Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A401GSJ0

Protein Details
Accession A0A401GSJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-42GSRGRSHSQPIPSRRQPNRQTFQSPTHydrophilic
821-843TERLPFYRTRQLRNPWNHDREVKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MSEQQSSGSTSEPGRPGSRGRSHSQPIPSRRQPNRQTFQSPTGPLYPPPASLEGMTPAPSTSTSFQSLPPQYQTPYGQQPGPYAGQYTLSPQPPMLPAHQSPPYAYPHHPGLHAPDSSMHAPQNPLLGYSQNTLVPIMQSHPHSYPYHPQSPEGSSSPSHSFSASPGPQTIYSSHPHSPAHPSPPPHPPLAPQGPAAHSAAHSTAYAGQTPYAPARYPTPSFAYPPHSFAPSPSVYMPHQYPPYPPAEQDTQGTWWYLPHAAARPSGQYESFQNPYALSFSPVPPRDVDPYAASAAQQQQQQQQQQQPGITSTLYPMSPRQNPVRYAQPQPPPPPAPPADPPAPRAQQPEPGPAAGGRPARRPYRPNPPAQRSEWVMWAGNVPSDATHDELWRFLNSTPPPAAPVTSTAAVASTSPPASGGVRSIFLIARSNCAFVNFQSEAQLQAAIRRFNGAPLRAHDARCPRLVCRVRGREDDLRAGVGGQRGAGMHVRWIRDRKVRAEARSREESEQSSPSSPDDFVSGAMAGLSVSSDAPEPHSSSSGSGSYASTSSSMLVQYFPKRYFILKSLTQHDLDLSVEKGVWATQHHNEGILDQAFRTSKEVYLIFGVNKSGEFYGYAKMAGPIQHGEFRISWASRADSPQQQPQQRRASASPPTARHTFFSPGELQPKYDSPQPVSPPGPPAAPYDEGATPRSVDAPMPASTVLSAPAELQQPHHRLSRFAPAPGMPQSLDTRRPPPPPPPPEDTFELDSSAPYRAMRGHAASAVTDPSSSGSSSSSMLDSPPPELGLDPSPRPLGSVREEESEGPAWGESFKVEWLRTERLPFYRTRQLRNPWNHDREVKVSRDGTELEPSVGQALLDEWDRPDPPPPPSPASERRTGRGQGEGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.36
4 0.43
5 0.5
6 0.49
7 0.51
8 0.56
9 0.6
10 0.64
11 0.68
12 0.69
13 0.68
14 0.73
15 0.77
16 0.79
17 0.81
18 0.85
19 0.85
20 0.87
21 0.87
22 0.85
23 0.83
24 0.79
25 0.78
26 0.75
27 0.67
28 0.6
29 0.57
30 0.5
31 0.44
32 0.44
33 0.37
34 0.31
35 0.32
36 0.3
37 0.26
38 0.25
39 0.25
40 0.22
41 0.21
42 0.21
43 0.18
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.17
48 0.17
49 0.19
50 0.22
51 0.22
52 0.25
53 0.33
54 0.36
55 0.37
56 0.39
57 0.38
58 0.36
59 0.4
60 0.42
61 0.39
62 0.43
63 0.43
64 0.41
65 0.39
66 0.4
67 0.39
68 0.38
69 0.32
70 0.25
71 0.22
72 0.21
73 0.2
74 0.23
75 0.25
76 0.25
77 0.25
78 0.23
79 0.25
80 0.26
81 0.29
82 0.27
83 0.27
84 0.27
85 0.32
86 0.37
87 0.35
88 0.34
89 0.35
90 0.37
91 0.35
92 0.35
93 0.34
94 0.35
95 0.36
96 0.35
97 0.33
98 0.35
99 0.36
100 0.34
101 0.3
102 0.26
103 0.29
104 0.29
105 0.3
106 0.24
107 0.21
108 0.22
109 0.22
110 0.25
111 0.2
112 0.2
113 0.18
114 0.19
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.16
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.17
127 0.21
128 0.22
129 0.26
130 0.27
131 0.3
132 0.38
133 0.42
134 0.48
135 0.45
136 0.45
137 0.45
138 0.46
139 0.47
140 0.39
141 0.34
142 0.27
143 0.3
144 0.31
145 0.3
146 0.26
147 0.23
148 0.21
149 0.2
150 0.28
151 0.26
152 0.24
153 0.23
154 0.25
155 0.25
156 0.26
157 0.26
158 0.21
159 0.22
160 0.26
161 0.27
162 0.28
163 0.29
164 0.29
165 0.36
166 0.38
167 0.42
168 0.42
169 0.43
170 0.44
171 0.52
172 0.53
173 0.47
174 0.43
175 0.38
176 0.42
177 0.45
178 0.42
179 0.35
180 0.35
181 0.34
182 0.35
183 0.33
184 0.24
185 0.18
186 0.17
187 0.15
188 0.13
189 0.12
190 0.1
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.16
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.18
