51
1214	0.47
1215	0.39
1216	0.3
1217	0.22
1218	0.17
1219	0.15
1220	0.13
1221	0.11
1222	0.1
1223	0.09
1224	0.12
1225	0.13
1226	0.13
1227	0.13
1228	0.14
1229	0.13
1230	0.14
1231	0.15
1232	0.12
1233	0.13
1234	0.11
1235	0.11
1236	0.1
1237	0.1
1238	0.09
1239	0.1
1240	0.11
1241	0.09
1242	0.09
1243	0.09
1244	0.13
1245	0.13
1246	0.15
1247	0.18
1248	0.18
1249	0.18
1250	0.18
1251	0.17
1252	0.14
1253	0.13
1254	0.12
1255	0.09
1256	0.09
1257	0.12
1258	0.13
1259	0.15
1260	0.19
1261	0.21
1262	0.25
1263	0.33
1264	0.36
1265	0.38
1266	0.42
1267	0.45
1268	0.47
1269	0.51
1270	0.5
1271	0.5
1272	0.5
1273	0.55
1274	0.55
1275	0.52
1276	0.53
1277	0.51
1278	0.51
1279	0.47
1280	0.49
1281	0.41
1282	0.39
1283	0.44
1284	0.39
1285	0.35
1286	0.32
1287	0.27
1288	0.25
1289	0.24
1290	0.21
1291	0.15
1292	0.19
1293	0.17
1294	0.16
1295	0.16
1296	0.14
1297	0.14
1298	0.15
1299	0.15
1300	0.13
1301	0.14
1302	0.16
1303	0.22
1304	0.28
1305	0.34
1306	0.43
1307	0.52
1308	0.61
1309	0.67
1310	0.75
1311	0.74
1312	0.76

A0A401GM49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer