FuNGI

A0A401G5P1

Protein Details

Accession

A0A401G5P1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
485-523	TVTRSRNESKEDKKLRKQAVKTKRQARRADKKATTEKFT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
494-517	KEDKKLRKQAVKTKRQARRADKKA

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSIFRQPEAQHFQLVHRSQRDPLIHDPEASQHVLKAFERRNLAKGKSRADLEGVITPSALAHDNERANIGQAALYGVYFDDTEYDYMQHLRTFGLQEDGVDSILIEAPAKPKAKGKATDLFDLPAEALPSTSELPRTYESQQAIPSSIAGFQPDMDPHLRQALEALEDDDFIEDDLDDDFFGELVQKGERGTDEHVDFAFREDGFTDGEQEKSTPGTEQTKGTDDEDPSWEARFAQFKKNQKATSRNGTSDVDAYSEGGDTVGTLPQLSVIGGKRRRKGTSDASGFSMSSSSMFRNEGLTLLDERFDQVIKEYESDEEDEDGVDSDDSDEAPELITSREDFDSLMSEFLDNYEILGGKMRPVLPGGTGMEKLDSIRKGLGTITLRVQDENNSEDEILMPLDVDDKKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRASRDKAVPKIRLDPRTGLPIVKENHPQSPDDNAQSGTSWVSDDEDDTRPTRVTVTRSRNESKEDKKLRKQAVKTKRQARRADKKATTEKFTTEASRQARMLVNKEKTKMRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.5
3	0.5
4	0.51
5	0.49
6	0.46
7	0.47
8	0.45
9	0.52
10	0.52
11	0.48
12	0.52
13	0.52
14	0.47
15	0.46
16	0.44
17	0.4
18	0.4
19	0.37
20	0.29
21	0.22
22	0.22
23	0.25
24	0.26
25	0.31
26	0.32
27	0.36
28	0.43
29	0.44
30	0.49
31	0.53
32	0.58
33	0.58
34	0.6
35	0.59
36	0.58
37	0.57
38	0.52
39	0.47
40	0.44
41	0.37
42	0.35
43	0.31
44	0.25
45	0.22
46	0.2
47	0.17
48	0.16
49	0.15
50	0.1
51	0.11
52	0.17
53	0.19
54	0.19
55	0.22
56	0.2
57	0.2
58	0.2
59	0.18
60	0.12
61	0.11
62	0.11
63	0.09
64	0.09
65	0.07
66	0.06
67	0.07
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.07
72	0.09
73	0.09
74	0.1
75	0.11
76	0.13
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.12
81	0.14
82	0.15
83	0.15
84	0.17
85	0.16
86	0.15
87	0.16
88	0.15
89	0.13
90	0.11
91	0.1
92	0.07
93	0.08
94	0.07
95	0.06
96	0.07
97	0.09
98	0.15
99	0.17
100	0.18
101	0.23
102	0.3
103	0.37
104	0.41
105	0.45
106	0.48
107	0.51
108	0.54
109	0.49
110	0.43
111	0.35
112	0.31
113	0.25
114	0.17
115	0.14
116	0.09
117	0.08
118	0.07
119	0.09
120	0.1
121	0.1
122	0.11
123	0.11
124	0.15
125	0.17
126	0.2
127	0.21
128	0.25
129	0.26
130	0.27
131	0.29
132	0.27
133	0.26
134	0.22
135	0.2
136	0.15
137	0.15
138	0.12
139	0.11
140	0.1
141	0.09
142	0.1
143	0.1
144	0.12
145	0.13
146	0.13
147	0.13
148	0.17
149	0.17
150	0.15
151	0.16
152	0.14
153	0.13
154	0.13
155	0.13
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.08
160	0.07
161	0.05
162	0.05
163	0.04
164	0.04
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.05
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.05
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.07
179	0.08
180	0.09
181	0.11
182	0.15
183	0.15
184	0.16
185	0.16
186	0.16
187	0.15
188	0.16
189	0.15
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.1
194	0.11
195	0.11
196	0.12
197	0.11
198	0.12
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.11