203 0.23
204 0.24
205 0.25
206 0.29
207 0.28
208 0.3
209 0.33
210 0.36
211 0.32
212 0.35
213 0.33
214 0.3
215 0.29
216 0.27
217 0.3
218 0.24
219 0.24
220 0.21
221 0.22
222 0.2
223 0.24
224 0.25
225 0.24
226 0.26
227 0.25
228 0.26
229 0.26
230 0.31
231 0.28
232 0.26
233 0.26
234 0.26
235 0.27
236 0.26
237 0.25
238 0.22
239 0.21
240 0.22
241 0.17
242 0.13
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.16
248 0.17
249 0.19
250 0.19
251 0.2
252 0.21
253 0.22
254 0.19
255 0.17
256 0.19
257 0.23
258 0.24
259 0.23
260 0.2
261 0.19
262 0.19
263 0.2
264 0.16
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.23
269 0.24
270 0.25
271 0.24
272 0.26
273 0.28
274 0.28
275 0.27
276 0.2
277 0.21
278 0.21
279 0.2
280 0.17
281 0.16
282 0.18
283 0.19
284 0.2
285 0.2
286 0.25
287 0.31
288 0.36
289 0.39
290 0.4
291 0.41
292 0.42
293 0.4
294 0.35
295 0.3
296 0.27
297 0.21
298 0.16
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.18
305 0.21
306 0.26
307 0.32
308 0.35
309 0.37
310 0.39
311 0.46
312 0.44
313 0.45
314 0.48
315 0.49
316 0.51
317 0.52
318 0.56
319 0.49
320 0.46
321 0.47
322 0.42
323 0.39
324 0.35
325 0.36
326 0.35
327 0.34
328 0.35
329 0.36
330 0.36
331 0.34
332 0.36
333 0.32
334 0.33
335 0.34
336 0.37
337 0.31
338 0.29
339 0.27
340 0.23
341 0.22
342 0.19
343 0.22
344 0.18
345 0.22
346 0.28
347 0.32
348 0.37
349 0.42
350 0.43
351 0.5
352 0.55
353 0.59
354 0.64
355 0.66
356 0.67
357 0.63
358 0.62
359 0.54
360 0.49
361 0.42
362 0.33
363 0.26
364 0.21
365 0.19
366 0.15
367 0.11
368 0.1
369 0.08
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.11
379 0.1
380 0.11
381 0.1
382 0.16
383 0.16
384 0.19
385 0.19
386 0.18
387 0.2
388 0.18
389 0.18
390 0.12
391 0.14
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.13
415 0.12
416 0.14
417 0.14
418 0.15
419 0.14
420 0.15
421 0.15
422 0.1
423 0.17
424 0.14
425 0.14
426 0.15
427 0.15
428 0.15
429 0.14
430 0.15
431 0.09
432 0.12
433 0.14
434 0.12
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.16
439 0.19
440 0.18
441 0.17
442 0.19
443 0.26
444 0.26
445 0.27
446 0.28
447 0.31
448 0.31
449 0.33
450 0.32
451 0.26
452 0.34
453 0.38
454 0.39
455 0.43
456 0.47
457 0.48
458 0.5
459 0.55
460 0.5
461 0.48
462 0.45
463 0.36
464 0.29
465 0.24
466 0.21
467 0.17
468 0.12
469 0.1
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.07
474 0.08
475 0.07
476 0.1
477 0.13
478 0.15
479 0.18
480 0.22
481 0.26
482 0.32
483 0.36
484 0.35
485 0.42
486 0.46
487 0.49
488 0.55
489 0.56
490 0.56
491 0.58
492 0.57
493 0.49
494 0.46
495 0.42
496 0.35
497 0.32
498 0.27
499 0.22
500 0.19
501 0.18
502 0.17
503 0.15
504 0.12
505 0.11
506 0.1
507 0.09
508 0.09
509 0.08
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.04
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.04
520 0.04
521 0.07
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.14
529 0.12
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.08
543 0.11
544 0.15
545 0.19
546 0.2
547 0.22
548 0.22
549 0.24
550 0.25
551 0.26
552 0.27
553 0.28
554 0.31
555 0.34
556 0.36
557 0.34
558 0.31
559 0.28
560 0.23
561 0.18
562 0.15
563 0.11
564 0.08
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.07
570 0.08
571 0.11
572 0.14
573 0.18
574 0.18
575 0.19
576 0.18
577 0.17
578 0.19
579 0.16
580 0.13
581 0.1
582 0.12
583 0.12
584 0.13
585 0.15
586 0.12
587 0.12
588 0.15
589 0.16
590 0.14
591 0.16
592 0.17
593 0.15
594 0.15
595 0.14
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.09
600 0.08
601 0.09
602 0.09
603 0.11
604 0.11
605 0.11
606 0.1
607 0.11
608 0.12
609 0.12
610 0.12
611 0.12
612 0.14
613 0.17
614 0.18
615 0.19
616 0.17
617 0.19
618 0.21
619 0.2
620 0.19
621 0.17
622 0.19
623 0.19
624 0.23
625 0.25
626 0.29
627 0.32
628 0.4
629 0.46
630 0.5
631 0.54
632 0.59
633 0.63
634 0.58
635 0.59
636 0.53
637 0.52
638 0.52
639 0.55
640 0.53
641 0.47
642 0.5
643 0.49
644 0.47
645 0.42
646 0.38
647 0.36
648 0.3
649 0.3
650 0.29
651 0.29
652 0.34
653 0.33
654 0.3
655 0.27
656 0.29
657 0.28
658 0.3
659 0.29
660 0.27
661 0.34
662 0.36
663 0.39
664 0.39
665 0.38
666 0.36
667 0.35
668 0.31
669 0.26
670 0.25
671 0.24
672 0.24
673 0.22
674 0.22
675 0.23
676 0.23
677 0.24
678 0.21
679 0.17
680 0.16
681 0.16
682 0.14
683 0.12
684 0.12
685 0.14
686 0.14
687 0.15
688 0.14
689 0.13
690 0.13
691 0.13
692 0.12
693 0.09
694 0.08
695 0.08
696 0.11
697 0.14
698 0.14
699 0.18
700 0.24
701 0.27
702 0.3
703 0.36
704 0.34
705 0.33
706 0.36
707 0.43
708 0.37
709 0.35
710 0.35
711 0.3
712 0.34
713 0.35
714 0.34
715 0.23
716 0.23
717 0.27
718 0.29
719 0.34
720 0.34
721 0.36
722 0.41
723 0.46
724 0.48
725 0.52
726 0.58
727 0.6
728 0.62
729 0.64
730 0.61
731 0.61
732 0.61
733 0.56
734 0.49
735 0.42
736 0.37
737 0.3
738 0.27
739 0.23
740 0.2
741 0.16
742 0.12
743 0.13
744 0.13
745 0.16
746 0.19
747 0.21
748 0.21
749 0.22
750 0.23
751 0.22
752 0.21
753 0.19
754 0.16
755 0.13
756 0.11
757 0.11
758 0.11
759 0.11
760 0.1
761 0.1
762 0.11
763 0.12
764 0.13
765 0.12
766 0.11
767 0.12
768 0.15
769 0.15
770 0.16
771 0.16
772 0.15
773 0.14
774 0.15
775 0.17
776 0.19
777 0.23
778 0.22
779 0.25
780 0.26
781 0.25
782 0.27
783 0.26
784 0.25
785 0.26
786 0.31
787 0.31
788 0.33
789 0.35
790 0.33
791 0.35
792 0.31
793 0.26
794 0.2
795 0.17
796 0.14
797 0.13
798 0.12
799 0.09
800 0.08
801 0.12
802 0.16
803 0.16
804 0.21
805 0.27
806 0.32
807 0.35
808 0.39
809 0.42
810 0.43
811 0.45
812 0.45
813 0.47
814 0.52
815 0.55
816 0.57
817 0.61
818 0.65
819 0.72
820 0.78
821 0.81
822 0.81
823 0.82
824 0.8
825 0.77
826 0.72
827 0.7
828 0.67
829 0.61
830 0.57
831 0.53
832 0.47
833 0.45
834 0.42
835 0.37
836 0.37
837 0.34
838 0.28
839 0.26
840 0.24
841 0.22
842 0.19
843 0.16
844 0.09
845 0.09
846 0.09
847 0.1
848 0.11
849 0.12
850 0.15
851 0.17
852 0.18
853 0.23
854 0.25
855 0.3
856 0.37
857 0.41
858 0.43
859 0.46
860 0.54
861 0.58
862 0.59
863 0.63
864 0.6
865 0.59
866 0.61
867 0.61
868 0.55