204	0.08
205	0.1
206	0.14
207	0.16
208	0.17
209	0.19
210	0.21
211	0.22
212	0.23
213	0.23
214	0.19
215	0.2
216	0.2
217	0.2
218	0.18
219	0.17
220	0.15
221	0.12
222	0.13
223	0.18
224	0.18
225	0.26
226	0.31
227	0.39
228	0.48
229	0.55
230	0.57
231	0.57
232	0.63
233	0.6
234	0.64
235	0.6
236	0.52
237	0.49
238	0.45
239	0.39
240	0.32
241	0.26
242	0.17
243	0.12
244	0.11
245	0.08
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.04
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.06
260	0.07
261	0.15
262	0.22
263	0.27
264	0.32
265	0.37
266	0.39
267	0.4
268	0.45
269	0.45
270	0.48
271	0.47
272	0.44
273	0.41
274	0.4
275	0.36
276	0.3
277	0.22
278	0.12
279	0.09
280	0.09
281	0.07
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.1
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.09
295	0.09
296	0.08
297	0.07
298	0.07
299	0.1
300	0.1
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.12
305	0.13
306	0.12
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.07
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.04
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.08
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.13
353	0.11
354	0.13
355	0.14
356	0.13
357	0.13
358	0.13
359	0.12
360	0.12
361	0.12
362	0.14
363	0.13
364	0.13
365	0.14
366	0.14
367	0.14
368	0.14
369	0.19
370	0.17
371	0.18
372	0.2
373	0.23
374	0.23
375	0.23
376	0.24
377	0.21
378	0.21
379	0.21
380	0.19
381	0.16
382	0.16
383	0.15
384	0.15
385	0.11
386	0.09
387	0.07
388	0.06
389	0.05
390	0.09
391	0.09
392	0.12
393	0.14
394	0.15
395	0.21
396	0.25
397	0.26
398	0.27
399	0.31
400	0.28
401	0.31
402	0.35
403	0.3
404	0.28
405	0.28
406	0.24
407	0.21
408	0.22
409	0.17
410	0.14
411	0.19
412	0.18
413	0.21
414	0.23
415	0.23
416	0.24
417	0.27
418	0.34
419	0.38
420	0.43
421	0.44
422	0.49
423	0.52
424	0.58
425	0.62
426	0.6
427	0.55
428	0.58
429	0.62
430	0.61
431	0.61
432	0.57
433	0.51
434	0.53
435	0.5
436	0.42
437	0.35
438	0.37
439	0.35
440	0.36
441	0.41
442	0.36
443	0.42
444	0.42
445	0.42
446	0.36
447	0.41
448	0.41
449	0.36
450	0.35
451	0.3
452	0.29
453	0.27
454	0.26
455	0.19
456	0.14
457	0.11
458	0.1
459	0.1
460	0.1
461	0.11
462	0.14
463	0.16
464	0.19
465	0.2
466	0.21
467	0.2
468	0.2
469	0.23
470	0.23
471	0.27
472	0.35
473	0.44
474	0.49
475	0.56
476	0.62
477	0.62
478	0.65
479	0.67
480	0.66
481	0.67
482	0.7
483	0.73
484	0.76
485	0.82
486	0.86
487	0.86
488	0.87
489	0.86
490	0.87
491	0.88
492	0.88
493	0.89
494	0.88
495	0.88
496	0.89
497	0.89
498	0.89
499	0.88
500	0.88
501	0.85
502	0.86
503	0.87
504	0.83
505	0.79
506	0.71
507	0.64
508	0.56
509	0.52
510	0.48
511	0.4
512	0.43
513	0.4
514	0.41
515	0.38
516	0.4
517	0.43
518	0.43
519	0.48
520	0.49
521	0.55
522	0.57
523	0.62
524	0.67

A0A401G5P1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer